Passive immunization with broadly neutralizing antibodies (bNAbs) of HIV-1 appears a promising strategy for eliciting long-term HIV-1 remiss … ng evidence supporting the hypothesis. We attributed VRC01 failure to single-mutant VRC01-resistant proviruses in the latent reservoir triggering viral recrudescence, particularly when VRC01 was at trough levels. Pre-existing resistant proviruses in the latent reservoir may similarly compromise other bNAbs. Our study provides a framework for designing bNAb-b …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite decades of suppressive antiretroviral therapy, human immunodeficiency virus (HIV) reservoirs in infected individuals persist and fuel viral rebound once therapy is interrupted. The persistence of viral reservoirs is the main obstacle to achieving HIV eradication or a long-term remission. The last decade has seen a profound change in our understanding of the mechanisms behind HIV persistence, which appears to be much more complex than originally assumed. In addition to the persistence of transcriptionally silent proviruses in a stable latent reservoir that is invisible to the immune sys…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell and serum samples from 7 Hungarian patients with mycosis fungoides were examined for the presence of HTLV-I-related DNA sequences and a … egrated in the DNA of mycosis fungoides cells to HTLV-I but not to HTLV-II. Data suggest that these proviruses and HTLV-I are similar to each other along gag and pol regions.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Determining the anatomic compartments that contribute to plasma HIV-1 is critical to understanding the sources of residual virem … w, lung, and brain. Analyses of intracellular DNA and RNA populations revealed that the majority of proviruses in tissues from untreated animal 8232 were not expressed, whereas a greater proportion of proviruses in tissues were expressed from 6760. Few intracellular RNA sequences were detected in treated animals and most contained inactivating mutations, suc …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Viruses are central to microbial community structure in all environments. The ability to generate large metagenomic assemblies o … circumvents traditional boundaries to maximize identification of lytic viral genomes and integrated proviruses, including highly diverse viruses. VIBRANT highlights viral auxiliary metabolic genes and metabolic pathways, thereby serving as a user-friendly platform for evaluating viral community function. VIBRANT was trained and validated on reference virus d …
СтатьяVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Modern HIV-1 treatment effectively suppresses viral amplification in people living with HIV. However, the persistence of HIV-1 DNA as proviruses integrated into the human genome remains the main barrier to achieving a cure. Next-generation sequencing (NGS) offers increased sensitivity for characterising archived drug resistance mutations (DRMs) in HIV-1 DNA for improved treatment options. In this study, we present an ultra-sensitive targeted PCR assay coupled with NGS and a robust pipeline to characterise HIV-1 DNA DRMs from buffy coat samples. Our evaluation supports the use of this assay for…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N-tropic murine leukemia viruses have been observed in connection with radiation-induced osteosarcomagenesis in BALB/c mice. We have investigated the bone disease-inducing potential of molecularly cloned, BALB/c-derived N-tropic viruses in the random-bred NMRI mouse strain. The germ-line virus and an exogenous virus isolate were found to induce high incidences of osteopetrosis and lymphomas and a lower incidence of osteomas. Two viruses derived from somatically acquired proviruses of independent radiation-induced osteosarcomas induced lower incidence of osteopetrosis and lymphomas. Nucleotide …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T lymphocytes of patients with human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1)-associated myelopathy (HAM) were cultured. After cultivating for … mphocytes (PBL) or lymph node cells of adult T-cell leukemia/lymphoma (ATL) patients. The PstI type proviruses were predominant in ATL patients. It was concluded that two major subgroups of HTLV-1 exist in Japan and both types have an ability to cause either of two diseases, ATL or HAM.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the possibility that HIV-1 replication in lymph nodes sustains the reservoir during ART, we looked for evidence of viral replication in 5 donors after up to 13 years of viral suppression. We characterized proviral populations in lymph nodes and peripheral blood before and during ART, evaluated the levels of viral RNA expression in single lymph node and blood cells, and characterized the proviral integration sites in paired lymph node and blood samples. Proviruses with identical sequences, identical integration sites, and similar levels of RNA expression were found in lymph nodes…
Клиническое исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: HIV-1 provirus integration in host genomes provides a lifelong reservoir of virally infected cells. Although not able to generate viral progeny, the expression of defective proviruses has been associated with activation. Provirus integration may influence host gene transcription and shifts may occur during disease progression or antiretroviral therapy (ART). The study aimed to analyze intact/defective provirus and sites of provirus integration in acute infections: changes after 48 weeks of early therapy were also evaluated.
METHODS: DNA from peripheral blood lymphom…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infection of viruses from the genera Bromovirus, Potyvirus, and Potexvirus in Nicotiana benthamiana induces significant up-regulation of the genes that encode the HSP70 family, including binding immunoglobulin protein 2 (BiP2). Three up-regulated genes were knocked down and infection assays with these knockdown lines demonstrated the importance of the BiP2 gene for potyvirus infection but not for infection by the other tested viruses. Distinct symptoms of cucumber mosaic virus (CMV) and potato virus X (PVX) were observed in the BiP2 knockdown line at 10 days postagroinfiltration. Interestingly
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Subtype B HIV-1 reservoirs have been intensively investigated, but reservoirs in other subtypes and how they respond to antiretroviral thera … ution, with detection primarily in secondary lymphoid tissues. Interestingly, the appendix harbored proviruses in all subjects. Unlike subtype B, subtype C provirus was rarely detectable in the CNS, and there was no detectable HIV-1 RNA. HIV-1 RNA was detected in peripheral lymphoid tissues of 6 out of 8 ART-suppressed cases. In addition to active HIV-1 expr …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV-1 natural controllers can limit plasma HIV RNA levels in the absence of antiretroviral therapy (ART). Although controllers have less HIV DNA, it remains unclear how HIV transcription differs from noncontrollers, and whether ART further reduces HIV DNA or RNA in controllers. To address these questions, we quantified different HIV transcripts and HIV DNA regions/proviruses in longitudinal blood samples collected before ART and up to 3-5 years on suppressive ART from 10 controllers (5 "elite" and 5 viremic) and compared them to ART-suppressed noncontrollers. Compared to noncontrollers, contro…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Coral reefs have undergone extensive coral loss and shifts in community composition worldwide. Despite this, some coral species … h is often associated with ecological resilience. The viral community exhibited a 50% enrichment of proviruses relative to other corals. These proviruses had the genomic capacity to laterally transfer genes involved in antibiotic resistance, central metabolism, and oxidative stress responses, potentially enhancing the adaptive capacity of the Madracis microb …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) is the etiological agent of adult T-cell leukemia (ATL) and HTLV-1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis (HAM/TSP). HTLV-1 cell-to-cell transmission is dependent on the release of infectious virus particles into the virological synapse. The HTLV-1 particle structure is still poorly understood, and previous studies analyzed viruses produced by transformed lymphocytic cell lines chronically infected with HTLV-1, particularly the MT-2 cell line, which harbors truncated proviruses and expresses aberrant forms of the Gag protein. In this stud…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Superinfection, where a person with HIV acquires a second phylogenetically distinct strain, provides an opportunity to study reservoir evolu … ithout displacing the original B strain. Five years after initiating therapy, replication-competent proviruses from both strains persisted in blood, though URF proviruses dominated (80%). Despite their unequal representation within the reservoir, both strains rapidly rebounded upon treatment interruption, though most rebounding sequences belonged to a URF su …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Complex human-pathogenic retroviruses cause high morbidity and mortality worldwide, but resist antiviral drugs and vaccine development due t … ower incidence, and longer latency than mammary tumors induced by wild-type MMTV (MMTV-WT). MMTV-SD proviruses had many G-to-A mutations on the proviral plus strand, but also C-to-T transitions within WRC motifs. Similarly, a lymphomagenic MMTV variant lacking Rem expression showed decreased proviral loads and increased WRC motif mutations relative to those …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptional noise contributes to gene expression variability, but its origin and impact in HIV-1 latency remain incompletely characterized. Here, we combine a dual-copy MS2-tagging system with dedicated mathematical analysis to investigate the variability of HIV-1 transcription in live cells. In the basal state, the transcriptional activity of proviruses located in the same cell was uncorrelated, indicating that expression variability primarily comes from the intrinsic stochasticity of promoter dynamics. Upon stimulation with diverse latency-reversing agents, transcription of viral copies …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early initiation of antiretroviral therapy (ART) following HIV-1 infection restricts the size of the latent reservoir, following both horizo … in adulthood, with some LeukoHIV individuals characterized by an absence or near absence of intact proviruses in up to a billion peripheral blood mononuclear cells (PBMCs). Higher frequencies of functional CD56bright natural killer (NK) cells with increased cytotoxic activity are detectable in the LeukoHIV cohort compared to an adult reference cohort, while …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eradicating HIV-1 is complicated by latently infected CD4+T cells harboring dormant proviruses capable of reactivation. Through a pooled shRNAmir screen targeting human chromatin regulators, we identified EP400, a member of the p400 chromatin remodeling complex, as a potent inhibitor of HIV-1 transcription in Jurkat and primary CD4+T cells. EP400 and its complex partner DMAP1 co-localize with paused RNA Polymerase II (RNAPII) at transcriptional start sites of protein-coding genes and their depletion modestly reduced RNAPII pausing. At the HIV-1 locus, EP400 and DMAP1 were co-recruited with RNA…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.