BACKGROUND: The presence of somatic mutations in splicing factor 3b subunit 1 (SF3B1) in patients with Myelodysplastic syndromes with ring sideroblasts (MDS-RS) highlights the importance of the RNA-splicing machinery in MDS. We previously reported the presence of bone marrow (BM) RS in Sf3b1 heterozygous (Sf3b1 (+/-)) mice which are rarely found in mouse models of MDS. Sf3b1 (+/-) mice were originally engineered to study the interaction between polycomb genes and other proteins.
METHODS: We used routine blood tests and histopathologic analysis of BM, spleen, and liver to evaluate the hematolo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-mediated pathogenesis is a recently developed disease model that proposes that certain types of mutant genes produce toxic transcripts that inhibit the activities of specific proteins. This pathogenesis model was proposed first for the neuromuscular disease myotonic dystrophy (DM), which is associated with the expansion of structurally related (CTG)(n) and (CCTG)(n) microsatellites in two unrelated genes. At the RNA level, these expansions form stable hairpins that alter the pre-mRNA splicing activities of two antagonistic factor families, the MBNL and CELF proteins. It is unclear which al…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We identified eight patients whose sera contained autoantibodies to the U2 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP), an RNA protein particle involved in the splicing of newly transcribed messenger RNA. Each of these patients had an overlap syndrome that included features of either systemic lupus erythematosus (SLE), scleroderma, and/or polymyositis. We then used these sera to characterize the autoantigenic polypeptides of the U1 and U2 snRNP particles. In immunoblots, all sera contained antibodies to the B" polypeptide of the U2 snRNP. A subset of these sera that more effectively immunoprecipit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This Commentary highlights the article by González-Andrade et al who investigated a conserved spliced leader RNA as an attractive new molecular target for next-generation diagnostics in diseases caused by trypanosomatids.
СтатьяКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MAGOH and MAGOHB are paralog proteins that can substitute each other in the exon junction complex (EJC). The EJC is formed of core components EIF4A3, RBM8A, and MAGOH/MAGOHB. As a part of the EJC, MAGOH proteins are required for mRNA splicing, export, translation and nonsense-mediated mRNA decay (NMD). MAGOH is also essential for embryonic development and normal cellular functioning. The haploinsufficiency of MAGOH results in disorders such as microcephaly and cancer. The present review discusses the discovery of MAGOH, its paralog MAGOHB, their roles in cellular function as part of the EJC, a…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epithelial ovarian cancer (EOC) is a highly lethal disease characterized by a high rate of platinum (PT)-resistant recurrence. Dysregulation of transcriptional and alternative splicing (AS) has been suggested as a possible mechanism of PT resistance involving transcriptional cyclin-dependent kinases (CDKs). We report that pharmacological CDK12/CDK13 inhibition (CDK12i) synergistically enhances PT-induced cytotoxicity in a large number of PT-sensitive and PT-resistant EOC models. CDK12i effectively delayed the emergence of PT-resistant recurrences in vitro and in vivo. Acquired resistance to CD
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate cancer (PCa) is a leading cause of cancer-related mortality, with significant racial disparities in outcomes. Long non-coding RNAs (lncRNAs) MALAT1 and TUG1 are implicated in oncogenic pathways. Aberrant RNA splicing, a hallmark of cancer, is often driven by dysregulation of serine-arginine protein kinase 1 (SRPK1), a key spliceosome regulator. The relationship between lncRNAs of splicing factors in cancer pathways remains underexplored, and thus, this study aimed to elucidate the roles of MALAT1 and TUG1 lncRNAs in relation to the SRPK1 inhibitor SPHINX31 in PCa.
METHODS…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Dysferlin is a large transmembrane protein that functions in critical processes of membrane repair and vesicle fusion. Dysferlin- … identified. We designed antisense oligonucleotides (AONs) to bypass the effects of this mutation on RNA splicing.
RESULTS: We identified a new pathogenic point mutation deep within dysferlin intron 50i. This intronic variant causes aberrant mRNA splicing and inclusion of an additional pseudoexon (PE, we term PE50.1) within the mature dysferlin mRNA. PE50.1 in …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer immunotherapy has improved outcomes across many tumor types, but primary and acquired resistance, tumor heterogeneity and a shortage of safe targets remain unresolved. Part of this gap arises because tumor cells evade immune recognition not only through genomic mutation but also through post-transcriptional mRNA processing, a network comprising 5' capping, splicing, alternative polyadenylation (APA), RNA editing, epitranscriptomic modification, nonsense-mediated decay (NMD), RNA stability and translational control. These processes govern antigen presentation, transcript degradation, che
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinocerebellar Ataxia type 2 (SCA2) and Amyotrophic Lateral Sclerosis type 13 (ALS13) are triggered by polyglutamine expansion in Ataxin-2 … odegenerative signs, we identify pathognomonic changes in the machinery for protein translation and RNA splicing. Glial fractions showed upregulation of Gpnmb (to 2082%), Cst7, Clec7a, Axl, Csf1, Lgals3, Lgals3bp, Slc11a1, and Usp18 as an unspecific neuroinflammatory signature, versus downregulation of axonal Nefh (to <19%), and synaptic Scn4b, Camk2b, Rab15, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TDP-43, an RNA-binding protein that is primarily nuclear and important in splicing and RNA metabolism, is mislocalized from the nucleus to the cytoplasm of neural cells in amyotrophic lateral sclerosis (ALS), and contributes to disease. We sought to investigate whether TDP-43 is mislocalized in infections with the acute neuronal GDVII strain and the persistent demyelinating DA strain of Theiler's virus murine encephalomyelitis virus (TMEV), a member of the Cardiovirus genus of Picornaviridae because: i) L protein of both strains is known to disrupt nucleocytoplasmic transport, including transp
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spliced transcripts of influenza A (fowl plague) virus (FPV) RNA (vRNA) segments 7 and 8 accumulate to a much greater extent during non-productive infection of mouse L cells, than they do during productive infection in primary chick embryo fibroblasts (CEF). Virus-specific protein synthesis, or a consequent event in virus replication appears necessary to promote splicing of vRNA segment 8-encoded mRNAs in both cell types, and of vRNA segment 7-encoded mRNAs in CEF. In L cells, however, splicing of the segment 7-encoded mRNAs seems to be independent of such virus-specific control. This observat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA splicing is a crucial step in eukaryotic gene expression, ensuring the accurate removal of introns and joining of exons to produce mature transcripts. Mutations that alter canonical splice sites or splicing regulatory elements can profoundly affect this process, resulting in aberrant mRNA species and disease. Genetic screening for Malignant Hyperthermia Susceptibility (MHS), resulted in the identified of a frameshift variant in RYR1 (c.14510delA, rs193922877) associated with MHS and core-like structures in skeletal muscle biopsies. The c.14510delA variant causes a frameshift leading to pre…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA) is an intractable neurodegenerative disease afflicting 1 in 6-10,000 live births. One of the key functions of the SMN protein is regulation of spliceosome assembly. Reduced levels of the SMN protein that are observed in SMA have been shown to result in aberrant mRNA splicing. SMN-dependent mis-spliced transcripts in motor neurons may cause stresses that are particularly harmful and may serve as potential targets for the treatment of motor neuron disease or as biomarkers in the SMA patient population. We performed deep RNA sequencing using motor neuron-like NSC-34 …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heterozygous somatic mutations affecting the spliceosome gene SF3B1 drive age-related clonal hematopoiesis, myelodysplastic syndromes (MDS) and other neoplasms. To study their role in such disorders, we generated knock-in mice with hematopoietic-specific expression of Sf3b1-K700E, the commonest type of SF3B1 mutation in MDS. Sf3b1K700E/+ animals had impaired erythropoiesis and progressive anemia without ringed sideroblasts, as well as reduced hematopoietic stem cell numbers and host-repopulating fitness. To understand the molecular basis of these observations, we analyzed global RNA splicing i…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Slow skeletal troponin T (ssTnT, TNNT1) is the tropomyosin-binding subunit of the troponin complex in the slow-twitch fibers of skeletal muscle. Exon 5 of TNNT1 is alternatively spliced, and retention of the 3' region of intron 11 (exon 12') has also been described. Variants in TNNT1 are known to cause nemaline myopathy (NM).
OBJECTIVE: To identify and further investigate the disease-causing variant in a patient with lethal NM.
METHODS: The genetic analyses included a gene panel, Sanger sequencing, whole-exome sequencing, and targeted array-CGH. Muscle biopsy was analyzed using r
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Galectin-1, a constituent of the mammalian β-galactoside-binding lectin family, plays a pivotal regulatory role in fibrotic cascades. Dysregulated fibrogenic cellular activity has been implicated as a critical driver of hypertrophic scar (HS) pathogenesis. Nevertheless, the precise mechanistic contributions and molecular pathways through which Galectin-1 modulates HS development remain incompletely characterized. qRT-PCR and western blot techniques were employed to explore the expression of Galectin-1 in hypertrophic scar tissues and cells. The Galectin-1 knockdown cell line was established by
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: This study reports a family with chronically abnormal blood liver function tests (LFT) and congenital hypofibrinogenemia. The proposita had cirrhosis initially related to alcohol abuse and chronic viral hepatitis C (HCV), but abnormal LFT persisted even when alcohol intake was stopped and despite HCV treatment was efficient based on serum RNA negative testing.
RESULTS: Needle biopsy specimens of the proposita and her brother showed eosinophilic intra-cytoplasmic inclusions that reacted strongly with fibrinogen antisera on direct immunofluorescence. Electron microscopic examinati
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Congenital diarrhea is persistent diarrhea that manifests during the neonatal period. Mutations in DGAT1, which is crucial for t … ere identified as pathogenic evidence of congenital diarrhea, and the detection of tissue-specific mRNA splicing and transcriptional effects can provide auxiliary evidence.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long noncoding RNA (lncRNA) metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1 (MALAT1) and retinopathy are 2 distinct yet interconnected areas of research in the field of ocular studies. MALAT1, with its diverse biological functions, has been extensively studied and demonstrated to play a role in various diseases, including ocular pathologies. Its involvement in alternative splicing regulation, transcriptional control, and the competing endogenous RNA (ceRNA) network suggests its potential implication in retinopathy. Retinopathy refers to a group of disorders that affect the retina, leadi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования