Degenerative musculoskeletal diseases like osteoarthritis can be initiated by joint injury. Injurious overloading-induced mechanical straining of articular cartilage and subsequent biological responses may trigger cartilage degradation. One early sign of degradation is loss of aggrecan content which is potentially accelerated near chondral lesions under physiological loading. Yet, the mechanoinflammatory mechanisms explaining time-dependent degradation in regions with disparate mechanical loading are unclear and challenging to assess with experiments alone. Here, we developed computational mod
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Forty-eight million people worldwide suffer from dementia, often associated with the growth of the elderly population. There are also concerns about the younger population, where increasing acute and chronic abuse of alcohol and neurotoxic substances may contribute to brain damage and the early onset of dementia. Alzheimer's disease (AD) accounts for 60% of dementia cases and most therapies used so far have been unsuccessful. Genetic, epigenetic and vascular factors contribute to the pathogenesis of AD. Among the epigenetic mechanisms, modulation of microRNA (miRs) plays an important role. To
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying miRNA-disease associations (MDAs) is crucial for improving the diagnosis and treatment of various diseases. However, biological experiments can be time-consuming and expensive. To overcome these challenges, computational approaches have been developed, with Graph Convolutional Network (GCN) showing promising results in MDA prediction. The success of GCN-based methods relies on learning a meaningful spatial operator to extract effective node feature representations. To enhance the inference of MDAs, we propose a novel method called PGCNMDA, which employs graph convolutional networks
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-invasive prenatal testing (NIPT) is a powerful screening method for fetal aneuploidy detection, relying on laboratory and computational analysis of cell-free DNA. Although several published computational NIPT analysis tools are available, no prior comprehensive, head-to-head accuracy comparison of the various tools has been published. Here, we compared the outcome accuracies obtained for clinically validated samples with five commonly used computational NIPT aneuploidy analysis tools (WisecondorX, NIPTeR, NIPTmer, RAPIDR, and GIPseq) across various sequencing depths (coverage) and fetal DN
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Due to the low contrast and ambiguous boundaries of the tumors in breast ultrasound (BUS) images, it is still a challenging task to automatically segment the breast tumors from the ultrasound. In this paper, we proposed a novel computational framework that can detect and segment breast lesions fully automatic in the whole ultrasound images. This framework includes several key components: pre-processing, contour initialization, and tumor segmentation. In the pre-processing step, we applied non-local low-rank (NLLR) filter to reduce the speckle noise. In contour initialization step, we cascaded
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntington's disease (HD) is a neurodegenerative disorder that is caused by an abnormal elongation of the polyglutamine (polyQ) chain in the Huntington (Htt) protein. At present, the normal function of Htt of neurons as well as the mechanism by which selective neurodegeneration is caused by the expanded polyQ chain in Htt remains ambiguous. A gain of function as a result of the elongated polyQ chain can lead to abnormal interaction of the Htt protein with its interacting partners, thereby resulting in the neuropathological changes seen in the Huntington's disease. Recent research indicates pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Bioinformatics has emerged as an important tool to analyze the large amount of data generated by research in different diseases. In this study, gene expression for radicular cysts (RCs) and periapical granulomas (PGs) was characterized based on a leader gene approach.
METHODS: A validated bioinformatics algorithm was applied to identify leader genes for RCs and PGs. Genes related to RCs and PGs were first identified in PubMed, GenBank, GeneAtlas, and GeneCards databases. The Web-available STRING software (The European Molecular Biology Laboratory [EMBL], Heidelberg, Baden-Württe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immunoinformatics focuses on modeling immune responses for better understanding of the immune system and in many cases for proposing agents able to modify the immune system. The most classical of these agents are vaccines derived from living organisms such as smallpox or polio. More modern vaccines comprise recombinant proteins, protein domains, and in some cases peptides. Generating a vaccine from peptides however requires technologies and concepts very different from classical vaccinology. Immunoinformatics therefore provides the computational tools to propose peptides suitable for formulati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mathematical modelling has been used to comprehend the pathology and the assessment of different treatment techniques such as heart failure and left ventricular assist device therapy in the cardiovascular field. In this study, an in-silico model of the heart is developed to understand the effects of idiopathic dilated cardiomyopathy (IDC) as a pathological scenario, with mechanisms described at the cellular, protein and organ levels. This model includes the right and left atria and ventricles, as well as the systemic and pulmonary arteries and veins. First, a multi-scale model of the whole hea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
European funding under framework 7 (FP7) for the virtual physiological human (VPH) project has been in place now for nearly 2 years. The VPH network of excellence (NoE) is helping in the development of common standards, open-source software, freely accessible data and model repositories, and various training and dissemination activities for the project. It is also helping to coordinate the many clinically targeted projects that have been funded under the FP7 calls. An initial vision for the VPH was defined by framework 6 strategy for a European physiome (STEP) project in 2006. It is now time t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis is a neglected infectious disease that constitutes a threat to both humans and animals. Comprehension about the epidemiological behavior and population dynamics of Leptospira may be helpful for the development of control measures. Thus, an effort was made to organize leptospiral sequences in a new and specific database. In addition, online bioinformatics tools were clustered in a web portal to facilitate sequences manipulation by scientists. LepBank (http://.lepbank.ufpel.edu.br) is a Leptospira sequences repository and a suite for systematics, which brings simplicity to leptospi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent studies have identified broadband phenomena in the electric potentials produced by the brain. We report the finding of power-law scaling in these signals using subdural electrocorticographic recordings from the surface of human cortex. The power spectral density (PSD) of the electric potential has the power-law form P(f ) approximately Af(-chi) from 80 to 500 Hz. This scaling index, chi = 4.0+/-0.1, is conserved across subjects, area in the cortex, and local neural activity levels. The shape of the PSD does not change with increases in local cortical activity, but the amplitude, A, incr
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori is the pathogenic bacterium linked to gastric and duodenal ulcers and gastric carcinoma. Genomic diversity of the organism has enabled new insights into its population biology through comparative genomics. genoBASE pylori is an online databank of several virulence-linked and phylogenetic markers of H. pylori strains obtained from different human populations. This knowledgebase is built upon a relational database management system which is connected to visualize the presence of known, pathogenicity markers such as the co-ordinates within the cag pathogenicity island (cagPAI)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Agent-based models of malaria transmission are useful tools for understanding disease dynamics and planning interventions, but they can be computationally intensive to calibrate. We present a multitask deep learning approach for emulating and calibrating a complex agent-based model of malaria transmission. Our neural network emulator was trained on a large suite of simulations from the EMOD malaria model, an agent-based model of malaria transmission dynamics, capturing relationships between immunological parameters and epidemiological outcomes such as age-stratified incidence and prevalence ac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reverse epidemiology is a mathematical modelling tool used to ascertain information about the source of a pathogen, given the spatial and temporal distribution of cases, hospitalisations and deaths. In the context of a deliberately released pathogen, such as Bacillus anthracis (the disease-causing organism of anthrax), this can allow responders to quickly identify the location and timing of the release, as well as other factors such as the strength of the release, and the realized wind speed and direction at release. These estimates can then be used to parameterise a predictive mechanistic mod
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a male term newborn presenting with a congenital macrocephaly 3.5 standard deviations above the median, with a wide and tense anterior fontanel, splayed calvarial sutures, and muscular hypotonia. Antenatal head circumferences were repeatedly below the median. A postnatal head ultrasound showed a large right intracerebral mass with right lateral ventricle compression, right temporal horn dilation, and right frontal horn enlargement with lateral displacement. Additional imaging by computed tomography scan and magnetic resonance imaging was performed. A decompression was performed and h
Клинический случайСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mammals adapt to a rapidly changing world because of the sophisticated perceptual and cognitive function enabled by the neocortex. The neocortex, which has expanded to constitute nearly 80% of the human brain seems to have arisen from repeated duplication of a stereotypical template of neurons and synaptic circuits with subtle specializations in different brain regions and species. Determining the design and function of this microcircuitry is therefore of paramount importance to understanding normal and abnormal higher brain function. Recent advances in recording synaptically-coupled neurons h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peptide therapeutics offer great promise in drug discovery, yet the accurate identification of peptide toxicity remains essential for both safety assessment and biodefense. We developed ToxMamba, a toxic peptide prediction framework that integrates Implicit Structure Model (ISM)-derived pretrained embeddings, state space models, multi-scale feature learning, and ensemble inference. Built upon the Mamba architecture, ToxMamba enables efficient sequence modeling and captures contextual patterns across multiple receptive fields from parallel branches. On the independent test set, ToxMamba consist
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phages (or bacteriophages) play a critical role in microbial communities, and accurately predicting the hosts of phages is essential for understanding the dynamics of these viruses and their impact on bacterial populations. In the prediction of classification of phage hosts, feature extraction is a critical step that directly affects the accuracy of the predictions. Among the techniques used for feature extraction, k-mers are the most commonly employed method. Although many methods based on k-mers have been proposed, these methods typically use only the frequency information of k-mers as featu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effects of external perturbations (or disorder) in the Hopf bifurcations of a central pattern generator (CPG) network of neurons that serves as a model for the circuit realization of ANIBOT-a biologically-inspired animal robot with four legs-are studied, analytically and computationally, from the standpoint of homeostasis. In particular, we employ recent developments in the mathematical description of homeostasis, e.g., input-output functions, to explore the CPG response to perturbations of the network connectivity, the internal dynamics of the neurons, and electronic noise as it arises in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования