Genomic and transcriptomic analyses have well established that the major fraction of the mammalian genome is transcribed into different classes of RNAs ranging in size from a few nucleotides to hundreds of thousands of nucleotides, which do not encode any protein. Some of these noncoding RNAs (ncRNAs) are directly or indirectly linked to the regulation of expression or functions of 25,000 proteins coded by <2% of the human genome. Among these regulatory RNAs, microRNAs are small (2125 nucleotides) RNAs that are processed from precursor RNAs that have stemloop structure, whereas noncoding RNAs
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Long non-coding RNAs (lncRNAs) play critical regulatory roles in diverse biological processes and diseases. While a large number of lncRNAs have been identified in skeletal muscles until now, their function and underlying mechanisms in skeletal myogenesis remain largely unclear.
METHODS: We characterized a novel functional lncRNA designated lncMGPF (lncRNA muscle growth promoting factor) using RACE, Northern blot, fluorescence in situ hybridization and quantitative real-time PCR. Its function was determined by gene overexpression, interference, and knockout experiments in C2C12 my
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Most statistical methods used to identify cancer driver genes are either biased due to choice of assumed parametric models or insensitive to directional relationships important for causal inference. To overcome modeling biases and directional insensitivity, a recent statistical functional chi-squared test (FunChisq) detects directional association via model-free functional dependency. FunChisq examines patterns pointing from independent to dependent variables arising from linear, non-linear, or many-to-one functional relationships. Meanwhile, the Functional Annotation of Mammalian
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Completion of the Human Genome Project has led to the identification of a large number of transcription start sites that are not paired with protein-coding genes, supporting the growing recognition of the abundance of encoded nonprotein-coding RNAs (ncRNAs) and their importance for speciation and species-specific development. Present in both plants and animals, ncRNAs vary in size, function, primary sequence, and secondary structure. While microRNAs (miRNAs) are the best known, there are a number of other ncRNAs (long[er] nonprotein-coding RNA, pseudogenes, circular RNAs, and so on) that have
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Dendritic cells (DCs) are the most efficient antigen-presenting cells, playing a key role in the adaptive immune responses to viral infections. Our studies demonstrate that wild-type (wt) rabies virus (RABV) does not activate DCs. Adoptive transfer of DCs primed with wt RABV did not activate DCs, stimulate virus neutralizing antibodies (VNA), or protect recipients against challenge. However, adoptive transfer of DCs primed with laboratory-attenuated RABV resulted in DC activation, production of VNA, and protection against challenge. In vitro studies with recombinant RABV (laborator
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypoxia is a key component of the tumor microenvironment and represents a well-documented source of therapeutic failure in clinical oncology. Recent work has provided support for the idea that non-coding RNAs, and in particular, microRNAs, may play important roles in the adaptive response to low oxygen in tumors. Specifically, all published studies agree that the induction of microRNA-210 (miR-210) is a consistent feature of the hypoxic response in both normal and malignant cells. miR-210 is a robust target of hypoxia-inducible factors, and its overexpression has been detected in a variety of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetics is a key mechanism regulating the expression of genes. There are three main and interrelated mechanisms: DNA methylation, post-translational modification of histone proteins and non-coding RNA. Gene activation is generally associated with lower levels of DNA methylation in promoters and with distinct histone marks such as acetylation of amino acids in histones. Unlike the genetic code, the epigenome is altered by endogenous (e.g. hormonal) and environmental (e.g. diet, exercise) factors and changes with age. Recent evidence implicates epigenetic mechanisms in the pathogenesis of co
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regulatory small RNAs (sRNAs) are known to play important roles in the Gram-positive bacterial pathogen Staphylococcus aureus; however, their existence is often overlooked, primarily because sRNA genes are absent from genome annotation files. Consequently, transcriptome sequencing (RNA-Seq)-based experimental approaches, performed using standard genome annotation files as a reference, have likely overlooked data for sRNAs. Previously, we created an updated S. aureus genome annotation file, which included annotations for 303 known sRNAs in USA300. Here, we utilized this updated reference file t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Down syndrome (DS), caused by trisomy 21, is the most common human chromosomal disorder. Hippocampal abnormalities have been believed to be responsible for the DS developmental cognitive deficits. Cumulative evidences indicated that non-coding RNAs (ncRNAs) participated in brain development and function. Currently, few was known whether dysregulated ncRNAs existed in DS whether the dysregulated ncRNAs played important pathology roles in DS.
OBJECTIVE: The purpose of this study was generating an overview map of the dysregulated ncRNAs in DS, including the microRNA (miRNA), long ncR
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Secondary hyperparathyroidism often occurs in chronic kidney disease (CKD) and vitamin D deficiency, resulting in increased fractures and mortality. Understanding factors that stimulate parathyroid hormone (PTH) synthesis is important for devising methods to treat this condition. Previous work has demonstrated that murine Pth mRNA levels are regulated by proteins that bind AU-rich elements (AREs) within the 3' UTR region of Pth mRNA and influence Pth mRNA stability. In this issue of the JCI, Nechama et al. demonstrate that in murine secondary hyperparathyroidism associated with CKD or Ca defic
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The worldwide emergence and spread of antimicrobial-resistant pathogens pose a significant risk to public health. The ESKAPE group of pathogens-specifically Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, and Enterobacter species has gained notoriety due to its multidrug-resistance and causing hospital-acquired infections. These pathogens are linked to higher rates of morbidity and mortality, as well as substantial economic burden. Bacterial small regulatory RNAs (sRNAs) represent a distinct class of RNA molecules and serve k
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Post-transcriptional regulatory mechanisms underlying autoimmune diseases remain poorly understood. Here, we employed integrated multi-omics approaches to systematically dissect the role of alternative polyadenylation (APA) and piRNA-mediated regulation in psoriasis pathogenesis.
METHODS: We performed transcriptome-wide association studies (TWAS) combined with Mendelian randomization to identify causal susceptibility genes. Long-read sequencing was used to characterize APA landscapes in 15 healthy controls and 10 psoriasis patients. Single-cell RNA sequencing was performed on lesi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The conserved non-coding RNA 7SK is a well-established global transcriptional repressor, yet its context-specific functions in cancer and therapy resistance remain paradoxical. Here, we resolve this paradox by uncovering a dual-axis mechanism through which 7SK drives colorectal cancer (CRC) resistance. By integrating single-cell multi-omics with functional assays, we demonstrate that 7SK not only selectively activates the JUN transcriptional network to fuel tumor proliferation but also reduces global transcriptional entropy to stabilize an immunosuppressive microenvironment and promote immune
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza A virus (IAV) is a human-infecting pathogen with a history of causing seasonal epidemics and on several occasions worldwide pandemics. Infection by IAV causes a dramatic decrease in host mRNA translation, whereas viral mRNAs are efficiently translated. The IAV mRNAs have a highly conserved 5'-untranslated region (5'UTR) that is rich in adenosine residues. We show that the human polyadenylate binding protein 1 (PABP1) binds to the 5'UTR of the viral mRNAs. The interaction of PABP1 with the viral 5'UTR makes the translation of viral mRNAs more resistant to canonical cap-dependent trans
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Post-testicular sperm maturation and storage within the epididymis is a key determinant of gamete quality and fertilization competence. Here we demonstrate that mouse spermatozoa possess a complex small non-protein-coding RNA (sRNA) profile, the composition of which is markedly influenced by their epididymal transit. Thus, although microRNAs (miRNAs) are highly represented in the spermatozoa of the proximal epididymis, this sRNA class is largely diminished in mature spermatozoa of the distal epididymis. Coincident with this, a substantial enrichment in Piwi-interacting RNA (piRNA) abundance in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exposure to ambient particulate matter (PM) has been associated with the onset of neurodevelopmental and neurodegenerative disorders, but the mechanism of toxicity remains unclear. To gain insight into this neurotoxicity, this study sought to examine global gene expression changes caused by exposure to ambient ultrafine PM. Microarray analysis was performed on primary human neurons derived from fetal brain tissue after a 24h exposure to 20μg/mL of ambient ultrafine particles. We found a majority of the changes in noncoding RNAs, which are involved in epigenetic regulation of gene expression, a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although the number of identified avian-borne picornaviruses (family Picornaviridae) is continuously increasing there remains several species-rich avian host groups, such as the order Falconiformes (with 290 bird species) from which picornaviruses have not been identified. This study reports the first complete genome of a novel, highly divergent picornavirus, named as Falcovirus A1 (KP230449), from the carnivorous bird, the common kestrel (Falco tinnunculus, order Falconiformes). Falcovirus A1 has the longest 3D(RdRp) genome region and distant phylogenetic relationship to the Hepatitis A virus
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pneumocystis jirovecii is an opportunistic pathogen that causes severe pneumonia in immunocompromised patients. To study the genetic diversity of P. jirovecii in India the upstream conserved sequence (UCS) region of Pneumocystis genome was amplified, sequenced and genotyped from a set of respiratory specimens obtained from 50 patients with a positive result for nested mitochondrial large subunit ribosomal RNA (mtLSU rRNA) PCR during the years 2005-2008. Of these 50 cases, 45 showed a positive PCR for UCS region. Variations in the tandem repeats in UCS region were characterized by sequencing al
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio cholerae is the waterborne bacterium responsible for worldwide outbreaks of the acute, potentially fatal cholera diarrhea. The primary factors this human pathogen uses to cause the disease are controlled by a complex regulatory program linking extracellular signaling inputs to changes in expression of several critical virulence genes. Recently it has been uncovered that many non-coding regulatory sRNAs are important components of the V. cholerae virulence regulon. Most of these sRNAs appear to require the RNA-binding protein, Hfq, to interact with and alter the expression of target gene
СтатьяПоддержка правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous studies by others and ourselves have suggested that the methylation pattern of imprinted genes in oocytes is altered during postovulatory aging. The purpose of the current study was to evaluate the effects of postovulatory aging of mouse oocytes on methylation and expression of imprinted genes at the mid-gestation development stages. Proestrous females were artificially inseminated at 13 h (fresh-oocyte group) or 22 h (aged-oocyte group) post-hCG. Estrous females were mated with males as a control group. On dpc (day post coitus) 10.5 of development, embryos and placentas were collecte
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования