OBJECTIVE: Chlamydia trachomatis conjunctivitis may present with extended symptoms, and it can have social ramifications as a sexually transmitted disease. For appropriate therapy, C. trachomatis conjunctivitis should be diagnosed definitively. This study presents the verification of nucleic acid amplification testing (NAAT; Gen-Probe Aptima Combo 2 assay) for detection of C. trachomatis ribosomal RNA (rRNA) from direct ocular samples.
DESIGN: Retrospective laboratory verification study.
SUBJECTS: Patients with infectious conjunctivitis.
METHODS: A battery of 25 true-positive specimens (dir
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nucleic acid amplification techniques (NAT) in routine blood donor screening considerably reduce the diagnostic window phase period. Nevertheless, several reports of false-negative NAT results were published. Here, four cases of human immunodeficiency virus Type 1 (HIV-1) RNA-positive blood donations that escaped detection by NAT screening are described.
STUDY DESIGN AND METHODS: A total of 2.7 million blood donations were screened for viral infections between January 2010 and October 2012 in our German Red Cross blood donation service. Four plasma specimens with false-negative NA
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The PUR domain is a nucleic acid-binding motif found in critical regulatory proteins of higher eukaryotes and in certain species of bacteria … ected mutagenesis of Bpur identified amino acid residues and domains critical for interactions with nucleic acids, and it revealed that the PUR domain has a distinct mechanism of interaction with each type of nucleic acid ligand. These data shed light on both gene regulation in the Lyme spirochete and functional mechanisms of the widely distributed PUR domain.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid identification of pathogens from blood cultures can decrease lengths of stay and improve patient outcomes. We evaluated the accuracy of the Verigene Gram-positive blood culture (BC-GP) nucleic acid test for investigational use only (Nanosphere, Inc., Northbrook, IL) for the identification of Gram-positive bacteria from blood cultures. The detection of resistance genes (mecA in Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis and vanA or vanB in Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis) by the BC-GP assay also was assessed. A total of 186 positive blood cultures (in BacT/Alert F
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Highly multiplexed assays, such as microarrays, can benefit arbovirus surveillance by allowing researchers to screen for hundreds of targets at once. We evaluated amplification strategies and the practicality of a portable DNA microarray platform to analyze virus-infected mosquitoes. The prototype microarray design used here targeted the non-structural protein 5, ribosomal RNA, and cytochrome b genes for the detection of flaviviruses, mosquitoes, and bloodmeals, respectively. We identified 13 of 14 flaviviruses from virus inoculated mosquitoes and cultured cells. Additionally, we differentiate
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Trichomonas vaginalis analyte-specific reagent is a highly sensitive assay for T vaginalis detection. We report how this diagnostic innovation influenced the sexually transmitted infection ordering practice patterns of 20 subacute-care clinicians.
METHODS: T vaginalis, Neisseria gonorrhoeae, and/or Chlamydia trachomatis screening data were audited on female swab submissions when only wet mount testing was available for detection of T vaginalis (2004-2007) and when T vaginalis detection options included analyte-specific reagent and wet mount (2008-2010).
RESULTS: Analyte-specific r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic rhinosinusitis (CRS) is a common disease with a complex pathophysiology involving a microbial component. Culture-independent molecular analysis represents a promising new approach to clarify the microbiology of CRS, but standardized, optimized sampling methods still have not been defined. This study was designed to compare nucleic acid extraction rates and recovery of bacteria for two methods of sampling the maxillary sinus, mucosal biopsy, and brushing.
METHODS: Samples were obtained from 20 patients undergoing maxillary sinus surgery. Total extracted nucleic acid concent
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Double stranded calf thymus deoxyribonucleic acid (dsCT-DNA) has been covalently immobilized onto self-assembled monolayer (SAM) of beta-merceptoethanol (MCE) on gold substrates via N-ethyl-N'-(3-dimethylaminopropyl) carbodiimide and N-hydroxysuccinimide chemistry for fabrication of the surface plasmon resonance (SPR) based biosensing device. The dsCT-DNA-MCE-SAM/Au bioelectrode has been characterized using electrochemical impedance spectroscopy, cyclic voltammetry, contact angle measurements and atomic force microscopy, respectively. This biosensing device has been utilized for detection of c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The use of hydrogen-bonding patterns in the same way as is known from DNA building blocks is a challenge for the construction of novel types of suitable chromophoric probes. This feature has been utilised for the construction of a novel type of UV/Vis probe for detection of supramolecular AAD or DAD sequences (A=hydrogen bond acceptor, D=hydrogen bond donor). Here we report on the structure of the enolisable chromophore 1-n-butyl-5-(4-nitrophenyl)barbituric acid (1), which has an adjustable hydrogen-bonding pattern. The position of the keto-enol equilibrium of this dye is strongly influenced b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We hypothesized that nucleic acids, free and/or complexed, filtered and/or locally released, might be entrapped in the kidneys because of the specific nucleic acid binding microbial pattern recognizing Toll-like receptors (TLRs). This hypothesis of nucleic acid binding potential was tested using paraffin sections from healthy control, SLE and transplant kidneys, which were labelled using TLR-specific rabbit or goat anti-human antibodies in immunoperoxidase staining. Normal and transplant kidneys contain some double- (TLR-3) and single-stranded RNA binding (TLR-8) receptors, but in particular d…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons2008eng
West Nile Virus (WNV)-specific nucleic acid amplification testing (NAAT) of organ and tissue donors remains controversial. We report three years of WNV donor screening in Alberta Canada using NAAT. Between 2003 and 2005, 1549 initial specimens were received. A valid negative result was issued within the specified turnaround time on 1531 (98.8%). The initial NAAT was successful for 1393 samples (90%), while repeat testing using an alternate NAAT resolved a further 126 samples. For 12 of 14 donors, a second specimen provided a valid negative result. Failure to generate a valid negative result in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We evaluated three of the CDC approaches for confirming Neisseria gonorrhoeae (gonococcus [GC])-positive nucleic acid amplification test (NAAT) results: (i) repeating the original test on the original specimen, (ii) testing the original specimen with a different test, and (iii) performing a different test on a duplicate specimen collected at the same visit. For the first approach, clinical specimens were initially tested by Aptima Combo 2 (AC2) (Gen-Probe Inc., San Diego, CA), ProbeTec (strand displacement amplification [SDA]) (Becton Dickinson Co., Sparks, MD), and Amplicor (PCR) (Roche Molec
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diagnosis of nongenital Neisseria gonorrhoeae infection by the Becton Dickinson ProbeTec ET Chlamydia trachomatis and N. gonorrhoeae Amplified DNA assay had low positive predictive value among an Australian community-based sample of homosexual men. Only 30.4% of oropharyngeal samples and 73.7% of anorectal samples were positive for N. gonorrhoeae by the porA assay. The accuracy of nucleic acid amplification tests in this context is compromised without supplemental testing.
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disseminated gonococcal infection (DGI) often presents a diagnostic challenge. Through the novel application of molecular technology, a case is presented that suggests how the diagnostic sensitivity for this systemic complication of gonococcal infection can be improved. In a typical case of DGI seen in a homosexual man in whom all mucosal and blood specimens were culture negative, nucleic acid amplification testing (NAAT) helped to confirm the diagnosis. Both throat and skin lesion specimens tested positive for gonococcal DNA and this was confirmed with a supplementary porA pseudogene NAAT. Th
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The advantages of nucleic acid amplification tests (NAT) over conventional methods for the detection of pathogens in lower respiratory tract samples have not been established. NAT for respiratory pathogens were performed on 439 endotracheal tube (ETT) and bronchoalveolar lavage (BAL) samples. A potential pathogen was detected in 87 samples. Of 22 samples that tested positive by conventional methods, 15 tested positive for the same pathogen by NAT, 1 tested positive for a different pathogen, 2 had co-infections identified only by NAT, and 4 tested negative by NAT. An additional 73 pathogens wer
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Combined binary ratio labeling (COBRA) is designed to increase the multiplicity of fluorescence in situ hybridization (FISH)--i.e., the number of targets that can be distinguished simultaneously. In principle, chemical (ULS), enzymatic (nick translation or random priming) or PCR-based labeling procedures of probes can be used. The method was originally designed to label chromosome-painting probes, but has also been used for probe sets specific for subtelomeric regions. COBRA imaging requires a digital fluorescence microscope equipped for sequential excitation and recording of color images. Sta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons2004eng
Porcine islets represent an alternative source of insulin-producing tissue, however, porcine endogenous retrovirus (PERV) remains a concern. In this study, SCID mice were transplanted with nonencapsulated (non-EC), microencapsulated (EC) or macroencapsulated (in a TheraCyte trade mark device) neonatal porcine islets (NPIs), and peripheral tissues were screened for presence of viral DNA and mRNA. To understand the role of an intact immune system in PERV incidence, mice with established NPI grafts were reconstituted with splenocytes. Peripheral tissues were screened for PERV and porcine DNA usin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Micronutrients regulate numerous metabolic processes in pregnancy but their possible antioxidant function and contributions of alterations in their metabolism to fetal and maternal morbidity and mortality have received insufficients attention. Serum levels of copper, manganese and zinc were determined in 40 pregnant Nigerian women spread across the three trimesters of pregnancy and compared with those of 25 non-pregnant women of similar demographic and anthropometric characteristics. Serum levels of uric acid were also determined in both groups of women. The mean serum levels of manganese and
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A molecular assay for the simultaneous detection of a Staphylococcus aureus-specific gene and the mecA gene, responsible for the resistance to methicillin in staphylococci, was evaluated. The assay included an automated DNA extraction protocol conducted with a MagNA Pure instrument and real-time PCR conducted with a LightCycler instrument. The performance and robustness of the assay were evaluated for a suspension of methicillin-resistant S. aureus (MRSA) strain with a turbidity equivalent to a McFarland standard of 0.5, which was found to be the ideal working concentration. The specificity of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования