RNA replicon derived from Flavivirus genome is a valuable tool for studying viral replication independent of virion assembly and maturation, besides being a great potential for heterologous gene expression. In this study we described the construction of subgenomic replicons of yellow fever virus by yeast-based homologous recombination technique. The plasmid containing the yellow fever 17D strain replicon (pBSC-repYFV-17D), previously characterized, was handled to heterologous expression of the green fluorescent protein (repYFV-17D-GFP) and firefly luciferase (repYFV-17D-Luc) reporter genes. Bo…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Imidocarb dipropionate (IMD) is a chemotherapeutic agent prescribed for the treatment and control of babesiosis; it is known to be a nucleic acid synthesis inhibitor. Although it is an effective babesicide, there are reports of persistent IMD residues retained at high levels in edible tissues of cattle, swine and sheep, raising concerns about potential effects on humans. Since the carcinogenic potential of a chemical compound can be assessed through its effect on the homologous recombination, we investigated whether IMD is recombinogenic in Aspergillus nidulans diploid cells and whether it is …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA polymerase eta (pol η) is the only DNA polymerase causally linked to carcinogenesis in humans. Inherited deficiency of pol η in the vari … tion of cells in S-phase, which persisted after IR. Cells deficient in pol η demonstrated increased homologous recombination (HR)-directed repair of double strand breaks created by IR. Depletion of the HR protein, X-ray repair cross-complementing protein 3 (XRCC3), abrogated the radioresistance observed in pol η-deficient cells as compared with pol η-complemented cells. T …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonallelic homologous recombination (NAHR) is the major mechanism underlying recurrent genomic rearrangements, including the large deletions at 17q11.2 that cause neurofibromatosis type 1 (NF1). Here, we identify a novel NAHR hotspot, responsible for type-3 NF1 deletions that span 1.0 Mb. Breakpoint clustering within this 1-kb hotspot, termed PRS3, was noted in 10 of 11 known type-3 NF1 deletions. PRS3 is located within the LRRC37B pseudogene of the NF1-REPb and NF1-REPc low-copy repeats. In contrast to other previously characterized NAHR hotspots, PRS3 has not developed on a preexisting allel…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Particulate hexavalent chromium [Cr(VI)] compounds are well-established human carcinogens. Cr(VI)-induced tumors are characterized by chromosomal instability (CIN); however, the mechanisms of this effect are unknown. We investigated the hypothesis that homologous recombination (HR) repair of DNA double-strand breaks protect cells from Cr(VI)-induced CIN by focusing on the XRCC3 and RAD51C genes, which play an important role in cellular resistance to DNA double-strand breaks. We used Chinese hamster cells defective in each HR gene (irs3 for RAD51C and irs1SF for XRCC3) and compared with their w…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chicken B lymphocyte precursors and DT40 cells diversify their immunoglobulin-variable (IgV) genes through homologous recombination (HR)-mediated Ig gene conversion. To identify DNA polymerases that are involved in Ig gene conversion, we created DT40 clones deficient in DNA polymerase eta (poleta), which, in humans, is defective in the variant form of xeroderma pigmentosum (XP-V). Poleta is an error-prone translesion DNA synthesis polymerase that can bypass UV damage-induced lesions and is involved in IgV hypermutation. Like XP-V cells, poleta-disrupted (poleta) clones exhibited hypersensitivi…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Aberrant nucleocytoplasmic transport mediated by Exportin 1 (XPO1) contributes to leukemogenesis, yet the molecular basis underlying the limited efficacy of the XPO1 inhibitor Selinexor in acute myeloid leukemia (AML) remains unclear. This study aimed to define the role of XPO1 in AML and elucidate the mechanism by which Selinexor regulates homologous recombination (HR).
METHODS: Public AML datasets and patient samples were analyzed to assess XPO1 expression and clinical relevance. Functional assays evaluated the effects of XPO1 knockdown on AML cell proliferation, apoptosis, and …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
R loop homeostasis is critical for DNA double-strand break (DSB) repair; however, how R loops are resolved in this context is poorly understood. Here, we define HELZ as a unique RNA-DNA helicase that resolves R loops to facilitate homologous recombination (HR) repair. From a synthetic lethal etoposide resistance siRNA screen, we found that HELZ depletion causes R loop-mediated hypersensitivity to DSB-inducing agents, and HELZ localizes and binds to DSBs. HELZ preferentially binds to and unwinds RNA-DNA hybrids with 5'ssRNA overhangs to promote R loop resolution genome-wide and at DSBs. Interes…
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homologous recombination deficiency (HRD) arising from BRCA1or BRCA2 or PALB2 mutations confers sensitivity to platinum chemotherapy and PARP inhibition in pancreatic cancer (PC) and may enable prolonged disease control with immune checkpoint blockade (ICB). The phase 2 POLAR trial evaluated maintenance pembrolizumab plus olaparib following platinum-based chemotherapy in biomarker-stratified metastatic PC. Sixty-three participants were enrolled into three cohorts: cohort A (BRCA1/BRCA2-mutated or PALB2-mutated HRD, n = 33), cohort B (non-core HRD, n = 15) and cohort C (platinum sensitive, HRD-…
СтатьяКлиническое исследование II фазыМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There are only a few whole genome sequencing studies of human gastric cancer (GC) conducted so far. We performed comprehensive whole genome, bulk RNA, and methylation sequencing analyses of 100 samples of GC and adjacent normal tissue. In a smaller non-EBV/non-MSI subset (n = 23), we also performed proteomic profiling by mass spectrometry. We validated the proteomic findings in an independent dataset. Using this unprecedented dataset of human GC samples, we examined the extent of chromothripsis, homologous recombination deficiency, and retrotransposition, and correlated these events with patie…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homologous recombination repair deficiency (HRD) is a key biomarker for targeting breast cancer (BC) with PARP inhibitors (e.g., olaparib), but its detection usually requires a comprehensive genomic analysis. We explored whether metabolic signatures could indicate HRD status. We refined published lactate metabolism gene sets to develop an HRD-related lactate signature using least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) regression. Using this signature, we stratifiedmore than1000 TCGA BC samples into high- and low-risk groups. We compared tumor immune-cell composition between groups u…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pathogenic germline variants in certain genes are associated with somatic tumour mutation signatures. The use of somatic tumour mutation data has the potential to improve the identification of true pathogenic variants but remains underexplored. We investigated the integration of tumour homologous recombination (HR) deficiency status as a predictor of pathogenicity for germline BRCA1 and BRCA2 variants, building on the established link between HR deficiency and germline pathogenic variants in these genes.
METHODS: We analysed breast tumour whole-genome sequence and matching germlin…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ATP-dependent chromatin remodeling is essential for replication, transcription, and DNA repair, especially DNA double-strand break (DSB) rep … unit of DNA polymerase ε (Polε). Polε is recruited to DSBs via CHRAC17, facilitating RAD51-mediated homologous recombination (HR) and conferring resistance to PARP inhibitors. These findings define a mechanism of homologous recombination driven by coordinated regulation of nucleosome dynamics by CHRAC and Polε, thereby ensuring genome stability.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mutations in genes encoding proteins involved the DNA damage response (DDR) occur in up to 20% of patients with cancer. It is un … xicities were observed.
CONCLUSION: The study failed to meet its primary end point of ORR. DDR and homologous recombination repair defects are not consistently actionable with olaparib as monotherapy or in combination with other targeted therapies in a histology-agnostic manner.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Gastric cancer is a lethal malignancy with limited targeted therapeutic options, particularly for HER2-negative disease. Through … on and fluoropyrimidines, including 5-fluorouracil (5-FU). Mechanistically, PARG directly bound the homologous recombination (HR) cofactor RAD51-associated protein 1 (RAD51AP1) via its N-terminal domain and removed PAR chains. The dePARylation prevented RNF169-mediated K48-linked ubiquitination of RAD51AP1, thereby protecting RAD51AP1 from proteasomal degradation. Consequ …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Loss of chromosome 16q is a recurrent genomic alteration in bladder and prostate cancers and is associated with poor clinical outcomes. However, the mechanisms by which 16q loss contributes to tumor progression remain poorly understood. Here, we identify the deubiquitinase CYLD as a major contributor to genomic instability associated with chromosome 16q deletion. Mechanistically, CYLD stabilizes the 53BP1 regulator TIRR by removing K48-linked polyubiquitin chains, thereby preventing excessive accumulation of 53BP1 at sites of DNA damage and maintaining efficient homologous recombination repair…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Poly(ADP-ribose) polymerase inhibitors (PARPi) have shown limited efficacy in gastric cancer, primarily due to the rarity of inherent homologous recombination (HR) deficiency. The nuclear Arp2/3 complex was recently implicated in DNA double-strand break repair via HR. Here, we investigate whether pharmacological inhibition of Arp2/3 can induce a functional HR-deficient state to synergize with PARPi in gastric cancer cells.
METHODS: HR repair efficiency was assessed using a direct repeat green fluorescent protein (DR-GFP) reporter assay in HEK-293T cells following Arp2/3 inhibition…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the molecular mechanism by which Astragali Radix enhances radiotherapy efficacy in lung cancer through speckle-type POZ protein(SPOP)-mediated homologous recombination repair. For in vitro experiments, A549 and H1299 cells were randomly divided into a blank group, a radiation group, and the radiation combined with 5%, 10%, and 20% Astragali Radix groups. Except for the blank group, all groups were irradiated with 4 Gy X-rays to establish the radiation model. After modeling, the radiation combined with low-, medium-, and high-dose Astragali Radix groups were trea…
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glioblastoma (GBM) standard of care includes surgical resection followed by ionizing radiation (IR) and Temozolomide, which induce DNA double-strand breaks. Homologous recombination (HR), a critical DNA double-strand break repair pathway, is augmented in GBM, contributing to resistance and poor patient outcomes. Here, we demonstrate that increasing deoxyribonucleoside triphosphate (dNTP) levels impairs HR-mediated double-strand break repair, rendering GBM cells sensitive to IR and Temozolomide. Interestingly, combining an elevated dNTP pool level with IR and/or Temozolomide promotes the recrui…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Recently, precision medicine has drastically modified clinical paradigm for the clinical stratification of high-grade serous ovarian cancer (HGSOC) patients. International societies approved poly (ADP-ribose) polymerase (PARP) inhibitors (PARPIs) to treat platinum-sensitive BRCA1/2 defective HGSOC patients. Beyond BRCA1/2, functional defects in homologous recombination repair (HRR) proteins laid the basis for genomic instability evaluation in HGSOC patients. Given that measurement of homologous recombination deficiency (HRD) is extremely complex molecular analysis is outsourced. Of note,…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования