A global collection of 26 isolates of Salmonella typhi was investigated by sequencing a total of 3336 bp in seven housekeeping genes. Only three polymorphic sites were found and the isolates fell into four sequence types. These results show that S. typhi is a recent clone whose last common ancestor existed so recently that multiple mutations have not yet accumulated. Based on molecular clock rates for the accumulation of synonymous polymorphisms, we estimate that the last common ancestor of S. typhi existed 15,000-150,000 years ago, during the human hunter-gatherer phase and prior to the devel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To compare the differences in chemical structure between vitrinite and inertinite and their effects on transformation and utilization, this paper separated vitrinite and inertinite from three parent coal samples (high-volatile bituminous coal (Rmax (%) = 0.65), medium-volatile bituminous coal (Rmax (%) = 1.25), and low-volatile bituminous coal (Rmax (%) = 1.7)), and the differences in chemical structure were analyzed from three aspects: aromatic structure, aliphatic structure, and cross-linking structure. The molecular structure model of a single maceral was constructed, and the chemical bond
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteins can be studied through their sequence statistics or structural properties. These represent complementary views that are useful but lack a quantitative framework to tell, family by family, which is most informative and how to combine them. We introduce a framework that builds both views in parallel: amino acid (AA) alignments are translated into parallel alignments over a 3D interaction (3Di) structure-informed alphabet. Variational autoencoders compress each into a two-dimensional map, and direct coupling analysis places a shared coevolutionary energy on both maps, turning them into l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hand, foot, and mouth disease (HFMD) is a common global infectious disease in children. Coxsackievirus A6 (CVA6) has emerged as the most important pathogen of HFMD. Molecular epidemiological and evolutionary surveillance of CVA6 is vital for the prevention and control of HFMD outbreaks. This study comprehensively analyzed the molecular epidemiology and genetic characteristics of CVA6 circulating in mainland China during 1992-2023. Phylogenetic analysis based on VP1 sequences revealed that in addition to the previously reported subgenotypes B1, B2, C1, D2, D3a, and D3b, genotype A was first ide
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutation is one of the most important drivers of viral evolution and genome variability, allowing viruses to potentially evade host immune responses and develop drug resistance. In the context of COVID-19, local genomic surveillance of circulating virus populations is therefore critical. The goals of this study were to describe the distribution of different SARS-CoV-2 lineages, assess their genomic differences, and infer virus importation events in Bangladesh. We individually aligned 1965 SARS-CoV-2 genome sequences obtained between April 2020 and June 2021 to the Wuhan-1 sequence and used the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Babesia ovata, belonging to the phylum Apicomplexa, is an infectious parasite of bovids. It is not associated with the manifestation of severe symptoms, in contrast to other types of bovine babesiosis caused by B. bovis and B. bigemina; however, upon co-infection with Theileria orientalis, it occasionally induces exacerbated symptoms. Asymptomatic chronic infection in bovines is usually observed only for B. ovata. Comparative genomic analysis could potentially reveal factors involved in these distinguishing characteristics; however, the genomic and molecular basis of these phenotyp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, a new Chlamydia-related organism, Protochlamydia naegleriophila KNic, was discovered within a Naegleria amoeba. To decipher the mechanisms at play in the modeling of genomes from the Protochlamydia genus, we sequenced the full genome of Pr. naegleriophila, which includes a 2,885,090 bp chromosome and a 145,285 bp megaplasmid. For the first time within the Chlamydiales order, we describe the presence of a clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) system, the immune system of bacteria, located on the chromosome. It is composed of a small CRISPR locus comprising
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
China's Guangdong Province is located along the same latitude as Kolkata, India and Dhaka, Bangladesh, and is also considered a source of epidemic cholera. However, molecular description and the genetic relationships between Vibrio cholerae O1 El Tor isolates in Guangdong remain unclear. In this study, 381 clinical V. cholerae O1 isolates recovered from cholera cases presenting in Guangdong between 1961 and 2013 were investigated by PCR, amplicon sequencing and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). During this time frame, four distinct epidemic periods (1-4) were observed based on the diffe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trypanosoma congolense is the most important agent of nagana, a wasting livestock trypanosomosis in sub-Saharan Africa. This species is a complex of three subgroups (Savannah, Forest and Kilifi) that differ in virulence, pathogenicity, drug resistance, vectors, and geographical distribution. Congopain, the major Cathepsin L-like cysteine protease (CP2) of T. congolense, has been extensively investigated as a pathogenic factor and target for drugs and vaccines, but knowledge about this enzyme is mostly restricted to the reference strain IL3000, which belongs to the Savannah subgroup. In this wo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Guizhou province, located between border provinces and Central province of China, plays a crucial role in the transmission of HIV-1, implying it is important to monitor the epidemic of HIV-1 in this region. Available HIV-1 infected patients' plasma (n=78) were collected from Tongren city, Eastern Guizhou. Full-length gag, partial pol and env gene sequences were amplified and analyzed using phylogenetic, recombinant and Bayesian molecular clock approaches. Phylogenetic and recombinant analyses showed that CRF01_AE predominated among injecting drug users and heterosexuals in Tongren city with 85
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
L-asparaginases (E.C.3.5.1.1, L- ASNases) have been widely used in clinical practice as chemotherapeutic drugs of acute lymphoblastic leukaemia (ALL). In order to evaluate the structural and functional role of selected residues in ASNases we report the screening of a library of L-ASNase mutants aiming to find detrimental mutations that significantly affect catalysis and substrate specificity. The library of mutants was created using the staggered extension process (StEp) and the genes of L- ASNases from Erwinia chrysanthemi (ErL-ASNase) and Erwinia carotovora (EcaL-ASNase). A mutant that displ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enamelin (ENAM) has been shown to be a crucial protein for enamel formation and mineralization. Previous molecular analyses have indicated a probable origin early in vertebrate evolution, which is supported by the presence of enamel/enameloid tissues in early vertebrates. In contrast to these hypotheses, ENAM was only characterized in mammals. Our aims were to 1) look for ENAM in representatives of nonmammalian tetrapods, 2) search for a pseudogene in the chicken genome, and 3) see whether the new sequences could bring new information on ENAM evolution. Using in silico approach and polymerase
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper describes the first isolation of a new Shigella flexneri serotype, designated 4s, in Beijing, China. Genotypic and phenotypic profiling suggests that this isolate is a clone of the S. flexneri serotype X variant reference strain. Of particular concern is the multidrug resistance exhibited by this isolate.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance genes in pathogenic bacteria belong to the most rapidly evolving DNA sequences, which results in an enormous structural diversity of resistance effectors. Structural modifications of resistance genes by mutation and recombination, together with a multitude of events that stimulate their mobility and expression, allow microorganisms to survive in environments saturated with antimicrobial agents of various types and generations. Genes coding for beta-lactamases in Gram-negative bacteria are a fascinating example of this multifocal and multidirectional evolution, with the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the transmission dynamics of generalist pathogens that infect multiple host species is essential for their effective control. Only by identifying those host populations that are critical to the permanent maintenance of the pathogen, as opposed to populations in which outbreaks are the result of 'spillover' infections, can control measures be appropriately directed. Rabies virus is capable of infecting a wide range of host species, but in many ecosystems, particular variants circulate among only a limited range of potential host populations. The Serengeti ecosystem (in northwester
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigates the evolutionary history of vertebrate red blood cell carbonic anhydrase (CA) by characterizing the isozyme properties and nucleotide sequence of an ancient fish, the longnose gar ( Lepisosteus osseus). The inhibitor sensitivities of gar rbc CA closely resembled those for mammalian CA II, as well as those for CAs from more recently evolved fishes. The kinetic properties of gar rbc CA were not closely aligned with either mammalian CA I and CA II, but fit well into an emerging phylogenetic pattern for early vertebrates. Gar rbc CA cDNA was also amplified from mRNA using 5
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plague, one of the most devastating diseases of human history, is caused by Yersinia pestis. In this study, we analyzed the population genetic structure of Y. pestis and the two other pathogenic Yersinia species, Y. pseudotuberculosis and Y. enterocolitica. Fragments of five housekeeping genes and a gene involved in the synthesis of lipopolysaccharide were sequenced from 36 strains representing the global diversity of Y. pestis and from 12-13 strains from each of the other species. No sequence diversity was found in any Y. pestis gene, and these alleles were identical or nearly identical to al
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A genomic DNA library of a Liberian strain of Onchocerca volvulus was prepared in the vector bacteriophage lambda gt10. The library was differentially screened by hybridisation with radiolabelled total DNA from the homologous parasite, two heterologous Onchocerca parasites (Onchocerca gibsoni and Onchocerca gutturosa) and human liver cells. A clone (C1A1) was isolated whose binding to O. volvulus DNA was at least 50 times stronger than to the other parasite DNA samples. No binding was observed with human DNA. The insert of C1A1 was subcloned into the filamentous phage vector M13 mp18 and seque
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The evolution and diversification of respiratory structures enabled arthropods to colonize terrestrial habitats multiple times independently. One such group of ancestrally marine arthropods, the Isopods, successfully colonized freshwater and terrestrial habitats. The transition to land was facilitated by the evolution of novel respiratory organs on the abdomen, the pleopodal lungs, which either complemented or replaced the ancestral pleopodal gills. Here, we review the current understanding of terrestrial isopod respiratory structure evolution and development and explore its potential molecula
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Host-parasite interactions are ubiquitous and are important drivers of host diversification and evolution. In particular, host immune systems are frequent targets of parasite-driven selection. The resulting rapid evolution of immune genes is usually framed as an ongoing 'arms race' between a co-evolving pair of host and parasite species. However, immune evolution may often be driven by the acquisition of a new and unfamiliar parasite. For instance, when marine populations of threespine stickleback (Gasterosteus aculeatus) colonized freshwater lakes approximately 12,000 years ago,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования