Single-cell multi-omics technologies capture complementary molecular layers, enabling a comprehensive view of cellular states and functions. However, integrating these data types poses significant challenges when their features are weakly linked and cell population sizes are imbalanced. Currently, no method efficiently addresses these two issues simultaneously. Therefore, we developed CelLink, a novel single-cell multi-omics data integration method designed to overcome these challenges. CelLink normalizes and smooths feature profiles to align scales across datasets and integrates them through
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Weaning is a critical phase determining post-weaning growth and economic efficiency in pig production. To unravel gut segment-specific mechanisms underlying weaning weight variation, we performed integrated transcriptomic and metabolomic analyses of the mid-jejunum, ileum, and colon in high- (HWW) and low-weaning-weight (LWW) piglets. HWW piglets showed upregulated expression of amino acid transport genes (NOS2, ASS1, GPT2), alongside elevated levels of metabolites including glycochenodeoxycholic acid (GUDCA), deoxycholic acid (GDCA), methionine, and isoleucine. In the ileum, HWW piglets exhib
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heart transplantation (HTx) remains the definitive treatment for patients with end-stage heart disease. Despite the number of HTx performed annually in worldwide continues to increase, complications of HTx still impact the quality of life and long-term prognosis, including rejection, infection, and allograft dysfunction. Endomyocardial biopsy remains the gold standard for monitoring cardiac allograft rejection post-heart transplantation, yet its invasiveness and interobserver error in histologic grading necessitate the development of novel noninvasive biomarkers to elucidate rejection mechanis
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invasive species like freshwater mussels extensively colonize water distribution systems, posing a significant threat to the safety and performance of hydraulic infrastructure. The demand for innovative technologies that balance efficacy, environmental safety, and sustainability for biofouling control is growing. This study explores the potential of potassium ferrate [Fe(VI)], a green oxidant, as an effective antifouling agent. Using Limnoperna fortunei as a model organism, we demonstrated that Fe(VI) exerts dose-dependent control over biofouling. Larval viability decreased by 62.48% (p < 0.05
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paris polyphylla (P. polyphylla), a medicinal herb valued in traditional Chinese medicine, struggles with slow growth rate and long maturation periods, hindering sustainable cultivation and commercial production-especially for polyphyllins, its key bioactive compounds. Although plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) have shown potential in enhancing crop productivity and secondary metabolite accumulation, their application in slow-growing medicinal plants like P. polyphylla remains underexplored. RESULTS: In this study, 25 strains with inorganic phosphorus-dissolving, potassium-solubiliz
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cr(VI) is widely used in industry and has high toxicity, making it one of the most common environmental pollutants. Long-term exposure to Cr(VI) can cause metabolic disorders and tissue damage. However, the effects of Cr(VI) on liver and gut microbes in fish have rarely been reported. In this study, 240 fish were randomly divided into 3 groups: the control group, low-dose Cr(VI) group (0.5 mg/L), and high-dose Cr(VI) group (2 mg/L). The mechanism by which Cr(VI) affects the enterohepatic axis of common carp was elucidated via multiomic analysis, serology, histomorphology, and physiological and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The pituitary tumor-transforming gene 1 (PTTG1), also recognized as securin, plays a crucial role in diverse biological processes, such as restraining sister chromatid segregation, facilitating DNA repair, contributing to organ development, and governing angiogenesis. Additionally, it regulates the expression and secretion of transfer factors. The epigenetic characteristics of PTTG1 suggest its potential in elucidating the progression of malignant tumors in pan-cancer. Nevertheless, the current comprehension of this relationship remains limited, necessitating further comprehensive
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicting the onset, progression, and outcome of rare and chronic neurological diseases, i.e. neuromuscular diseases, is an important goal for both clinicians and researchers and should guide clinical decision-making and personalized treatment plans. A prime example is myasthenia gravis (MG), an antibody-mediated disease that affects multiple components of the postsynaptic membrane, impairing neuromuscular transmission and producing fatigable muscle weakness. MG is characterized by several clinical phenotypes, defined by a broad spectrum of factors, which have contributed to the current lack
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Late-onset Alzheimer's disease is the leading cause of dementia worldwide, accounting for a growing burden of morbidity and mortality. Diagnosing Alzheimer's disease before symptoms are established is clinically challenging, but would provide therapeutic windows for disease-modifying interventions. Blood biomarkers, including genetics, proteins and metabolites, are emerging as powerful predictors of Alzheimer's disease at various timepoints within the disease course, including at the preclinical stage. In this review, we discuss recent advances in such blood biomarkers for determining disease
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epidemiological and clinical data have demonstrated that exposure to cadmium (Cd), a toxic heavy metal, is associated with an increased risk of female infertility. Granulosa cells, the main somatic cells comprising ovarian follicles, are one of the main targets of Cd in the ovaries. However, the mechanism by which Cd induces cytotoxicity in granulosa cells has not been fully elucidated. In this study, we exposed human ovarian granulosa cells (KGN cells) to Cd and conducted in vitro cell experiments and multi-omics (metabolomics and transcriptomics) methods to elucidate these mechanisms. Cd exp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endometriosis, characterized by the presence of active endometrial-like tissues outside the uterus, causes symptoms like dysmenorrhea and infertility due to the fibrosis of endometrial cells, which involves excessive deposition of extracellular matrix (ECM) proteins. Ubiquitination, an important post-transcriptional modification, regulates various biological processes in human diseases. However, its role in the fibrosis process in endometriosis remains unclear.
METHODS: We employed multi-omics approaches on two cohorts of endometriosis patients with 39 samples. GO terms and KEGG p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbon disulfide (CS2) is a widely used enzyme inhibitor with cytotoxic properties, commonly employed in viscose fibers and cellophane production due to its non-polar characteristics. In industry, CS2 is often removed by aeration, however, residual CS2 may enter the wastewater treatment plants, impacting the performance of nitrifying sludge. Currently, there is a notable dearth of research on the response of nitrifying sludge to CS2-induced stress. This study delves into the alterations in the performance of nitrifying sludge under short-term and long-term CS2 stress, scrutinizes the toxic eff
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The skin is a complex and dynamic organ where homeostasis is maintained through the intricate interplay between the immune system and metabolism, particularly cholesterol metabolism. Various factors such as cytokines, inflammatory mediators, cholesterol metabolites, and metabolic enzymes play crucial roles in facilitating these interactions. Dysregulation of this delicate balance contributes to the pathogenic pathways of inflammatory skin conditions, notably psoriasis. In this article, we provide an overview of omics biomarkers associated with psoriasis in relation to cholesterol metabolism. W
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasis and atopic dermatitis fall within the category of cutaneous immune-mediated inflammatory diseases (IMIDs). The prevalence of IMIDs is increasing in industrialized societies, influenced by both environmental changes and a genetic predisposition. However, the exact immune factors driving these chronic, progressive diseases are not fully understood. By using multi-omics techniques in cutaneous IMIDs, it is expected to advance the understanding of skin biology, uncover the underlying mechanisms of skin conditions, and potentially devise precise and personalized approaches to diagnosis an
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reliable biomarkers for common disorders of gut-brain interaction characterized by abdominal pain, including irritable bowel syndrome (IBS), are critically needed to enhance care and develop individualized therapies. The dynamic and heterogeneous nature of the pathophysiological mechanisms that underlie visceral hypersensitivity have challenged successful biomarker development. Consequently, effective therapies for pain in IBS are lacking. However, recent advances in modern omics technologies offer new opportunities to acquire deep biological insights into mechanisms of pain and nociception. N
ОбзорСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several genetic defects, including a mutation in myosin heavy chain 11 (Myh11), are reported to cause familial thoracic aortic aneurysm and dissection (FTAAD). We recently showed that mice lacking K1256 of Myh11 developed aortic dissection when stimulated with angiotensin II, despite the absence of major pathological phenotypic abnormalities prior to stimulation. In this study, we used a comprehensive, data-driven, unbiased, multi-omics approach to find underlying changes in transcription and metabolism that predispose the aorta to dissection in mice harboring the Myh11 K1256del mutation. Path
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: Hepatic fibrosis is a common pathogenic outcome of almost all chronic liver diseases and a growing public health problem globally. However, the key genes or proteins driving liver fibrosis and cirrhosis are not well understood. We aimed to identify novel hepatic fibrosis genes of human primary hepatic stellate cells (HSCs).
METHODS: Human primary HSCs were isolated from surgically resected advanced fibrosis liver tissues (n = 6) and surgical resection of normal liver tissue around hemangioma (n = 5). Differences in the expression levels of mRNA and proteins from HSCs in ad
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human mouth, or oral cavity, is at the crossroads of our external and internal environments, and it is increasingly evident that local colonization of dental, oral, and craniofacial (DOC) tissues and cells by bacteria and viruses may also have systemic effects across myriad diseases and disorders. Better understanding of this phenomenon will require a holistic understanding of host-microbial interactions in both spatiotemporal and biogeographical contexts while also considering person-, organ-, tissue-, cell-, and molecular-level variation. After the acute phase interaction with microbes,
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advances in our understanding of the nature of the immune response to SARS-CoV-2 infection, and how this varies within and between individuals, is important in efforts to develop targeted therapies and precision medicine approaches. Here we present a database for the COvid-19 Multi-omics Blood ATlas (COMBAT) project, COMBATdb (https://db.combat.ox.ac.uk). This enables exploration of multi-modal datasets arising from profiling of patients with different severities of illness admitted to hospital in the first phase of the pandemic in the UK prior to vaccination, compared with community cases, he
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 has led to a devastating global health crisis, which emphasizes the urgent need to deepen our understanding of the molecular mechanism and identifying potential antiviral drugs. Here, we comprehensively analyzed the transcriptomic and proteomic profiles of 178 COVID-19 patients, ranging from asymptomatic to critically ill. Our analyses found that the RNA binding proteins (RBPs) were likely to be perturbed in infection. Interactome analysis revealed that RBPs interact with virus proteins and the viral interacting RBPs were likely to locate in central regions of human protein-protei
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования