During the transit through the oviduct, the early embryo initiates an extensive DNA methylation reprogramming of its genome. Given that these epigenetic modifications are susceptible to environmental factors, components present in the oviductal milieu could affect the DNA methylation marks of the developing embryo. The aim of this study was to examine if culture of bovine embryos with oviductal fluid (OF) can induce DNA methylation changes at specific genomic regions in the resulting blastocysts. In vitro produced zygotes were cultured in medium with 3 mg/mL bovine serum albumin (BSA) or 1.25%…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As a universally common endocrinopathy in women of reproductive age, the polycystic ovarian syndrome is characterized by composite clinical phenotypes reflecting the contributions of reproductive impact of ovarian dysfunction and metabolic abnormalities with widely varying symptoms resulting from interference of the genome with the environment through integrative biological mechanisms including epigenetics. We have performed a genome-wide DNA methylation analysis on polycystic ovarian syndrome and identified a substantial number of genomic sites differentially methylated in the whole blood of …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The association of in vitro fertilisation (IVF) and DNA methylation has been studied predominantly at regulatory regions of imprinted genes and at just thousands of the ~28 million CpG sites in the human genome.
METHODS: We investigated the links between IVF and DNA methylation patterns in whole cord blood cells (n = 98) and cord blood mononuclear cells (n = 82) from newborn twins using genome-wide methylated DNA immunoprecipitation coupled with deep sequencing.
RESULTS: At a false discovery rate (FDR) of 5%, we identified one significant whole blood DNA methylation change linked…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Gestational diabetes mellitus (GDM) has always been a concerning issue for pregnant women. In recent studies, GDM was found to be rela … to GDM. GDM was diagnosed via a 75g oral glucose tolerance test (OGTT) at 24-28weeks of pregnancy. DNA methylation was measured at 841,573 CpG sites via the Infinium HumanMethylationEPIC BeadChip. An Ingenuity Pathway Analysis was conducted afterwards to identify genes and pathways epigenetically affected by GDM.
RESULTS: We identified the top 200 loci and thei …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
E-cadherin, a calcium-dependent cell-cell adhesion molecule, has an important role in epithelial cell function, maintenance of tissue architecture and cancer suppression. Loss of E-cadherin promotes tumor metastatic dissemination and predicts poor prognosis. The present study investigated the clinicopathological significance of E-cadherin expression in cutaneous, mucosal and uveal melanoma related to epigenetic mechanisms that may contribute to E-cadherin silencing. E-cadherin expression was reduced in 55/130 cutaneous (42.3%), 49/82 mucosal (59.7%) and 36/64 uveal (56.2%) melanoma samples as
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several lines of evidence indicate one's age at exposure to radiation strongly modifies the risk of radiation-induced breast cancer. We previously reported that rat mammary carcinomas induced by pre- and post-pubertal irradiation have distinct gene expression patterns, but the changes underlying these differences have not yet been characterized. The aim of this investigation was to see if differences in CpG DNA methylation were responsible for the differences in gene expression between age at exposure groups observed in our previous study. DNA was obtained from the mammary carcinomas arising i…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Methadone maintenance treatment is characterized by large interindividual dose variability. The aim of this study was to evaluate whether DNA methylations are associated with daily dose of methadone.
MATERIALS & METHODS: Subjects stabilized at high (n = 12) or low (n = 12) methadone doses were selected from two independent cohorts (French and Swiss). DNA methylation patterns were analyzed using HumanMethylation450 BeadChips.
RESULTS: In total, 584 differentially methylated sites were identified in the French cohort corresponding to 352 genes. Of these, 26 were replicated in the Swiss co…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aberrant DNA methylation status early in carcinogenesis represents a potential indicator of tumor detection. We would like to establish a DNA methylation biomarker panel for bladder cancer detection in the research.
METHODS: Seven candidate genes with known cancer associations were selected for this study. The DNA methylation status of the candidate genes was analyzed by methylation-specific polymerase chain reaction assays to evaluate the relationship between bladder cancer and target gene methylation status in the urine sediments of participants.
RESULTS: 112 bladder cancer pat…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies have identified twenty loci associated with late-onset Alzheimer disease (LOAD). We examined each of the twenty loci, specifically the ±50kb region surrounding the most strongly associated variant, for changes in gene(s) transcription specific to LOAD. Post-mortem human brain samples were examined for expression, methylation, and splicing differences. LOAD specific differences were detected by comparing LOAD to normal and "disease" controls. Eight loci, prominently ABCA7, contain LOAD specific differences. Significant changes in the CELF1 and ZCWPW1 loci occurre
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Experience-dependent plasticity is the ability of brain circuits to undergo molecular, structural and functional changes as a function of ne … NA in activity-induced remodeling of neuronal circuits. Here, we provide an overview of the role of DNA methylation and hydroxylmethylation in brain plasticity both during adulthood, with emphasis on learning and memory related processes, and during postnatal development, focusing specifically on experience-dependent plasticity in the visual cortex.
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Autism spectrum disorder (ASD) is associated with preterm birth (PTB), although the reason underlying this relationship is still unclear. Our objective was to examine DNA methylation patterns of 4 ASD candidate genes in human fetal membranes from spontaneous PTB and uncomplicated term birth.
STUDY DESIGN: A literature search for genes that have been implicated in ASD yielded 14 candidate genes (OXTR, SHANK3, BCL2, RORA, EN2, RELN, MECP2, AUTS2, NLGN3, NRXN1, SLC6A4, UBE3A, GABA, AFF2) that were epigenetically modified in relation to ASD. DNA methylation in fetal leukocyte DNA in 4 …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Testing for high-risk (hr) types of human papillomavirus (HPV) is highly sensitive as a screening test of high-grade cervical intraepithelial neoplastic (CIN2/3) disease, the precursor of cervical cancer. However, it has a relatively low specificity. Our objective was to develop a prediction rule with a higher specificity, using combinations of human and HPV DNA methylation. Exfoliated cervical specimens from colposcopy-referral cohorts in London were analyzed for DNA methylation levels by pyrosequencing in the L1 and L2 regions of HPV16, HPV18, HPV31 and human genes EPB41L3, DPYS and MAL. Sam…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation studies have elucidated a methylation signature distinguishing primary melanomas from benign nevi and provided new insights about genes that may be important in melanoma development. However, it is unclear whether methylation differences among primary melanomas are related to tumor pathologic features with known clinical significance. We utilized the Illumina GoldenGate Cancer Panel array to investigate the methylation profiles of 47 primary cutaneous melanomas. Arraywide methylation patterns revealed a positive association of methylation with Breslow thickness and mutated BRAF…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Treatment of pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) has improved, but there is a considerable fraction of patients experiencing a poor outcome. There is a need for better prognostic markers and aberrant DNA methylation is a candidate in other malignancies, but its potential prognostic significance in T-ALL is hitherto undecided.
DESIGN AND METHODS: Genome wide promoter DNA methylation analysis was performed in pediatric T-ALL samples (n = 43) using arrays covering >27000 CpG sites. Clinical outcome was evaluated in relation to methylation status and compared with a …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In utero environmental perturbations have been associated with epigenetic changes in the offspring and a lifelong susceptibility to cardiovascular diseases (CVD). DNA methylation at the ATP-binding cassette transporter A1 (ABCA1) gene was previously associated with CVD, but whether these epigenetic marks respond to changes in the maternal environment is unknown. This study was undertaken to assess the associations between the maternal metabolic profile and ABCA1 DNA methylation levels in placenta and cord blood. Placenta and cord blood samples were obtained at delivery from 100 women including…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer clusters within families but genetic factors identified to date explain only a portion of this clustering. Lower global DNA methylation in white blood cells (WBC) has been associated with increased breast cancer risk. We examined whether WBC DNA methylation varies by extent of breast cancer family history in unaffected women from high-risk breast cancer families. We evaluated DNA methylation levels in LINE-1, Alu and Sat2 in 333 cancer-free female family members of the New York site of the Breast Cancer Family Registry, the minority of which were known BRCA1 or BRCA2 mutation car…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Few studies have evaluated the association between DNA methylation in white blood cells (WBC) and the risk of breast cancer. The evaluation of WBC DNA methylation as a biomarker of cancer risk is of particular importance as peripheral blood is often available in prospective cohorts and easier to obtain than tumor or normal tissues. Here, we used prediagnostic blood samples from three studies to analyze WBC DNA methylation of two ATM intragenic loci (ATMmvp2a and ATMmvp2b) and genome-wide DNA methylation in long interspersed nuclear element-1 (LINE1) repetitive elements. Samples were from a cas…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Changes in DNA copy number (CN) and DNA methylation represent important aberrations for lymphomas and other cancers. Here, for the first time, we show that the Illumina Infinium Methylation (IIM) assay, although not originally designed for CN profiling, is able to estimate CN changes. We compared the IIM CN profiles to those obtained with a standard technique in a series of diffuse large B-cell lymphomas: the profiles showed a high degree of consensus. The demonstration of CN profiling as an additional function of the IIM assay may impact the choice of platform for methylation profiling of hae…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV) is associated with Burkitt lymphoma, nasopharyngeal carcinoma, opportunistic lymphomas in immunocompromised hosts, … epigenotype gastric cancer cell, MKN7, 3 independently established subclones displayed increases in DNA methylation. The promoters targeted by methylation were mostly shared among the 3 subclones, and the new methylation changes caused gene repression. In summary, DNA methylation profiling classified gastric cancer into 3 epigenotypes, and EBV(+) gastric cancers …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mantle cell lymphoma (MCL) is a mostly incurable malignancy arising from naive B cells (NBCs) in the mantle zone of lymph nodes. We analyzed genomewide methylation in MCL patients with the HELP (HpaII tiny fragment Enrichment by Ligation-mediated PCR) assay and found significant aberrancy in promoter methylation patterns compared with normal NBCs. Using biologic and statistical criteria, we further identified 4 hypermethylated genes CDKN2B, MLF-1, PCDH8, and HOXD8 and 4 hypomethylated genes CD37, HDAC1, NOTCH1, and CDK5 when aberrant methylation was associated with inverse changes in mRNA leve
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования