PURPOSE: The aim of this study was to discover and optimize a novel chemical scaffold capable of selectively inhibiting p38α, a kinase involved in inflammatory and neurodegenerative diseases. Despite decades of work, most p38α inhibitors have failed clinically due to limited selectivity, compensatory signaling, and safety issues. We sought to combine computational and experimental approaches to identify potent, drug-like, and selective inhibitors suitable for further development.
METHODS: A consensus virtual screening workflow (ESSENCE-Dock), integrating DiffDock, LeadFinder, and GNINA, was a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer remains a major global health challenge, driven in part by dysregulation of key oncogenic signaling pathways such as phosphatidylinositol 3-kinase alpha (PI3Kα), which plays a central role in tumor growth and therapeutic resistance. In this study, an integrative computational strategy combining quantitative structure-activity relationship (QSAR) modeling, drug-likeness and ADMET prediction, and molecular docking was applied to investigate dammarane-type triterpenoid derivatives as potential PI3Kα inhibitors. A dataset of 22 reported compounds was analyzed using multiple linear regressio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing prevalence of multidrug-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) has necessitated the development of alternative therapeutic strategies targeting bacterial virulence factors. This study employed an integrated in silico approach to identifying potential inhibitors of the iron-regulated surface determinant B Near-iron Transporter domain, a key protein involved in heme acquisition and pathogenicity. Virtual screening and molecular docking identified certain similarity-selected small molecules possessing strong binding affinities, with (4-(1-oxoisoindolin-2-yl)benzoic acid (TOP1) and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triple-negative breast cancer (TNBC) represents one of the most aggressive and therapeutically challenging subtypes of breast cancer, characterized by the absence of estrogen receptor, progesterone receptor, and HER2 expression. Due to the lack of specific molecular targets, treatment options for TNBC remain limited, resulting in higher recurrence rates, increased metastatic potential, and poorer overall survival compared with other breast cancer subtypes. Therefore, identifying novel therapeutic targets and potential bioactive compounds is essential for improving TNBC management. In this stud
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic Hepatitis C Virus (HCV) infection remains a significant global health challenge, necessitating the development of pan-genotypic inhibitors to overcome the limitations of genotype-specific therapies. The NS5B RNA-dependent RNA polymerase, particularly its conserved Palm II region, is a promising target for such broad-spectrum antivirals. In this study, we integrated advanced deep learning and multi-scale computational approaches to design novel pan-genotypic HCV NS5B inhibitors. First, we employed AlphaFold3 to predict the high-resolution structures of NS5B polymerase from genotypes wit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral respiratory infections still exist as a major global health concern. Influenza A viruses and human metapneumoviruses are among the main pathogens responsible for infections that can progress to severe acute respiratory forms. Despite the availability of certain therapeutic options, the need for effective treatment remains an issue. The exploration of innovative approaches based on medicinal plants, capable of simultaneously targeting several viruses, represents a promising strategic option for limiting the viral activity of these pathogens. In this work, an integrated computational workf
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic autoimmune inflammatory disease, and ginger contains phenolic constituents with anti-inflammatory potential. This study evaluated the antiarthritic efficacy of ginger ethanolic extract (GE) and explored its potential mechanisms through integrated pharmacological and computational approaches. Methods: GE was prepared by 70% ethanol reflux extraction and administered to adjuvant-induced arthritis (AIA) rats, with methotrexate as a positive control. Body weight; paw swelling; arthritis index; spleen index; and serum interleukin-6 (IL-6
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoporosis is a prevalent skeletal disorder characterized by excessive bone resorption and an increased risk of fragility fracture. Cathepsin K (CatK), a lysosomal cysteine protease predominantly expressed in osteoclasts, is an established target for anti-resorptive drug development. Here, an integrated computational workflow comprising virtual screening, molecular docking, 300 ns molecular dynamics (MD) simulations, molecular mechanics/Poisson-Boltzmann surface area (MM/PBSA) calculations, and drug-likeness/ADMET prediction was used to prioritize natural product-derived CatK ligands from th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Nitrogen-rich carbocyclic cage compounds serve as versatile platforms for the design and development of explosives with tailored properties. Their compact and rigid structure due to efficient packing leads to high crystal density. Moreover, their structural characteristics and amenability to functionalization make them indispensable in the quest for more powerful and efficient energetic materials. Adamantane derivatives are promising candidates for high-energy materials due to their unique molecular structure and the ability to introduce explosophoric groups onto their scaffold. In th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global emergence of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis necessitates innovative therapeutic strategies targeting essential metabolic pathways. This study employs an integrated computational approach to identify inhibitors of IrtAB, a critical iron transporter in Mtb, leveraging structure-based drug design to overcome existing resistance mechanisms. Virtual screening of 201,544 compounds from the ZINC20 database was performed using defined drug-likeness criteria (MW 300-350 Da, LogP 1-3.5, neutral charge at pH 7.4), followed by molecular docking. Three lead compounds demonstrated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Microplastics are tiny plastic particles, typically less than 5 mm in size, formed from the breakdown of larger plastic products. This breakdown releases additives, including benzyl butyl phthalate (BBP), into the environment. Humans can be exposed to BBP through contaminated food and water, inhalation, and dermal contact.
AIM: Research suggests that BBP, like other phthalates, may have neurotoxic effects, potentially contributing to neurodevelopmental disorders, though its specific toxic targets are not yet clear.
METHODOLOGY: In this study, high-performance computational method
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
β-site amyloid precursor protein cleaving enzyme 1 (BACE1) is a central therapeutic target in Alzheimer's disease, as it catalyzes the rate-limiting step in amyloid-β production. Verubecestat (VER), a clinical BACE1 inhibitor, failed in late-stage trials due to limited efficacy and safety concerns. This study employed an integrative computational approach to design VER derivatives with improved binding affinity, stability, and pharmacokinetic profiles. Structural similarity analysis, Molecular docking, frontier molecular orbital (FMO) analysis, pharmacophore modeling, 200 ns molecular dynamics
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In late 2019, the emergence of a novel coronavirus led to its identification as SARS-CoV-2, precipitating the onset of the COVID-19 pandemic. Many experimental and computational studies were performed on SARS-CoV-2 to understand its behavior and patterns. In this research, Molecular Dynamic (MD) simulation is utilized to compare the behaviors of SARS-CoV-2 and its Variants of Concern (VOC)-Alpha, Beta, Gamma, Delta, and Omicron-with the hACE2 protein. Protein structures from the Protein Data Bank (PDB) were aligned and trimmed for consistency using Chimera, focusing on the receptor-binding dom
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Manganese oxides (MnxOy) have been widely applied in various chemical industrial processes owing to their long lifetime, low cost and high abundance. They have been used as co-reactants for the elimination of volatile organic compounds (VOCs); however, their oxidation mechanism is not clearly established. In this theoretical study, interaction capacities between benzene (C6H6) and MnxOy clusters, which were modeled with MnO2 and Mn2O3 molecules, were investigated by quantum chemical computations using density functional theory (DFT) with the PBE-D3 functional. The interaction capacity between
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Anorexia nervosa (AN) is a neuropsychological public health concern with a socially disabling routine and affects a person's healthy relationship with food. The role of the NNAT (Neuronatin) gene in AN is well established. The impact of mutation at the protein's post-translational modification (PTM) site has been exclusively associated with the worsening of the protein's biochemical dynamics.
METHODS: To understand the relationship between genotype and phenotype, it is essential to investigate the appropriate molecular stability of protein required for proper biological functioning.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: More than fifty years after the commercialization of the Ventolin metered-dose inhaler (MDI), its constituent active ingredient, salbutamol sulfate (SS), remains the most prescribed short-acting beta agonist for the first-line treatment of acute asthma attacks and the metered-dose inhaler remains its primary dosage form. The first generation of Ventolin MDI was developed at a time when environmental and regulatory concerns were less stringent than today. The MDI industry is now on the verge of a second major reformulation effort in response to environmental concerns. This paper s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleotide excision repair (NER) excises a variety of environmentally derived DNA lesions. However, NER efficiencies for structurally different DNA lesions can vary by orders of magnitude; yet the origin of this variance is poorly understood. Our goal is to develop computational strategies that predict and identify the most hazardous, repair-resistant lesions from the plethora of such adducts. In the present work, we are focusing on lesion recognition by the xeroderma pigmentosum C protein complex (XPC), the first and required step for the subsequent assembly of factors needed to produce succe
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have developed an on-the-fly kinetic Monte Carlo (KMC) model to predict the degradation mechanisms and fates of intermediates and byproducts that are produced during aqueous-phase advanced oxidation processes (AOPs). The on-the-fly KMC model is composed of a reaction pathway generator, a reaction rate constant estimator, a mechanistic reduction module, and a KMC solver. The novelty of this work is that we develop the pathway as we march forward in time rather than developing the pathway before we use the KMC method to solve the equations. As a result, we have fewer reactions to consider, an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human metapneumovirus (HMPV) is a leading cause of acute respiratory tract infections, particularly in pediatric, elderly, and immunocompromised populations. Despite its clinical significance, no licensed vaccine is currently available for HMPV. This study employed an in silico immunoinformatics-based approach to design a multi-epitope subunit vaccine candidate targeting key structural proteins of HMPV, including Matrix2-2, Matrix2-1, Matrix, and Phosphoprotein. B-cell and T-cell epitopes were systematically predicted and screened based on their immunogenicity, antigenicity, non-toxicity, and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Advancing next-generation probiotics (NGPs) as precision therapeutics depends on a detailed understanding of host-microbe molecular interactions, as these organisms exert targeted effects through defined bioactive molecules rather than broad, nonspecific mechanisms. This review addresses the need to systematically organize emerging knowledge on microbe-derived molecules (MDMs) that underpin NGP efficacy.
AREAS COVERED: This narrative review summarizes recent discoveries of MDMs isolated from NGPs and classifies them based on three principal molecular interaction interfaces: prot
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования