Cattle are a well-suited "model organism" to study the genetic underpinnings of variation in male reproductive performance. The adoption of artificial insemination and genomic prediction in many cattle breeds provide access to microarray-derived genotypes and repeated measurements for semen quality and insemination success in several thousand bulls. Similar-sized mapping cohorts with phenotypes for male fertility are not available for most other species precluding powerful association testing. The repeated measurements of the artificial insemination bulls' semen quality enable the differentiat
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Delftia acidovorans is distributed widely in the environment and has the potential to promote the growth of plants and degrade organic pollutants. However, it is also an opportunistic pathogen for human and many reports demonstrated that D. acidovorans has strong resistance to aminoglycosides and polymyxins.
OBJECTIVE: The aim of this work was to reveal the antibiotic resistance genes and pathogenic genes in a novel conditional pathogenic strain-D. acidovorans B804, which was isolated from the radiation-polluted soil from Xinjiang Uyghur Autonomous Region, China.
METHODS: The ant
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterococcus faecalis is an important intestinal colonizing bacteria and can cause various tissue infections, including invasive blood infec … E. faecalis. Comparative genomic analysis revealed that the BI E. faecalis isolates had the largest genome size but the lowest GC content, fsr quorum-sensing system genes were enriched in the BI E. faecalis, and the fsr gene cluster could enhance biofilm formation and serum resistance ability. Our findings also provide deep insight into the genomic difference …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The use of next generation sequencing (NGS) to profile tumor genomes for the presence of diagnostic, prognostic, or therapeutically targetable variants is revolutionizing the practice of oncology and is increasingly utilized in clinical laboratory settings. Beginning with the isolation of DNA of sufficient quality and quantity from a tumor specimen, the creation of a library of genomic fragments representing the portion of the genome of interest, ranging from a few genes to the entire exome, is the first step required in the sequencing process. Fixed tumor tissue in the form of a tissue block
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydiae are an example of obligate intracellular bacteria that possess highly reduced, compact genomes (1.0-3.5 Mbp), reflective of their abilities to sequester many essential nutrients from the host that they no longer need to synthesize themselves. The Chlamydiae is a phylum with a very wide host range spanning mammals, birds, fish, invertebrates, and unicellular protists. This ecological and phylogenetic diversity offers ongoing opportunities to study intracellular survival and metabolic pathways and adaptations. Of particular evolutionary significance are Chlamydiae from the recently pr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Chinese Meishan (ME) breed of pig is unique for many reproductive traits. Compared with Western breeds of swine, ME females reach puberty earlier, ovulate more ova per estrus, and have greater uterine capacity, while intact males (boars) have smaller testes and extremely elevated plasma levels of pituitary-derived glycoprotein hormones. In an effort to identify the genetic mechanisms controlling the elevated plasma levels of pituitary-derived glycoprotein hormones [in particular, follicle-stimulating hormone (FSH)] and to determine whether some of these genetic factors are also responsible
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genetic defect leading to cholesteryl ester storage disease (CESD) has been determined in a 12-yr-old patient. Lysosomal acid lipase (LAL) activity in cultured skin fibroblasts was reduced to approximately 9% of control fibroblasts. Plasma cholesterol (255 mg/dl) and LDL-cholesterol (215 mg/dl) were elevated whereas HDL-cholesterol was reduced (19 mg/dl). Triglycerides were moderately elevated (141 mg/dl). There were no clinical abnormalities with the exception of hepatosplenomegaly. Both parents have reduced LAL activity in white blood cells. PCR analysis of the LAL mRNA from the proposit
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exercise addiction (EA) is a complex behavioral phenotype characterized by a loss of control over exercise despite adverse physical, psychological, and social consequences. Although its psychological and performance-related aspects have been widely studied, its underlying etiology remains largely unclear, leading to increased interest in potential genetic vulnerability. Therefore, an exploratory pilot study investigated genetic variants associated with EA among elite athletes using a genome-wide association study (GWAS). The study comprised 168 Turkish elite athletes. Allele frequencies of cri
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Effect size estimates in genome-wide association studies (GWAS) and Mendelian randomization (MR) based on unrelated individuals are often confounded by dynastic effects (DE). Existing family-trio-based methods can mitigate this bias, but they typically discard parental phenotypes and cannot jointly model multiple correlated traits. We propose FT-SEM, a multivariate GWAS framework that uses structural equation modeling for family trio data, with the aim of integrating genotypes and phenotypes from parents and offspring across multiple traits to estimate direct genetic effects on a s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Neolamarckia (Rubiaceae) genus is composed of only two species: N. cadamba and N. macrophylla. Both species are fast-growing plants with significant industrial and medicinal values. Here, we provided a high-quality chromosome-level assembly of the N. macrophylla genome for the first time. The assembled genome size was approximately 598.43 Mb, with contig N50 and scaffold N50 lengths of 23.41 and 24.54 Mb, respectively. The two species diverged at 6.5-23.5 Mya and one whole-genome duplication (WGD) event was detected to occur prior to their divergence. The assembled genomes showed that N. m…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leishmania infantum is an intracellular protozoan parasite that causes visceral leishmaniasis, predominantly affecting marginalized populations in tropical and subtropical countries. The parasite genome comprises 36 chromosomes whose ends have not been characterized. In most eukaryotes, chromosome termini are capped by telomeres and associated proteins, forming nucleoprotein structures that maintain genome stability and prevent the ends from being mistaken as broken DNA. Leishmania telomeres are composed of G-rich repetitive DNA replenished by telomerase activity. Here, we showed a detailed vi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-throughput sequencing-based whole-genome sequencing (WGS) is highly effective for identifying viral pathogens in microbial research. However, applying WGS directly to foodborne viruses remains challenging because food matrices contain PCR inhibitors and viral titers are typically much lower than those found in clinical specimens. This study aimed to develop a WGS method for analyzing the hepatitis A virus (HAV) genome in clams using the Illumina MiSeq platform. To enhance the HAV WGS method, we applied four approaches to HAV-positive clam field samples: size-exclusion chromatography for s
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An extracellular polysaccharide-producing strain labelled GBG-M4T was isolated from the faeces of a C57BL/6 J mouse model with ulcerative co … n GBG-M4T were iso-C 17: 0 3-OH and iso-C 15: 0. Genome analysis revealed that strain GBG-M4T has a genome size of 5.56 Mb and a DNA G+C content of 45.57 mol%. A total of 4,576 genes were predicted by genome sequence analysis. On the basis of phenotypic, chemotaxonomic and phylogenetic characterization, strain GBG-M4T represents a novel species within the gen …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary breast and ovarian cancer (HBOC) is one of the most frequent genetic cancer predisposition syndromes. Individuals at risk are identified mainly by family history and histopathological criteria. The current standard genetic testing is exome or panel sequencing. However, many high-risk families remain genetically unexplained. Genome sequencing has the potential to increase the diagnostic yield. This single-center real-world study aims to evaluate advantages of short-read genome sequencing (GS) in HBOC families. We report genome sequencing results of 818 index patients, who fulfilled c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-invasive prenatal testing (NIPT) enables the screening of fetal chromosomal abnormalities by analyzing cell-free DNA (cfDNA) in maternal blood. Recent technological advancements have expanded its applications to the detection of copy number variations (CNVs). However, the clinical utility of CNV detection remains unclear. We aimed to investigate the association between fetal CNVs detected by genome-wide NIPT and perinatal outcomes in a large cohort in Japan. This retrospective cohort study included 46,082 patients who underwent NIPT at certified facilities in Japan between January 2015 and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Japanese encephalitis virus (JEV) has a positive-sense single-stranded RNA genome and belongs to the genus Flavivirus of the family Flaviviridae. Persistent JEV infection was previously shown in pig blood cells, which act as a natural reservoir of this virus. We aimed to determine the pathogenicity factors involved in persistent JEV infection by analyzing the pathogenicity and genome sequences of a virus isolated from a persistent infection model. We established persistent JEV infections in cells by inoculating mouse fetus primary cell cultures with the Beijing-1 strain of JEV and then perform
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The objective of this study is to explore the molecular basis of trimethoprim-sulfamethoxazole (SXT) resistance in Nocardia, an SXT-resistant N. farcinica strain, named SZ 1509, by whole-genome sequencing.
METHODS: Antimicrobial susceptibility testing of SZ 1509 was performed by broth microdilution, Etest, and disk diffusion arrays. Genome sequencing and analysis were performed to discover the SXT resistance determinant and its genetic context. Inverse PCR was conducted to confirm the circular form of the composite transposon. PCR for the sul1 gene was performed among SXT-suscepti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Teleosts exhibit extensive diversity of sex determination (SD) systems and mechanisms, providing the opportunity to study the evolution of SD and sex chromosomes. Here we sequenced the genome of the common lumpfish (Cyclopterus lumpus Linnaeus), a species of increasing importance to aquaculture, and identified the SD region and master SD locus using a 70 K single nucleotide polymorphism array and tissue-specific expression data. The chromosome-level assembly identified 25 diploid chromosomes with a total size of 572.89 Mb, a scaffold N50 of 23.86 Mb and genome annotation-predicted 21,480 prote
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biofilm-forming fungi, Candida albicans, are currently a serious problem in infectious disease cases. Soil bacteria Streptomyces sp. GMR22 have a large genome size and antifungal metabolites against C. albicans, but its potential antibiofilm activity is not clearly defined. The aims of this study were to determine the antibiofilm activity of GMR22 against C. albicans, identify the main constituents of active extracts, and investigate the biosynthesis gene clusters encoding the enzymes related to metabolism pathways. Antifungal and antibiofilm measurements were performed using in vitro assays o…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diet is a significant modifiable risk factor for type 2 diabetes (T2D), and its effect on disease risk is under partial genetic control. Identification of specific gene-diet interactions (GDIs) influencing risk biomarkers such as glycated hemoglobin (HbA1c) is a critical step towards precision nutrition for T2D prevention, but progress has been slow due to limitations in sample size and accuracy of dietary exposure measurement. We leveraged the large UK Biobank (UKB) cohort and a diverse group of dietary exposures, including 30 individual dietary traits and 8 empirical dietary patterns, to con
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования