Obesity and metabolic dysregulation are closely associated with chronic low-grade inflammation, in which interleukin-6 (IL-6) plays a key regulatory role. Genetic variation in the IL-6 gene may influence inflammatory responses and metabolic homeostasis. To identify single-nucleotide variants (SNVs) in the IL-6 gene in a cohort of Colombian high-performance athletes and to evaluate their potential functional and structural consequences using bioinformatic prediction and protein-modeling approaches. A descriptive observational study was conducted in a cohort of 23 high-performance Colombian athl
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aims to elucidate the molecular mechanisms by which the widely used organophosphate flame retardant and plasticizer, triphenyl phosphate (TPhP), disrupts bone metabolism, highlighting the potential impact of environmental chemicals on bone homeostasis.
METHODS: A combined approach of network toxicology and molecular docking was employed to investigate the molecular mechanisms underlying the effects of TPhP on bone metabolism. Potential targets associated with both TPhP and bone metabolism were identified through database searches in ChEMBL, STITCH, GeneCards, and OMIM. A
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lack of complete genomic data of Bothrops jararaca impedes molecular biology research focusing on biotechnological applications of venom gland components. Identification of full-length coding regions of genes is crucial for the correct molecular cloning design.
METHODS: RNA was extracted from the venom gland of one adult female specimen of Bothrops jararaca. Deep sequencing of the mRNA library was performed using Illumina NextSeq 500 platform. De novo assembly of B. jararaca transcriptome was done using Trinity. Annotation was performed using Blast2GO. All predicted proteins after
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Angiotensin-converting enzyme (ACE) and dipeptidyl peptidase-IV (DPP-IV) play critical roles in the development of hypertension and type 2 diabetes, respectively. Inhibiting ACE and DPP-IV activity using peptides has become part of new therapeutic strategies for supporting medicinal treatment of both diseases. In this study, oilseed proteins, including soybean, flaxseed, rapeseed, sunflower and sesame are evaluated for the possibility of generating ACE and DPP-IV inhibitory peptides using different integrated bioinformatic approaches (UniProt knowledgebase, ProtParam, BLAST, BIOPEP, PeptideRan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In spite of the decrease in breast cancer (BC) death rates, it has remained a significant public health concern. Dysregulation of the Hippo pathway contributes to breast cancer development and progression by enhancing cancerous cell proliferation, survival, invasion, and migration. Investigating the connection between specific lncRNAs (SNHG15, HCP5, and LINC01433) and YAP and WWTR1, and the impact of these lncRNAs on the expression of YAP and WWTR1 proteins in the Hippo pathway, may offer valuable understanding for BC diagnosis and treatment. Forty BC tissue samples were acquired from the Tumo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effects of early-life iron deficiency anemia (IDA) extend past the blood and include both short- and long-term adverse effects on many tissues including the brain. Prior to IDA, iron deficiency (ID) can cause similar tissue effects, but a sensitive biomarker of iron-dependent brain health is lacking. To determine serum and CSF biomarkers of ID-induced metabolic dysfunction we performed proteomic and metabolomic analysis of serum and CSF at 4- and 6- months from a nonhuman primate model of infantile IDA. LC/MS/MS analyses identified a total of 227 metabolites and 205 proteins in serum. In C
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Burkitt's lymphoma (BL) is a highly aggressive malignant lymphoma, its molecular biological mechanism has not been fully investigated. The construction of protein-protein interaction (PPI) networks and the identification of complexes through a cluster analysis are important research directions in the post-genome era. However, different cluster analysis algorithms have their own characteristics, and a single analysis has some limitations. In this study, we obtained the target and pathway information of BL using different clustering analyses.
MATERIAL AND METHODS: First, we obtained
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & OBJECTIVES: Limited studies have been reported on Japanese encephalitis (JE) with reference to microarray data analysis. The present study involved an in silico approach for identification and characterization of differentially expressed genes in human microglial cell (CHME3) samples, infected with P20778 strain of Japanese encephalitis virus (JEV).
METHODS: Gene expression data (GSE57330) belonging to mRNA expression profile of CHME3 cells infected with JEV, was downloaded from the gene expression omnibus (GEO) database, processed and normalized by robust multichip averaging (RM
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction Acne vulgaris is a common skin problem caused by inflammation of the sebaceous glands and hair follicles as a result of hormonal fluctuations, bacteria, and overproduction of oil. The plant Peltophorum pterocarpum (P. pterocarpum) has been investigated for possible medical uses. Its anti-inflammatory, antibacterial, and antioxidant qualities are well recognised, and they may be applied to treat several diseases. This study investigates the plant's phytochemicals for their effectiveness in treating acne. Methods The Indian Medicinal Plants, Phytochemistry and Therapeutics (IMPPAT)
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic morphine usage induces lasting molecular and microcellular adaptations in distinct brain areas, resulting in addiction-related behavioural abnormalities, drug-seeking, and relapse. Nonetheless, the mechanisms of action of the genes responsible for morphine addiction have not been exhaustively studied.
METHODS: We obtained morphine addiction-related datasets from the Gene Expression Omnibus (GEO) database and screened for Differentially Expressed Genes (DEGs). Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA) functional modularity constructs were analyzed for genes assoc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОтозванная публикацияПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Postmenopausal osteoporosis (PO) is a common disease in females >50 years of age worldwide and is becoming an increasing burden to society. The present study aimed to assess the molecular mechanism of PO using bioinformatic methods. The gene expression data from patients with PO and normal controls were downloaded from the ArrayExpress database provided by European Bioinformatics Institute. Following the screening of the differentially expressed genes (DEGs) using the Limma package in R language, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathways enrichment analysis was performed using the Datab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteins involved in synaptic transmission in normal hearing, acoustic stimulation, and tinnitus were identified using protein-protein interaction (PPI) networks. The gene list for tinnitus was compiled from the GeneCards database using the keywords "synaptic transmission" AND "inferior colliculus" AND "tinnitus" (Tin). For comparison, two gene lists were built using the keywords "auditory perception" (AP) and "acoustic stimulation" (AS). The STRING and the Cytoscape data analyzer were used to identify the top two high-degree proteins (HDPs) and the corresponding high-score interaction protein
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gene nomenclature contains current official symbols and various numbers of synonyms, which pose a challenge to integrating genomic data and increase the probability that different genes share the same symbol. Therefore, we retrieved identifiers assigned to all protein-coding genes in human, mouse, rat and pig genomes that are available in the Ensembl genome browser (release 113) to assess the number of genes, compare species and identify ambiguous symbols.
RESULTS: Our analysis revealed that the total number of symbols, both official symbols and synonyms, used to identify protein-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gouty arthritis (GA) is a common metabolic rheumatological disease. Si-Miao decoction has therapeutic effects on GA. In our study, we investigated the mechanism of Si-Miao decoction against GA using network pharmacology and molecular docking analytical methods. The Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database was used as the basis for screening the main targets and agents of the Si-Miao decoction, and the Genecards, OMIM, and Drugbank databases were used to screen GA-related targets. They were analyzed using Venn with the drug targets to obtain the intersection targets. We used C
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
(1) Background: A large and diverse microbial population exists in the human intestinal tract, which supports gut homeostasis and the health of the host. Short-chain fatty acid (SCFA)-secreting microbes also generate several metabolites with favorable regulatory effects on various malignancies and immunological inflammations. The involvement of intestinal SCFAs in kidney diseases, such as various kidney malignancies and inflammations, has emerged as a fascinating area of study in recent years. However, the mechanisms of SCFAs and other metabolites produced by SCFA-producing bacteria against ki
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Interaction between cancer cells with microenvironment is essential for cancer progression, therapeutic resistance and prognosis. Chemokine CXCL1 shows variable roles in the development of cancers. DACH1 has been considered as a tumor suppressor and represses the expressions of several chemokines. The relationship between CXCL1 and DACH1 in non-small cell lung cancer (SCLC) deserves further investigation. Methods: Immunohistochemistry staining was performed on tumor tissue microarrays from lung cancer patients to detect CXCL1 protein. The CXCL1 concentration in the serum of adenoca
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurately identifying drug off-targets is essential for reducing toxicity and improving the success rate of pharmaceutical discovery pipelines. However, current deep learning approaches often struggle to fuse chemical structure, protein biology, and multi-target context. Here, we introduce HDPC-LGT (Hybrid Dual-Prompt Cross-Attention Ligand-Protein Graph Transformer), a framework designed to predict ligand binding across sixteen human translation-related proteins clinically associated with antibiotic toxicity. HDPC-LGT combines graph-based chemical reasoning with protein language model embedd
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: SARS-CoV-2 is a positive-sense single-stranded RNA virus that has a propensity for infecting epithelial cells and the respiratory system. The two important proteins, structural and nonstructural proteins, make the architecture of this virus. Aim: This research aimed at studying significant mutations in spike protein of SARS-CoV-2 variants of concern (VoCs) and finding shared mutations among omicron and other four variants (alpha, beta, gamma, and delta). The purpose of this study was to draw structural comparisons between wild type and mutant proteins, followed by identifying poten
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: There are many challenges related to the treatment of coronary atherosclerotic heart disease (CAD). Studies have confirmed that Epimedium extract inhibits myocardial injury induced by myocardial ischaemia, but the mechanism of action remains unclear. This study aimed at analysed the effective components and mechanisms of Epimedium in treating CAD based on network pharmacology and molecular docking studies and to verify the mechanism in vitro.
MATERIALS AND METHODS: The TCMSP and UniProt databases were used to filter for the active components and drug targets of Epimedium. The GeneC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
No standardized computational pipeline exists for systematically prioritizing microbial metabolite-associated host genes and protein-ligand complexes from publicly available chemical, genomic, and structural databases. This article describes an eight-stage workflow that accepts a user-defined set of gut microbiota-derived metabolites and produces a ranked shortlist of candidate metabolite-associated host genes, enriched biological pathways, and structurally prioritized protein-ligand complexes for experimental follow-up. The pipeline integrates (i) chemoinformatic metabolite profiling; (ii) mu
СтатьяVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.