OBJECTIVE: To determine the relative frequencies of reinfection vs. reactivation or treatment failure in patients from a high tuberculosis incidence setting with a low prevalence of HIV infection.
METHOD: We performed DNA fingerprinting on serial isolates from one and multiple TB episodes from 97 retreatment patients; 35 patients had been previously cured, whereas 62 had not.
RESULTS: DNA fingerprinting patterns of recurrence Mycobacterium tuberculosis isolates of 5 of the 35 previously cured patients did not match with those of the corresponding initial isolates, indicating reinfection. We …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PCR-based genomic fingerprinting by use of enterobacterial repetitive intergenic consensus primers (ERIC-PCR) was evaluated for its use in fingerprinting DNA of mixed Gram-negative bacterial strains and BIOLOG Gram-negative (GN) microplate substrate communities. ERIC-PCR fingerprints of six different pure bacterial strains and a combined mixture of the strains were compared with fingerprints obtained by two more established methods: amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) and random amplified polymorphic DNA analysis (RAPD-PCR). The ERIC-PCR fingerprint of the mixed strains was hi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A case report is presented of monozygotic twins with variable expression of hypodontia. DNA fingerprinting was used to confirm monozygosity, and this evidence supports the theory that genetic coding is not the sole controlling factor in tooth agenesis. It is suggested that DNA fingerprinting should be considered the gold standard for determination of monozygosity.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The highly leukotoxic JP2 clone of Actinobacillus actinomycetemcomitans is strongly associated with aggressive periodontitis in adolescents of African descent. DNA fingerprinting using the frequently cutting restriction enzyme MspI and multilocus sequence typing (MLST) showed that five strains of this clone were genetically virtually identical, although ribotyping of the six rrn genes and EcoRI RFLP analysis of the seven IS150-like elements revealed differences. PCR analyses demonstrated that these multi-copy sequences are subject to intragenomic homologous recombination, resulting in transloc…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study aimed to determine intra-patient colonization patterns of Helicobacter pylori strains based on DNA fingerprinting and antibiotic susceptibility.
METHODS: Two biopsies, one from the antrum and one from the body of the stomach, were taken from 97 patients. Prior informed consent was obtained. The status of cagA gene of H. pylori strains was analysed by using the polymerase chain reaction (PCR) technique, while DNA fingerprints were generated by PCR-based, random amplified polymorphic DNA (RAPD) fingerprinting. The antibiotic susceptibility of the H. pylori isolates was ex…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 7-kb linear plasmid, harbored by a URA5 transformant, hybridized to all the chromosomes of Cryptococcus neoformans separated by contour-clamped homogeneous electric field electrophoresis. Its linear maintenance was determined to have been facilitated by the presence of telomere-like sequences at its free ends. Hybridization of this plasmid to AccI-digested genomic DNAs of 26 C. neoformans strains generated 21 unique DNA fingerprints. The DNA fingerprints of isolates within the same serotype were more similar to one another than to those from different serotypes. An acapsular clinical isolate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A total of 217 and 73 strains of Salmonella enterica serotype Typhi isolated from 1985 to 1997 in Hong Kong and in 2 months of 1989 and 1990 in Vietnam, respectively, were studied. These isolates were typed by plasmid profile analysis, plasmid fingerprinting, ribotyping with PstI, and total DNA fingerprinting with NarI. There appeared to be no major outbreak of typhoid fever in Hong Kong during the study period since there was considerable heterogeneity among the isolates. Isolates from Hong Kong were different from those from Vietnam. Thirty-seven percent of Vietnamese isolates belonged to tw…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To determine whether there is diversity among clinical isolates of Helicobacter pylori in Chinese patients with peptic ulcer disease, 40 strains of H. pylori were isolated from antral biopsy specimens obtained at the gastroenterology clinic of Xiangya Hospital from January 1996 to June 1998. Total protein profile by sodium dodecyl sulphate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and DNA diversity by polymerase chain reaction-random amplified polymorphic DNA (PCR-RAPD) fingerprinting were performed with these isolates. All the isolates from peptic ulcer disease were relatively homogeneous
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biorepository processing includes nucleic acid extractions in batch mode from a large number of blood samples from many different donors. Ha … ity of isolating DNA directly from blood collected in PAXgene RNA tubes for use as template for STR DNA fingerprinting for blood donor identity verification. We determined that DNA extraction can be performed manually with the QIAamp DNA Blood Minikit or on the QIAxtractor instrument with minimal pre-processing protocol additions, and that DNA isolated from blood co …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PCR-based DNA fingerprinting was used to characterize 48 clinical isolates of Yersinia enterocolitica. The samples were examined by random amplified polymorphic DNA (RAPD-PCR) and inter-repeat PCR (IR-PCR). IR-PCR with two enterobacterial repetitive intergenic consensus primers resulted in patterns which were poorly discriminated; 2 of 11 arbitrary primers (RAPD-PCR) provided sufficient discriminatory power. In comparisons with serotyping and biotyping, RAPD-fingerprinting was the most discriminatory technique and may therefore be a valuable epidemiological tool for the study of Y. enterocolit…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Representative strains of EHV isolated from an aborted foetus and from a horse with rhinopneumonitis in New Zealand had restriction endonuclease DNA fingerprints typical of those usually associated with these syndromes elsewhere and now designated EHV1 and 4 respectively. EHV1 was isolated from the brain and spinal cord of a 4-year-old gelding that died of myeloencephalitis. A mare on the same farm, at about the same time as the gelding developed myeloencephalitis, aborted and EHV1 was isolated from the tissues of the aborted foetus. Restriction endonuclease DNA fingerprints of the viruses iso
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A total of 33 clinical isolates of the Mycobacterium avium complex from 25 patients, identified by means of biochemical and cultural characteristics, the Accuprobe system and DT1/DT6 PCR, were further analysed using novel insertion elements IS1245 and IS1311 in a French Caribbean setting. PvuII-cleaved DNA and non-radioactive Southern hybridization and detection systems were used for fingerprinting with both IS elements. The data confirmed the specificity of the two probes for M. avium in our setting and highlighted a significant proportion of M. intracellulare-infected patients in this region
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonellosis is one of the most common causes of food-borne infection worldwide. In the last decade, Salmonella enterica serovar Kentucky has shown an increase in different parts of the world with the concurrent emergence of multidrug-resistant isolates. These drug-resistant types spread from Africa and the Middle East to Europe and Asia. Although S. Kentucky serovar is of potential human relevance, there is currently no standardized fingerprinting method for it, in Tunisia. In the present study, a collection of 57 Salmonella Kentucky isolates were analyzed using plasmid profiling, pulsed-fie
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the period from January 1987 to June 1988 DNA fingerprinting was used to identify carriers of the disease-causing strain of Neisseria meningitidis among the patients contacts. A total of 432 persons were screened during nine episodes. The overall carrier-rate was 16.2%, and the causative strain was found in 3.4% of the contacts. Eleven carriers were successfully treated with rifampicin, whereas two of three carriers treated with penicillin remained carriers. We conclude that DNA fingerprinting is a valuable tool for rapid identification of carriers of the causative organism in order to …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic fingerprinting is one of the most challenging applications of any hybridization membranes. Forensic DNA fingerprinting typically uses samples in the range of 100-400 ng of genomic DNA. To ensure the ability to successfully reprobe the samples, it is imperative that repeated stripping of sample DNA be minimized while stripping of the probe DNA be maximized. By using standard dilutions of K562 cell line, we compared the following three stripping techniques: NaOH at 25 degrees C, formamide (HCONH2) at 65 degrees C and 0.1 x standard saline citrate and 0.1% sodium dodecyl sulfate at 95 deg…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pulsed-field gel electrophoresis of DNA macrorestriction fragments (macrorestriction analysis) allows epidemiologic typing and delineation of genetic relatedness of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) by indexing variations in the global chromosome architecture. Polymerase chain reaction (PCR)-mediated genome fingerprinting can also discriminate MRSA strains by detecting locally variable DNA motifs. To assess the correlation between these methods, 48 epidemic MRSA strains collected from 20 hospitals over a 10-year period were tested in a blind comparison by (i) macrorestriction
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ornithobacterium rhinotracheale (ORT) is an infectious respiratory pathogen of chickens, turkeys, and wild birds. There are 18 serotypes of ORT reported worldwide. In this study, enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC) polymerase chain reaction and random amplified polymorphic DNA assay with Universal M13 primer-based fingerprinting techniques were investigated for their ability to differentiate ORT isolates. The authors examined 50 field isolates and 8 reference strains of ORT for their genetic differences. The fingerprint patterns were compared with serotyping results of ORT b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The identification and characterization of Leishmania are relevant to diagnosis, treatment, eco-epidemiology studies, prophylactic measures … fication of polymorphic DNA (RAPD), simple sequence repeat-anchored PCR amplification (SSR-PCR) and DNA fingerprinting profiles, infectivity to murine macrophages and cellular immune response. Infections of mice and macrophages were significantly different among the strains studied. Attempts to infect mice with culture promastigotes were unsuccessful with BH121, but …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of this article is to review the status of DNA assays used for the detection, identification, and individualization of Bacillus … hain reaction (AFLP-PCR), and more recently, repetitive element polymerase chain reaction (REP-PCR) DNA fingerprinting. The methodologies of 16S ribosomal RNA gene DNA sequencing and DNA fingerprinting of microorganisms are well established within the field of diagnostic microbiology for DNA identification purposes, as well as DNA typing for epidemiological and gene …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Premature identical twins are described who according to molecular fingerprinting of their viral isolates, demonstrate a nonmaternal nursery … epeat urine culture of their mother was positive for CMV, and here CMV-CF titer had risen to 1:128. DNA fingerprinting by restriction endonuclease digestion analyses of the viruses isolated from the two infants indicate that they were infected with different strains of CMV. In addition the DNA fingerprinting pattern of the mother's isolate is identical to that of Tw …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования