Epigenetic abnormalities, including DNA methylation, are thought to contribute to the pathobiology of multiple myeloma (MM). Recent studies have shown that the hypermethylation of tumor suppressor gene promoters is associated with MM progression; however, its prognostic significance remains unclear. In this study, we focused on the methylation status of two genes, cadherin-1 (CDH1) and maternally expressed gene 3 (MEG3), and found that methylation was associated with poor prognosis in MM. We determined the methylation status of CDH1 and MEG3 in 57 patients with newly diagnosed MM by methylatio…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is a key epigenetic modification regulating gene expression without altering the DNA sequence, and its aberrant patterns serve as important biomarkers for cancer and cardiovascular diseases. Electrochemical biosensors have emerged as powerful platforms for site-specific methylation analysis due to their high sensitivity, simplicity, low cost, and compatibility with miniaturized devices. More importantly, electrochemical interfaces enable direct coupling between molecular recognition and nanoscale signal amplification, allowing detection limits to be pushed beyond intrinsic elec…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The vast collection of human-specific traits- such as our unique morphology, cognition, behavior, and diseases- has long been attributed to gene expression divergence between us and our closest living relatives, chimpanzees. Theory suggests that changes to cis -regulatory elements such as promoters and enhancers may drive evolutionary adaptation, and DNA methylation is a key factor in transcriptional cis -regulation. However, we still lack an understanding of 1) how species-specific methylation patterns arise; 2) their downstream effects; and 3) whether they are a common target of natural sele…
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer remains a leading malignancy among women globally, with its pathogenesis strongly associated with persistent high-risk human papillomavirus (HPV) infection. Despite the widespread adoption of HPV testing in cervical cancer screening, its suboptimal specificity frequently results in overdiagnosis and overtreatment. Gene methylation, a key epigenetic modification, has emerged as a highly specific biomarker associated with cervical precancerous lesions and carcinogenesis, holding significant promise for enhancing screening precision. This review comprehensively summarizes recent a…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Maternal obesity predisposes offspring to metabolic disease, yet how oocytes transmit this risk remains unclear. Here, we show that maternal obesity induces locus-specific DNA methylation changes in oocytes to drive intergenerational metabolic dysfunction in a tissue-specific and sex-specific manner. Among these, a subset of metabolic genes, notably Hnf1α, Thra and Pdk4, exhibited persistent intergenerational methylation and transcriptional dysregulation. Although these methylation marks were erased during embryogenesis, H3K36me2 enrichment was retained at the loci, suggesting a potential chro…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is a key epigenetic mechanism that mediates gene expression and informs cellular identity. Methyl-CpG binding protein 2 (MeCP2) is a protein capable of recognizing and interpreting the methylated DNA code to bring about phenotypic outcomes through co-factor interactions. Altered DNA methylation patterns and MeCP2 function, therefore, disrupt cellular epigenetic homeostasis and contribute to human diseases. MeCP2 loss-of-function or amplification events are responsible for Rett syndrome and MECP2 duplication syndrome, respectively, where patients present with multisystem pathoph…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alterations in ribosomal DNA copy number (rDNA-CN) and global DNA methylation have been associated with genomic instability and various diseases. However, their relevance in myocardial infarction (MI) has not been fully investigated.
METHODS: We measured rDNA-CN and global DNA methylation in blood samples from MI patients (n = 100) and healthy controls (n = 109) using Droplet Digital PCR (ddPCR) and ELISA, respectively. Logistic regression was used to assess associations with MI, before and after adjustment for age and sex. Correlations of rDNA CN and global DNA methylation with a…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To establish an analytical method for human DNA contamination with mouse DNA using a DNA methylation microarray.
MATERIALS AND METHODS: A pure human DNA sample was generated by mixing fully methylated and unmethylated DNA originating from the human cell line HCT116 and fully methylated mouse DNA. The pure human DNA sample, human DNA samples mixed with 30% and 60% mouse DNA, and the pure mouse DNA samples were analyzed using the Infinium MethylationEPIC v2.0 kit. Cell line xenografts (CDX) were prepared from RKO and Pa-Tu-8902 cell lines.
RESULTS: We identified 7,446 low-reproducibility …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Redox-active covalent organic frameworks (COFs) are promising materials for electronics, sensing, and catalysis. However, their synthesis is hampered by the scarcity of redox-active monomers and the difficulty of functionalizing as-synthesized frameworks without compromising crystallinity. Here, we introduce a reductive N-methylation strategy that enables the universal and mild conversion of imine-linked COFs into crystalline tertiary amine-linked frameworks (NMe-COFs). The method preserves structural order while imparting strong electron-donating and redox-responsive properties. Among the NMe…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pulmonary hypertension is a malignant cardiovascular disease characterized by pulmonary vascular remodeling, with core pathologi … n14, an m6A methyltransferase complex subunit) was identified as a potential modulator of KRT17 RNA methylation, enhancing its RNA stability and protein expression. Furthermore, KRT17 promoted PASMCs proliferation through upregulation of LCN2 (lipocalin-2).
CONCLUSIONS: Our study reveals a novel molecular mechanism by which KRT17 expression is regulated via …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: 5-methylcytosine (5-mC) RNA methylation is a prevalent post-transcriptional modification affecting both coding and non-coding RNAs. 5-mC methylation can regulate the expression level of relevant genes and biological processes by affecting RNA stability, translation efficiency, spatial structure, protein interactions, and other processes. Emerging evidence highlights its critical role in cancer biology. MAIN BODY: Abnormal changes in 5-mC methylation lead to aberrant expression of oncogenes or inactivation of suppressor genes, which in turn affects the growth and differentiation of …
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 disease, caused by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2, proved to be a global pandemic with effect on mitochondrial functions. Mitochondrial genetics plays an essential role in disease severity. We identified differential methylation patterns in mitochondrial DNA and nuclear encoded mitochondrial genes in Indian COVID-19 patients through bisulphite sequencing. The study groups included severe deceased, recovered and healthy individuals. Differentially methylated regions (DMR) were obtained. Based on DMRs, differentially methylated genes (DMGs) having methylation in pro…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present MouseRS-CMD, a murine DNA methylation-based immune cell deconvolution tool. Neutrophils, monocytes, natural killer cells, B cells, CD4 + and CD8 + T cells were purified. DNA methylation was measured with the Illumina Mouse Methylation BeadChip at > 285,000 CpG loci for reference library development and in eye and terminal bleed whole blood with flow cytometry measurements for validation. The IDOL algorithm identified an optimal reference library of 300 CpGs with RMSE < 2.7 for four cell types and < 3.5 for all cell types. MouseRS-CMD enables immune profiling in archival samples and …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Over the years, multiple studies have linked phenotypic plasticity to changes in gene expression and alternative splicing, but the role of epigenomic regulation, such as DNA methylation, in mediating plastic responses are still poorly understood. DNA methylation has been proposed as a promising regulatory mechanism because of its potential effects on transcriptional activity and pre-mRNA splicing, especially when present within gene bodies in insects. Here, we examined the role of DNA methylation in the developing wings of the Bicyclus anynana butterflies by testing its association with differ…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is a fundamental epigenetic modification that plays crucial roles in transcriptional regulation, cellular differentiation, and genome stability. However, how locus-specific DNA methylation is determined by intrinsic DNA sequence remains poorly understood. Here, we introduce Melody, a deep learning framework that predicts DNA methylation from 10-kb genomic sequences, enabling the integration of both local and long-range sequence signals. Across 39 human tissues, Melody accurately predicts methylation profiles and consistently outperforms existing state-of-the-art methods in whol…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Targeting specific protein-protein interactions, particularly those involving DNA methyltransferases (DNMTs), offers a promising strategy to resensitise glioblastoma multiforme cells to temozolomide. Glioblastoma multiforme is a highly aggressive brain cancer with a poor prognosis. The long-term efficacy of standard treatment, including temozolomide, is limited due to resistance development. Temozolomide resistance, often due to MGMT overexpression owing to global DNA hypomethylation and complex epigenetic regulation, significantly limits its efficacy. Thus, we developed site-specific DNMT1 in…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sequence variants in ARID1B, a subunit of the BRG1 (BRM)-associated factors (BAF) complex, are often challenging to classify clinically due to the broad phenotypic spectrum of ARID1B-related disorders (ARID1B-RD). Our previous work has shown that pathogenic variants in epigenetic regulatory genes are associated with DNA methylation (DNAm) signatures, which have proven diagnostic utility for variant classification. Given the role of ARID1B in chromatin remodeling, we profiled whole-blood DNAm for 22 individuals with ARID1B variants and 240 typically developing individuals using Illumina's Infin…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dysregulated HSP90AA1 chaperone activity is a hallmark of multiple cancers; however, its post-translational regulation in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) remains poorly defined. Here, we defined PRMT5-dependent symmetric dimethylation of HSP90AA1 at arginine 182 (R182) as a critical molecular switch driving ESCC progression. HSP90AA1 physically interacted with PRMT5, and genetic or pharmacological inhibition of PRMT5 markedly reduced HSP90AA1 R182 methylation, accompanied by suppression of epithelial-mesenchymal transition (EMT) programs. HSP90AA1 depletion significantly impaired ESC…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the FMR1 gene, expansion of the CGG triplet beyond 200 repeats triggers DNA methylation, resulting in the Fragile X Syndrome (FXS). There exist rare individuals who carry a CGG expansion >200 that remains unmethylated, rescuing them from expressing the FXS phenotype. We tested the hypothesis that active FMR1 transcription regulates DNA methylation of the locus through the binding of its mRNA to DNMT1 enzyme. Our results show that DNMT1 binds FMR1-mRNA in transcriptionally active cells preventing them from being methylated, whereas it binds to the FMR1 locus in FXS cells, resulting in gene s…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here, we provide a detailed protocol for Direct Methylation Sequencing (DM-Seq), a method for localizing 5-methylcytosine (5mC) at single-base resolution within CpG contexts. DM-Seq relies solely on enzymatic transformation of DNA, thereby circumventing the generation of destructive or biased intermediates commonly seen with chemical sequencing methods, and provides results with high library yield, sample diversity, and fidelity. DM-Seq is particularly well-suited for low-input samples and applications where the detection of 5mC is desired without being confounded by 5-hydroxymethylcytosine. I…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования