Ulcerative colitis (UC) is a chronic immune-mediated disorder of the gastrointestinal tract underpinned by dysregulated mucosal immune responses. Although biological therapies targeting individual cytokines have improved clinical outcomes, most patients fail to achieve durable remission, highlighting the limitations of single-target approaches. Emerging evidence suggests that cytokines function not in isolation but within highly interconnected signaling networks. Systems-level analyses using single-cell transcriptomics and network-based reconstruction reveal that UC phenotypes are characterize
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Determining molecular markers that mediate clinically aggressive phenotypes in prostate cancer is a significant challenge. While traditional linear models offer some interpretability, they often lack the precision needed for complex multi-omics data. Conversely, conventional deep learning methods provide robust predictions but typically remain opaque, hindering the identification of impactful molecular markers and biological mechanisms. To address this, we propose the Cross-omics Interpretable Neural Network (CINN), a biomimetic framework designed to predict prostate cancer states and identify
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hairtail is prone to spoilage during refrigerated storage and it is due to microbial activity, which will directly lead to changes in the composition of metabolites in vivo. This study systematically elucidates the spoilage phenomena in hairtail during eight days of refrigeration at 4 °C through multi-omics analysis. Pseudomonas and Shewanella were identified as key spoilage bacteria, and their nutrient utilization pathways were different Pseudomonas dominated the early stage and used monosaccharides; however, Shewanella appeared in the later stage, and its metabolism is heavily dependent on a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heat stress negatively affects the growth and health of fish. In this study, Eurasian perch (Perca fluviatilis) were exposed to control (18° … indicate that acute heat stress induces hepatic oxidative damage, energy-metabolism disturbance and multiomics alterations in P. fluviatilis. This study provides a basis for understanding the hepatic responses of temperate freshwater fish to elevated temperatures.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid growth of high-dimensional biological data has necessitated advanced data fusion techniques to integrate and interpret complex multi-omics and longitudinal datasets. Shared and unshared structure across such datasets can be identified in an unsupervised manner with Advanced Coupled Matrix and Tensor Factorization (ACMTF), but this cannot be related to an outcome. Conversely, N-way Partial Least Squares (NPLS) is supervised and captures outcome-associated variation but cannot identify shared and unshared structure. To bridge the gap between data exploration and prediction, we introduc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leaves of Paeonia lactiflora are underutilized by-products with potential as natural antioxidant sources. In this study, 18 cultivars were evaluated for phytochemical composition and in vitro antioxidant capacity. Total phenolic content correlated strongly with DPPH and ABTS activities, and the comprehensive antioxidant index identified 'Coral Charm' and 'Hangshao' as representative high- and low-antioxidant cultivars, respectively. Untargeted metabolomics detected 2677 metabolites and identified 908 differential metabolites between the two cultivars. Targeted phenolic profiling quantified 27
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute respiratory distress syndrome (ARDS) is a complex and heterogeneous clinical syndrome characterized by diffuse alveolar damage, severe hypoxemia, and a high risk of respiratory complications. Among these, the Macklin effect has emerged as an early radiological sign associated with the subsequent development of barotrauma. Although several genetic and molecular factors have been implicated in ARDS susceptibility and progression, their potential contribution to the biological processes underlying Macklin effect development remains largely unexplored.
OBJECTIVE: This review aim
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Iron is a limiting micronutrient in various environments, and its scarcity orchestrates microbial interactions across diverse ecosystems. The cheese surface, which is oxic, iron-limited, and a host of moderately complex ecosystems, can serve as a model system to study iron-mediated microbial interactions. In this work, we focused on two ripening bacteria isolated from cheese, Hafnia alvei and Brevibacterium aurantiacum. We combine growth measurements, transcriptomics, proteomics, and metabolomics to examine the role of iron in their interactions within a synthetic medium designed to mimic late
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The widespread use of commercial active dry yeasts (ADYs) in winemaking is well-established. Its successful implantation during industrial fermentation varies significantly according to wineries and regions. This inconsistency frequently causes undesirable quality fluctuations and deterioration. However, their interactions with native microbiota has not been fully elucidated. This study deciphers microbiota and metabolite profiles during industrial Cabernet Sauvignon wine fermentations with different implantation percentage of commercial active dry yeasts (ADYs) through multi-omics. Strain-lev
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) presents considerable heterogeneity in disease risk and outcomes, posing a major challenge for effective therapeutic development. Recent advances in multi-omics profiling are revolutionizing our understanding of the complex AD pathogenesis. Leveraging long-read sequencing and large-scale multi-ancestry genetic studies, researchers are unraveling the complex polygenic architecture of AD. Additionally, advances in multi-omics techniques unlock the power of molecular profiling of human biological samples, particularly spatial omics of human postmortem brain tissues and mo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) caused a global pandemic due to its high transmissibility and ability to evade innate immune responses. Comprehensive characterization of the disease is essential for elucidating its pathophysiology and clinical progression. In this study, we performed multi-omics analyses of plasma samples collected from SARS-CoV-2-positive patients prior to clinical deterioration of coronavirus disease 2019 (COVID-19). These samples revealed the potential of previously reported clinical parameters, including CRP and neutrophil level, to predict COV
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PM2.5, a ubiquitous air pollutant, exacerbates periodontitis progression through mechanisms previously unclear. This study employed cytological and integrated transcriptomic-metabolomic analyses to investigate PM2.5's toxic effects on gingival fibroblasts. Results demonstrated that PM2.5 exposure decreased gingival fibroblasts viability, adhesion, and migration, while increased inflammation and disrupted mitochondrial homeostasis. Transcriptomics identified 7034 differentially expressed genes (DEGs) with 3834 upregulated and 3200 downregulated. KEGG enrichment revealed upregulated DEGs primari
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1. Lipids are fundamental regulators of cellular structure, energy balance, and signalling, while their dysregulation contributes significantly to the development of chronic diseases. 2. Recent advances in multi-omics technologies, including genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, lipidomics, and epigenomics, have transformed the investigation of lipid metabolism by enabling high-resolution characterisation of lipid species, metabolic pathways, and regulatory networks. 3. This review emphasises the significance of lipids in chronic metabolic diseases like cardiovascular disease, t
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitamin D deficiency (VD-deficiency) has been implicated in various autoimmune diseases, including uveitis, yet its mechanistic role remains unclear. Emerging evidence suggests that gut microbial dysbiosis and metabolic disturbances may serve as critical intermediates linking VD-deficiency and autoimmune disease pathogenesis. Here, using an experimental autoimmune uveitis (EAU) model induced in B10RIII mice, we demonstrate that VD-deficiency exacerbates EAU severity, accompanied by enhanced Th1 and Th17 responses, suppressed regulatory T cells, and disruption of both intestinal and blood–retin
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The oral microbiome, mainly includes microorganisms located in supragingival and subgingival plaques. These bacterial communities maintain the stability of specific niches and host immune homeostasis by forming a complex regulatory network, thereby maintaining periodontal health. Local periodontal dysbiosis occurs when this stability is disrupted, which leads to the excessive production of toxic products. Recent advances in meta-omics technologies have revealed the characters of the oral microbiome. In this review, we discuss the most recent insights into the oral microbiome associated with pe
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glaucoma is a leading cause of irreversible blindness worldwide, characterized by progressive retinal ganglion cell loss and functional impairment. It is a clinically heterogeneous disease driven by complex, multilayered molecular mechanisms. High-throughput multi-omic technologies are catalyzing a shift toward integrated multi-omic strategies to define glaucoma trajectory and disentangle its pathophysiology. Genomic, transcriptomic, epigenomic, proteomic, metabolomic, lipidomic, microbiome, and phenomic data can help identify biomarkers, molecular endotypes, and pathways that shape glaucoma s
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periosteal cells (PCs) play a crucial role in bone regeneration. Currently, the spatial landscapes of jaw-bone periosteum during bone grafting remains unclear. In this study, we propose a modified guided bone regeneration (GBR) model and integrate single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and spatial transcriptomics (ST) to dissect its spatial characteristics. We identify a functional subset of Ctsk+Fmod+ PCs within the jaw-bone periosteum of rat and human. In addition, we describe a spatial niche around the bone graft substitute, characterized by massive infiltration of macrophages interacting w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The southern root-knot nematode (Meloidogyne incognita, M. incognita) poses a severe threat to cucurbit production, yet no resistant germplasm exists among cultivated species. Although Cucumis metuliferus (C. metuliferus), a wild Cucurbitaceae species, exhibits resistance to M. incognita and prior transcriptomic studies have identified key responsive genes and signaling pathways, an integrated understanding of the dynamic transcriptional and metabolic reprogramming is still lacking. Here, an integrated transcriptomic and metabolomic analysis was performed on resistant (CM064) and susceptible (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Skeletal muscle fiber composition is a key determinant of meat quality and metabolic traits. The early postnatal period constitutes a primary window for muscle fiber transformation. In this study, distinct muscle fiber composition is analyzed by histological and molecular characterization of longissimus dorsi muscle of 2-week-old lean-type and Chinese indigenous pigs. Multi-omics analyses reveal divergence in chromatin states, enhancer landscapes, and promoter activity between breeds. Lean-type pigs show increased chromatin accessibility and enhancer activation at genes involved in oxidative m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Food spoilage is a major cause of food loss, while it remains less understood in complex, multi-component foods than in single-ingredient products. This review reframes spoilage in such foods as a community-driven ecological process, not simply the result of single dominant organisms, and argues that spoilage is best understood through microbial activity rather than microbial presence or relative abundance alone. We develop this framework around three central ideas: (i) ingredient-derived microbiotas interact within a shared matrix, so spoilage depends on microbial succession and competition d
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования