INTRODUCTION: Distant metastasis accounts for the majority of Breast Cancer (BC)-related mortality. The brain is one of the most common regions of metastasis. However, the underlying molecular mechanisms remain uncertain.
METHODS: In this study, gene expression profiles were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Datasets GSE100534 and GSE52604, containing 16 primary brain tumor samples and 38 breast cancer brain metastasis samples, were used to identify the Differentially Expressed Genes (DEGs). The Metascape database was used to analyze enriched Gene Ontology (GO) entri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Deregulation of cellular metabolism is a hallmark of cancer, in which tumour cells upregulate glycolysis and preferentially ferment glucose to lactate in the 'Warburg effect'. Tumour-specific upregulation of hexokinase 2 (HK2), which catalyses the first rate-limiting step of glycolysis, is a key driver of this phenotype and represents a promising therapeutic target in glioblastoma. Here, we sought to identify HK2-associated tumour processes that could serve as therapeutic co-targets by profiling the transcriptomic consequences of HK2 knockdown (HK2KD) in model established gliobla
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) and Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) are distinct diseases that may share overlapping molecular mechanisms, particularly in immune dysregulation. However, the specific regulatory pathways driving this shared pathophysiology have remained elusive, as prior studies have been limited by single-level data. To dissect this common pathobiology, we implemented a synergistic computational framework, integrating bulk transcriptomics with single-cell data. Through a multi-tiered analysis pipeline employing differential expression, weighted gene co-expression networks, and mach
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epigenetic landscape and tumor microenvironment (TME) interactions of non-functioning pituitary adenomas (NFPAs), benign tumors with high morbidity and recurrence rates, are not well characterized. We completed single-nucleus (sn) multiomics assays on 4 gonadotrope NFPAs (34,819 cells) and 11 non-diseased postmortem control pituitaries (51,535 cells), finding decreased proportions of tumor-associated endothelial cells and pericytes and increased proportions of macrophages. We identified bidirectional tumor-macrophage crosstalk comprising nine ligand-receptor interactions and experimentally
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung cancer (LC), particularly lung adenocarcinoma, is a leading cause of cancer-related mortality, while systemic sclerosis-associated interstitial lung disease (SSc-ILD) is a chronic fibrotic autoimmune disorder. Growing evidence suggests shared molecular mechanisms between these conditions, although their genetic overlap remains insufficiently characterized. In this study, integrative bioinformatics approaches were applied to identify common differentially expressed genes (DEGs) and regulatory networks linking LC and SSc-ILD. Comparative transcriptomic analysis revealed 72 shared DEGs, incl
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer-associated fibroblasts (CAFs) orchestrate immune-excluded tumor microenvironment (TME), but the CAF heterogeneity remains incompletely understood in gastric cancer (GC). In this study, we integrated multicohort single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), spatial transcriptomics, and bulk transcriptomic data to construct a comprehensive atlas of the GC TME. Unsupervised clustering identified eight transcriptionally distinct CAF subpopulations, among which CTHRC1+ CAFs were selectively enriched in tumors and showed the strongest association with T cell exclusion. Pseudotemporal trajectory ana
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sample-specific gene regulatory network analysis can reveal molecular heterogeneity associated with individual characteristics, such as anticancer drug sensitivity. The varying coefficient model with kernel-based L1 regularization enables the estimation of such networks, but its performance depends strongly on hyperparameter selection. Conventional cross-validation is computationally intensive and provides only an averaged evaluation across samples, limiting its suitability for sample-specific analysis. To address these limitations, we propose doubleS-GCV, a sample-specific generalized cross-v
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: The transcription factor OCT4A, a well-established master pluripotency factor, exerts regulatory effects on cell fate determination that are closely associated with its protein levels. This study aims to uncover the downstream gene profile features relevant to tumorigenic potential mediated by OCT4A under varying protein abundance in somatic cancer cells (SCCs).
MATERIALS AND METHODS: CRISPR-Cas9-mediated knockout and doxycycline-inducible OCT4A expression systems were established in cervical (HeLa) and hepatocellular (HepG2, Huh7) cancer cells. Single-cell sequencing, spatial transcrip
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tertiary lymphoid structures (TLSs) are lymphoid structures found in non-lymphoid tissues, which have been involved in the pathogenesis of multiple chronic diseases including tumors. TLSs are associated with better prognosis and response to immunotherapy in most types of tumors. However, what their associations with prognosis and the exact roles of TLS-related genes in gallbladder cancer (GBC) are still unclear. Here, we investigated the associations of TLS with the prognosis in 85 patients with GBC. Our results showed that the presence of intra-tumoral TLS was negatively associated with T sta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Next-generation sequencing technology enables uniform and impartial assessment of cancer diagnoses and prognosis. However, such studies are mostly type-specific, and capturing shared genomic abnormalities responsible for neoplastic transformation and progression is a challenging task. Pan-cancer analysis offers insights into the shared and unique molecular mechanisms driving cancer. We conducted an integrated gene-expression analysis using 10,629 samples from 30 distinct cancer types characterized by The Cancer Genome Atlas (TCGA). A gene co-expression network was constructed and genes overlap
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundNasopharyngeal carcinoma (NPC) is a neoplasm that arises from the mucosal lining of the nasopharynx. Recent investigations have underscored that reprogramming of lipid metabolism is a salient metabolic alteration in neoplastic cells. Consequently, identifying lipid metabolism-associated biomarkers in NPC is of paramount importance.MethodsUtilizing transcriptomic datasets, differentially expressed genes (DEGs) were identified from GSE12452, contrasting NPC specimens with normal controls. The Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA) was employed to discern key module genes
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: In this study, we employed a bioinformatics approach to identify diagnostic biomarkers for tongue squamous cell carcinoma (TSCC) and investigate the infiltration of immune cells in TSCC, as well as the relationship between biomarkers and immune cells.
METHODS: We obtained the TSCC expression dataset from a database and conducted differential gene expression analysis between TSCC and adjacent normal tissues using R software. Enrichment analysis of the differentially expressed genes (DEGs) was performed using the DAVID website. Protein interaction networks for the DEGs were construct
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: MicroRNAs (miRNAs) exhibit essential regulatory functions related to cell growth, apoptosis, development and differentiation. Dysregulated expression of miRNAs is associated with a wide variety of human diseases. As such miRNA signatures are valuable as biomarkers for disease and for making treatment decisions. Hepatitis B virus (HBV) is a major risk factor for hepatocellular carcinoma (HCC). Here we screened for miRNAs in chronic HBV associated HCC.
METHODS: To determine the miRNAs in HCC occurrence associated with HBV infection, we analyzed global miRNA expression profiles in 12
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The differences in molecular mechanisms between osteochondroma and bizarre parosteal osteochondromatous proliferation (BPOP) remain to be fully elucidated. In the present study, the differentially expressed genes between BPOP and osteochondroma were obtained from the Gene Expression Omnibus online database, and the associations among these genes were analyzed using the Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery (DAVID) online bioinformatics software. The results revealed several differentially expressed genes between human BPOP and osteochondroma. These differentially exp
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurofibromatosis 2 (NF2) is a tumor predisposition syndrome in which affected individuals develop nervous system tumors at an increased frequency. The most common tumor in individuals with NF2 is the schwannoma, which is composed of neoplastic Schwann cells lacking NF2 gene expression. Moreover, inactivation of the NF2 gene is observed in nearly all sporadic schwannomas, suggesting that the NF2 gene is a critical growth regulator for Schwann cells. In an effort to gain insights into the function of the NF2 gene product, merlin or schwannomin, we performed a detailed functional analysis of eig
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Many evidences showed that cyclooxygenase-2 (COX-2), an enzyme that catalyzes the synthesis of prostaglandins, has an important role in carcinogenesis. It has been observed in experimental models that selective COX-2 inhibitors suppress the formation of tumors including tongue carcinoma. The aim of this study was to investigate the immunohistochemical expression of COX-2 in oral squamous cell carcinoma (OSCC) compared to normal oral mucosa and oral dysplasia.
MATERIALS AND METHODS: A total of 60 paraffined blocks (20 cases of OSCC, 20 cases of oral epithelial dysplasia and 20 case
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Hodgkin and Reed/Sternberg (HRS) tumor cells of classical Hodgkin lymphoma (HL) and the lymphocyte-predominant tumor cells of nodular lymphocyte-predominant HL are both derived from germinal center B cells. HRS cells, however, have largely lost their B-cell gene-expression program and coexpress genes typical of various types of hematopoietic cells. Multiple signaling pathways show a deregulated activity in HRS cells. The genetic lesions involved in the pathogenesis of HL are only partly known, but numerous members and regulators of the NF-κB and JAK/STAT signaling pathways are affected, su
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mutations of c-kit gene, which encodes a transmembrane receptor tyrosine kinase (CD117-KIT) or activation of CD117, lead to the activation of signal transduction cascades regulating cell proliferation, apoptosis, chemotaxis, and adhesion. The aim of this study was to investigate the expression of CD117 in normal, inflammatory, neoplastic, and reactive lesions of the thyroid. Using polyclonal anti-CD117 antibody, we performed immunohistochemical staining on tissue blocks from 230 cases obtained from the archives of the Department of Pathology, Ondokuz Mayis University (Samsun, Turkey), coll
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To investigate the effect of DACH1 over-expression on proliferation and invasion of laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC).
METHODS: The 120 cases of LSCC tumors and 114 adjacent non-neoplastic tissues were collected to detect the expression of DACH1 by immunohistochemistry. The changes of DACH1 expression from each group were assessed and correlated to the clinical parameters of the patients. Plasmid-DACH1 was transfected into Hep-2 cells to up-regulate the expression of DACH1C. Real-time PCR, Western blot, CCK8 and transwell assay were used to verify the cell proliferation and
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite significant advancements in identifying novel therapeutic targets and compounds, cancer stem cells (CSCs) remain pivotal in driving therapeutic resistance and tumor progression in gastric cancer (GC). High-resolution knowledge of the transcriptional programs underlying the role of CSC niche in driving tumor stemness and progression is still lacking. Herein, spatial and single-cell RNA sequencing of 32 human gastric mucosa tissues at various stages of malignancy, illuminating the phenotypic plasticity of tumor epithelium and transcriptional trajectory from mature gastric chief cells to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования