In view of the possible physiological importance of the 9-kDa cholecalcin (a 9000-Mr cholecalciferol-induced calcium-binding protein) in the intestinal transport of calcium in mammals, the gene expression of this protein has been analysed. Its regulation in the digestive tract of the growing rat by calcitriol (1,25-dihydroxycholecalciferol) was studied using a specific cloned [32P]cDNA to 9-kDa cholecalcin. Northern hybridisation studies show that the cDNA sequence hybridises to a single 500-600-nucleotide species throughout the digestive tract and therefore demonstrate identical 9-kDa-choleca
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anzi Heji (AZHJ) has been used to treat anticardiolipin antibody- (ACA-) positive pregnant women at risk of spontaneous abortion for many years. The aim of this study was to investigate the protective mechanism of AZHJ in a mouse model of ACA-positive pregnancy at risk of spontaneous abortion using label-free quantitative proteomics. Mice were divided into three groups: normal pregnant mice (control group), ACA-positive pregnant mice administered normal saline (model group), and ACA-positive pregnant mice administered AZHJ (AZHJ group). The model was established by injecting β2-glycoprotein I
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: Liver transplantation (LT) following total hepatectomy is a life-saving treatment for hepatocellular carcinoma (HCC). The HCC recurrence after LT hinders the effectiveness of the procedure. The objective of this study is to develop a pre-operative risk stratification model based on a liquid biopsy.
METHODS: We conducted a comprehensive multi-omics study of 260 HCC patients from three centers, including clinical data, low-coverage whole-genome sequencing of cell-free DNA (cfDNA) from plasma, as well as whole-exome, single-nucleus RNA, and spatial transcriptomics from matched t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Immune checkpoint inhibitors (ICI) are used to treat unresectable advanced or recurrent gastric cancer; however, reliable predictive biomarkers remain limited. This study aimed to identify biomarkers for predicting ICI efficacy using two independent cohorts.
METHODS: Plasma-derived cell-free RNA (cfRNA) transcriptome analysis was performed on pretreatment plasma samples from 34 patients in the VOYAGER phase II trial of the early induction of nivolumab monotherapy as third line or later. Candidate genes were identified using differentially expressed gene analyses based on three ind
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Effective surveillance of the hepatitis populations reduces liver cancer incidence and improves prognosis. This study aimed to develop an easy and non-invasive risk assessment model for this population. A total of 392 subjects were included in the present study, comprising 72 cases of chronic hepatitis, 31 cases of liver fibrosis, 152 cases of cirrhosis and 137 cases of liver cancer from diverse ethnic groups in China. Concurrent evaluation of the methylation levels of the GNB4 and Riplet genes in plasma, alongside the age-male-albumin-bilirubin-platelet (aMAP) score and serum AFP, was perform
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC), known for its high fatality rate, is often diagnosed in its advanced stages where surgical options are not viable. This highlights the critical need for innovative and effective early detection techniques. This study focuses on the potential of cell-free DNA (cfDNA) fragmentomics integrating advanced machine learning to identify early-stage PDAC with high accuracy.
METHODS: Our study included a broad cohort of 1,167 participants, from which plasma was collected and subjected to shallow whole-genome sequencing. After rigorous quality assessment
СтатьяВалидационное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons2025eng
Donor-derived cell-free DNA (ddcfDNA) is increasingly used in clinical practice to monitor lung transplant patients for acute rejection (AR). However, its association with conventional approaches to monitor immunosuppression remains unclear. This multicenter observational cohort study examines the association of ddcfDNA with surrogate measures of immunosuppression. We collected serial plasma samples to quantify ddcfDNA and anellovirus abundance using shotgun and metagenomic sequencing. Adjudication committees reviewed clinical data to define acute cellular and antibody-mediated rejection. The
СтатьяНаблюдательное исследованиеМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Cell-free mitochondrial DNA (cf-mtDNA) has emerged as a promising non-invasive method to predict embryo implantation potential. This study presents the first sequencing of cf-mtDNA in follicular fluid, aiming to explore the impact of ovarian stimulation treatment on the accumulation of mtDNA mutations and assess their implications for IVF outcomes.
METHODS: We selected 24 women aged 27 to 35 from the Assisted Reproduction Unit based on inclusion criteria requiring them to be undergoing their first IVF cycle without known infertility issues. For each participant, blood samples were co
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
COVID-19 demonstrates distinct clinical heterogeneity, ranging from mild symptoms to severe acute respiratory distress syndrome (ARDS). Neutrophil extracellular traps (NETs), which are web-like structures consisting of decondensed DNA adorned with cytotoxic proteins such as myeloperoxidase (MPO) and citrullinated histone H3 (CitH3), play a crucial role in pathogen containment. However, they may also promote immunothrombosis and tissue injury. This research aimed to explore the association between NET formation and the severity of COVID-19. Plasma samples were collected from 99 patients diagnos
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder cancer (BC) is a lethal urological malignancy, with current diagnostic and follow-up methods being invasive and costly. Cell-free DNA (cfDNA) in liquid biopsies has shown promise in cancer diagnostics, but its fragmentation and integrity in urine remain underexplored in BC, becoming the aim of this study. cfDNA was isolated from the urine of 156 patients with BC of most stages and 79 matched controls without renal or bladder conditions. The amount of a large (>250-bp) and a nested small (<125-bp) fragment of ACTB, AR, MYC, BCAS1, and STOX1 was quantified by quantitative real-time PCR.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This article investigates the theoretical detection rate of non-invasive prenatal screening (NIPS) and the residual risk of copy-number variations (CNVs) after normal NIPS results, for fetuses with isolated mild increased nuchal translucency (ImiNT), compared to chromosomal microarray analysis (CMA).
METHODS: A retrospective analysis was conducted on CMA results in a cohort with ImiNT (2.5 mm or 95th percentile ≤ NT < 3.5 mm). Theoretical detection rates and residual risk values were calculated for four NIPS panels-Basic NIPS-3, Basic NIPS-5, Expanded NIPS (ExpNIPS), and Genome-Wi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Placental DNA methylation differences have been associated with timing in gestation and pregnancy complications. Maternal cell-free DNA (cfDNA) partly originates from the placenta and could enable the minimally invasive study of placental DNA methylation dynamics. We will for the first time longitudinally investigate cfDNA methylation during pregnancy by using Methylated DNA Sequencing (MeD-seq), which is compatible with low cfDNA levels and has an extensive genome-wide coverage. We aim to investigate DNA methylation in placental tissues and cfDNA during different trimesters in u
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Surgical aortic valve replacement (AVR) is the standard of care for severe aortic valve disease; however, post-operative complications continue to pose challenges. Inflammation caused by increased release of cell-free mitochondrial DNA (cf-mtDNA) during surgery may be a contributing factor. The aim of this pilot study was to investigate the relationship between cf-mtDNA release and the risk of inflammatory-mediated post-operative complications in adult AVR patients. Plasma was collected from patients undergoing an AVR with cardiopulmonary bypass (CPB) at baseline, intra-operatively and post IC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Plasma cell-free Human Papillomavirus DNA (cfHPVDNA) is a biomarker for oropharyngeal carcinoma. Existing diagnostics may be limited by inadequate sensitivity or high cost/complexity for longitudinal monitoring.
OBJECTIVES: We hypothesized that sensitive and specific plasma cfHPVDNA detection may be achieved via a highly-multiplex qPCR method.
STUDY DESIGN: We designed and validated a single-tube one-step genotype-specific qPCR assay for detection of cfHPV16DNA in human plasma using >8,000 genomes spanning 18 genotypes. Amplicons were optimized for cfHPVDNA fragment size.
RESULT
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystic Echinococcosis (CE) is a zoonotic disease caused by Echinococcus granulosus sensu lato. Diagnosing CE primarily relies on imaging techniques, and there is a crucial need for an objective laboratory test to enhance the diagnostic process. Today, cell-free DNAs (cfDNAs) have gained importance regarding their biomarker potential. This study aims to investigate the diagnostic capabilities of different cfDNA targets (Echinococcus-specific repeat sequences (mgs-4 and mgs-12) and partial fragment of repetitive sequence (EG1 Hae III)) and evaluate their diagnostic effectiveness when compared to
СтатьяСравнительное исследованиеОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alveolar echinococcosis (AE), a parasitic disease caused by the Echinococcus multilocularis (E. multilocularis), primarily affects the liver and has the potential to spread to other organs, which can be quite invasive. This disease has been receiving increasing attention on a global scale. The objective of this study is to evaluate the clinical value of droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR) technology in the diagnosis of hepatic alveolar echinococcosis (HAE) through the detection of plasma and to explore the relationship between ddPCR quantitative results and lesion siz
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The international journal of tuberculosis and lung disease : the official journal of the International Union against Tuberculosis and Lung Disease2025eng
<sec><title>BACKGROUND</title>Existing TB diagnostic tests rely on sputum samples, which can be difficult to collect from all patients. This study examines plasma Mycobacterium tuberculosis cell-free DNA (Mtb cfDNA) based quantitative PCR (qPCR) assay for the diagnosis of pulmonary TB (PTB).</sec><sec><title>METHODS</title>The qPCR assay targeted insertion sequence (IS6110), cyp141, and devR genes on plasma samples from 106 PTB patients and 60 controls. Sensitivity was calculated using the Xpert® MTB/RIF test, culture, and clinical diagnosis for the PTB group, while specificity was determined
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUNDS: Despite recent advances, many cancers are still detected too late for curative treatment. There is, therefore, a need for the development of new diagnostic methods and biomarkers. One approach may arise from the detection of extrachromosomal circular DNA (eccDNA), which is part of cell-free DNA in human plasma.
AIMS: First, we assessed and compared two methods for the purification of eccDNA from plasma. Second, we tested for an easy diagnostic application of eccDNA liquid biopsy-based assays.
MATERIALS & METHODS: For the comparison we tested a solid-phase silica purification met
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute and chronic forms of lung allograft injury are associated with specific respiratory pathogens. Donor-derived cell free DNA (ddcfDNA) has been shown to be elevated with acute lung allograft injury and predictive of long-term outcomes. We examined the %ddcfDNA values at times of microbial isolation from bronchoalveolar lavage (BAL).
METHODS: Two hundred and six BAL samples from 51 Lung Transplant Recipients (LTRs) with concurrently available plasma %ddcfDNA were analyzed along with microbiology and histopathology. Microbial species were grouped into bacterial, fungal, and vira
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rationale: Long extracellular RNAs (exRNAs) in plasma can be profiled by new sequencing technologies, even with low abundance. However, cancer-related exRNAs and their variations remain understudied. Methods: We investigated different variations (i.e. differential expression, alternative splicing, alternative polyadenylation, and differential editing) in diverse long exRNA species (e.g. long noncoding RNAs and circular RNAs) using 79 plasma exosomal RNA-seq (exoRNA-seq) datasets of multiple cancer types. We then integrated 53 exoRNA-seq datasets and 65 self-profiled cell-free RNA-seq (cfRNA-se
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.