Primary human hepatocytes were used to develop a culture model for in vitro propagation of hepatitis C virus (HCV). Production of positive- strand full-length viral RNA in cells and culture supernatants was monitored by PCR methods targeting three regions of the viral genome: the 5' NCR, the 3' X-tail and the envelope glycoprotein E2. De novo synthesis of negative-strand RNA was also demonstrated. Evidence for a gradual increase in viral components over a 3 month period was obtained by two quantitative assays: one for evaluation of genomic titre (quantitative PCR) and one for detection of the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia trachomatis is an obligate intracellular pathogen that replicates in a vacuole termed the inclusion. Many of the interactions of chlamydiae with the host cell are dependent upon bacterial protein synthesis and presumably exposure of these proteins to the cytosol. Because of the dearth of genetic tools for chlamydiae, previous studies examining secreted proteins required the use of heterologous bacterial systems. Recent advances in genetic manipulation of chlamydia now allow for transformation of the bacteria with plasmids. We describe here a shuttle vector system, pBOMB4, that permit
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global epidemic of drug-resistant Candida auris continues unabated. We do not know what caused the unprecedented appearance of pan-drug resistant (PDR) Candida auris strains in a hospitalized patient in New York; the initial report highlighted both known and unique mutations in the prominent gene targets of azoles, amphotericin B, echinocandins, and flucytosine antifungal drugs. However, the factors that allow C. auris to acquire multi-drug resistance and pan-drug resistance are not known. Therefore, we conducted a comprehensive genomic, transcriptomic, and phenomic analysis to better unde
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Hallé subacute sclerosing panencephalitis (SSPE) measles virus isolate and its plaque-purified progeny were investigated to determine whether any unusual properties could be associated with its ability to cause persistent infection. Three types of plaque-purified progeny were isolated. One population appeared to be similar in biological and biochemical properties to laboratory-adapted measles virus and had the ability to induce syncytia (syn+). A second population (syn-) plaqued more efficiently at 39 degrees C than at 33 degrees C, did not cause normal cell fusion at either temperature, a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein prenylation is an important protein modification that is responsible for diverse physiological activities in eukaryotic cells. This modification is generally catalyzed by three types of prenyl transferases, which include farnesyl transferase (FT), geranylgeranyl transferase (GGT-1) and Rab geranylgeranyl transferase (GGT-2). Studies in malaria parasites showed that these parasites contain prenylated proteins, which are proposed to play multiple functions in parasites. However, the prenyl transferases have not been functionally characterized in parasites of subphylum Apicomplexa. Here,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The outbreak of COVID-19 caused by SARS-CoV-2 virus continually led to infect a large population worldwide. Currently, there is no specific viral protein-targeted therapeutics. The Nucleocapsid (N) protein of the SARS-CoV-2 virus is necessary for viral RNA replication and transcription. The C-terminal domain of N protein (CTD) involves in the self-assembly of N protein into a filament that is packaged into new virions. In this study, the CTD (PDB ID: 6WJI) was targeted for the identification of possible inhibitors of oligomerization of N protein. Herein, multiple computational approaches were
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis C virus, Nonstructural 3 helicase (NS3h) protein is a well-studied segment of Non-structural 3/4 A helicase-protease protein that is crucial for the RNA duplex unwinding and RNA translocation during the process of HCV replication. Similar to other HCV nonstructural proteins, helicase is a potential target for antiviral drugs and several antiviral molecules have been used to target the RNA-binding cleft, despite the fact that none of those helicase antivirals have advanced the clinical trials. Compound 2t9 (5-bromo-1H-indol-3-yl acetic acid) has been identified through the integrated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We generated novel, effective candidate vaccine against Brucella abortus based on recombinant influenza viruses expressing the Brucella ribosomal protein L7/L12 or outer membrane protein (Omp)-16 from the NS1 open reading frame. The main purpose of this work was to evaluate the safety, immunogenicity and protectiveness of vaccine candidate in laboratory animals.
METHODS AND RESULTS: Four recombinant influenza A viral constructs of the subtypes Н5N1 or H1N1 expressing the Brucella proteins L7/L12 or Omp16 were obtained by a reverse genetics method: Flu-NS1-124-L7/L12-H5N1, Flu-NS1-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To examine the expression characteristics of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the SRD5A2 gene and investigate their potential association with differences in the clinical characteristics between sexes in patients with chronic hepatitis B virus (HBV) infection.
METHODS: A total of 30 loci in six genes primarily involved in the metabolism and signaling of sex hormones/sex hormone receptors, namely AKR1C2, AKR1C3, HSD17B6, SRD5A1, SRD5A2, and ESR1, were genotyped in 1007 patients from eight counties (cities) in Northeastern China with chronic HBV infection and 1040 healthy c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Chronic idiopathic axonal polyneuropathy (CIAP) accounts for approximately 20%-30% of adult-onset axonal polyneuropathies. Pathogenic RFC1 repeat expansions have emerged as a frequent cause of idiopathic sensory neuropathy, but their recognition in routine clinical practice may be challenging, particularly in the presence of potentially confounding comorbidities. We aimed to determine the prevalence of pathogenic RFC1 repeat expansions in a well-defined CIAP cohort, characterize the associated clinical and electrophysiological phenotype, and evaluate whether coexisting wel
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vaccines based on live attenuated viruses are the most effective strategy for controlling infections, since they elicit long-lasting natural and effective immune response, but entail challenges for safety and virulence. Hepatitis C Virus (HCV) causes liver diseases and liver cancer, with millions infected each year and hundreds of thousands of annual fatalities; but no vaccine is currently available for the virus. Here, we present a novel computational approach for the accurate prediction of virus attenuation.
RESULTS: We rationally design viral variants by inserting a large numbe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite effective combination antiretroviral therapy (cART), people living with HIV (PLWH) continue to harbor replication-competent and transcriptionally active virus in infected cells, which in turn can lead to ongoing viral antigen production, chronic inflammation, and increased risk of age-related comorbidities. To identify new agents that may inhibit postintegration HIV beyond cART, we screened a library of 512 pure compounds derived from natural products and identified (-)-hopeaphenol as an inhibitor of HIV postintegration transcription at low to submicromolar concentrations without cytot
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Posttranslational modifications, such as SUMOylation, play specific roles in the life cycle of invading pathogens. However, the effect of SUMOylation on the adaptation, pathogenesis, and transmission of influenza A virus (IAV) remains largely unknown. Here, we found that a conserved lysine residue at position 612 (K612) of the polymerase basic protein 1 (PB1) of IAV is a bona fide SUMOylation site. SUMOylation of PB1 at K612 had no effect on the stability or cellular localization of PB1, but was critical for viral ribonucleoprotein (vRNP) complex activity and virus replication in vitro. When t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary adult-onset ataxias are a heterogeneous group of phenotypically overlapping conditions, often caused by pathogenic expansions of short tandem repeats. Currently, 18 repeat disorders with a core phenotype of adult-onset ataxia are known. Diagnosis typically relies on sequential PCR-based methods, which are labour-intensive and lack precision. Long-read sequencing (LRS) has the potential to overcome these limitations and is currently implemented and validated in clinical genetics. Using clinical nanopore Cas9-targeted sequencing (Clin-CATS) for parallel in-depth repeat analysis, we ev
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cerebellar ataxia with neuropathy and vestibular areflexia syndrome (CANVAS) is a recessively inherited neurodegenerative ataxic disorder, which has been associated with intronic biallelic repeat expansions in the RFC1 gene. Our objective was to assess retrospectively the prevalence of CANVAS in Polish population. We screened 2523 Polish patients in whom other repeat expansions were excluded. To determine the repeat expansions in the RFC1 gene in patients, we performed RFC1-flanking PCR and repeat primed PCR (RP-PCR) and to measure the size of the expansion we used Southern blotting and optica
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: RFC1-related CANVAS and FGF14-related SCA27B are recently recognized genetic causes of late-onset cerebellar ataxia (LOCA). Despite advances in genetic testing, most panels do not detect these intronic repeat expansions, often resulting in repeated testing, delayed diagnosis, and greater patient burden. Vestibular dysfunction is common in both disorders and may help differentiate them from idiopathic LOCA (ILOCA) subtypes, guiding targeted genetic testing.
OBJECTIVES: To evaluate whether vestibulo-ocular reflex (VOR) gain measured by video head impulse test (vHIT) can differentiat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: DNA polymerase ε (Polε) is an essential replicative polymerase consisting of Pol2, Dpb2, Dpb3, and Dpb4 subunits and has not been explored in the pathogenic yeast Candida albicans. C. albicans is accountable for >40% of deaths due to systemic candidiasis per year worldwide. Genome plasticity is one of the adaptive mechanisms associated with virulence, and as it is associated with DNA polymerase function, this study explored the role of Polε in genome stability and pathogenesis of C. albicans. POL2 and DPB2 are haploinsufficient, but DPB3 and DPB4 are dispensable for cell survival i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Short tandem repeats are inherently unstable during DNA replication depending on repeat length, and the expansion of the repeat length in the human genome is responsible for repeat expansion disorders. Pentanucleotide AAGGG and ACAGG repeat expansions in intron 2 of the gene encoding replication factor C subunit 1 (RFC1) cause cerebellar ataxia, neuropathy, vestibular areflexia syndrome (CANVAS) and other phenotypes of late-onset cerebellar ataxia. Herein, we reveal the structural polymorphism of the RFC1 repeats associated with CANVAS in vitro. Single-stranded AAGGG repeat DNA formed a hybrid
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, the expansion of an intronic AAGGG repeat in the replication factor C subunit 1 (RFC1) gene was reported to cause cerebellar ataxia, neuropathy, vestibular areflexia syndrome (CANVAS). In Europeans, the expansion accounted for 22% of sporadic patients with late-onset ataxia. We genotyped 37 Japanese patients comprising 25 familial (autosomal recessive or undecided transmission) and 12 sporadic ones with late-onset ataxia. We found intronic repeat expansions in RFC1 in three (12%) of the familial patients and one (8.5%) of the sporadic ones. Although our cohort study was small, the di
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Direct-acting antiviral agents (DAAs) for hepatitis C treatment tend to fare better in individuals who are also likely to respond well to interferon-alpha (IFN), a surprising correlation given that DAAs target specific viral proteins whereas IFN triggers a generic antiviral immune response. Here, we posit a causal relationship between IFN-responsiveness and DAA treatment outcome. IFN-responsiveness restricts viral replication, which would prevent the growth of viral variants resistant to DAAs and improve treatment outcome. To test this hypothesis, we developed a multiscale mathematical model i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.