A quick, reliable detection system is necessary to deal with bioterrorism. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is a DNA amplification method that can amplify specific DNA fragments in isothermal conditions. We developed a new highly mobile and practical LAMP anthrax detection system that uses a disposable pocket warmer without the need for electricity (pocket-warmer LAMP). In our tests, the detection limit of the pocket-warmer LAMP was 1,000 copies of Bacillus anthracis pag and capB gene fragments per tube. The pocket-warmer LAMP also detected B. anthracis genes from DNA extracted fr
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rearrangements of the mitochondrial DNA (mtDNA) are a hallmark of senescence in wild-type strains of the ascomycete P. anserina. These rearrangements include the systematic amplification of the first intron (p1-intron) of the cytochrome oxidase subunit-I gene (CoI) as a circular DNA molecule (p1DNA). In addition, deletions and amplifications of other regions of the mtDNA occur. The molecular basis of the underlying processes is not understood in detail. A comparative analysis of the wild-type strain and of the long-lived mutant grisea, affected in the uptake of copper, revealed that mtDNA inst
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Double minutes (dmins), a form of extrachromosomal DNA (ecDNA), represent a rare cytogenomic event in myeloid neoplasms and are most commonly associated with amplification of oncogenes such as MYC or KMT2A. Dmins derived from the 11q24 region that exclude KMT2A are exceedingly uncommon, and their pathogenic significance remains poorly understood. We report a 74-year-old female initially diagnosed with myelodysplastic syndrome (MDS) with isolated del(5) (q13q33) and mutations in TP53 and SF3B1. After eight years and treatment with lenalidomide with excellent clinical response, she developed pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ocular albinism type 1 (OA1) is an X-linked recessive disorder characterized by a major impairment of visual acuity, nystagmus, strabismus, photophobia and retinal hypopigmentation. From the analysis of patients carrying deletions and translocations involving the distal short arm of the X chromosome (Xp22.3) we have identified a region of approximately 110 kb in which the OA1 gene must lie. We have extensively searched for genes in this region using a variety of techniques which included exon amplification, cDNA selection and direct hybridization of cosmid inserts to cDNA libraries. Putative e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epidermal growth factor receptor (EGFR) tyrosine kinase inhibitors (TKIs) are standard treatments for non-small cell lung cancer (NSCLC) patients with EGFR mutations, but resistance inevitably develops. While resistance mechanisms in classical mutations are well studied, those in nonclassical mutations remain unclear. As a widely used EGFR-TKI, afatinib's resistance mechanisms in nonclassical mutations warrant further investigation to improve clinical outcomes. This study included NSCLC patients from multiple hospitals with nonclassical mutations who were finally resistant to afatinib. Baselin
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pseudomonas aeruginosa is one of the most common pathogens causing severe complications of lower respiratory tract infections. To rapidly and visually detect P. aeruginosa in sputum samples, we have developed a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay targeting the oprM gene, a key component of the outer-membrane MexAB-OprM and MexXY-OprM efflux pumps.
METHODS AND RESULTS: To evaluate the LAMP method, an artificial sputum sample spiked with P. aeruginosa was used; it was more efficient than PCR and showed no interference under the test conditions. The LAMP assay was opt
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lipases are industrially important enzymes having vast applications in various fields. Cloning and expression of lipase enzyme-encoding genes in suitable host lead to their widespread use in different fields. The present study represents the first attempt towards the expression of the synthetic lipase gene in Pseudomonas aeruginosa. An alkalophilic lipase gene (GenBank accession number: NP_388152) from Bacillus subtilis was synthetically designed and introduced in the pJN105 vector and subsequently cloned in Pseudomonas aeruginosa SDK-6. Agarose gel electrophoresis confirmed the transformation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The aim of this study was to evaluate the diagnostic value of immunoglobulin (Ig) clonal gene rearrangements for mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphoma of the parotid gland.
STUDY DESIGN: We collected and retrospectively analyzed clinical data of 21 patients referred to our institution between 2009 and 2017. Eight patients had been primarily diagnosed MALT lymphoma of the parotid gland and the remaining patients with lymphoepithelial lesion. Paraffin-embedded tissues were chosen for extracting genomic DNA and multiplex primer polymerase chain reaction amplification by u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cronobacter spp. has caused life-threatening neonatal infections mainly resulted from consumption of contaminated powdered infant formula. A total of 102 vegetable samples from retail markets were evaluated for the presence of Cronobacter spp. Thirty-five presumptive Cronobacter isolates were isolated and identified using API 20E and 16S rDNA sequencing analyses. All isolates and type strains were characterized using enterobacterial repetitive intergenic consensus sequence PCR (ERIC-PCR), and genetic profiles of cluster analysis from this molecular typing test clearly showed that there were di
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cholecystokinin (CCK) is a multi-functional brain-gut peptide in fish and mammals. To investigate the role of CCK in appetite regulation in fish, a 770-bp full-length cDNA sequence of CCK gene was obtained by RT-PCR and rapid amplification of cDNA ends methods in grass carp Ctenopharyngodon idellus. Homology analysis showed that the CCK cDNA sequence of grass carp had the highest similarity (90 %) to that of goldfish Carassius auratus and a higher similarity (>70 %) to those of other teleosts than to mammals. The PCR amplification using genomic DNA identified that the CCK gene of grass carp wa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ABL1 amplification, due to a cryptic episomal translocation NUP214/ABL1, is a novel finding in T-cell acute lymphoblastic leukemia (ALL). Here we report on the incidence and clinical features of this genetic defect in a series of 30 consecutive adult T-cell ALL patients. Multiple copies of the ABL1 gene were detected in two patients (6.6%), one with the karyotype 46,XY,t(1;3)(p36;p21),del(6)(q23)/46,XY and the other without analyzable metaphases. Metaphase/interphase fluorescence in situ hybridization (FISH) detected multiple uncountable signals corresponding to ABL1 in mitotic cells and nucle
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Non-small cell lung cancer with leptomeningeal metastasis (NSCLC-LM) is emerging as a new management challenge for oncologists and is associated with poor prognosis. This study aimed to investigate the molecular characteristics and prognostic factors of NSCLC-LM.
METHODS: This retrospective study included 97 patients with NSCLC-LM between January 2015 and October 2021. Progression-free survival (PFS) and overall survival (OS) were evaluated. Gene mutations were detected by next-generation sequencing (NGS).
RESULTS: The median PFS and OS were 8.4 (95 % confidence interval [CI]: 4.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To determine vacA dominant genotypes of Helicobacter pylori in patients with peptic ulcer (PU) or chronic gastritis (CG).
METHODS: H.pylori strains were isolated from mucosa samples of gastric antrum and corpus of patients suffering from PU (n=29) or CG (n=34), 126 strains of H.pylori were selected for PCR to detect s and m regions in vacA gene of the isolates. Parts of the amplification products were sequenced after T A cloning. The correlation between infection or coinfection with different vacA genotypes of H.pylori and different gastroduodenal diseases was further analyzed.
RE
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three targeted therapies are currently available for spinal muscular atrophy (SMA), which have dramatically changed the natural history of this severe and potentially fatal disease. More than 95% of SMA cases have a homozygous deletion of exon 7 of the SMN1 gene. Disease expression mainly depends on the copy number of SMN2, a hypomorphic copy of SMN1. Many countries in the world have implemented newborn screening (NBS) programs for early identification and treatment of children with SMA. We herein present the first two-year results of the SMA NBS program in Campania, a region with one of the h
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Erlotinib is a reversible tyrosine kinase inhibitor of epidermal growth factor receptor (TKI EGFR). In Poland, as of July 2012, it is used i … h erlotinib as the second- or third-line therapy. Molecular tests (examination of EGFR mutation and gene amplification) were carried out retrospectively. Objective response rate, overall survival (OS) and progression-free survival (PFS) were calculated. Effects of clinical and molecular factors including the presence of EGFR mutations, EGFR gene amplification, patie …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate the sensitivity and specificity of the Allplex™ Entero-DR, a quantitative PCR-based method, for the detection of β-lactamase-encoding genes and vancomycin-resistance determinants in 156 previously characterized Gram-negative bacilli and Enterococcus spp. from bacterial cultures.
RESULT: The method had 100% sensitivity and between 92 and 100% of specificity for identifying blaKPC, blaVIM, blaIMP, blaNDM, blaOXA-48-like, blaCTX-M and vanA. In nine isolates, unspecific amplifications were detected. The Ct of these false positives was above 33. The Ct of the correctly ident
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To reveal the relative contribution of the recombination activating gene (RAG)1/2 nuclease to lymphomagenesis, we conducted a genome-wide analysis of T cell lymphomas from p53-deficient mice expressing or lacking RAG2. We found that while p53-/- lymphoblastic T cells harbor primarily ectopic DNA deletions, Rag2-/-p53-/- T cell lymphomas display complex genomic rearrangements associated with amplification of the chromosomal location 9qA4-5.3. We show that this amplicon is generated by breakage-fusion-bridge during mitosis and arises distinctly in T cell lymphomas originating from an early proge
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystic echinococcosis is a zoonotic disease with a cosmopolital distribution. It is caused by the larval stages (metacestodes) of the parasite Echinococcus granulosus which infects different animal species. In this report, we present a case of E. granulosus infection in a mule and molecular characterization of the cyst. For this purpose parasite material was collected from the liver of a necropsied mule. DNA was isolated and PCR amplification of mitochondrial 12S rRNA as well as partial sequencing of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (mt-CO1) genes were performed. Six unilocular cys
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myotonic dystrophy type 1 is an autosomal dominant neuromuscular disorder that is caused by the expansion of a CTG trinucleotide repeat in the DMPK gene. The confirmation of a clinical diagnosis of DM-1 usually involves PCR amplification of the CTG repeat-containing region and subsequent sizing of the amplification products in order to deduce the number of CTG repeats. In the case of repeat hyperexpansions, Southern blotting is also used; however, the latter has largely been superseded by triplet repeat-primed PCR (TP-PCR), which does not yield a CTG repeat number but nevertheless provides a m
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fourteen Histoplasma capsulatum isolates recovered from infected bats captured in Mexican caves and two human H. capsulatum reference strains were analyzed using random amplification of polymorphic DNA PCR-based and partial DNA sequences of four genes. Cluster analysis of random amplification of polymorphic DNA-patterns revealed differences for two H. capsulatum isolates of one migratory bat Tadarida brasiliensis. Three groups were identified by distance and maximum-parsimony analyses of arf, H-anti, ole, and tub1 H. capsulatum genes. Group I included most isolates from infected bats and one c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования