Parkinson's disease (PD) and dementia with Lewy body (DLB) are the most common synucleinopathies. SNCA gene is a major genetic risk factor for these diseases group, and dysregulation of its expression has been implicated in the genetic etiologies of several synucleinopathies. DNA methylation at CpG island (CGI) within SNCA intron 1 has been suggested as a regulatory mechanism of SNCA expression, and changes in methylation levels at this region were associated with PD and DLB. However, the role of DNA methylation in the regulation of SNCA expression in a cell-type specific manner and its contri…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: To investigate the association between placental genome-wide methylation at birth and antenatal depression and stress during pregnancy. Methods: We examined the association between placental genome-wide DNA methylation (n = 301) and maternal depression and stress assessed at six gestation periods during pregnancy. Correlation between DNA methylation at the significantly associated CpGs and expression of nearby genes in the placenta was tested. Results: Depression and stress were associated with methylation of 16 CpGs and two CpGs, respectively, at a 5% false discovery rate. Methylation le…
СтатьяResearch Support, American Recovery and Reinvestment ActПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Biological aging estimators derived from DNA methylation data are heritable and correlate with morbidity and mortality. Consequently, identification of genetic and environmental contributors to the variation in these measures in populations has become a major goal in the field.
RESULTS: Leveraging DNA methylation and SNP data from more than 40,000 individuals, we identify 137 genome-wide significant loci, of which 113 are novel, from genome-wide association study (GWAS) meta-analyses of four epigenetic clocks and epigenetic surrogate markers for granulocyte proportions and plasmin…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Environmental factors can promote phenotypic variation through alterations in the epigenome and facilitate adaptation of an organism to the environment. Although hydrogen sulfide is toxic to most organisms, the fish Poecilia mexicana has adapted to survive in environments with high levels that exceed toxicity thresholds by orders of magnitude. Epigenetic changes in response to this environmental stressor were examined by assessing DNA methylation alterations in red blood cells, which are nucleated in fish. Males and females were sampled from sulfidic and nonsulfidic natural environments; indiv…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Women with a history of complications of pregnancy, including hypertensive disorders, gestational diabetes or an infant fetal growth restriction or preterm birth, are at higher risk for cardiovascular disease later in life. We aimed to examine differences in maternal DNA methylation following pregnancy complications.
METHODS: Data on women participating in the Young Finns study (n = 836) were linked to the national birth registry. DNA methylation in whole blood was assessed using the Infinium Methylation EPIC BeadChip. Epigenome-wide analysis was conducted on differential CpG meth…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study aims to investigate the independent and combined effects of progesterone and suppressor of cytokine signaling (SOCS)-3 DNA methylation on type 2 diabetes mellitus (T2DM) among men and postmenopausal women in rural China.
METHODS: A case-control study with 914 participants (329 T2DM, 585 controls) was conducted. Serum progesterone was detected with liquid chromatography-tandem mass spectrometry. DNA methylation of SOCS3 was determined by MethylTarget™. Linear regression was applied to evaluate the associations of progesterone and SOCS3 methylation with marks of glucose m…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
STUDY QUESTION: What is the sperm DNA methylation status of imprinted genes in male partners from couples experiencing recurrent pregnancy loss (RPL)?
SUMMARY ANSWER: Aberrations in sperm DNA methylation status of several imprinted genes, such as insulin like growth factor-2-H19 differentially methylated region (IGF2-H19 DMR), intergenic differentially methylated region (IG-DMR), mesoderm specific transcript (MEST), zinc finger protein which regulates apoptosis and cell cycle arrest (ZAC), DMR in intron 10 of KCNQ1 gene (KvDMR), paternally expressed gene 3 (PEG3) and paternally expressed gene…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA methylation is an important part of epigenetic modification, and its abnormality is closely related to esophageal adenocarcinoma (EAC). This study was aimed at using bioinformatics analysis to identify methylation-driven genes (MDGs) in EAC patients and establish a risk model as a biological indicator of EAC prognosis.
METHOD: Downloaded EAC DNA methylation, transcriptome, and related clinical data from TCGA database. MethylMix was used to identify MDGs. R package clusterProfiler and the ConsensusPathDB online database were used to analyze the rich functions and pathways of th…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uterine leiomyoma (LM) is the most common tumor in women and can cause severe morbidity. Leiomyoma growth requires the maintenance and proli … ntiation, depleting the stem cell population and inhibiting tumor initiation. Our data suggest that DNA methylation maintains the pool of LSC, which is critical for the regeneration of LM tumors.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oxytocin is an important neuromodulator involved in cognition and socio-emotional processing that exerts its central activities via oxytocin receptors. Epigenetic alterations in the oxytocin receptor gene (OXTR) may be a molecular mechanism in the pathogenesis of obsessive-compulsive disorder (OCD). This study investigated the association between OXTR DNA methylation and the OCD status of a Korean population.
RESULTS: Quantitative leukocyte DNA methylation levels of three cytosine-phosphate-guanine (CpG) sites in the 5' untranslated region (UTR) of OXTR exon 2 and eight CpG sites …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Obsessive-compulsive disorder (OCD) is associated with high chronicity and treatment resistance, indicating the need for early therapy response markers enabling fast and personalized treatment adaptations. Although epigenetic mechanisms such as DNA methylation of the oxytocin receptor (OXTR) gene have previously been linked to OCD pathogenesis, epigenetic markers as predictors of treatment success have not yet been investigated in OCD.
OBJECTIVE: For the first time, this therapyepigenetic study aimed to investigate the role of OXTR methylation as a treatment response marker in O…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alpha-subunit of the interleukin-2 receptor (IL2RA) is involved in the regulation of T-cell function and has been related to autoimmune thyroid disease (AITD). Although the exact mechanisms are not fully understood, promoter methylation might account for differences in gene expression. The aim of this study was to investigate whether there are differences in the percentage of DNA methylation within the IL2RA gene promoter in young patients with AITD.
MATERIALS AND METHODS: In a cross-sectional design, the presence of DNA methylation in the IL2RA gene promoter was quantified, by re…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Decline in episodic memory performance usually causes the first clinical symptoms of Alzheimer's disease. At present, Alzheimer's disease can only be diagnosed at a very late stage when neurodegeneration and cognitive impairment is already irreversible. New early disease markers are needed for earlier and more efficient Alzheimer's disease intervention. To identify early disease markers, we implemented a genome-wide bisulphite sequencing method for the analysis of plasma cell-free DNA methylation profiles and compared differences associated with episodic memory performance in Finnish twin pair…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Infants born very preterm are more likely to experience neonatal morbidities compared to their term peers. Variations in DNA methylation (DNAm) associated with these morbidities may yield novel information about the processes impacted by these morbidities.
METHODS: This study included 532 infants born < 30 weeks gestation, participating in the Neonatal Neurobehavior and Outcomes in Very Preterm Infants study. We used a neonatal morbidity risk score, which was an additive index of the number of morbidities experienced during the NICU stay, including bronchopulmonary dysplasia (BPD)…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Reduced gene expression of PPARGC1A in subjects with insulin resistance (IR) has been reported. Insulin resistance occurs early on the course of Turner syndrome (TS). The main objective of this study was to evaluate the relationship between PPARGC1A promoter DNA methylation status in lymphocytes and insulin sensitivity and secretion in Ecuadorian females with TS.
METHODS: We examined a cohort of 34 Ecuadorian patients with TS along with a sex-, age- and BMI-matched reference group. All subjects received a standard 75 g oral glucose tolerance test. Insulin resistance and secretion …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Epigenetic variation of DNA methylation of the mu-opioid receptor gene (OPRM1) has been identified in the blood and saliva of individuals with opioid use disorder (OUD) and infants with neonatal opioid withdrawal syndrome (NOWS). It is unknown whether epigenetic variation in OPRM1 exists within placental tissue in women with OUD and whether it is associated with NOWS outcomes. In this pilot study, the authors aimed to 1) examine the association between placental OPRM1 DNA methylation levels and NOWS outcomes, and 2) compare OPRM1 methylation levels in opioid-exposed versus non-exposed co…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To compare the deoxyribonucleic acid (DNA) methylation signature of neuroendocrine tumors (NETs) by primary tumor site and inherited predisposition syndromes von Hippel-Lindau disease (VHL) and multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1).
METHODS: Genome-wide DNA methylation (835 424 CpGs) of 96 NET samples. Principal components analysis (PCA) and unsupervised hierarchical clustering analyses were used to determine DNA methylome signatures.
RESULTS: Hypomethylated CpGs were significantly more common in VHL-related versus sporadic and MEN1-related NETs (P < .001 for both comparisons).…
Сравнительное исследованиеСтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudoexfoliation syndrome (PXF) is the most common cause of secondary open angle glaucoma worldwide. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the gene Lysyl oxidase like 1 (LOXL1) are strongly associated with the development of pseudoexfoliation glaucoma (PXFG). However, these SNPs are also present in 50-80% of the general population, suggestive of other factors being involved in the pathogenesis of PXFG. In this study, we aimed to investigate the influence of epigenetic regulation, specifically DNA methylation, on LOXL1 expression in PXFG using human tenons fibroblasts (HTFs), aqueous humou…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The HIV-1 proviral genome harbors multiple CpG islands (CpGIs), both in the promoter and intragenic regions. DNA methylation in the promoter region has been shown to be heavily involved in HIV-1 latency regulation in cultured cells. However, its exact role in proviral transcriptional regulation in infected individuals is poorly understood or characterized. Moreover, methylation at intragenic CpGIs has never been studied in depth.
RESULTS: A large, well-characterized HIV-1 patient cohort (n = 72), consisting of 17 long-term non-progressors and 8 recent seroconverters (SRCV) without…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trichomonas vaginalis is a common sexually transmitted parasite that colonizes the human urogenital tract causing infections that range from asymptomatic to highly inflammatory. Recent works have highlighted the importance of histone modifications in the regulation of transcription and parasite pathogenesis. However, the nature of DNA methylation in the parasite remains unexplored. Using a combination of immunological techniques and ultrahigh-performance liquid chromatography (UHPLC), we analyzed the abundance of DNA methylation in strains with differential pathogenicity demonstrating that N6-…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.