The appropriate repair of DNA double strand breaks is critical for genome maintenance. Thus, several cellular pathways collaborate to orchestrate a coordinated response. These include the repair of the breaks, which could be achieved by different mechanisms. A key protein involved in the regulation of the repair of broken chromosomes is CtIP. Here, we have found new partners of CtIP involved in the regulation of DNA break repair through affecting DNA end resection. We focus on the splicing complex SF3B and show that its depletion impairs DNA end resection and hampers homologous recombination.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aicardi-Goutières syndrome (AGS) is a severe infant or juvenile-onset autoimmune disease characterized by inflammatory encephalopathy with an elevated type 1 interferon-stimulated gene (ISG) expression signature in the brain. Mutations in seven different protein-coding genes, all linked to DNA/RNA metabolism or sensing, have been identified in AGS patients, but none of them has been demonstrated to activate the IFN pathway in the brain of an animal. The molecular mechanism of inflammatory encephalopathy in AGS has not been well defined. Adenosine Deaminase Acting on RNA 1 (ADAR1) i
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autophagy and endocytosis are dynamic and tightly regulated processes that contribute to many fundamental aspects of biology including survival, longevity, and development. However, the molecular links between autophagy and endocytosis are not well understood. Here, we report that BEC-1, the C. elegans ortholog of Atg6/Vps30/Beclin1, a key regulator of the autophagic machinery, also contributes to endosome function. In particular we identify a defect in retrograde transport from endosomes to the Golgi in bec-1 mutants. MIG-14/Wntless is normally recycled from endosomes to the Golgi through the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Saccharomyces cerevisiae Rad1-Rad10 (XPF-ERCC1 in humans) is a 3'-flap endonuclease with key roles in DNA repair. Pathway-specific repair factors determine its recruitment to specific DNA substrates. Saw1 recruits it to 3' non-homologous tail recombination intermediates, while Rad14 recruits it to UV-lesions repaired by nucleotide excision repair. However, the exact recruitment mechanisms are unknown. We determined the cryo-EM structure of the Rad1-Rad10-Saw1 complex at 3.7 Å resolution. The structure reveals that Saw1 wraps around the helicase-like domain of Rad1 defining an extensive interfa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hematophagous insects transmit infectious diseases. Sand flies are vectors of leishmaniasis, but can also transmit viruses. We have been studying immune responses of Lutzomyia longipalpis, the main vector of visceral leishmaniasis in the Americas. We identified a non-specific antiviral response in L. longipalpis LL5 embryonic cells when treated with non-specific double-stranded RNAs (dsRNAs). This response is reminiscent of interferon response in mammals. We are investigating putative effectors for this antiviral response. Secreted molecules have been implicated in immune responses, including
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Airway epithelial cells are important regulators of innate and adaptive immunity. Although mast cells are known to play a central role in manifestations of allergic inflammation and are found in the epithelium in patients with T(H)2-related diseases, their role is incompletely understood.
OBJECTIVES: The objective of this study was to investigate the role of airway epithelial cells in the production of T(H)2 cytokines in mast cells.
METHODS: Normal human bronchial epithelial (NHBE) cells were stimulated with TNF, IL-4, IFN-γ, IL-17A, and double-stranded RNA (dsRNA) alone or in co
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type I interferons (IFNs) include IFNalpha and IFNbeta, both of which are elevated in acute viral infections and both of which have been shown to induce symptoms such as fever and somnolence when administered in pharmacological doses. To investigate the role of type I IFNs in mediation of acute respiratory viral symptoms we examined sleep and body temperature responses in mice with a targeted mutation of the IFN receptor type I (IFN-RI knockouts). IFN-RI knockouts (KOs) or wild-type 129 SvEv controls were challenged intratracheally (IT) with combined poly[rI.rC] (synthetic double-stranded RNA)
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
R-spondin1 (Rspo1) is a member of the secreted furin-like domain-containing protein family, and it is recognized for its significance in mammalian ovarian development. However, its role in teleost ovarian development remains largely uninvestigated. The Qi River crucian carp (Carassius auratus) is a species capable of gynogenesis, and it encounters challenges of premature ovarian maturation in aquaculture settings. Previous research established the essential involvement of Rspo1 in oocyte growth in Qi River crucian carp, but the precise molecular mechanisms underlying its role remain poorly und
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Smooth muscle cell (SMC) phenotypic switching has been increasingly detected in aortic aneurysm and dissection (AAD) tissues. However, the diverse SMC phenotypes in AAD tissues and the mechanisms driving SMC phenotypic alterations remain to be identified.
METHODS: We examined the transcriptomic and epigenomic dynamics of aortic SMC phenotypic changes in mice with angiotensin II-induced AAD by using single-cell RNA sequencing and single-cell sequencing assay for transposase-accessible chromatin. SMC phenotypic alteration in aortas from patients with ascending thoracic AAD was exami
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Adult-onset Still's disease (AOSD) is a severe autoinflammatory disease. Neutrophil activation with enhanced neutrophil extracellular trap (NET) formation is involved in the pathogenesis of AOSD. Functional leukocyte immunoglobulin-like receptor A3 (LIR-A3; gene name LILRA3) has been reported to be associated with many autoimmune diseases. We aimed to investigate the association of LILRA3 with disease susceptibility and neutrophil activation in AOSD.
METHODS: The LILRA3 deletion polymorphism and its tagging single-nucleotide polymorphism rs103294 were genotyped in 164 patients with
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flaviviruses are arthropod-borne viruses found worldwide and are responsible for significant human and veterinary diseases, including dengue, Zika, and West Nile fever. Some flaviviruses are insect specific and replicate only in mosquitoes. We report a genetically divergent group of insect-specific flaviviruses from Anopheles mosquitoes that do not replicate in arthropod cell lines or heterologous Anopheles species, exhibiting unprecedented specialization for their host species. Determination of the complete sequences of the RNA genomes of three of these viruses, Karumba virus (KRBV), Haslams
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Base editors are regarded as reliable and precise editing tools due to their ability to efficiently and accurately modify the target genes without inducing double-strand breaks (DSBs). Notably, base editors offer distinct advantages in base editing, particularly in multiplex gene editing. However, application of base editors in the filamentous fungus Trichoderma remains underdeveloped. In this study, two cytosine base editors (CBE), designated as rAPOBEC1-CBE and mini-SDD7-CBE, respectively, were constructed in Trichoderma koningiopsis. Three targets related with cellulase production were chos
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CRISPR/Cas12a system has emerged as a highly useful tool for genomic editing due to its ability to process multiple guide RNAs (gRNAs) from a single promoter. In this study, we explored the potential of combinatorial CRISPR/Cas12a to excise targeted loci in the mammalian genome by inducing double-strand breaks (DSBs) upstream and downstream of targeted exons. We designed a library of gRNA pairs targeting introns flanking 54 exons of 18 essential genes and 17 exons of 10 nonessential genes, aiming to assess the efficiency of Cas12 in excising targeted loci. While single gRNAs directly targe
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many viruses, including mammarenaviruses, have evolved mechanisms to counteract different components of the host cell innate immunity, which is required to facilitate robust virus multiplication. The double strand (ds)RNA sensor protein kinase receptor (PKR) pathway plays a critical role in the cell antiviral response. Whether PKR can restrict the multiplication of the Old World mammarenavirus lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) and the mechanisms by which LCMV may counteract the antiviral functions of PKR have not yet been investigated. Here we present evidence that LCMV infection resul
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ATM is an important cancer susceptibility gene that encodes a critical apical kinase of the DNA damage response (DDR) pathway. We show that a key nonsense-mediated RNA decay switch exon (NSE) in ATM is repressed by U2AF, PUF60 and hnRNPA1. The NSE activation was haplotype-specific and was most promoted by cytosine at rs609621 in the NSE 3' splice-site (3'ss), which is predominant in high cancer risk populations. NSE levels were deregulated in leukemias and were influenced by the identity of U2AF35 residue 34. We also identify splice-switching oligonucleotides (SSOs) that exploit competition of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rubella virus (RV), a member of Togaviridae, is an important human pathogen that can cause severe defects in the developing fetus. Compared to other togaviruses, RV replicates very slowly suggesting that it must employ effective mechanisms to delay the innate immune response. A recent study by our laboratory revealed that the capsid protein of RV is a potent inhibitor of apoptosis. A primary mechanism by which RV capsid interferes with programmed cell death appears to be through interaction with the pro-apoptotic Bcl-2 family member Bax. In the present study, we report that the capsid protein
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This short review article on some pertinent observations in the unfolding story of interferon is dedicated to Professor Ilona Béládi on the occasion of her 80th birthday. This by no means covers the whole story on interferon. It just highlights some of the more striking findings made with interferon (or its inducers) over a time span of almost 50 years since its original discovery (in 1957) by Isaacs and Lindenmann. These observations concern (i) the induction of interferon by synthetic polyanions such as polyacrylic acid and polymethacrylic acid; (ii) the prolonged antiviral activity shown by
БиографияИсторическая статьяСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Giardia duodenalis (G. duodenalis) is a prevalent intestinal protozoan parasite responsible for causing diarrhea, particularly in children and travelers. Although many infections are asymptomatic, they can result in severe malnutrition and cognitive developmental impairments in pediatric populations. Giardia lamblia virus (GLV) is a protozoan virus that specifically infects G. duodenalis. This virus is characterized by its non-segmented, non-enveloped double-stranded RNA structure and contains essential proteins such as RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and capsid protein (GLVCP). While the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reverse genetic systems have been used to introduce heterologous sequences into the rotavirus segmented double-stranded (ds)RNA genome, enabling the generation of recombinant viruses that express foreign proteins and possibly serve as vaccine vectors. Notably, insertion of SARS-CoV-2 sequences into the segment seven (NSP3) RNA of simian SA11 rotavirus was previously shown to result in the production of recombinant viruses that efficiently expressed the N-terminal domain (NTD) and the receptor-binding domain (RBD) of the S1 region of the SARS-CoV-2 spike protein. However, efforts to generate a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenosine deaminase acting on RNA 2 (ADAR2), an RNA editing enzyme is involved in a site-selective modification of adenosine (A) to inosine (I) in double-stranded RNA (dsRNA). Its role in the lungs is unknown. The phenotypic characterization of Adarb1 mice that lacked ADAR2 auto-regulation due to the deletion of editing complementary sequence (ΔECS mice) determined the functional role of ADAR2 in the lungs. ADAR2 protein expression increased in the ΔECS mice. These mice display immune cell infiltration and alveolar disorganization. The lung wet by dry ratio indicates there is no lung edema in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования