Melioidosis and leptospirosis, caused by two different bacteria, Burkholderia pseudomallei and Leptospira spp., are potentially fatal infections that share a very similar spectrum of clinical features and cause significant mortality and morbidity in humans and livestock. Early detection is important for better clinical consequences. To our knowledge, there is no diagnostic tool available to simultaneously detect and differentiate melioidosis and leptospirosis in humans and animals. In this study, we described a duplex TaqMan probe-based qPCR for the detection of B. pseudomallei and Leptospira
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida auris is an emerging multidrug resistant pathogenic fungus that causes candidaemia with high mortality rates and exhibits the ability to persist within the hospital environment. Candida auris is phylogenetically closely related to Candida haemulonii, C. lusitaniae, C. pseudohaemulonii and C. duobushaemulonii and is frequently misidentified by commercial identification methods. In the present study, the GPS™ MONODOSE dtec-qPCR kit (dried single-dose PCR tubes) for the detection of C. auris was validated following the guidelines of the UNE/EN ISO/IEC 17025:2005, the French Standard NF T9
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasma gondii is an obligatory intracellular protozoon parasite that causes toxoplasmosis in humans and all warm-blooded animals. In this study, we aimed to investigate the presence of T. gondii DNA in a Eurasian badger (Meles meles) that was found dead in the wildlife area of Izmir. According to the results of real time polymerase chain reaction, T. gondii REP gene was found to be positive in the Eurasian badger brain homogenate. In conclusion, Eurasian badger, a known carnivore, can be a potential source of toxoplasmosis in the natural settings of İzmir, Turkey.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we aimed to investigate the incidence of Dientamoeba fragilis with different diagnostic methods in patients with gastrointestinal symptoms and determine the sensitivity and specificity of existing diagnostic methods. Fecal samples collected from 101 patients with gastrointestinal complaints (especially upper abdominal pain, abdominal and pelvic pain, nausea and vomiting, gastroenteritis and colitis, unexplained fever and diarrhea) and 20 control cases from various clinics were included in the study. Samples were first examined with native-Lugol (N-L) method and cultured in Robin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Detecting the presence of a parasite within its host is crucial to the study of host-parasite interactions. The Schistocephalus solidus-threespine stickleback pair has been studied extensively to investigate host phenotypic alterations associated with a parasite with a complex life cycle. This cestode is localized inside the stickleback's abdominal cavity and can be visually detected only once it passes a mass threshold. We present a non-lethal quantitative PCR (qPCR) approach based on detection of environmental DNA from the worm (eDNA), sampled in the fish abdominal cavity. Using this approac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the present study, we developed a phage-based real-time quantitative PCR (qPCR) methodology for sensitive diagnosis of bloodstream infection (BSI) caused by Acinetobacter baumannii (A. baumannii). An isolated A. baumannii phage p53 was used for Taqman qPCR through detecting phage replication in live A. baumannii cells in serum samples. At the phage concentration of 103 PFU/mL, the sensitive detection of A. baumannii (down to 10 CFU in 100 μL serum) has been obtained within 4 h in spiked serum samples without bacteria isolation and DNA extraction. Subsequent testing of 22 simulated serum sam
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mouthrot, caused by Tenacibaculum maritimum is a significant disease of farmed Atlantic salmon, Salmo salar on the West Coast of North America. Smolts recently transferred into saltwater are the most susceptible and affected fish die with little internal or external clinical signs other than the characteristic small (usually < 5 mm) yellow plaques that are present inside the mouth. The mechanism by which these smolts die is unknown. This study investigated the microscopic pathology (histology and scanning electron microscopy) of bath infected smolts with Western Canadian T. maritimum isolates
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human adenoviruses (HAdVs) are a major cause of infection and have been proposed as viral indicators of water quality. Human noroviruses (NoV) are the main cause of viral acute gastroenteritis. Quantitative data on the environmental prevalence of both viruses are needed. The genomes of HAdVs enteric adenovirus type 41 (HAdV41) and noroviruses of genogroups I and II (NoV GGI and GGII) were quantified over a 6-month period in a river located in north-eastern France. The samples were collected downstream from the discharge of a wastewater treatment plant. The viruses were concentrated using a gla
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Early diagnosis of leptospirosis is important for ensuring better clinical management and achieving better outcomes. Currently, serological assays suffer from inconsistent performance and are less useful for early diagnosis of leptospirosis. As an alternative, qPCR is more sensitive, specific and able to detect the presence of leptospiral DNA during the acute phase of the infection. Meanwhile, most molecular assays do not detect the non-pathogenic group of Leptospira, even though these groups may also infect humans, although less frequently and less severely.
METHODS: A set of pri
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The last fifteen years brought a revolution both in treatment and diagnostics of chronic myeloid leukemia. Nowadays, the main method for monitoring of the disease is molecular monitoring with real-time PCR technology which can indicate treatment modification. With the development of the international scale and inter-laboratory standardization the residual tumor mass can be measured accurately and the results are comparable between the different laboratories. By the growing experience in the field of molecular responses we can now accurately predict treatment outcome early on with the so called
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dirofilaria immitis is a mosquito-borne pathogen that is spreading worldwide, and the associated infection (i.e. dirofilariosis) is becoming a threat to animals and humans living in endemic areas. Little is known about the occurrence and risk of infection of D. immitis in pinnipeds. Here we report dirofilariosis by D. immitis in several pinniped species kept in captivity in Portugal.
METHODS: Animals were housed in an oceanographic park located in Algarve, southern Portugal, a geographical area endemic for canine dirofilariosis. To assess the occurrence of D. immitis, blood was co
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The prevalence of the Histoplasma capsulatum var. capsulatum (Hcc) histoplasmosis may be underestimated West Africa, both because the diagnosis is not mentioned in the early stages of the disease and due to limited biological resources available.
CASE REPORT: We report a case of disseminated histoplasmosis due to Hcc in a Senegalese HIV patient. The diagnosis was suspected following the demonstration of small encapsulated yeasts within neutrophils on a thin blood smear. It was further confirmed using a specific real-time PCR applied on a DNA specimen extracted from the thin blood
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate quantitative measurement of viable hookworm ova from environmental samples is the key to controlling hookworm re-infections in the endemic regions. In this study, the accuracy of three quantitative detection methods [culture-based, vital stain and propidium monoazide-quantitative polymerase chain reaction (PMA-qPCR)] was evaluated by enumerating 1,000 ± 50 Ancylostoma caninum ova in the laboratory. The culture-based method was able to quantify an average of 397 ± 59 viable hookworm ova. Similarly, vital stain and PMA-qPCR methods quantified 644 ± 87 and 587 ± 91 viable ova, respective
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic memory affects the timing of bud burst phenology and the expression of bud burst-related genes in genetically identical Norway spruce epitypes in a manner usually associated with ecotypes. In Norway spruce, a temperature-dependent epigenetic memory established during embryogenesis affects the timing of bud burst and bud set in a reproducible and predictable manner. We hypothesize that the clinal variation in these phenological traits, which is associated with adaptation to growth under frost-free conditions, has an epigenetic component. In Norway spruce, dehydrins (DHNs) have been a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucella ceti and Brucella pinnipedialis have been documented as occurring in marine mammals, and B. ceti has been identified in 3 naturally acquired human cases. Seroconversion and infection patterns in Pacific Northwest harbor seals ( Phoca vitulina richardii) and North Atlantic hooded seals ( Cystophora cristata) indicate post-weaning exposure through prey consumption or lungworm infection, suggesting fish and possibly invertebrates play an epizootiologic role in marine Brucella transmission and possible foodborne risk to humans. We determined if real-time quantitative PCR (qPCR) assays can
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Understanding and quantifying the sources and implications of error in the measurement of helminth egg intensity using Kato-Katz (KK) and the newly emerging "gold standard" quantitative polymerase chain reaction (qPCR) technique is necessary for the appropriate design of epidemiological studies, including impact assessments for deworming programs.
METHODS: Repeated measurements of Ascaris lumbricoides infection intensity were made from samples collected in western Kenya using the qPCR and KK techniques. These data were combined with data on post-treatment worm expulsions. Random e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
California sea lion adenovirus 1 (CSLAdV-1) has been associated with hepatitis and enteritis in several wild and captive populations of diverse pinniped species. Currently available tests have been limited to pan-adenoviral polymerase chain reaction (PCR) followed by sequencing. We present the development of a quantitative probe-hybridization PCR (qPCR) assay for rapid, sensitive, and specific detection of this virus in California sea lions ( Zalophus californianus) and other pinnipeds. This assay did not amplify other mammalian adenoviruses and is able to detect consistently down to 10 viral
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Foodborne illnesses associated with contaminated fresh produce are a common public health problem and there is an upward trend of outbreaks caused by enteric viruses, especially human noroviruses (HNoVs) and hepatitis A virus (HAV). This study aimed to assess the use of DNase and RNase coupled to qPCR and RT-qPCR, respectively, to detect intact particles of human adenoviruses (HAdVs), HNoV GI and GII and HAV in fresh produce. Different concentrations of DNase and RNase were tested to optimize the degradation of free DNA and RNA from inactivated HAdV and murine norovirus (MNV), respectively. Re
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenoviral vector production for therapeutic applications is a well-established routine process. However, current methods for measurement of adenovirus particle titers as a quality characteristic require highly purified virus preparations. While purified virus is typically obtained in the last step of downstream purification, rapid and reliable methods for adenovirus particle quantification in intermediate products and crude lysates to allow for optimization and validation of cell cultures and intermediate downstream processing steps are currently not at hand. Light scattering is an establishe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: 5-Aminolevulinic acid photodynamic therapy (5-ALA-PDT) for condylomata acuminate (CA) is effective and safe, but how this treatment affects immune reaction is poorly understood. We aimed to explore the effects of PDT on local immunity in CA.
PATIENTS AND METHODS: Immunohistochemical analysis before and after PDT was performed to analyze local changes in the distribution of T lymphocytes, CD123+ plasmacytoid dendritic cells (pDCs) and CD1a+ myeloid DCs. Quantitative Real-time PCR (qRT-PCR) was used to detect changes in mRNA levels of interferon (IFN), ISG-15, Mx-2, TLR9, and IRF7.
СтатьяОтозванная публикацияПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.