Genetical genomics has been suggested as a powerful approach to study the genotype-phenotype gap. However, the relatively low power of these experiments (usually related to the high cost) has hindered fulfillment of its promise, especially for loci (QTL) of moderate effects.One strategy with which to overcome the issue is to use a targeted approach. It has two clear advantages: (i) it reduces the problem to a simple comparison between different genotypic groups at the QTL and (ii) it is a good starting point from which to investigate downstream effects of the QTL. In this study, from 698 F2 bi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helminths almost invariably have an over-dispersed distribution in the host population. Human and animal studies have provided evidence suggesting that a large part of this variation is due to host genetic factors. Recently, the heritability for roundworm (Ascaris suum) infection levels in pigs was estimated to be 0.45. We used single nucleotide polymorphism markers to perform a whole-genome scan on 195 pigs experimentally infected with A. suum. A putative quantitative trait locus for worm burden on chromosome 4 covering 2.5 Mbp was identified by measured genotype analysis, although none of th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Iron deficiency anemia is a global problem which often affects women and children of developing countries. Strategy I plants, su … activity in a range of genotypes and in a low × high seed iron cross (DOR364 x G19833), to identify quantitative trait loci (QTL) for this trait, and to assess possible associations with seed iron levels.
RESULTS: The experiments were carried out with hydroponically grown plants provided different amounts of iron varying between 0 and 20 μM Fe(III)-EDDHA. The parents, D …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Potato chromosome 5 harbours numerous genes for important qualitative and quantitative traits, such as resistance to the root cyst nematode Globodera pallida and the late blight fungus, Phytophthora infestans. The genes make up part of a "hot spot" for resistances to various pathogens covering a genetic map length of 3 cM between markers GP21 and GP179. We established the physical size and position of this region on chromosome 5 in potato and tomato using fluorescence in situ hybridization (FISH) on pachytene chromosomes. Five potato bacterial artificial chromosome (BAC) clones with the geneti
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the LMNA gene, encoding the nuclear envelope protein lamin A/C, are responsible for a number of distinct disease entities including Dunnigan-type familial partial lipodystrophy. Dunningan-type lipodystrophy is characterized by loss of subcutaneous adipose tissue, insulin resistance, dyslipidemia, and type 2 diabetes and shares many of the features of the metabolic syndrome. Furthermore, several genome-wide linkage scans for type 2 diabetes have found evidence of linkage at chromosome 1q21.2, the region that harbors the LMNA gene. Therefore, LMNA is a biological and positional cand
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pathogenic fungus Histoplasma capsulatum causes disease ranging from mild to fatal in healthy and immunocompromised humans. Infection rates reach 80% in endemic areas, including the Midwestern United States. We used inbred mice to identify a 300-fold difference in fungal burden. A/J mice showed lower fungal burden and morbidity than C57BL/6J mice, a reversal of the trend observed for many bacterial pathogens. We mapped the differences in fungal burden to discrete locations on chromosomes 1, 6, 15 and 17 with high significance. Substitution of a single resistant chromosome 17 onto the susce
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Various rationale have been considered in the familial inheritance pattern of major depression ranging from simple one-gene Mendelian inheritance to pseudo-additive gene action. We instead predict broad genetic expressivity patterns in the progeny of parents where at least one parent has recurrent major depression. In keeping with this idea, we feel that recurrent major depression could involve an expression imbalance of "normal" genes either exclusively or along with allelic variation(s). The patterns of pathology are theoretically conceptualized as qualitative and quantitative, meaning that
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several quantitative trait loci regulating murine Lyme arthritis severity have been mapped, including a highly significant linkage found on chromosome 5, termed Bb2Bb3. Within this region, the Ncf1 gene of the phagocyte nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH) oxidase has recently been identified as a major regulator of arthritis severity in rodent models of rheumatoid arthritis, an effect attributed to protective properties of reactive oxygen species. To assess the role of Ncf1 in Lyme arthritis, we introgressed Bb2Bb3 from severely arthritic C3H/He mice onto mildly arthritic C57BL…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reduced cardiac vagal control reflected in low heart rate variability (HRV) is associated with greater risks for cardiac morbidity and mortality. In two-stage meta-analyses of genome-wide association studies for three HRV traits in up to 53,174 individuals of European ancestry, we detect 17 genome-wide significant SNPs in eight loci. HRV SNPs tag non-synonymous SNPs (in NDUFA11 and KIAA1755), expression quantitative trait loci (eQTLs) (influencing GNG11, RGS6 and NEO1), or are located in genes preferentially expressed in the sinoatrial node (GNG11, RGS6 and HCN4). Genetic risk scores account f…
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A deep understanding of the genetic control of drought tolerance and iron deficiency tolerance is essential to hasten the process of developing improved varieties with higher tolerance through genomics-assisted breeding. In this context, an improved genetic map with 1205 loci was developed spanning 2598.3 cM with an average 2.2 cM distance between loci in the recombinant inbred line (TAG 24 × ICGV 86031) population using high-density 58K single nucleotide polymorphism (SNP) "Axiom_Arachis" array. Quantitative trait locus (QTL) analysis was performed using extensive phenotyping data generated f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Obesity is a major public health concern in Mexico and worldwide. Although the estimated heritability is high, common variants identified by genome-wide association studies explain only a small proportion of this heritability. A combination of linkage and association strategies could be a more robust and powerful approach to identify other obesity-susceptibility variants. We thus sought to identify novel genetic variants associated with obesity-related traits in the Mexican population by combining these methods. We performed a genome-wide linkage scan for body mass index (BMI) and other obesit
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anthrax toxin causes anthrax pathogenesis and expression levels of ANTXR2 (anthrax toxin receptor 2) are strongly correlated with anthrax toxin susceptibility. Previous studies found that ANTXR2 transcript abundance varies considerably in individuals of different ethnic/geographical groups, but no eQTLs (expression quantitative trait loci) have been identified. By using 3C (chromatin conformation capture), CRISPR-mediated genomic deletion and dual-luciferase reporter assay, gene loci containing cis-regulatory elements of ANTXR2 were localized. Two SNPs (single nucleotide polymorphism) at the c…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
GWAS on grain uniformity and transcriptomics across spike shapes/positions reveal checkpoints in barley grainheterogeneity development. Grain uniformity, defined as the consistency of grain size among siblings within a sample, can influence yield performance and malting quality in barley, yet its genetic basis remains poorly understood. Here, we combine genome-wide association analysis of 334 barley accessions with spatiotemporal transcriptomics of two cultivars exhibiting contrasting uniformity. We identified six quantitative trait loci (QTLs) across chromosomes 1H, 2H, 4H, and 5H. The non-un…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genetic control of GFD in sorghum closely overlaps with that of grain size, is influenced by both pre- and post-anthesis processes, offering new opportunities for yield improvement through targeted breeding and inter-racial trait introgression. The duration of the grain filling period has been associated with yield increases in cereals including maize and sorghum. The genetic control of grain filling duration (GFD) is however not known in sorghum. This study explored the genetic variation and extent of genetic control for GFD in a diverse panel of sorghum genotypes (n=904), in three enviro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Restless legs syndrome (RLS) is a common sensorimotor disorder with limited treatment options and incompletely understood pathophysiology. Genome-wide association studies have identified numerous risk loci, but translating these findings into causal genes and therapeutic targets remains challenging. We performed a proteome-wide association study (PWAS) integrating RLS genome-wide association study (GWAS) data from FinnGen with two brain pQTL datasets (ROSMAP and Banner). We validated the identified proteins using TWAS, SMR, and colocalization analyses using brain pQTL and eQTL datasets. To fur
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer disease (AD) risk differs across ancestral populations, yet most genetic studies have focused on non-Hispanic White (NHW) cohorts. We conducted a multi-population transcriptome-wide association study (TWAS) using whole-blood RNA sequencing (RNA-seq) and genotype data from NHW (n = 235), African American (AA; n = 224), and Hispanic (HISP; n = 292) Multi-Ancestry Genomics, Epigenomics, and Transcriptomics of Alzheimer's (MAGENTA) participants. Using sum of shared single effects (SuShiE) for multi-population cis-eQTL fine-mapping, we identified credible sets for 8,748 genes, improving f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Graves' disease (GD) is a classical autoimmune disorder caused by interactions between genetic susceptibility and immune dysre … cript usage, alternative splicing events (ASEs), RNA-binding protein (RBP) regulation, and splicing quantitative trait loci (sQTLs) were systematically analyzed to characterize transcriptomic alterations associated with different disease states.
RESULTS: Compared with NC, relapse-associated differentially expressed genes (DEGs) were mainly enriched in antimicrobial humo …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell sequencing has revolutionized the scale and resolution of molecular profiling of tissues and organs. Here we present an integrat … on. This integrated atlas enhanced the fine-mapping of genome-wide association study and expression quantitative trait loci variants. Accessible through interactive browsers, this multimodal multidonor and multilab HRCA can facilitate a better understanding of retinal function and pathology.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Migraine is a highly prevalent and disabling neurological disorder characterized by marked clinical heterogeneity, particularly between migraine with aura (MA) and migraine without aura (MO). Although genome-wide association studies (GWASs) have identified numerous risk loci, the cell-type-specific regulatory mechanisms linking genetic variation to brain structure and migraine susceptibility remain unclear. We integrated brain cell-type-specific cis-expression quantitative trait loci (eQTL) from single-nucleus RNA sequencing with large-scale GWAS summary statistics for overall migraine, MA, an…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myocardial infarction (MI) is a major global health burden with limited restorative therapies. Natural compounds such as curcumin and resveratrol offer potential as adjunctive treatments. To elucidate their molecular targets and mechanisms in MI using integrated network pharmacology and summary-data-based Mendelian randomization (SMR). Potential targets of curcumin, resveratrol, and MI-related genes were retrieved from multiple databases. SMR and colocalization analyses using genome-wide association study (FinnGen R12, Million Veteran Program) and expression/protein quantitative trait loci (eQ…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования