Patients with recurrent pregnancy loss (RPL) account for approximately 1%-5% of women aiming to achieve childbirth. Although studies have shown that RPL is associated with failure of endometrial decidualization, placental dysfunction, and immune microenvironment disorder at the maternal-fetal interface, the exact pathogenesis remains unknown. With the development of high-throughput technology, more studies have focused on the genomics, transcriptomics, proteomics and metabolomics of RPL, and new gene mutations and new biomarkers of RPL have been discovered, providing an opportunity to explore
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is known that the progressive climate changes and environmental pollution prevalent all over the world lead to increasingly frequent and prolonged episodes of stress, and it challenges plants to adapt to changing adverse conditions. Given the significant crop losses caused by challenging environments, protecting plants from the destructive effects of these factors has become one of the most pressing challenges in modern agricultural biology and plant physiology. One of the approaches to protect plants from stressors in modern agrobiotechnology is the use of nitric oxide (NO) donors, which a
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite prolific genomic data from individuals with Alzheimer's disease (AD), translation into treatments has lagged. Here we applied Mendelian randomization to multiple AD genome-wide association studies and functional multiomics datasets to nominate druggable targets, identifying 19 targets for individuals of European ancestry and 7 for African ancestry. This included epoxide hydrolase 2 (EPHX2), for which we identified a protective missense variant (p.Arg287Gln). Experiments in induced pluripotent stem cell-derived neurons and cerebral organoids from patients with AD validated the protectiv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Radiotherapy remains a cornerstone in the local management of rectal cancer (RC); however, resistance to radiation significantly compromises therapeutic efficacy and adversely affects patient prognosis. Identification of biomarkers associated with radioresistance and the development of a prognostic model based on radiotherapy-related genes in RC remain critical for enhancing treatment outcomes.
METHODS: Data related to RC were obtained from public repositories, including bulk RNA-seq data from 993 patients across four Gene Expression Omnibus (GEO) and one The Cancer Genome Atlas (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) is a dynamic process during which cells lose their epithelial characteristics and acquire mesenchymal traits. In cancer, EMT is closely associated with tumor initiation, progression, invasion, metastasis, and therapy resistance. Rather than being a binary state switch, EMT encompasses a spectrum of tumor states with distinct functional properties. However, the transcription factors (TFs) that govern transitions between these EMT states remain poorly defined. Here, using multi-omic approaches combining single-cell RNA-seq and single-cell ATAC-seq, we d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Multiomics data integration aims to identify biological patterns shared across molecular modalities. Most existing methods detect either jointly shared variation, across all modalities, or individual variation, unique to a single modality, but overlook partially shared variation, shared by only a subset of modalities. This is a critical limitation, because many biological mechanisms manifest in some but not all molecular modalities.
RESULTS: We present an open-source R package implementing data integration via analysis of subspaces (DIVAS), a framework for systematically identifyi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Largemouth bass (Micropterus salmoides) is among the most economically important freshwater fish species. High temperature is a major abiotic stressor, leading to increased mortality and significant economic losses. However, research on the regulatory mechanisms of heat stress response in largemouth bass is limited. This study aims to elucidate the mechanisms of adaptability in largemouth bass during heat stress and subsequent recovery.
RESULTS: The morphobiochemical alterations and adaptive mechanisms induced by high water temperature in the gill, brain and liver tissues of large
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis-associated encephalopathy (SAE) is a diffuse neurological injury that results from severe sepsis, and its underlying pathophysiological mechanisms remain largely unknown. This study aimed to elucidate the pathological basis of SAE and identify potential diagnostic biomarkers by integrating analyses of the intestinal microbiome, plasma metabolomics, and circulating microRNAs (miRNAs). We analyzed data from 50 patients who were divided into SAE or non-SAE groups. The results revealed significant differences in microbial composition between these groups, with a marked decrease in Bacteroid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heart failure is a leading cause of morbidity and mortality, yet gene-regulatory mechanisms driving cell type-specific pathologic responses remain undefined. Here, we present the cell type-resolved transcriptomes, chromatin accessibility, histone modifications, and chromatin organization of 13 nonfailing and 23 failing human hearts across all cardiac chambers. Integrative analyses revealed dynamic changes in cell type composition, gene-regulatory programs, and chromatin organization, particularly in cardiomyocytes and fibroblasts. Mapping cell type-specific enhancer-gene interactions from thes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiovascular-kidney-metabolic disease (CKM) represents a growing public health challenge driven by the convergence of obesity, diabetes, and cardiovascular risk within aging populations. Despite major therapeutic advances, risk stratification remains anchored to conventional markers such as creatinine, urine albumin-to-creatinine ratio, natriuretic peptides, troponins, lipids, and glycated hemoglobin. Although prognostically useful, these parameters largely reflect established organ dysfunction rather than the upstream biological processes responsible for disease initiation and progression.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aimed to investigate cellular composition and gene/pathway alterations in VLS tissue compared with normal skin using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and lipid metabolomics.
METHODS: scRNA-seq was conducted on 4 VLS samples and self-control vulvar skin. Lipid metabolism analysis was performed on 15 VLS samples. Bioinformatics assessed cellular abundance, differentially expressed genes (DEGs), and functional pathways between VLS and normal tissues. DEGs were validated via immunofluorescence.
RESULTS: The authors found significant changes in cell-type abundance in t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integrative multiomics analysis offers valuable insights into complex biological systems, yet conventional stepwise extraction methods are often limited by tissue spatial heterogeneity and technical biases introduced through repeated processing, which may compromise cross-omics comparability. To address this, we evaluated a coextraction strategy for multiomics profiling of mouse brain tissue. This approach increased RNA yield per milligram of tissue by 32.55% compared with traditional methods while maintaining comparable sequence coverage (88.14%) and reproducibility (r > 0.98). At the proteom
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ankylosing spondylitis (AS) is an immune-mediated disease with an unknown etiology, posing challenges in effective treatment. This study aims to investigate the underlying mechanisms and explore the potential of traditional Chinese medicine (TCM) as a treatment avenue. Employing a multiomics analysis and leveraging public databases, we scrutinized AS immune cell subpopulations and associated genes. Gene regulatory mechanisms were dissected, and molecular docking was performed to assess the therapeutic efficacy of TCM. Our findings revealed a significant elevation in effector CD8+ memory T (Tem
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We conducted a multiomics analysis of paediatric acute promyelocytic leukaemia (APL) in 36 patients enrolled in the Japanese AML-P05 study. Targeted deep sequencing identified EP300 mutations (n = 2) and MYC-internal tandem duplication (ITD) (n = 1), which have not been previously reported in APLs. DNA methylation analysis classified 34 paediatric APLs into two groups: hypermethylation and hypomethylation. Patients in the hypermethylation group had significantly worse outcomes compared to those in the hypomethylation group (3-year overall survival: 80% vs. 100%, p = 0.043; 3-year event-free su
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Breast cancer prognosis prediction remains challenging due to the heterogeneous nature of clinical and multiomics data and the complex interactions among diverse biological mechanisms. This study proposes a multimodal deeplearning framework integrating clinical variables, gene expression profiles, and copy number variation (CNV) data for breast cancer prognosis prediction.
MATERIALS AND METHODS: Three modality-specific models were developed: a one-dimensional convolutional neural network for clinical data, a multilayer perceptron for gene expression data, and a denoising autoenc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peripheral artery disease (PAD) is a prevalent, disabling manifestation of systemic atherosclerosis that carries high risks of major adverse cardiovascular and limb events, yet remains incompletely explained by conventional risk factors and haemodynamic indices. Although genome-wide association studies have nominated reproducible susceptibility loci and high-throughput profiling has expanded the landscape of circulating, imaging, vascular and skeletal muscle biomarkers, most signals are noncoding, mechanistic attribution is often uncertain and few biomarkers have demonstrated durable increment
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hemoglobinopathies are the most common monogenic genetic disorders, primarily managed through blood transfusions or bone marrow transplantation. Clinical severity other than mutational effect is not well investigated and still unknown. This study aimed to identify dysregulated molecular pathways in red blood cells (RBCs) contributing to thalassemia severity. From a cohort of 285 patients with hemoglobinopathy, 10 age-matched individuals with identical compound heterozygous mutations (IVS 1-5 G>C and CD 26 G>A) were screened. Five had severe thalassemia requiring regular transfusions, whereas 5
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To investigate the association between purine metabolism-related genes and trigeminal neuralgia (TN) using multiomics approaches.
METHODS: A multiomics summary-data-based Mendelian randomization (SMR) approach was applied to investigate associations between purine metabolism-related genes and TN. Genome-wide association study (GWAS) data from FinnGen R10 were integrated with blood-derived DNA methylation quantitative trait loci (mQTL), expression quantitative trait loci (eQTL), and protein quantitative trait loci (pQTL) datasets. Associations were evaluated by colocalization and repl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ObjectiveLung cancer is the leading cause of cancer-related mortality worldwide, with lung adenocarcinoma representing the predominant subtype. The increasing incidence of lung adenocarcinoma underscores the urgent need to establish novel therapeutic targets for clinical intervention.MethodsWe performed Mendelian randomization and colocalization analyses on large-scale lung adenocarcinoma genome-wide association study datasets. Bulk transcriptome and single-cell RNA sequencing were further applied to explore the function of candidate targets and related cell types.ResultsMendelian randomizatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is the most common inherited cardiac disease in cats, often leading to congestive heart failure, arterial thromboembolism, and sudden cardiac death. The genetics of feline HCM are poorly understood and limited genetic discoveries remain breed- or family-specific. We aimed to identify novel causative or disease-modifying variants in a large cohort of cats reflective of the general cat population. In a second cohort, we sought to characterize transcriptomics differences between HCM-affected cats and healthy controls. DNA was isolated from 138 domestic cats (109
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.