Persistence of chronic hepatitis B (CHB) is attributed to maintenance of the intrahepatic pool of the viral covalently closed circular DNA (cccDNA), which serves as the transcriptional template for all viral gene products required for replication. Current nucleos(t)ide therapies for CHB prevent virus production and spread but have no direct impact on cccDNA or expression of viral genes. We describe a potential curative approach using a highly specific engineered ARCUS nuclease (ARCUS-POL) targeting the hepatitis B virus (HBV) genome. Transient ARCUS-POL expression in HBV-infected primary human
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Promoters and vectors are critical components of gene therapy, enabling the delivery and expression of therapeutic genes to correct both loss- and gain-of-function mutations. Adeno-associated virus (AAV) vectors are the leading platform for in vivo gene delivery; however, the widely used Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9, 4.1 kb) approaches the AAV packaging limit of 4.7 kb. This constraint often necessitates dual-vector systems, which reduce therapeutic efficiency, or the use of smaller nucleases such as SaCas9 (3.2 kb) and AacCas12b (3.4 kb), which have lower PAM site frequencies. To enhan
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mutation pattern of immunoglobulin genes was studied in mice deficient for DNA polymerase eta, a translesional polymerase whose inactivation is responsible for the xeroderma pigmentosum variant (XP-V) syndrome in humans. Mutations show an 85% G/C biased pattern, similar to that reported for XP-V patients. Breeding these mice with animals harboring the stop codon mutation of the 129/Olain background in their DNA polymerase iota gene did not alter this pattern further. Although this G/C biased mutation profile resembles that of mice deficient in the MSH2 or MSH6 components of the mismatch re
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Telomerase RNA (TERC) has a noncanonical function in myelopoiesis binding to a consensus DNA binding sequence and attracting RNA polymerase II (RNA Pol II), thus facilitating myeloid gene expression. The CR4/CR5 domain of TERC is known to play this role, since a mutation of this domain found in dyskeratosis congenita (DC) patients decreases its affinity for RNA Pol II, impairing its myelopoietic activity as a result. In this study, we report that two aptamers, short single-stranded oligonucleotides, based on the CR4/CR5 domain were able to increase myelopoiesis without affecting erythropoiesis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
7,8-Dihydro-8-oxo-2'-deoxyguanosine (8-oxo-dG) is one of the most common DNA lesions induced by oxidative stress. This lesion can be bypassed by DNA polymerase eta (Pol eta) using in vitro translesion synthesis (TLS) reactions. However, the role that Pol eta plays in vivo contributing to 8-oxo-dG mutagenesis remains unclear. To clarify the role of Pol eta in 8-oxo-dG mutagenesis, we have used an siRNA knockdown approach in combination with a supF shuttle vector (pSP189) which replicates in mammalian cells. The pSP189 plasmid was treated with methylene blue plus light (MBL), which produces pred
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA lesion bypass is an important cellular response to genomic damage during replication. Human DNA polymerase eta (Pol(eta)), encoded by the Xeroderma pigmentosum variant (XPV) gene, is known for its activity of error-free translesion synthesis opposite a TT cis-syn cyclobutane dimer. Using purified human Pol(eta), we have examined bypass activities of this polymerase opposite several other DNA lesions. Human Pol(eta) efficiently bypassed a template 8-oxoguanine, incorporating an A or a C opposite the lesion with similar efficiencies. Human Pol(eta) effectively bypassed a template abasic site
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ZMYND11 is the sole known reader of H3.3K36me3. It has been characterized as a transcriptional repressor that fine-tunes RNA polymerase II (Pol II) elongation through recognition of gene body-localized H3K36me3, based primarily on earlier ChIP-seq data showing predominant ZMYND11 occupancy at gene bodies. However, subsequent data suggest that ZMYND11 may also localize to promoter regions. Here, using CUT&Tag assay, we demonstrate that ZMYND11 robustly occupies promoter regions in mouse ESCs and MEFs, with its promoter enrichment positively correlating with gene expression levels and Pol II occ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the Feline immunodeficiency virus (FIV) / Feline leukemia virus (FeLV) infection prevalence among looking healthy stray cats in Western Turkey by serologic and molecular-based tests. A total of 1008 blood samples from the stray cats were used in this study. All samples were tested for FIV antibodies / proviral DNA and FeLV antibodies / antigens / proviral DNA. The genetic characterization and phylogenetic analysis of FeLV and FIV were carried out in this study. These cats also tested for Leishmaniasis and Toxoplasmosis previously. FIV Ab and proviral DNA detecte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human cytomegalovirus (HCMV) is an important human pathogen primarily affecting immunocompromised patients, like transplant recipients or HIV- infected individuals. Early diagnosis of cytomegalovirus (CMV) infection in high-risk patients is essential in order to start preemptive treatments. pol (UL54) gene encoding for HCMV viral DNA polymerase is a well-defined target for HCMV detection in clinical samples and identifying most highly conserved regions for primer design remains crucial. Though real-time polymerase chain reaction (qPCR) is a rapid and sensitive method for HCMV detection, fa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dyskeratosis congenita (DC) is a rare inherited bone marrow failure and cancer predisposition syndrome caused by mutations in telomerase or telomeric proteins. Here, we report that zebrafish telomerase RNA (terc) binds to specific DNA sequences of master myeloid genes and controls their expression by recruiting RNA Polymerase II (Pol II). Zebrafish terc harboring the CR4-CR5 domain mutation found in DC patients hardly interacted with Pol II and failed to regulate myeloid gene expression in vivo and to increase their transcription rates in vitro. Similarly, TERC regulated myeloid gene expressio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous molecular studies investigating the presence of HTLV-I proviral DNA in cell lines and tissue samples of patients with cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) have reported a detection rate ranging from 0-92%. Despite the lack of epidemiologic data linking HTLV-I infection with CTCL, the molecular data still invite speculation regarding the precise role of HTLV-I in the pathogenesis of CTCL. To determine the detection rate of HTLV-I proviral DNA among CTCL patients referred to our medical center, we analyzed Epstein-Barr virus-transformed cell lines established from peripheral blood of seven
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Humans possess four Y-family polymerases: pols eta, iota, kappa and the Rev1 protein. The pivotal role that pol eta plays in protecting us from UV-induced skin cancers is unquestioned given that mutations in the POLH gene (encoding pol eta), lead to the sunlight-sensitive and cancer-prone xeroderma pigmentosum variant phenotype. The roles that pols iota, kappa and Rev1 play in the tolerance of UV-induced DNA damage is, however, much less clear. For example, in vitro studies in which the ability of pol iota to bypass UV-induced cyclobutane pyrimidine dimers (CPDs) or 6-4 pyrimidine-pyrimidone (
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA polymerase (Pol) III has a noncanonical role of viral DNA sensing in the innate immune system. This polymerase transcribes viral genomes to produce RNAs that lead to induction of type I interferons (IFNs). However, the genetic and functional links of Pol III to innate immunity in humans remain largely unknown. Here, we describe a rare homozygous mutation (D40H) in the POLR3E gene, coding for a protein subunit of Pol III, in a child with recurrent and systemic viral infections and Langerhans cell histiocytosis. Fibroblasts derived from the patient exhibit impaired induction of type I IFN an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arginine vasopressin maintains water homeostasis by regulating epithelial water permeability through complex transcriptional mechanisms in kidney collecting duct cells. Although CTNNB1 (β-catenin) functions as a transcriptional coregulator in vasopressin-responsive gene transcription, its role remains poorly understood. To identify CTNNB1-dependent components mediating the vasopressin-responsive transcription, we profiled transcriptomic changes following Ctnnb1 knockdown in mouse kidney collecting duct cells using RNA sequencing (RNA-Seq). RNA-Seq and promoter enrichment analyses identified br
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To examine whether the fidelity of DNA synthesis is reduced in tumor cells, M13 mp2-based fidelity assays were carried out using 15 samples of whole-cell extracts from primary mouse thymic lymphomas induced by alkylating agents. We found that DNA synthesis activities of thymic lymphomas, detected as incorporation of [3H]TTP into acid-insoluble materials, were 2- to 10-fold higher compared to those of normal thymus. Furthermore, mutant frequencies in the forward mutation assay of DNA synthesis were increased 2- to 7-fold in cell extracts from thymic lymphomas compared to those from normal thymu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During lytic replication, herpesviruses express their genes in a temporal cascade culminating in expression of "late" genes. Two subfamilies of herpesviruses, the beta- and gammaherpesviruses (including human herpesviruses cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, and Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus), use a unique strategy to facilitate transcription of late genes. They encode six essential viral transcriptional activators (vTAs) that form a complex at a subset of late gene promoters. One of these vTAs is a viral mimic of host TATA-binding protein (vTBP) that recognizes a strikingly minimal
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Anti-hepatitis B virus (HBV) nucleos(t)ides analogs (NA) exert selective pressures on polymerase (pol) and surface (S) genes, inducing treatment resistance and increasing the risk of vaccine escape mutants. The rate of emergence for these mutations is largely unknown in patients coinfected with human immunodeficiency virus (HIV) and HBV undergoing dual-active therapy. In a 3-year, repeat-sampling, prospective cohort study, HBV viral genome sequences of 171 HIV-HBV coinfected patients, presenting with HBV viremia for at least one visit, were analyzed every 12 months via DNA chip. Lo
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Treacher Collins syndrome (TCS) is a rare congenital disorder characterized by craniofacial deformities. Although mutations in several genes involved in ribosome biogenesis have been identified in patients with TCS, the molecular mechanisms underlying their effects remain poorly understood. In this study, we analyzed the effects of TCS type 4 (TCS4)-associated mutations in Schizosaccharomyces pombe by introducing R1022C or R1022S mutations into Rpa2, the second-largest subunit of RNA polymerase I (Pol I). The rpa2R1022C and rpa2R1022S mutants exhibited impaired cell growth under nutrient-rich
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The inability to replicate mitochondrial genomes (mtDNA) by the mitochondrial DNA polymerase (pol γ) leads to a subset of mitochondrial diseases. Many mutations in POLG, the gene that encodes pol γ, have been associated with mitochondrial diseases such as myocerebrohepatopathy spectrum (MCHS) disorders, Alpers-Huttenlocher syndrome, myoclonic epilepsy myopathy sensory ataxia (MEMSA), ataxia neuropathy spectrum (ANS), and progressive external ophthalmoplegia (PEO). This chapter explores five important topics in POLG-related disease: (1) clinical symptoms that identify and distinguish POLG-relat
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anticancer nitrogen mustard drugs including cyclophosphamide, mechlorethamine and chlorambucil induce covalent DNA-protein cross-links (DPCs) by sequentially alkylating the N7 position of guanine in DNA and amino acid residues within proteins. In cells, DPCs are proteolytically processed to yield corresponding peptide-DNA cross-links (DpCs), allowing polymerase bypass. In this study, site-specific, hydrolytically stable DNA lesions resembling nitrogen mustard-induced DpCs were generated via oxime ligation of an 11-mer peptide derived from histone H4 (NH2-GGGK*GLGKGGA, K*=oxy-lysine) to 7-deaza
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования