OBJECTIVE: To establish a real-time PCR assay for the rapid detection of Listeria monocytogenes in simulated milk specimens.
METHODS: Based on part fragments of hlyO gene, a pair of primers and Taq-Man probe were designed for quantitative detection of L. monocytogenes. The specificity of the primers and probe were tested by using different L. monocytogenes strains and other common pathogenic bacteria.
RESULTS: L. monocytogenes strains were positive in the detection and other tested strains were negative. The sensitivity of assay was 9 copies per PCR reaction.
CONCLUSION: The specificity and
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orf is a zoonotic parapoxvirus typically transmitted to humans by a bite from goats or sheep. We present an unusual case of multiple orf lesions on the fingers of a 13-month-old child who was bitten by a goat and subsequently developed progressive swelling, blistering, and necrotic papulonodules of the hand followed by an additional diffuse, pruritic, papular rash. A primary diagnosis of orf infection was confirmed using real-time polymerase chain reaction, and the diffuse eruption was clinically consistent with an id reaction. Extensive necrosis and papular id reaction associated with orf rar…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Real-time reverse-transcription polymerase chain reaction (rRT-PCR) to detect enterovirus 71 (EV-A71) and coxsackievirus A16 (CV-A16) has facilitated the rapid and accurate identification of the two most common etiological agents underlying hand, foot, and mouth disease (HFMD). However, the worldwide emergence of CV-A6 infection in HFMD necessitates development of an improved multiplex rRT-PCR method. To rapidly determine the etiology of HFMD, two rRT-PCR assays using TaqMan probes were developed to differentiate among three selected common enteroviruses (EV-A71, CV-A16 and CV-A6) and to enabl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antisense oligonucleotides (ASOs) are widely used for the identification of gene functions and regulation of genes involved in different diseases for therapeutic purposes. For in vitro evaluation of the knockdown activity of gapmer ASOs, we often use lipofection or electroporation to deliver gapmer ASOs into the cells. Here, we describe a method for evaluating the knockdown activity of gapmer ASOs by a cell-free uptake mechanism, termed as Gymnosis, using MALAT1 gapmer ASOs modified with 2'-O-methoxyethyl RNA (2'-MOE) or 2'-O,4'-C-ethylene-bridged nucleic acid (ENA). This method is robust beca
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tick-borne pathogens (TBPs) represent an increasing threat to both human and animal health, driven by the expanding distribution and abundance of tick populations, even in regions traditionally considered unsuitable for their development. Among TBPs, Ehrlichia canis is primarily known as the causative agent of canine ehrlichiosis, mainly transmitted by the brown dog tick Rhipicephalus sanguineus. However, recent evidence indicates a broader host range, including potential zoonotic transmission to humans. In this study, adult ticks were collected from carcasses of domestic and wild animals and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One of the most abundant and ubiquitous members of the phytoplankton in the marine ecosystem is the unicellular cyanobacteria of the genus Synechococcus, which contributes to a substantial fraction of the ocean's primary productivity. Nevertheless, like any other organism, Synechococcus is infected by a specific kind of virus: the cyanophages. These viruses, highly abundant and widely distributed throughout the world's oceans, shape the bacterial communities by regulating their abundance, diversity, and physiology. However, the information regarding the occurrence of Synechococcus-infecting ph
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Reliable qPCR analysis depends on stable endogenous controls, particularly in high-throughput pre-amplification workflows where technical bias may arise. The suitability of highly abundant 18 S rRNA as a reference gene in multiplex OpenArray® platforms remains debated. This study evaluated the stability of 18 S rRNA, its impact on co-amplified targets, and comparability between archived and newly manufactured primer pools.
METHODS: Plasma RNA from the Fenofibrate Intervention and Event Lowering in Diabetes (FIELD) trial was analysed using TaqMan OpenArray® following reverse transc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helopeltis antonii Signoret is an important sucking pest of cashew and other tree crops. Reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) is a widely used technique for analyzing gene expression. The selection of reliable reference genes is critical for accurate quantification of target gene expression using RT-qPCR. There are no studies to identify reliable reference genes or gene expression studies in H. antonii. In this study, the expression stability of eight candidate genes, RPS3A, βTubulin1, RPL13A, 18S, EF1α, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 g (UBQ), GAPDH, and TBP, was evaluated across
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study evaluated a commercial qPCR assay for P. vivax detection. Among 167 samples, the assay showed greater sensitivity than microscopy, detecting three additional positives. It also demonstrated high specificity and no cross-reactivity. Our results support its value as a reliable tool for malaria diagnosis and surveillance.
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Psittacine adenoviruses belong to the Adenoviridae family, that includes genera Aviadenovirus, Barthadenovirus, and Siadenovirus and may cause either fatal disease or subclinical infections. Subclinical infections are particularly relevant when infected birds enter the bird trade, as infected birds can act as sources of viral spread. Given the ease of transmission of these viruses, the availability of sensitive and specific diagnostic tools is essential. The purpose of this study was to establish a TaqMan-based quantitative PCR (qPCR) assay for the detection and quantification of P
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeria monocytogenes (LM) is found in various environmental sources, including animal intestinal tracts, soil, and sewage. LM can contaminate various food products, including meat, seafood, cheese, fruits, and vegetables. Individuals with underlying medical conditions, the elderly, pregnant women, and infants, may develop meningitis and sepsis upon consuming LM-contaminated food. A rapid and standardized quantification method for evaluating initial contamination levels of LM in food remains to be established. This study aimed to develop a rapid quantification method to monitor LM contaminati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria gonorrhoeae is a major sexually transmitted pathogen and global public health concern. A porA pseudogene-targeting TaqMan quantitative PCR (qPCR) assay was evaluated as a complementary laboratory-based method for the qualitative detection of N. gonorrhoeae and exploratory Z017-calibrated molecular estimation in cultured reference strains. Two candidate probe sets were evaluated, and the probe set generating a 157 bp amplicon was selected for a defined two-step qPCR workflow with a 52 min on-instrument amplification runtime. In silico analysis showed compatible target site arrangement
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Berries are frequently implicated in outbreaks of foodborne illness due to viruses, particularly norovirus and hepatitis A virus. Compounds naturally present in berries can compromise the reliability of RT-qPCR methods, such as ISO 15216-1:2017, for detecting and quantifying viruses in foods. The aim of this study was to evaluate the inhibitory impact of seven phenolic compounds (ellagic acid, hydroxybenzoic acid, caffeic acid, coumaric acid, ferulic acid, quercetin, and cyanidine-3-glucoside) found naturally in raspberries as well as batch effects due to different concentrations of inhibitors
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Co-infections with multiple viruses are common in geese, complicating clinical diagnosis. Here, we developed a quadruplex TaqMan-probe based qPCR method for the simultaneous detection of Goose parvovirus (GPV), Goose circovirus (GoCV), Tembusu virus (TMUV), and Goose astrovirus Ⅱ (GAstV-Ⅱ). Specific primers and hydrolysis probes were designed targeting the following conserved regions: the VP3 gene of GPV, the Rep gene of GoCV, the E gene of TMUV, and the ORF2 gene of GAstV-Ⅱ, respectively. No cross-reactivity was observed with other common avian pathogens, including Goose paramyxovirus (GPMV),
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
α-Hemoglobin (Hb) variants are common genetic mutations worldwide. The appropriate techniques must be followed to scan and identify these variants, particularly in routine investigations for thalassemia and hemoglobinopathies in countries with high prevalence of α and β-thalassemia. High resolution melting (HRM) analysis is a popular and effective technique for identifying genetic variations with rapid output results. This study designed four newly developed primer pairs that had full coverage of the HBA genes for detection of α-Hb variants using real-time PCR with HRM analysis. Forty-one bloo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Equine coronavirus (ECoV) causes fever, anorexia and sometimes enteric signs (e.g. diarrhea) in adult horses. Three ECoV outbreaks among draft horses at the same Japanese racecourse have been reported previously, in 2004, 2009 and 2012. We describe the epidemiological, clinical and genetic features of the fourth ECoV outbreak at the same racecourse in 2025. In January 2025, a sudden increase in the number of draft horses showing various combinations of fever, anorexia and enteric signs was observed at Obihiro Racecourse, in Hokkaido, Japan. Of about 800 horses, 176 showed clinical signs. Speci
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-protein interactions drive gene regulation, subcellular organization, and noncoding RNA function. Here, we present a protocol for measuring RNA-protein associations in formaldehyde-crosslinked mammalian cells using RNA immunoprecipitation followed by sequencing (RIP-seq) and quantitative PCR (RIP-qPCR). We include steps and best practices for qualifying reagents, preparing cells, and processing and analyzing data, including a standardized set of steps to quantify signal over noise. This protocol is broadly applicable for the study of RNA-protein interactions in cells. For complete details
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The potent neurotoxin domoic acid is produced by some species of diatoms in the genus Pseudo-nitzschia, which can lead to amnesic shellfish poisoning (ASP) events in marine food webs. Of the toxin-producing Pseudo-nitzschia, P. australis has caused the most toxic and widespread events, making it a species of concern. Toxic and non-toxic Pseudo-nitzschia species cannot be distinguished easily by light microscopy, necessitating molecular testing. We designed a real-time quantitative PCR assay for rapid and accurate detection of P. australis in environmental DNA (eDNA) samples, targeting the inte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Goose astrovirus (GAstV) is an important pathogen causing joint and visceral gout in goslings. Its high incidence and mortality had caused enormous economic losses to the goose farming industry. To achieve the simultaneous and rapid identification and detection of Goose astrovirus genotype 1 (GAstV-1) and genotype 2 (GAstV-2), the present study aimed to design and synthesize specific recombinase polymerase amplification (RPA) primers and exo probes targeting the ORF1b gene of GAstV. Utilizing a portable fluorescence detector (Genie III), the RPA primers and exo probes were optimized for concen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In recent years, enzootic nasal tumor virus 2 (ENTV-2) has become prevalent in China, resulting in substantial economic losses for the goat industry. In order to enrich the availability of detection methods for ENTV-2, this study developed an expedited and accurate reverse-transcription quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR) assay to facilitate the detection and quantification of ENTV-2.
METHODS: Specifically, a pair of primers and a TaqMan probe targeting conserved regions of the pro gene were designed to allow the specific amplification and detection of viral…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.