Gastric adenocarcinoma not located in the cardia still remains second only to lung cancer as the leading cause of cancer-related mortality w … mismatch repair is associated with gastric cancer. The most common genetic abnormalities tend to be loss of heterozygosity of particularly tumor suppressor p53 gene or "adenomatous polyposis coli" gene. The latter leads to gastric carcinogenesis through changes related to E-cadherin-catenin complex, which plays a critical role in normal tissue architecture maintenance. …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Follicular lymphoma (FL) constitutes the second most common non-Hodgkin's lymphoma in the Western world. The clinical course is var … -activated cell-sorted (FACS) FL specimens for chromosomal copy number changes and 46 specimens for loss of heterozygosity (LOH).
RESULTS: We report (a) previously unknown high-frequency copy-neutral LOH (uniparental disomy) in FL on chromosomes 1p (approximately 50%) and 6p (approximately 30%); (b) that del6q is complex, as reported, with at least two regions of minim …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mouse cpk mutation is the most extensively characterized murine model of polycystic kidney disease (PKD) and closely resembles human aut … y origin, in the livers of both aged D2-+/cpk and F(1) heterozygotes. Genetic analysis demonstrated loss of heterozygosity at the cpk interval and supports a loss-of-function model for biliary cysts. We conclude that the cpk allele contains an inactivating mutation which disrupts tubulo-epithelial differentiation in the kidney and biliary tract. Expression of the biliar …
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SMARCA4- deficient undifferentiated uterine sarcoma (SDUS) is a rare, highly aggressive SWI/SNF-deficient malignancy that can morphologicall … ed biallelic SMARCA4 inactivation (somatic frameshift deletion c.3717del, p.W1239fs; VAF 0.89) with loss of heterozygosity at 19p13.2, microsatellite stability, and low tumor mutational burden (0.70 mut/Mb), without additional canonical driver mutations; notably, no TP53 mutation was detected despite hemizygous 17p loss. A focal copy-number gain involving the BRCA1 locu …
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lynch syndrome (LS) is not considered part of childhood cancer predisposition syndromes.
CASE PRESENTATION: Analysis of a pediatric osteosarcoma (OS) displayed hypermutation (16.8), alternative lengthening of telomeres (ALT), loss of PMS2 expression in tumor tissue (retained in non-neoplastic cells), PMS2 loss of heterozygosity (LOH), and high-degree of microsatellite instability (MSI) tested by PCR. A heterozygous duplication c.1076dup p.(Leu359Phefs*6) in exon 10 of NM_000535.6:PMS2 was detected by SNV analysis in peripheral blood, confirming diagnosis of LS in the patient. The …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The uncommon diagnosis of atypical parathyroid adenoma (APA) creates a clinical conundrum for surveillance. We evaluated a large … owth (37%), and increased mitotic count (24%); the mean APA weight was 3.14 g (range, 167 mg-38 g). Loss of heterozygosity occurred in 25 of 38 tested patients (66%) at the p21 locus in 9 cases, at CDC73 and PTEN in 6, and at RB1 in 4 cases, with mean fractional allelic loss of 24% (range, 6-79). With mean follow-up of 5 years (range, 0.5-18), no patient has developed r …
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Von Hippel-Lindau (VHL) inactivation develops a tumor syndrome characterized by highly vascularized tumors as a result of hypoxia inducible … iver hemangioblastomas in VHL disease may, therefore, require secondary mutation in addition to VHL loss of heterozygosity which is permissive for vascular lesion development or augments levels of HIF-1alpha.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Allogeneic hematopoietic cell transplantation (allo-HCT) offers curative potential for acute myeloid leukemia (AML) through its graft-versus-leukemia (GVL) effects, but this same alloreactivity can cause graft-versus-host disease (GVHD), making separation of these effects a central challenge. Proposed mechanisms of post-allo-HCT immune evasion by AML cells include HLA loss via 6p loss of heterozygosity, epigenetic HLA class II silencing, upregulation of immune-suppressive ligands on AML cells, and persistence of leukemia stem cells (LSCs) after transplantation. In addition, donor T-cell exhaus…
СтатьяОбзорАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Classic Ehlers-Danlos syndrome (cEDS) is characterized by fragile, hyperextensible skin and hypermobile joints. cEDS can be caused by heterozygosity for missense mutations in genes COL5A2 and COL5A1, which encode the α2(V) and α1(V) chains, respectively, of collagen V, and is most often caused by COL5A1 null alleles. However, COL5A2 null alleles have yet to be associated with cEDS or other human pathologies. We previously showed that mice homozygous null for the α2(V) gene Col5a2 are early embryonic lethal, whereas haploinsufficiency caused aberrancies of adult skin, but not a frank cEDS-like
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BRCA1 dysfunction may occur by different mechanisms that are rarely evaluated concomitantly. We aimed to analyze BRCA1 germline mutations, loss of heterozygosity (LOH) and promoter methylation in unselected ovarian carcinomas in the context of their clinicopathologic characteristics and other molecular changes. BRCA1 mutations were analyzed in 257 carcinomas using single-strand conformation polymorphism (SSCP), heteroduplex, and sequencing methods. LOH at the BRCA1 locus was screened for in 180 cancers. Methylation analysis was performed for 241 tumors using quantitative methylation specific P…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wilms tumors in Asian populations demonstrate uniquely favorable biological characteristics and are not appropriately stratified by current risk markers like loss of heterozygosity of 1p and 16q. We analyzed the prognostic associations of copy number changes at other genomic loci in a population-based cohort of Wilms tumor and explored genomic profiles of relapsed cases. Chromosomal aberrations of targeted loci were evaluated in 61 Wilms tumors treated with National Wilms Tumor Study regimens in Singapore hospitals from 2001-2022, and 26 tumors from a separate Asian validation set, and correla…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The proapoptotic BH3-only protein BIM (Bcl2l11) plays key roles in the maintenance of multiple hematopoietic cell types. In mice, germline knockout or conditional pan-hematopoietic deletion of Bim results in marked splenomegaly and significantly increased numbers of B cells. However, it has remained unclear whether these abnormalities reflect the loss of cell-intrinsic functions of BIM within the B lymphoid lineage and, if so, which stages in the lifecycle of B cells are most impacted by the loss of BIM. Here, we show that B lymphoid-specific conditional deletion of Bim during early developmen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Mutations in the ATM gene are common in multiple cancers, but clinical studies of therapies targeting ATM-aberrant cancers have yie … prevalence of deleterious (Tier 1) versus unknown/benign (Tier 2) variants, selective pressure for loss of heterozygosity, and concordance between a deleterious variant and ATM loss of protein (LOP). A novel ATM LOF biomarker approach that accounts for variant classification, relationship to ATM LOP, and tissue-specific penetrance significantly enriched for patients wh …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tuberous sclerosis-2 (Tsc-2) gene is a suppressor of renal tumorigenesis and an early target of reactive oxygen species-induced renal cancer. Tuberin, the protein product of the Tsc-2 gene, participates in the regulation of cell proliferation, although the mechanism by which it suppresses proliferation is unknown. Quinol-thioether-transformed rat renal epithelial (QT-RRE) cell lines, derived from quinol-thioether-transformed primary renal epithelial cells from Eker rats, lack tuberin expression due to loss of heterozygosity of the Tsc-2 gene. These cell lines were used to examine the mecha…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Patients with papillary thyroid carcinoma often have two or more distinct papillary tumors at thyroidectomy. Whether these multifoc … repared from formalin-fixed, paraffin-embedded tissue sections using laser-capture microdissection. Loss of heterozygosity assays for three microsatellite polymorphic markers for putative tumor suppressor genes on chromosomes 3p25 (D3S1597), 9p21 (D9S161), and 18p11.22-p11 (D18S53) were done. In addition, X-chromosome inactivation analysis was done on the tumors from al …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Pathogenic germline MAX variants are associated with pheochromocytoma and paraganglioma (PPGL), pituitary neuroendocrine tumors and … AX variant (c.200C>A, p.Ala67Asp) was identified in all individuals with PC and both children, with loss of heterozygosity in PC tissue. Immunohistochemistry showed loss of MAX staining in PCs and other neural crest tumors. In vitro studies confirmed the variant as loss of function. In Family B, the proband has bilateral and metastatic PC, prolactin-producing pituitary …
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sex-inference in forensic DNA analysis is a critical investigative parameter, commonly relying on the Amelogenin locus, along with the Y-Indel marker (rs2032678) and a limited set of Y-chromosomal markers included in autosomal STR multiplexes and quantitative PCR assays. However, structural rearrangements of the Y chromosome can result in discordant profiles that misidentify phenotypically male individuals as "false females" in standard autosomal kits. We report an exceptionally rare case from central India exhibiting three convergent genetic anomalies in a phenotypic male blood sample: the lo
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Classification of gliomas involves the combination of histological features with molecular biomarkers to establish an integrated histomolecu … ods, including immunohistochemistry, Sanger sequencing, pyrosequencing, microsatellite analyses for loss of heterozygosity, as well as real-time PCR- or microarray-based copy number assays. Particular strengths of the ddPCR approach are (1) its high analytical sensitivity allowing for reliable detection of mutations even with low mutant allele frequencies, (2) its quant …
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosome 9p21 is frequently deleted in malignant melanoma, and one familial malignant melanoma gene has been linked to 9p21-22. Recently, … and p15INK4b loss to occur in a subset of cutaneous melanomas and suggest, in view of the frequent loss of heterozygosity on chromosome 9p21, the presence of another tumour suppressor gene within this chromosomal region.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Abnormalities involving class I HLA are frequent in many lymphoma subtypes but have not yet been extensively studied in cutaneous T-cell lymphomas (CTCLs). We characterized the occurrence of class I HLA abnormalities in 65 patients with advanced mycosis fungoides or Sézary syndrome. Targeted DNA sequencing, including coverage of HLA loci, revealed at least 1 HLA abnormality in 26 of 65 patients (40%). Twelve unique somatic HLA mutations were identified across 9 patients, and loss of heterozygosity or biallelic loss of HLA was found to affect 24 patients. Although specific HLA alleles were comm…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования