BACKGROUND: Autophagy plays critical adaptive and nonadaptive roles in the pathogenesis of Sepsis-associated acute kidney injury (Sepsis-AKI). However, it remains unknown whether myocardial infarction associated transcript (MIAT) is involved in the process of autophagy in Sepsis-AKI. This study aimed to explore the exact association between MIAT1 and Beclin 1 (BECN1)-mediated autophagy in Sepsis-AKI in vitro.
METHODS: HK-2 (human renal tubular epithelial cell line) cells were stimulated by lipopolysaccharide (LPS) to construct a septic kidney injury cell model in vitro. The relative expressio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The adult mammalian heart has limited regenerative capacity, while the neonatal heart fully regenerates during the first week of life. Postnatal regeneration is mainly driven by proliferation of preexisting cardiomyocytes and supported by proregenerative macrophages and angiogenesis. Although the process of regeneration has been well studied in the neonatal mouse, the molecular mechanisms that define the switch between regenerative and nonregenerative cardiomyocytes are not well understood. Here, using in vivo and in vitro approaches, we identified the lncRNA Malat1 as a key player in postnata
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We previously demonstrated that the polycomb repressive complex 2 chromatin-modifying enzyme can directly transfer between RNA and DNA without a free-enzyme intermediate state. Simulations suggested that such a direct transfer mechanism may be generally necessary for RNA to recruit proteins to chromatin, but the prevalence of direct transfer capability is unknown. Herein, we used fluorescence polarization assays and observed direct transfer for several well-characterized nucleic acid-binding proteins: three-prime repair exonuclease 1, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U, Fem-3-binding fa
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how RNA binding proteins control the splicing code is fundamental to human biology and disease. Here, we present a comprehensive study to elucidate how heterogeneous nuclear ribonucleoparticle (hnRNP) proteins, among the most abundant RNA binding proteins, coordinate to regulate alternative pre-mRNA splicing (AS) in human cells. Using splicing-sensitive microarrays, crosslinking and immunoprecipitation coupled with high-throughput sequencing (CLIP-seq), and cDNA sequencing, we find that more than half of all AS events are regulated by multiple hnRNP proteins and that some combina
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Massive numbers of modified bases in mRNAs sculpt the epitranscriptome and play vital roles in RNA metabolism. The only known acetylated RNA modification, N-4-acetylcytidine (ac4C), is highly conserved across cell types and among species. Although the GCN5-related acetyltransferase 10 (NAT10) functions as an ac4C writer, the mechanism underlying the acetylation process is largely unknown. In this study, the NAT10/PCBP/TDP43 complex mediated mRNA ac4C formation in mammalian cells is identified. RNA-binding proteins (RBPs) are identified, affiliated with two different families, poly(rC)-binding
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orthodontically induced tooth root resorption (OIRR) is a serious complication during orthodontic treatment. Stimulating cementum repair is the fundamental approach for the treatment of OIRR. Parathyroid hormone (PTH) might be a potential therapeutic agent for OIRR, but its effects still lack direct evidence, and the underlying mechanisms remain unclear. This study aims to explore the potential involvement of long noncoding RNAs (lncRNAs) in mediating the anabolic effects of intermittent PTH and contributing to cementum repair, as identifying lncRNA-disease associations can provide valuable in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The regulation of transcription of the growth hormone (GH) gene by glucocorticoids was studied in MtT/S cells, a cell line derived from an oestrogen-induced mammotrophic tumour in the rat, and in the primary culture of the anterior pituitary gland of adult mice. The levels of the GH heteronuclear RNA (GH hnRNA), which are mainly determined by the transcription rate, increased by 25-fold during 24 h in response to dexamethasone (DEX; 1 μM) in MtT/S cells that were cultured in the medium containing charcoal-stripped serum for 7 days. The stimulatory effect of DEX on the GH hnRNA levels was detec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SUMOylation is a dynamically regulated post-translational modification involving covalent attachment of small ubiquitin-like modifiers (SUMOs) to lysine residues of target proteins. SUMOylation modulates multiple fundamental host cellular pathways, including pathways hijacked by HIV-1 to enable replication, but has not been explored by large-scale proteomics in the context of HIV-1 infection. Here, we performed a proteome-wide, mass spectrometry-based screen to identify proteins that are SUMOylated in response to HIV-1 infection. We show that infection with HIV-1 leads to the widespread increa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deletion of hnRNPK in mouse spermatogonia leads to male sterility due to arrest permatogenesis, yet the underlying molecular mechanisms remain elusive. This study investigated the testicular proteome on postnatal day 28 (P28) to elucidate the infertility associated with Hnrnpk deficiency, identifying 791 proteins with altered expression: 256 were upregulated, and 535 were downregulated. Pathway enrichment analysis demonstrated that the downregulated proteins are primarily involved in spermatogenesis, fertilization, and piRNA metabolic processes. In Hnrnpk cKO mice, key proteins essential for p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The interplay between host factors and viral components impacts viral replication efficiency profoundly. Members of the cellular heterogeneous nuclear ribonucleoprotein family (hnRNPs) have been extensively studied as HIV-1 host dependency factors, but whether they play a role in innate immunity is currently unknown. This study aimed to identify hnRNPA0 as a type I interferon (IFN)-repressed host factor in HIV-1-infected cells. Knockdown of hnRNPA0, a situation that mirrors conditions under IFN stimulation, increased LTR activity, export of unspliced HIV-1 mRNA, viral particle production, and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regulation of SMN2 exon 7 splicing is crucial for the production of active SMN protein and the survival of Spinal Muscular Atrophy (SMA) patients. One of the most efficient activators of exon 7 inclusion is hnRNP G, which is recruited to the exon by Tra2-β1. We report that in addition to the C-terminal region of hnRNP G, the RNA Recognition Motif (RRM) and the middle part of the protein containing the Arg-Gly-Gly (RGG) box are important for this function. To better understand the mode of action of hnRNP G in this context we determined the structure of its RRM bound to an SMN2 derived RNA. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuronal uptake of ascorbic acid (AA) in humans occurs via the human sodium-dependent vitamin C transporter-2 (hSVCT2). Recent studies show that a significantly lower level of vitamin C is present in the blood of epileptic patients. Consequently, focused studies investigating the involved molecular mechanisms for hSVCT2 regulation are vital to enhance vitamin C body homeostasis. Currently, little is known about the role of valproic acid (VPA), a drug utilized to treat epilepsy and a class I histone deacetylase inhibitor (HDACi), on AA uptake in neuronal systems. Thus, this study aims to examin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spatial and temporal organization of nuclear processes is increasingly interpreted through principles associated with liquid-liquid phase separation (LLPS), whereby multivalent interactions among proteins and nucleic acids generate dynamic, membraneless assemblies. In DNA repair, such assemblies have been proposed to coordinate damage sensing, signaling, and repair pathway choice; however, their causal contribution in physiological immune contexts remains under active investigation. Antibody class switch recombination (CSR) provides a stringent immunological model in which to examine these
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA epigenetics has received a great deal of attention in recent years, and the reversible N6-methyladenosine (m6A) modification on messenger RNAs (mRNAs) has emerged as a widespread phenomenon. The vital roles of m6A in diverse biological processes are dependent on many RNA-binding proteins (RBPs) with 'reader' or 'nonreader' functions. Moreover, m6A effector proteins affect cellular processes, such as stem cell differentiation, tumor development and the immune response by controlling signal transduction. This review provides an overview of the interactions of m6A with various RBPs, including
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal Muscular Atrophy is caused by homozygous loss of SMN1. All patients retain at least one copy of SMN2 which produces an identical protein but at lower levels due to a silent mutation in exon 7 which results in predominant exclusion of the exon. Therapies targeting the splicing of SMN2 exon 7 have been in development for several years, and their efficacy has been measured using either in vitro cellular assays or in vivo small animal models such as mice. In this study we evaluated the potential for constructing a mini-pig animal model by introducing minimal changes in the endogenous porcin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To put the insight into the trichloroethylene (TCE)-induced effect on the differential expression of subcellular proteins in human normal liver cell line (L-02).
METHODS: The membrane proteins and nuclear proteins of TCE-treated (8.0 mmol/L) group and controls were extracted by subcellular proteome extraction kit, respectively. The TCE-induced differentially expressions were analyzed by a two-dimensional fluorescence difference gel electrophoresis (2D-DIGE) and matrix-assisted laser desorption/ionization tandem time-of-flight spectrometry (MALDI-TOF-MS). Bioinformatics analysis was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins (hnRNPs) constitute a family of multifunctional RNA-binding proteins able to process nuclear pre-mRNAs into mature mRNAs and regulate gene expression in multiple ways. They comprise at least 20 different members in mammals, named from A (HNRNP A1) to U (HNRNP U). Many of these proteins are components of the spliceosome complex and can modulate alternative splicing in a tissue-specific manner. Notably, while genes encoding hnRNPs exhibit ubiquitous expression, increasing evidence associate these proteins to various neurodevelopmental and neurodegenerativ
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The heterogeneous nuclear ribonucleoprotein (hnRNPA2B1, hereafter A2B1) was identified as a novel nuclear DNA sensor that mediates antiviral immunity by recognizing viral DNA in the nucleus. However, it remains largely unclear whether A2B1 could function as a nucleic acid pattern-recognition receptor during cytoplasmic RNA virus infection. Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus (SFTSV), which causes severe hemorrhagic fever, is a tick-borne RNA virus that poses a serious threat to public health. In this study, we observed that during SFTSV infection, the interaction between A2B1 and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Bovine leukemia virus is a single-stranded RNA virus that targets B cell CD5+ lymphocytes in cattle. Only a tiny percentage of individuals develop malignant lymphoproliferative disorders, while most remain healthy carriers or experience persistent lymphocytosis. The exact mechanisms leading to lymphoma development are complex and not fully understood. RNA-seq analysis of cows' peripheral blood leukocytes (PBLs) with and without Bovine leukemia virus (BLV) antibodies was conducted to gain a deeper understanding of molecular events beyond BLV infection.
METHOD: Eighteen samples we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcribed enhancer maps can reveal nuclear interactions underpinning each cell type and connect specific cell types to diseases. Using a 5' single-cell RNA sequencing approach, we defined transcription start sites of enhancer RNAs and other classes of coding and noncoding RNAs in human CD4+ T cells, revealing cellular heterogeneity and differentiation trajectories. Integration of these datasets with single-cell chromatin profiles showed that active enhancers with bidirectional RNA transcription are highly cell type-specific and that disease heritability is strongly enriched in these enhancer
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования