Many fusion genes have been recognized as biomarkers and therapeutic targets. However, the lack of knowledge on protein structures and targeting approaches made it challenging to develop effective targeting therapeutics. To fill this, we developed a computational pipeline, FusionTarget, which annotates the genomic DNA breakage to RNA and protein sequences, predicts the 3D structures of fusion proteins, and performs comparative virtual screening, comparative molecular dynamics simulation, and quantitative analyses to identify the fusion protein-selective small molecules by selecting drugs with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the third case of a renal cell carcinoma bearing a fusion of the vinculin (VCL) and anaplastic lymphoma kinase (ALK) genes. Like the 2 other reported cases, this neoplasm occurred in a young patient (6 y old) with sickle-cell trait and demonstrated distinctive morphologic features including medullary epicenter, discohesive polygonal or spindle-shaped cells with prominent cytoplasmic vacuoles, and prominent lymphocytic infiltrate. The neoplastic cells demonstrated focal membranous labeling for ALK protein by immunohistochemistry, ALK gene rearrangement by fluorescence in situ hybridiz
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosomal centromeric dots (Cd) of peripheral blood in 20 couples with spontaneous abortion and 10 normal couples were studied by Cd-banding technique. The frequencies of Cd loss and centromeric dots-nucleolar organizer region (Cd-NOR) fusion were 0.36 +/- 0.15/cell and 0.31 +/- 0.20/cell in the couples with abortion, 0.22 +/- 0.13/cell and 0.20 +/- 0.19/cell in normal couples respectively. These results showed that frequencies of Cd loss and Cd-NOR fusion in couples of spontaneous abortion were significantly higher than those in the normal couples. We suggested that the occurrence of sponta
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) is not as frequently reported as the B-cell counterpart (B-ALL), only occurring in about 15% of pediatric cases with a typically heterogeneous etiology. Approximately 8% of childhood T-ALL cases have rearrangements involving the ABL1 tyrosine kinase gene at 9q34.12; although a t(9;22), resulting in a fusion of ABL1 with the BCR gene at 22q11.23 is a common occurrence in B-ALL, it is not a typical finding in T-ALL. A subset of 10 of 40 documented cases of T-ALL analyzed over a 5-year period is presented, each having gene rearrangements within band 9q3
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alveolar rhabdomyosarcoma (ARMS) is a pediatric sarcoma that typically occurs in older children predominantly arising in the trunk and extremities, and exhibits a worse prognosis than other types of rhabdomyosarcomas. Most ARMS tumors have t(2; 13) or t(1; 13) translocations, involving PAX3-FKHR and PAX7-FKHR fusion genes, respectively. These genetic events result in a molecular gain of function of the fusion protein which is proposed, in a yet unspecified mechanism, to perturb the differentiation of muscle progenitor cells. While a significant amount of work has been done characterizing PAX-F
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have hypothesized that metacentric and submetacentric chromosomes frequently observed in malignant canine tumors are a result of telomeric fusions. Therefore cells from a canine mammary pleomorphic adenoma were transformed with a plasmid containing the SV40 'early region', known to cause telomeric associations. Compared with non-transformed adenoma cells, the cells had a higher proliferative capacity and expressed the large SV40-T-antigen. Karyotype studies showed the conversion from a normal to an aberrant karyotype with an increase of bi-armed chromosomes resulting from fusions of acrocen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene fusions, like BCR/ABL1 in chronic myelogenous leukemia, have long been recognized in hematologic and mesenchymal malignancies. The recent finding of gene fusions in prostate and lung cancers has motivated the search for pathogenic gene fusions in other malignancies. Here, we developed a "breakpoint analysis" pipeline to discover candidate gene fusions by tell-tale transcript level or genomic DNA copy number transitions occurring within genes. Mining data from 974 diverse cancer samples, we identified 198 candidate fusions involving annotated cancer genes. From these, we validated and furt
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human endogenous retrovirus type W (HERV-W) is expressed in various cancers. We previously developed an adenovirus-vectored cancer vaccine targeting HERV-W by encoding an assembled HERV-W group-specific antigen sequence and the HERV-W envelope sequence Syncytin-1. Syncytin-1 is constitutively fusogenic and forms large multinucleated cell fusions when overexpressed. Consequently, immunising humans with a vaccine encoding Syncytin-1 can lead to the formation of extensive syncytia, which is undesirable and poses a potential safety issue. Here, we show experiments in cell lines that restoring an e…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Maoto () is a traditional Japanese Kampo formula composed of four crude drugs-Ephedrae Herba, Armeniacae Semen, Cinnamomi Cortex, and Glycyrrhizae Radix-and has been used to treat febrile viral illnesses. Among these, Ephedrae Herba has been associated with antiviral activity in previous studies. However, little is known about the effects of Ephedrae Herba on viral infection, spike (S) protein-mediated syncytium formation (cell-cell fusion), and viral enzymes, or the specific metabolites underlying these activities. In this study, we focused on Ephedrae Herba and comparatively ev…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The kinase activity of DNA-dependent protein kinase (DNA-PK) is required for efficient repair of DNA double-strand breaks (DSB) by non-homologous end joining (NHEJ). DNA-PK also participates in protection of mammalian telomeres, the natural ends of chromosomes. Here we investigate whether the kinase activity of DNA-PK is similarly required for effective telomere protection. DNA-PK proficient mouse cells were exposed to a highly specific inhibitor of DNA-PK phosphorylation designated IC86621. Chromosomal end-to-end fusions were induced in a concentration-dependent manner, demonstrating that the
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paramyxoviruses enter cells by fusion of their lipid envelope with the target cell plasma membrane. Fusion of the viral membrane with the plasma membrane allows entry of the viral genome into the cytoplasm. For paramyxoviruses, membrane fusion occurs at neutral pH, but the trigger mechanism that controls the viral entry machinery such that it occurs at the right time and in the right place remains to be elucidated. Two viral glycoproteins are key to the infection process-an attachment protein that varies among different paramyxoviruses and the fusion (F) protein, which is found in all paramyxo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mouse Hepatitis Virus (MHV) is a single-stranded positive sense RNA virus with the ability to promote acute and chronic diseases in mice. The MHV spike protein (S) is a major virulence determinant which in addition to binding to cellular receptors to mediate cell entry and facilitate virus spread to adjacent cells by cell-cell fusion, also is a molecular mimic of the FcγRII receptor. This molecular mimicry of FcγRII by the MHV S protein is also exhibited by other lineage 2a betacoronaviruses, with the exception of the human coronavirus HCoV-OC43. In this work we undertook a mutational analysis…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) is a clinically validated target for cancer therapy, and targeted therapies are often used in regimens for patients with a high HER2 expression level. Despite the success of current drugs, a number of patients succumb to their disease, which motivates development of novel drugs with other modes of action. We have previously shown that an albumin binding domain-derived affinity protein with specific affinity for HER2, ADAPT6, can be used to deliver the highly cytotoxic protein domain PE25, a derivative of Pseudomonas exotoxin A, to HER2 overex
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although dendritic cell (DC) vaccines are considered to be promising treatments for advanced cancer, their production and administration is costly and labor-intensive. We developed a novel immunotherapeutic agent that links a single-chain antibody variable fragment (scFv) targeting mesothelin (MSLN), which is overexpressed on ovarian cancer and mesothelioma cells, to Mycobacterium tuberculosis (MTB) heat shock protein 70 (Hsp70), which is a potent immune activator that stimulates monocytes and DCs, enhances DC aggregation and maturation and improves cross-priming of T cells mediate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Apolipoprotein A-I binding protein (AIBP) is a protein involved in regulation of lipid rafts and cholesterol efflux. AIBP has been suggested … es (MDMs), and exogenous AIBP was much less effective in T cells than in MDMs. AIBP inhibited virus-cell fusion, specifically targeting cells with lipid rafts mobilized by cell activation or Nef-containing exosomes. MDM-HIV fusion was sensitive to AIBP only in the presence of Nef provided by the virus or exosomes. Peripheral blood mononuclear cells from donor …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the second case of splenorenal fusion and the first occurrence of spleen fusion associated with a right retroperitoneal structure. Hypersplenism was cured by removal of the mass. A concomitant renal cell carcinoma and multiple adenomas within the mass were incidental clinical features. Aside from the rarity of the lesion, its documented occurrence on the right side is significant in that it provides evidence for the possible migration of spleen cells in embryogenesis as an explanation for some other splenic fusion anomalies.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently we showed that the membrane-proximal stem region of the vesicular stomatitis virus (VSV) G protein ectodomain (G stem [GS]), together with the transmembrane and cytoplasmic domains, was sufficient to mediate efficient VSV budding (C. S. Robison and M. A. Whitt, J. Virol. 74:2239-2246, 2000). Here, we show that GS can also potentiate the membrane fusion activity of heterologous viral fusion proteins when GS is coexpressed with those proteins. For some fusion proteins, there was as much as a 40-fold increase in syncytium formation when GS was coexpressed compared to that seen when the f
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Complementation analysis was performed 24 h after fusion of UV-sensitive CHO cells (CHO 12 RO) with XP cells of complementation groups A, B, C, D, F and G. The parental cells are characterized by low levels of unscheduled DNA synthesis (UDS). In all combinations, the UDS levels observed in heterokaryons were higher than those in parental mutant cells, clearly indicating cooperation of human and Chinese hamster repair functions. In heterokaryons of CHO 12 RO with XP-A and XP-C cells, the UDS values reached about the normal human level, whereas in heterokaryons with XP-B, XP-D and XP-F, UDS was
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurotropism is a defining characteristic of alphaherpesvirus pathogenicity. Glycoprotein K (gK) is a conserved virion glycoprotein of all alphaherpesviruses that is not found in other herpesvirus subfamilies. The extracellular amino terminus of gK has been shown to be important to the ability of the prototypic alphaherpesvirus herpes simplex virus 1 (HSV-1) to enter neurons via axonal termini. Here, we determined the role of the two conserved N-linked glycosylation (N48 and N58) sites of gK in virus-induced cell fusion and replication. We found that N-linked glycosylation is important to the …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We applied Western blotting, using an antibody against the carboxy terminal of the FLI1 protein, for detection of the 68-kDa EWS/FLI1 fusion protein in cultured Ewing's sarcoma cells and in four surgical biopsies of Ewing's sarcoma. Of six different human cell lines, the 68-kDa fusion protein was identified only in Ewing's sarcoma cells carrying the t(11;22)(q24;q12) translocation. The four samples from Ewing's sarcoma patients were also found to contain the 68-kDa fusion protein. The lowest detection level for total protein loaded on the gel was 0.3 microg. When whole Ewing's sarcoma cells we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования