HKU1 is a human betacoronavirus that causes mild yet prevalent respiratory disease, and is related to the zoonotic SARS and MERS betacoronaviruses, which have high fatality rates and pandemic potential. Cell tropism and host range is determined in part by the coronavirus spike (S) protein, which binds cellular receptors and mediates membrane fusion. As the largest known class I fusion protein, its size and extensive glycosylation have hindered structural studies of the full ectodomain, thus preventing a molecular understanding of its function and limiting development of effective interventions
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interaction of bacterial outer membrane secretin PulD with its dedicated lipoprotein chaperone PulS relies on a disorder-to-order transition of the chaperone binding (S) domain near the PulD C terminus. PulS interacts with purified S domain to form a 1:1 complex. Circular dichroism, one-dimensional NMR, and hydrodynamic measurements indicate that the S domain is elongated and intrinsically disordered but gains secondary structure upon binding to PulS. Limited proteolysis and mass spectrometry identified the 28 C-terminal residues of the S domain as a minimal binding site with low nanomolar aff
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
L-Rhamnose is a ubiquitous bacterial cell-wall component. The biosynthetic pathway for its precursor dTDP-L-rhamnose is not present in humans, which makes the enzymes of the pathway potential drug targets. In this study, the three-dimensional structure of the first protein of this pathway, glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (RfbA), from Bacillus anthracis was determined. In other organisms this enzyme is referred to as RmlA. RfbA was co-crystallized with the products of the enzymatic reaction, dTDP-α-D-glucose and pyrophosphate, and its structure was determined at 2.3 Å resolution. This
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
L-Glutamate oxidase (LGOX) from Streptomyces sp. X-119-6, which catalyzes the oxidative deamination of L-glutamate, has attracted increasing attention as a component of amperometric L-glutamate sensors used in the food industry and clinical biochemistry. The precursor of LGOX, which has a homodimeric structure, is less active than the mature enzyme with an alpha(2)beta(2)V(2) structure; enzymatic proteolysis of the precursor forms the stable mature enzyme. We solved the crystal structure of mature LGOX using molecular replacement with a structurally homologous model of L-amino acid oxidase (LA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hemoglobin-based oxygen carriers have been sought as stable, sterile alternatives to red cells in transfusions. Problems in clinical trials using cross-linked tetramers have led to proposals that larger assemblies of tetramers may alleviate some of the problems. A study of such assemblies requires materials with defined structures and physical properties. Evaluation of cross-linked bis-tetramers with inflexible linear links between the tetramers revealed that these have very low cooperativity in oxygen binding and would thus be inefficient as oxygen carriers. New, more flexible reagents were d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Force-bearing tissues such as blood vessels, lungs, and ligaments depend on the properties of elasticity and flexibility. The 10 to 12 nm diameter fibrillin microfibrils play vital roles in maintaining the structural integrity of these highly dynamic tissues and in regulating extracellular growth factors. In humans, defective microfibril function results in several diseases affecting the skin, cardiovascular, skeletal, and ocular systems. Despite the discovery of fibrillin-1 having occurred more than two decades ago, the structure and organization of fibrillin monomers within the microfibrils
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dicamba (3,6-dichloro-2-methoxybenzoic acid) is a widely used herbicide that is efficiently degraded by soil microbes. These microbes use a novel Rieske nonheme oxygenase, dicamba monooxygenase (DMO), to catalyze the oxidative demethylation of dicamba to 3,6-dichlorosalicylic acid (DCSA) and formaldehyde. We have determined the crystal structures of DMO in the free state, bound to its substrate dicamba, and bound to the product DCSA at 2.10-1.75 A resolution. The structures show that the DMO active site uses a combination of extensive hydrogen bonding and steric interactions to correctly orien
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (CCHF-V) and Ebola virus are lethal pathogens that cause widespread outbreaks of hemorrhagic fever. Both diseases can be transmitted through contact with the bodily fluids of infected individuals, but as an arbovirus, CCHF-V is primarily transmitted through tick bites. Both of these viruses are classified as Risk Group 4 due to the appreciable health threat they pose. To date, there are few effective treatments available to combat these deadly hemorrhagic fevers. Consequently, identifying and characterizing ion channels (viroporins) encoded in the viral ge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human islet amyloid polypeptide (hIAPP) is an intrinsically disordered protein that can self-assemble into fibrillar aggregates that play a key role in the pathogenesis of the type II diabetes mellitus. hIAPP can transiently adopt α -helix and β -strand conformations that could be important intermediate species on the fibrillization pathway. However, experimental studies of the monomeric peptide conformations are limited due to its high aggregation propensity, and the early steps of the hIAPP association are not clearly characterized. In particular, the question of whether the aggregation-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integrase (IN) is the catalytic component of the preintegration complex, a large nucleoprotein assembly critical for the integration of the retroviral genome into a host chromosome. Although partial crystal structures of human immunodeficiency virus IN alone and its complex with the integrase binding domain of the host factor PSIP1/lens epithelium-derived growth factor (LEDGF)/p75 are available, many questions remain regarding the properties and structures of LEDGF-bound IN oligomers. Using analytical ultracentrifugation, multiangle light scattering, and small angle x-ray scattering, we have e
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphopantetheine adenylyltransferase (PPAT) catalyzes the fourth of five steps in the coenzyme A biosynthetic pathway, reversibly transferring an adenylyl group from ATP onto 4'-phosphopantetheine to yield dephospho-coenzyme A and pyrophosphate. Burkholderia pseudomallei is a soil- and water-borne pathogenic bacterium and the etiologic agent of melioidosis, a potentially fatal systemic disease present in southeast Asia. Two crystal structures are presented of the PPAT from B. pseudomallei with the expectation that, because of the importance of the enzyme in coenzyme A biosynthesis, they will
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human amylin is a 37 amino acid residue peptide hormone whose fibrillogenesis has been correlated with type 2 diabetes. These fibrils are rope-like bundles of several 5nm diameter protofilaments. Here, we propose, as a model for the protofilament, a variant of the parallel superpleated beta-structure previously derived for amyloid filaments of the yeast prion Ure2p. In the amylin model, individual polypeptides from residues 9 to 37 have a planar S-shaped fold with three beta-strands. These serpentines are stacked in register, with a 0.47 nm axial rise and a small rotational twist per step, gen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new principle in constructing molecular complexes from the known high-resolution domain structures joining data from NMR and small-angle x-ray scattering (SAXS) measurements is described. Structure of calmodulin in complex with trifluoperazine was built from N- and C-terminal domains oriented based on residual dipolar couplings measured by NMR in a dilute liquid crystal, and the overall shape of the complex was derived from SAXS data. The residual dipolar coupling data serves to reduce angular degrees of freedom, and the small-angle scattering data serves to confine the translational degrees
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fibrillins form the structural framework of a unique and essential class of extracellular microfibrils that endow dynamic connective tissues with long-range elasticity. Their biological importance is emphasized by the linkage of fibrillin mutations to Marfan syndrome and related connective tissue disorders, which are associated with severe cardiovascular, ocular and skeletal defects. These microfibrils have a complex ultrastructure and it has proved a major challenge both to define their structural organization and to relate it to their biological function. However, new approaches have at last
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lumazine synthase from Brucella abortus was overexpressed in Escherichia coli, refolded, and purified to apparent homogeneity. Crystals of lumazine synthase were grown by the hanging drop vapor diffusion method using polyethylene glycol 8000 or ammonium sulfate as precipitants. They belong to the trigonal space group P321 with cell parameters a = b = 132.00A, c = 167.25 A. A complete diffraction data set to 3.7 A resolution has been collected using synchrotron radiation. Preliminary analysis of the quaternary structure of this protein by means of a self-rotation function calculated with the di
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human γS-crystallin is an important component of the human eye lens nucleus and cortex. The mutation V42M in the molecule causes severe congenital cataract in children. We compare the structure of the mutant protein with that of the wild type in order to understand how structural changes in the mutant relate to the mechanism of opacification.
METHODS: Both proteins were made using conventional cloning and expression procedures. Secondary and tertiary structural features of the proteins were analyzed using spectral methods. Structural stabilities of the proteins were analyzed using
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Omicron lineage of SARS-CoV-2, which was first reported in November 2021, has spread globally and become dominant, splitting into several sublineages. Experiments have shown that Omicron lineage has escaped or reduced the activity of existing monoclonal antibodies, but the origin of escape mechanism caused by mutation is still unknown. This work uses molecular dynamics and umbrella sampling methods to reveal the escape mechanism of BA.1.1 to monoclonal antibody (mAb) Tixagevimab (AZD1061) and BA.5 to mAb Cilgavimab (AZD8895), both mAbs were combined to form antibody cocktail, Evusheld (AZD
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Islet amyloid polypeptide (IAPP) is a peptide hormone whose pathological self-assembly is a hallmark of the progression of type II diabetes. IAPP-membrane interactions catalyze its higher-order self-assembly and also underlie its toxic effects toward cells. While there is great interest in developing small molecule reagents capable of altering the structure and behavior of oligomeric, membrane-bound IAPP, the dynamic and heterogeneous nature of this ensemble makes it recalcitrant to traditional approaches. Here, we build on recent insights into the nature of membrane-bound states and develop a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease is associated with the abnormal self-assembly of the amyloid-β (Aβ) peptide into toxic β-rich aggregates. Experimental studies have shown that hydrophobic nanoparticles retard Aβ fibrillation by slowing down the nucleation process; however, the effects of nanoparticles on Aβ oligomeric structures remain elusive. In this study, we investigate the conformations of Aβ(16-22) octamers in the absence and presence of a single-walled carbon nanotube (SWCNT) by performing extensive all-atom replica exchange molecular-dynamics simulations in explicit solvent. Our simulations startin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Filamentous inclusions made of α-synuclein are found in nerve cells and glial cells in a number of human neurodegenerative diseases, including Parkinson disease, dementia with Lewy bodies, and multiple system atrophy. The assembly and spreading of these inclusions are likely to play an important role in the etiology of common dementias and movement disorders. Both α-synuclein and the homologous β-synuclein are abundantly expressed in the central nervous system; however, β-synuclein is not present in the pathological inclusions. Previously, we observed a poor correlation between filament format
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования