BACKGROUND: Pneumocystis jirovecii pneumonia (PCP) is a serious opportunistic infection in immunocompromised children. Real-time polymerase chain reaction (PCR) is widely used for the diagnosis of PCP due to its good accuracy. However, the diagnostic performance of multiplex real-time PCR on sputum in children with PCP has never been explored.
METHODS: Medical records of 63 consecutive pediatric patients were analyzed retrospectively, including 13 cases with PCP and 50 with non-PCP pneumonia. Pneumocystis jirovecii (P. jirovecii) and other co-pathogens detected by multiplex real-time PCR in s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmid-mediated colistin resistance is increasingly described worldwide in Enterobacteriaceae from animal and human isolates. Diffusion of these resistance traits among carbapenem-resistant enterobacterial isolates is of particular concern as colistin has become the last resort antibiotic for treating human infections with these organisms. Therefore, being able to monitor the presence of these transferable colistin resistance genes (mcr-1 to mcr-5-variants) is crucial. This paper describes the development of a multiplex polymerase chain reaction (PCR) protocol for detection of all currently k…
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid identification of the microorganisms in patients with bacteremia may be useful in clinical practice. We evaluated the impact of the multiplex polymerase chain reaction (PCR) on appropriate antibiotic use for patients with gram-positive cocci cluster (GPCC) bacteremia. We divided the GPCC bacteremia cases into a pre-PCR group (2010-2011) and a post-PCR group (2012-2013). A total 664 cases were included in the pre-PCR group; and 570, in the post-PCR group. In methicillin-susceptible Staphylococcus aureus (MSSA) cases, optimal antibiotics were administered earlier in the post-PCR group (77.…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Genital Ulcer Disease (GUD) is common sexually transmitted infection (STI). Multiple studies have shown that GUDs are strongly associated with the transmission and the acquisition of HIV infection. An accurate diagnosis of common etiology of GUD namely Herpes, syphilis and Chancroid is possible using Multiplex PCR (M-PCR). However, frequent presence of Polymerase Chain Reaction inhibitors in the ulcer swab specimen limits the performance of the assay. In order to overcome this problem, alternative specimen preparation method was used.
MATERIALS AND METHODS: To determine the common et
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel multiplex nested PCR (nPCR) method was developed for detecting and differentiating simultaneously the DNA of polyomaviruses JC, BK and SV40 in a single tube. In the first amplification step the same set of primers were used to amplify a conserved DNA region of the large T antigen gene of JCV, BKV and SV40. The second round of multiplex nPCR was carried out using a set of primers designed to render products of different size for each related virus. The thermocycling parameters and concentration of each reaction component were optimised systematically to achieve optimal specificity and s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid diagnosis of infectious diarrhea is lifesaving for intensive care unit (ICU) patients. This study evaluated a commercially available multiplex polymerase chain reaction (PCR) (BioFire FilmArray) for the diagnosis of parasitic and bacterial infections in ICU patients with secretory diarrhea in comparison to other traditional methods. This cross-sectional study included 50 subjects with infectious diarrhea. Their stool samples were subjected to macroscopic and microscopic examinations, concentration techniques, permanent staining techniques, stool culture, identification of bacterial i…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spread of infectious diseases with significantly high mortality rates can wreak devastating damage on global health systems and economies, underscoring the need for better disease diagnostic platforms. Solid-phase polymerase chain reaction (SP-PCR) potentially combines the advantages of conventional PCR-based diagnostics with the capability of multiplexed detection, given that the spatial separation between primers circumvents unwanted primer-primer interactions. However, the generally low efficiency of solid-phase amplification results in poor sensitivity and limits its use in detection s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE/BACKGROUND: Clinical diagnosis of indeterminate and tuberculoid leprosy is often difficult due to limited and confounding signs and symptoms. In the current study, we evaluated the utility of new multiplex polymerase chain reaction (PCR) using Mycobacterium leprae-specific DNA sequences in the pseudogene regions of ML1545, ML2180, and ML2179 for PCR-based diagnosis of indeterminate leprosy (IND) and leprosy cases across the immunological spectrum. The sensitivity was compared with that of RLEP PCR.
METHODS: DNA was extracted from paraffin-embedded skin biopsy specimens of 220 lepros…
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: Trichinellosis remains a public health concern globally due to the zoonotic potential of consuming undercooked meat infe … anized, and muscle tissues were examined histologically. Molecular confirmation was performed using multiplex polymerase chain reaction on formalin-fixed tissues.
RESULTS: Despite larval motility post-thaw, no viable T. britovi DNA was detected in the muscle tissues of infected mice. Histological examination showed structures resembling Trichinella cysts in all experimental groups, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
8-Aminoquinoline antimalarial drugs (primaquine, tafenoquine) are required for complete cure of Plasmodium vivax malaria, but they are contraindicated in patients with glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) deficiency. In the absence of spectrophotometry, which is a gold standard for measuring G6PD activity, G6PD genotyping is one of the alternatives to establish a database and distribution map of G6PD enzyme deficiency in Mauritania, which has become a new epicenter of P. vivax malaria in West Africa. The aim of our study was to assess the performance of multiplex allele-specific polymerase
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To prospectively evaluate automated multiplex PCR and isothermal microcalorimetry tests for rapid and accurate diagnosis of septic arthritis.
METHODS: Patients with acute arthritis were prospectively included from October 2014 to September 2015. In synovial fluid (SF), leukocyte count and differential, culture, PCR, and microcalorimetry were determined. Septic arthritis was diagnosed by positive SF culture or (1) local clinical signs and symptoms, (2) increased SF leukocyte count, and (3) exclusion of noninfectious causes of inflammatory arthropathy. The performance of individual t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human leukocyte antigen HLA-B*13:01 is identified currently as a marker of individual susceptibility to drug-induced hypersensitivity reaction, such as dapsone-induced hypersensitivity reactions (DIHRs) and trichloroethylene-induced dermatitis. Therefore, screening for the HLA-B*13:01 allele can assist clinics in identifying patients at risk of developing DIHRs. By combining the allele-specific primers with TaqMan probes, we established a single tube, triplex real-time PCR to detect HLA-B*13:01. The reliability of this assay was validated by the comparison of genotyping results with those by s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effect of Chlamydia trachomatis, Ureaplasma urealyticum and Mycoplasma hominis over the sperm quality is still unclear. The aim of this study was to determine their prevalence in infertile Bulgarian men. A total of 281 men were examined by applying mRT-PCR. The registered prevalence was as follows: C. trachomatis - 13.9%, U. urealyticum - 19.2%, M. hominis - 9.9%. Co-infection was established in eight swabs. This first in Bulgaria to study for detection of chlamydia and mycoplasmas in infertile men by mRT-PCR demonstrates higher prevalence of the tested microorganisms in the infertile grou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid identification of single and multiple infectious agents is vital in clinical settings and during biothreat attack. This study assesses the assay of single-stranded multiplex polymerase chain reaction (PCR) amplicons by suspension bead array (SSMP-SBA) for multiple pathogens identification in a single-tube reaction. A 15-plex assay for identification of 11 highly infectious pathogens was developed to evaluate the performance of SSMP-SBA. Pathogen-specific amplicons were obtained by sequential amplification of genomic DNAs using gene-specific primers tagged with artificial unique sequences…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porcine chlamydial infection is an enzootic infectious disease caused by multiple members of the family Chlamydiaceae (e.g. Chlamydophila abortus, Chlamydia suis, and Chlamydophila pneumoniae). Rapid and accurate differentiation of these pathogens is critical in the control and prevention of disease. The aim of the current study was to develop a nested multiplex polymerase chain reaction (nmPCR) assay to simultaneously detect the 3 chlamydial pathogens in clinical samples. In the first round of the nmPCR, 1 pair of family-specific primers were used to amplify the 1,100 base pair (bp) fragment …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The lack of rapidity and the low sensitivity and specificity of traditional laboratory methods limits their usefulness in the laboratory diagnosis of viral central nervous system (CNS) infections. This study describes the use of a commercially available multiplex polymerase chain reaction (mPCR)-based reverse hybridization assay (RHA) for the simultaneous detection of the genomes of 8 viruses and Toxoplasma gondii in cerebrospinal fluids (CSF) from 181 patients suspected of having viral meningitis. Twenty-two/181 (12.15%) CSF samples resulted positive by mPCR. Eighteen/22 were positive for 1 v…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A multiplex, real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) assay was developed that allowed simultaneous detection and rapid differentiation of vesicular stomatitis virus strains--New Jersey (VSV-NJ) and Indiana 1, 2, and 3 (VSV-IN1-3). This assay involves use of a set of VSV universal primers located in the L gene that amplify VSV-IN1-3 and VSV-NJ using probes that allow differentiation of the major serotypes Indiana and New Jersey. The assay was evaluated using reference VSV, foot-and-mouth disease virus, swine vesicular disease virus, and vesicular exanthema of swine vi
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study reports a method for the easy, rapid and cost effective detection of heterozygous large deletions. As a model gene all exons of the antithrombin gene were amplified in a one tube multiplex polymerase chain reaction (PCR) and the products separated according to their size by reverse-phase ion-pair high performance liquid chromatography. A significant reduction in the height of a peak in the probandOs sample compared to in the control indicates the presence of a large deletion of the corresponding allele. Using this approach we identified heterozygous deletions in four patients…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clinical application of quantitative fluorescent polymerase chain reaction (QF-PCR) for rapid prenatal detection of chromosome aneuploidies has been limited in most studies to the detection of autosomal trisomies. Recently it has been shown that a newly identified highly polymorphic marker, termed X22, which maps to the Xq/Yq pseudoautosomal region of the sex chromosomes, used together with the X-linked short tandem repeat (STR) HPRT, allows the accurate detection of gonosome aneuploidies. We have developed a rapid assay, which includes these STR markers together with a sequence of the ame
Клиническое исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) is commonly detected in pneumonia patients who travel from the Middle East regions. Besides MERS-CoV, many other pathogenic agents cause pneumonia. Detection of such organisms must be done swiftly, especially in case of the negative MERS-CoV samples. The aim of this study was to identify the pathogenic agents that might account for bacterial pneumonia, from Hajj and Umrah pneumonia cases.
MATERIALS AND METHODS: We conducted a cross-sectional study, 38 pneumonia clinical samples from suffering of Hajj and Umrah
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования