BACKGROUND: Enterobacter cloacae complex (ECC) is a formidable opportunistic pathogen, yet its ecological niche and role as a silent reservoir for antimicrobial resistance (AMR) in the healthy human gut remain underappreciated. Herein, we aim to characterize the prevalence, genomic epidemiology, and mobile resistome of ECC in a widespread healthy demographic.
METHODS: In a nationwide, cross-sectional genomic surveillance study conducted across China (2024-2025), we analyzed 10,300 fecal samples from healthy individuals across 31 provinces. High-resolution whole-genome sequencing (WGS), compar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Urinary tract infections (UTIs) represent a major global health challenge, necessitating the precise identification of causative pathogens for effective diagnosis and treatment. While metagenomic next-generation sequencing (mNGS) has emerged as a powerful diagnostic tool, its clinical application has been limited by the lack of high-quality microbial genomes from urine samples. RESULTS: We reconstructed 223 reliable quality MAGs spanning bacterial, fungal, mycoplasmal, and viral, including the first demonstration of multiple Escherichia coli subpopulations within individual urine s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vibrio fluvialis is an emerging enteric pathogen increasingly implicated in diarrhoeal disease outbreaks and sporadic infections, particularly in low- and middle-income countries. Reports of multidrug resistance (MDR) in this species are rising; however, comprehensive genomic data from Indian clinical isolates remain limited. A detailed understanding of its antimicrobial resistance (AMR) determinants, virulence repertoire, and population structure is essential for guiding surveillance and public health interventions.
METHODS: We performed whole-genome sequencing of clinical V. flu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to identify circulating lineages of the most prevalent human-associated Salmonella serotypes identified through routine surveillance in Romania between 2023 and 2025 and assess their role in the spread of antimicrobial resistance (AMR). A total of 271 isolates (217 S. Enteritidis, 28 monophasic S. Typhimurium, and 26 S. Typhimurium) were investigated using Illumina short-read sequencing. The isolates were assigned to 9 MLST sequence types (STs) and 109 core genome MLST complex types. The predominant STs were ST11 (96% in S. Enteritidis), ST19 (77% in S. Typhimurium), and ST34
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson’s disease (PD) is a common neurodegenerative syndrome characterized by the loss of dopaminergic neurons and is also a progressive neurodegenerative disorder that is characterized by dopamine deficiency. We established strains artificially selected for longer and shorter durations of tonic immobility, an antipredator behavior that has received much attention recently, in the red flour beetle, Tribolium castaneum, a model insect species for molecular analyses different from Drosophila melanogaster. Previous studies have shown that the long strains (L-strain) have significantly lower le
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite increasing reports of zoonotic simian foamy virus (SFV) infections globally, knowledge of its genetic adaptation in humans and impact on viral transmission and pathogenicity remains limited. We obtained complete SFV genomes using metagenomics analysis of viral isolates from peripheral blood lymphocytes (PBLs) and throat specimens from a worker (Case 6) and source chimpanzee (B1) that bit him. We analyzed viral diversity in three genomic regions (LTR, tas, and bet) involved in replication and latency using longitudinal specimens (PBLs, throat, saliva, urine, and semen) from Case 6 over
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human adenoviruses (HAdVs) are important pathogens that are associated with a wide array of clinical diseases, particularly in the pediatric population. Despite numerous reports of HAdV infections in Tanzania, there are currently no whole genome sequences from this region available in global public databases. This gap presents challenges to our efforts to understand their dissemination and evolution over time. This study employed nanopore-based metagenomic sequencing to detect and sequence the whole genomes of HAdV strains in Tanzanian infants with diarrhea. We present the first whole genome o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pseudomonas promysalinigenes is a newly described bacterial species renowned for producing promysalin, a species-selective lipopeptide antibiotic. All previously reported strains of this species are derived from environmental niches such as plant rhizospheres, and no clinical infection cases associated with this bacterium have been documented to date. Thus, the clinical microbiology relevance, genomic features, and adaptive potential of P. promysalinigenes remain largely unexplored, and current reference databases have limited coverage of this rare species.
METHODS: A bacterial st
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human brucellosis remains endemic in Bosnia and Herzegovina (B&H), yet integrative studies explaining transmission patterns, population structure, and susceptibility profiles in an endemic setting are lacking. This study aimed to characterise human Brucella melitensis (B. melitensis) isolates from B&H using a combined epidemiological, phenotypic, and genomic approach.
METHODS: A total of 60 B. melitensis blood isolates obtained from patients with confirmed brucellosis between 2015 and 2021 were selected from a multicentre collection for phenotypic antimicrobial susceptibility test
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-canonical (non-B) DNA secondary structures, e.g., G-quadruplexes and triplex DNA, are mutation hotspots and genome regulators contributing to disease and evolution. Yet they remain uncharacterized in complete genomes in vivo. Here we exploited the fact that many non-B DNA structures form single-stranded DNA (ssDNA). Using permanganate/S1 footprinting across 14 cell lines, we generated ssDNA profiles for human and six non-human ape telomere-to-telomere (T2T) genomes. Newly resolved satellite arrays-e.g., at ribosomal DNA and centromeres-displayed high ssDNA levels, implicating non-B DNA in
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer is a global killer that causes approximately 940 thousand deaths annually. Terminalia ivorensis (TI) is a tropical tree, the bark of which is used in African traditional medicine for the treatment of diabetes, malaria, and ulcer. This study investigated TI as a potential anticancer agent in human colon cells in vitro. TI was extracted sequentially with petroleum ether, chloroform, ethyl acetate, and ethanol. Antioxidant activity was assessed by DPPH and FRAP, and differential effects on cell viability, growth, DNA damage, DNA repair, and migration were measured in human colon
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serovar Derby is a foodborne pathogen that poses an increasing threat to global public health due to its widespread distribution and increasing antimicrobial resistance (AMR). Herein, a comprehensive genomic overview of 2628 S. Derby strains isolated from 27 countries between 1905 and 2023 was performed to investigate the AMR determinants, population structure, and transmission routes. These isolates were primarily sourced from food items (1393, 53.01 %), particularly pork products (1090, 41.48 %). S. Derby isolates belonged to 21 distinct sequence types (STs), with ST40 be
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disinfectants are essential for biosecurity, preventing the persistence and spread of zoonotic pathogens on farms and subsequent human infections. In this study, transcriptomics and genomics were utilised to assess the effect of disinfectant exposure on pathogenic Escherichia coli. The exposure of E. coli O157:H7 to sub-optimal concentrations of commonly used farm disinfectants elicited changes in both the transcriptome and genome. The transcriptomics identified upregulation of >300 genes and downregulation of >100 genes with functions, which included stress response, metabolism, transcription
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stress-induced genomic changes in Candida albicans contribute to the adaptation of this species to various environmental conditions. Variations of the genome composition of animal-origin C. albicans strains are largely unexplored and drug resistance or other selective pressures driving the evolution of these yeasts remained an intriguing question. Comparative genome analysis was carried out to uncover chromosomal aneuploidies and regions with loss of heterozygosity (LOH), two mechanisms that manage genome plasticity. We detected aneuploidy only in human isolates. Bird-derived isolates showed L
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trueperella pyogenes is an opportunistic zoonotic bacterial pathogen, whose antimicrobial resistance, virulence, and genetic relatedness between strains from animals and humans are barely studied. These characteristics were therefore analyzed for clinical T. pyogenes strains from 31 animals of 11 different species and 8 humans determining their complete circular genome sequence and antimicrobial susceptibility. The MICs of 19 antimicrobials including 3 antiseptics correlated to the resistance genes identified in silico within the genomes revealing a predominance of resistance to streptomycin (
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Baloxavir marboxil (baloxavir) is an FDA-approved inhibitor of the influenza virus polymerase acidic (PA) protein. Here, we used next-generation sequencing to compare the genomic mutational profiles of IAV H1N1 and H3N2, and IBV wild type (WT) and mutants (MUT) viruses carrying baloxavir resistance-associated substitutions (H1N1-PA I38L, I38T, and E199D; H3N2-PA I38T; and IBV-PA I38T) during passaging in normal human bronchial epithelial (NHBE) cells. We determined the ratio of nonsynonymous to synonymous nucleotide mutations (dN/dS) and identified the location and type of amino acid (AA) subs
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neoscytalidium dimidiatum and Bipolaris species are fungal plant pathogens that have been reported to cause human diseases. Recently, we have isolated numerous N. dimidiatum and Bipolaris species from the skin scrapings and nails of different patients. In this work, we have sequenced the genome of one strain of N. dimidiatum. The sequenced genome was compared to that of a previously reported Bipolaris papendorfii genome for a better understanding of their complex lifestyle and broad host-range pathogenicity. Both N. dimidiatum UM 880 (~ 43 Mb) and B. papendorfii UM 226 (~ 33 Mb) genomes includ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The human epididymis is poorly studied due to the lack of availability of tissue samples. Our understanding of its structure and function depends upon anatomical and histological observations of archived material.
OBJECTIVES: Here we used single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) technologies to elucidate the identity of cells within the human efferent ducts (EDs) and compared them to caput epididymis cells. We also compared the cellularity of primary tissues with those of 2D and 3D (organoid) culture models used for functional studies.
MATERIALS AND METHODS: Human epididymis tissue
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus suis is a zoonotic pathogen that causes invasive infections in humans and pigs. Herein, we performed genomic analysis of seven S. suis serotype 4 strains belonging to clonal complex (CC) 94 that were recovered from a human patient or from diseased and clinically healthy pigs. Genomic exploration and comparisons, as well as in vitro cytotoxicity tests, indicated that S. suis CC94 serotype 4 strains are potentially virulent. Genomic analysis revealed that all seven strains clustered within minimum core genome group 3 (MCG-3) and had a high number of virulence-associated genes simil
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The evolutionary conserved NEAT1-MALAT1 gene cluster generates large noncoding transcripts remaining nuclear, while tRNA-like transcripts (mascRNA, menRNA) enzymatically generated from these precursors translocate to the cytosol. Whereas functions have been assigned to the nuclear transcripts, data on biological functions of the small cytosolic transcripts are sparse. We previously found NEAT1-/- and MALAT1-/- mice to display massive atherosclerosis and vascular inflammation. Here, employing selective targeted disruption of menRNA or mascRNA, we investigate the tRNA-like molecules as critical
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования