Motility is an essential colonization factor for the human gastric pathogen Helicobacter pylori. The H. pylori genome encodes most known flagellar proteins, although a number of key transcription regulators, chaperones, and structural proteins have not yet been identified. Using recently published yeast two-hybrid data we identified HP0958 as a potential motility-associated protein due to its strong interactions with RpoN (sigma(54)) and FliH, a flagellar ATPase regulator. HP0958 exhibits no sequence similarity to any published flagellar genes but contains a carboxy-terminal zinc finger domain
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The capacity of the Brucella spp. to establish and maintain long-term residence in the phagosomal compartment of host macrophages is critical to their ability to produce chronic infections in their mammalian hosts. The RNA binding protein host factor I (HF-I) encoded by the hfq gene is required for the efficient translation of the stationary-phase sigma factor RpoS in many bacteria, and a Brucella abortus hfq mutant displays a phenotype in vitro, which suggests that it has a generalized defect in stationary-phase physiology. The inability of the B. abortus hfq mutant to survive and replicate i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The enzymatic reduction of molecular nitrogen to ammonia requires high amounts of energy, and the presence of oxygen causes the catalyzing nitrogenase complex to be irreversible inactivated. Thus nitrogen-fixing microorganisms tightly control both the synthesis and activity of nitrogenase to avoid the unnecessary consumption of energy. In the free-living diazotrophs Klebsiella pneumoniae and Azotobacter vinelandii, products of the nitrogen fixation nifLA operon regulate transcription of the other nifoperons. NifA activates transcription of nif genes by the alternative form of RNA-polymerase, s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 4 kb fragment of chromosomal DNA was cloned from a clinical strain of methicillin-resistant Staphylococcus aureus. It comprises part of a section of the chromosome that was lost when the strain was cured of resistance to methicillin and to other antimicrobial agents. The fragment mediates an increased level of methicillin resistance when inserted into a shuttle vector and transformed back into the sensitive strain generated when the original DNA was deleted.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptional fusions to the lacZ gene from Escherichia coli can be used to study gene expression. Here, we describe protocols for using a miniTn5 derivative to generate random insertions of the lacZY operon in the genome of Salmonella enterica serovar Typhimurium, to analyze the expression of transcriptional lac fusions under different conditions, and to identify the genomic location of some fusions.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biofilms are crucial for enhancing microbial productivity in industrial applications, yet the mechanisms underlying their stress resistance and formation in functional microorganisms remain inadequately explored. Tetragenococcus halophilus, a halophilic lactic acid bacterium, is widely utilized in traditional fermentation industries; however, research has focused on its planktonic state. To address this gap, this study investigated the molecular mechanisms of biofilm formation in T. halophilus JY1 under low-salt (0.2 M, LS) and high-salt (3 M, HS) stress conditions. Physiological analyses reve
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mixed-linkage β-glucans (MLGs) are emerging as promising biopolymers with significant biotechnological potential due to their unique structural and rheological properties. In rhizobia, MLG biosynthesis is controlled by the second messenger cyclic di-GMP (c-di-GMP) and mediated by the bicistronic operon bgsBA. However, the full composition of the biosynthetic machinery and strategies for enhanced production remain incompletely understood. In this study, we demonstrate that the outer membrane protein TolC is essential for MLG production in Sinorhizobium meliloti. Genetic disruption of tolC aboli
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mucA gene is a major genetic determinant of mucoid conversion in Pseudomonas aeruginosa isolated from patients with cystic fibrosis (CF) and represents a frequent hotspot for adaptive mutations. Although the role of the mucA gene in pathogen adaptation and virulence has been progressively elucidated, a comprehensive and systematic synthesis of its emerging functions and regulatory networks remains lacking. Here, we summarize current advances in the study of mucA, including its evolutionary origin, structural and functional characteristics, regulatory role in alginate biosynthesis, its muta
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In Salmonella Typhimurium (S. Typhimurium), yiiD encodes a two-domain protein, with one domain having bona fide malonyl-ACP decarboxylase activity, and the other showing sequence similarity to Gcn5-type acetyltransferases (GNATs). Recent work on this enzyme was motivated by the essentiality of its decarboxylase domain to initiation of fatty acid biosynthesis in a strain devoid of β-ketoacyl-[acyl-carrier-protein, ACP] synthase III (FabH) activity. A function for the putative GNAT domain has not been established. We find that a ∆yiiD strain has an unconventional, slow-growth lag phenotype durin
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bacterium Zymomonas mobilis is widely studied for its potential as an industrial biofuel producer. Anoxic fermentation by Z. mobilis in lignocellulosic hydrolysate can generate bioethanol from renewable plant biomass. In this study, we deleted a gene from the Z. mobilis genome encoding a homolog of OxyR, a transcription factor that activates an oxidative stress response in bacteria to reduce reactive oxygen species (ROS). Deletion of this transcription factor inhibited growth of Z. mobilis in oxic, but not anoxic, conditions in laboratory media. A ROS probe revealed that the oxyR response
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotic-resistant bacteria are one of the greatest challenges in modern medicine, as multidrug-resistant strains continue to outpace traditional antibiotic development. Unlike conventional antibiotics that promote resistance through selective pressure, quorum sensing-targeted therapies disrupt bacterial communication systems that regulate, among other traits, virulence, biofilm formation, and resistance acquirement through competence without directly killing the bacteria. In this study we examined quorum sensing modulation in Streptococcus mitis, a commensal oral bacterium that has recently
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Evolutionary constraints governing flagellar number in bacterial pathogens remain poorly understood. While related Pseudomonas species are hyperflagellated, Pseudomonas aeruginosa maintains strict monoflagellation through the FleQ-FleN regulatory circuit. Here, we demonstrate that FleN dosage is essential for maintaining monoflagellation and fitness. Confirming earlier reports, wild-type P. aeruginosa displayed unipolar monoflagellation, whereas ∆fleN mutants developed multiple flagella, frequently more than four, in unipolar or bipolar arrangements. These hyperflagellated cells showed marked
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The opportunistic pathogen Staphylococcus aureus colonizes a broad spectrum of different hosts and intra-host niches. Recently, it has been demonstrated that mouse-adapted S. aureus strains are better suited to investigate S. aureus infections in the mouse model than human-adapted strains. One of the most studied mouse-adapted strains is JSNZ (CC88-MSSA). Under control conditions at 37 °C, JSNZ secretes very large amounts of the prophage-encoded serine protease Jep (JSNZ extracellular protease). Given S. aureus' ability to colonize a broad variety of host niches, we investigated Jep expression
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa is a ubiquitous, Gram-negative bacterium that forms biofilms and is responsible for antibiotic-resistant hospital-acquired infections in humans. The P. aeruginosa BqsRS two-component system regulates biofilm formation and dispersal by sensing extracytoplasmic Fe2+, but the mechanistic details of this process are poorly understood. In this work, we report the crystal and solution structures of the PaBqsR response regulator receiver domain, comprising a (βα)5 response regulator assembly, and the DNA-binding domain, comprising a helix-turn-helix motif. Consistent with its c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: PlrSR, a member of the NtrYX family of two-component regulatory systems (TCSs), is required for the classical bordetellae, including the causative agent of whooping cough, Bordetella pertussis, to persist in the lower respiratory tract. The plrSR genes are in the middle of a six-gene cluster whose regulation and roles during infection were unknown. rsmB and plrP are often found 5' to plrSR homologs in β- and γ-proteobacteria, while trkAH is often found 3' to plrSR homologs in ⍺-proteobacteria. We investigated these genes to determine if they have a functional link to plrSR. We foun
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
External resistance is a key operational variable in microbial fuel cells (MFCs), yet its mechanistic influence on pure-culture electrogenic biofilms remains incompletely understood. Here, we investigated how fixed external resistances (10, 100, 500, and 1000 Ω) applied during start-up modulate electrochemical performance, architecture, membrane-integrity-associated viability, and extracellular electron transfer (EET)-related gene expression in Shewanella oneidensis MR-1 anodic biofilms. After 10 days in dual-chamber MFCs, polarization analysis, cyclic voltammetry, confocal microscopy with LIV
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen that uses several mechanisms to survive in the iron-limiting host environment. The innate immune protein calprotectin (CP) sequesters ferrous iron [Fe(II)], among other divalent transition metal ions, to limit its availability to pathogens. CP levels are increased in individuals with cystic fibrosis (CF), a hereditary disease that leads to chronic pulmonary infection by P. aeruginosa. We previously showed that aerobic CP treatment of P. aeruginosa induces a multi-metal starvation response that alters expression of several virulence properties
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa (Pa) uses quorum sensing (QS), a cell-cell communication system that enables it to sense cell density and alter gene expression. Pa has three complete QS circuits controlled by the regulators LasR, RhlR, and PqsR, which together activate the transcription of hundreds of genes. In the well-studied strain PAO1, QS is organized hierarchically, with PqsR and RhlR activity dependent on LasR. This hierarchy depends on the transcription factor MexT; deletion of mexT allows for RhlR activity in the absence of LasR. We aimed to identify how MexT modulates Pa QS architecture. We c
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Clostridium acetobutylicum is an important solventogenic bacterium capable of acetone-butanol-ethanol fermentation by utilizing a variety of carbon sources. It employs the transport systems of the phosphoenolpyruvate:sugar phosphotransferase systems (PTSs) to assimilate various saccharides. Here, we investigated a β-glucoside PTS (bglT) encoded by the bgl operon (bglGTH) in C. acetobutylicum, which showed significant expression in response to cellobiose and sucrose. Interestingly, bglT is not essential for the transport of these sugars, as C. acetobutylicum possesses dedicated PTSs
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ethylene glycol is a monomer of the plastic polyethylene terephthalate (PET) and an environmental pollutant of increasing concern. Although it is generally accepted that bacteria use ethylene glycol as growth substrate, not all involved enzymes are well understood. Here, we show that Paracoccus denitrificans assimilates ethylene glycol solely via NAD-dependent alcohol and aldehyde dehydrogenases. Using comparative proteomics, we identify a gene cluster that is strongly expressed in the presence of ethylene glycol. We report the functional and structural characterization of EtgB and EtgA, key e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования