The cross talk between gametes, embryos, and female reproductive tract plays a crucial role in fine tuning of different reproductive events as well as influencing the epigenetic profile of offspring and their health in adulthood. Here, we describe some background to the recent investigations leading to the discovery of this cross talk. We will also point to important requirements for understanding the maternal communication with gametes and embryos. Finally, we mention two probable hypotheses regarding how gametes and embryos are recognized by the female reproductive tract. It is clear that un
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We performed a pilot study in which Illumina (ILMN) and nanopore (ONT) whole genome sequencing (WGS) was generated for samples obtained from a 37-year-old patient with locally advanced rectal cancer who did not respond to neoadjuvant chemoradiotherapy (nCRT). Pre-treatment and post-treatment tumour biopsy, adjacent normal tissue, and matched pre-treatment blood samples were sequenced to identify somatic alterations. We used DNA methylation from ONT WGS to detect changes in the tumour epigenomes compared to adjacent normal tissue. We employed established pipelines for the identification of soma
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic regulation, including DNA methylation, histone modifications, non-coding RNAs, and higher-order chromatin remodeling, plays a cen … te biomarkers. Future priorities include prospective multi-institutional validation, integration of epigenomics with other molecular layers in multidimensional classifiers, and the application of spatial and single cell approaches to resolve intra-tumoral heterogeneity. Ultimately, epigenetic research has redefined our understanding of NEN pathogenesis and pr …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel disease (IBD), including Crohn's disease and ulcerative colitis, is increasingly recognized not merely as an immune-mediated disorder, but as a systems-level condition arising from dynamic interactions among host genetics, environmental exposures, the gut microbiome, and epigenetic regulation. While genetic susceptibility confers risk, accumulating evidence indicates that epigenetic mechanisms act as molecular integrators that translate environmental and microbial signals into sustained transcriptional programs governing immune tolerance, epithelial integrity and tissue repa
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Functional DNA methylation abnormalities are a hallmark of human cancers and may be a promising biomarker for their early diagnosis. Moreover, the largest methylation differences can improve the sensitivity of noninvasive diagnoses of solid tumors. We combined whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) and mRNA-seq data from 33 paired hepatocellular carcinoma (HCC) and adjacent tissues to identify methylation markers that could be used for noninvasive diagnosis in blood samples. Methylation markers were selected according to the following criteria: differentially methylated regions (DMR) located
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cold stress is a significant challenge to cotton (Gossypium hirsutum L.) production during seed emergence and early seedling establishment, as cotton is native to tropical and subtropical environments. Low temperatures during these sensitive stages impair photosynthetic efficiency, damage cellular structures, and reduce yield. Although cotton responses to cold stress have been extensively investigated at physiological, molecular, and transcriptional levels, increasing evidence suggests that transient gene expression changes alone are insufficient to explain sustained stress performance. This r
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-Cas9 technology has rapidly advanced as a transformative genome-editing platform, facilitating precise genetic modifications and expanding therapeutic opportunities across various diseases. This review explores recent developments and clinical translations of CRISPR applications in oncology, genetic and neurological disorders, infectious diseases, immunotherapy, diagnostics, and epigenome editing. CRISPR has notably progressed in oncology, where it enables the identification of novel cancer drivers, elucidation of resistance mechanisms, and improvement of immunotherapies through enginee
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA methylation (DNAm) can regulate gene expression, and its genome-wide patterns (epigenetic scores or EpiScores) can act as biomarkers for complex traits. The relative stability of methylation profiles may enable better assessment of chronic exposures compared to single time-point protein measures. We present the first large-scale epigenetic study of the highly-abundant serum proteome measured via ultra-high throughput mass spectrometry in 14,671 samples from the Generation Scotland cohort. We further demonstrate the first large-scale comparison of protein EpiScores and their res
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ovine pulmonary adenocarcinoma (OPA) is an infectious neoplastic disease caused by jaagsiekte sheep retrovirus (JSRV), leading to significant economic losses due to the absence of effective treatments. Based on the discovery that endogenous JSRV LTR is highly methylated in healthy tissues while exogenous JSRV LTR is demethylated in OPA lung tissues, this study explored targeted DNA methylation as an epigenetic therapeutic strategy. We constructed dCas9-DNMT3A and dCas9-KRAB epigenome editing systems targeting key CpG hotspots in the U3 region of exogenous JSRV LTR and established an exJSRV-LTR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Past experiences of maltreatment and life adversity induce DNA methylation changes in adults, but less is known about their impact on mothers' maladaptive neglectful parenting and its negative effects. We performed an epigenome-wide association study to investigate the role of DNA methylation levels in mothers with neglectful care, who were exposed to childhood maltreatment and neglect, and their current negative effects. Saliva DNA methylation was determined with the Illumina Human Methylation EPIC BeadChip v1. The individual epigenome was the input to a machine learning algorithm
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genome-wide association studies (GWAS) have identified 30 risk loci for primary sclerosing cholangitis (PSC). Variants within these loci are found predominantly in noncoding regions of DNA making their mechanisms of conferring risk hard to define. Epigenomic studies have shown noncoding variants broadly impact regulatory element activity. The possible association of noncoding PSC variants with regulatory element activity has not been studied. We aimed to (1) determine if the noncoding risk variants in PSC impact regulatory element function and (2) if so, assess the role these regul
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Traditional developmental toxicity testing practice examines fetal apical endpoints to identify a point of departure (POD) for risk assessment. A potential new testing paradigm involves deriving a POD from a comprehensive analysis of molecular-level change. Here, the rat ketoconazole endocrine-mediated developmental toxicity model was used to test the hypothesis that maternal epigenomic (miRNA) and transcriptomic (mRNA) PODs are similar to fetal apical endpoint PODs. Sprague-Dawley rats were exposed from gestation day (GD) 6-21 to 0, 0.063, 0.2, 0.63, 2, 6.3, 20, or 40 mg/kg/day ketoconazole.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The efficiency of somatic cell cloning in mammals remains disappointingly low. Incomplete and aberrant reprogramming of epigenetic memory of somatic cell nuclei in preimplantation nuclear- transferred (NT) embryos is one of the most important factors that limit the cloning effectiveness. The extent of epigenetic genome-wide alterations, involving histone or DNA methylation and histone deacetylation, that are mediated by histone-lysine methyltransferases (HMTs) or DNA methyltransferases (DNMTs) and histone deacetylases (HDACs) can be modulated/reversed via exogenous inhibitors of these enzymes
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Panic disorder (PD) affects about four million Europeans, with women affected twice as likely as men, causing substantial suffering and high economic costs. The etiopathogenesis of PD remains largely unknown, but both genetic and environmental factors contribute to risk. An epigenome-wide association study (EWAS) was conducted to compare medication-free PD patients (n = 89) with healthy controls (n = 76) stratified by gender. Replication was sought in an independent sample (131 cases, 169 controls) and functional analyses were conducted in a third sample (N = 71). DNA methylation was assessed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Follicular lymphoma (FL) is a form of non-Hodgkin's lymphoma (NHL) that arises from germinal center (GC) B-cells. Despite the significant advances in immunotherapy, FL is still not curable. Beyond transcriptional profiling and genomics datasets, there currently is no epigenome-scale dataset or integrative biology approach that can adequately model this disease and therefore identify novel mechanisms and targets for successful prevention and treatment of FL.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: We performed methylation-enriched genome-wide bisulfite sequencing of FL cells and normal CD1
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sorghum (Sorghum bicolor L.), the fifth-most important cereal crop globally, serves as a cornerstone crop for food security, forage producti … n. In recent years, rapid advances in multi-omics technologies-including genomics, transcriptomics, epigenomics, single-cell omics, and microbiomics-have propelled sorghum research from single-gene mapping to systems-level dissection of regulatory networks, providing a novel paradigm for elucidating the molecular basis of agronomic traits across all molecular …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer of unknown primary (CUP) is a heterogeneous group of rare metastatic malignancies that lack an identifiable primary site. Molecular p … anging from single‑gene assays to integrated multi‑omics (genomics, transcriptomics, proteomics and epigenomics) surveys enhance TOO determination, detect actionable DNA alterations and therapy selection. TOO-directed therapy has shown mixed survival benefit; however, integrating molecular data with clinical and pathological evaluation via multidisciplinary t …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Advances in omics technologies, such as epigenomics and metabolomics, provide novel insights into the biological mechanisms underlying Alzheimer's disease (AD). However, little is known how different omics layers interact and jointly relate to AD neuropathology.
METHODS: We performed a comprehensive single- and multi-omics analysis integrating genome-wide DNA methylation and high-resolution metabolomics data from 157 frontal cortex samples. We developed novel single and multi-omics profile scores (PS) for AD pathology, using a combination of machine learning, regression, and pathw…
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PRC2/EZH2 inhibitors (PRC2i/EZH2i) are promising for the treatment of advanced cancers including metastatic prostate cancer. Here, we show t … of tumor growth. In contrast to the current perception, our comprehensive, integrated genomics and epigenomics profiling of patient-derived xenografts (PDXs) and clinical tumors revealed that PRC2/EZH2 suppressed CSP genes by maintaining chromatin bivalency. Hyperactive Wnt/β-catenin signaling and inhibitors of polycomb-repressive complex 2/enhancer of zeste …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flowering time is a critical developmental process that directly influences reproductive success, environmental adaptation, and agricultural … genes, particularly FLC, remain insufficiently characterized in Brassica species. Transcriptomics, epigenomics, proteomics, single-cell sequencing, and CRISPR/Cas genome editing further reveal that WRKY proteins participate in regulatory networks associated with photoperiodic signalling, vernalization, gibberellin pathways, stress-responsive flowering, and h …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.