It is well known spinal cord injury (SCI) can cause chronic neuropathic pain (NP); however its underlying molecular mechanisms remain elusive. This study aimed to disclose differentially expressed genes (DEGs) and activated signaling pathways in association with SCI induced chronic NP, in order to identify its diagnostic and therapeutic targets. Microarray dataset GSE5296 has been downloaded from Gene Expression Omnibus (GEO) database. Significant analysis of microarray (SAM), Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analysis, and pathway network analysis have been use
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Thalidomide is an anti-inflammatory and anti-angiogenic drug currently used for the treatment of several diseases, including erythema nodosum leprosum, which occurs in patients with lepromatous leprosy. In this research, we use DNA microarray analysis to identify the impact of thalidomide on gene expression responses in human cells after lipopolysaccharide (LPS) stimulation. We employed a two-stage framework. Initially, we identified 1584 altered genes in response to LPS. Modulation of this set of genes was then analyzed in the LPS stimulated cells treated with thalidomide.
RESULT…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-content data have the potential to inform mechanism of action for toxicants. However, most data to support this notion have been genera … question of how predictive gene expression analysis is, for a given mode of action. Gene expression microarray analysis was performed on cells after 24h and 48h of exposure to each chemical using Affymetrix microarrays. Cluster analysis suggests that the primary hepatocyte model was capable of responding to these hepatotoxicants, with changes in gene expression that …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Comparative genomics of Dehalococcoides strains and an enrichment were performed using a microarray targeting genes from all available sequenced genomes of the Dehalococcoides genus. The microarray was designed with 4305 probe sets to target 98.6% of the open-reading frames from strains 195, CBDB1, BAV1 and VS. The microarrays were validated and applied to query the genomes of two recently isolated Dehalococcoides strains, ANAS1 and ANAS2, and their enrichment source (ANAS) to understand the genome-physiology relationships. Strains ANAS1 and ANAS2 can both couple the reduction of trichloroethe
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microarray experiments involve many steps, including spotting cDNA, extracting RNA, labeling targets, hybridizing, scanning, and analyzing images. Each step introduces variability, confounding our ability to obtain accurate estimates of the biological differences between samples. We ran repeated experiments using high-density cDNA microarray membranes (Research Genetics Human GeneFilters Microarrays Version I) and 33P-labeled targets. Total RNA was extracted from a Burkitt lymphoma cell line (GA-10). We estimated the components of variation coming from: (1) image analysis, (2) exposure time to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Peptides (B-cell epitopes) have broad applications in disease diagnosis and surveillance of pathogen exposure. In this framework, we present a pilot study to design and produce a peptide microarray for the integrated surveillance of neglected tropical diseases. The peptide microarray was evaluated against peptides derived from Ascaris lumbricoides, Necator americanus, Schistosoma haematobium, Schistosoma mansoni, Trichuris trichiura, Bacillus anthracis, Mycobacterium leprae, Wuchereria bancrofti, Rabies lyssavirus, Chlamydia trachomatis and Trypanosoma brucei.
METHODS: S. haemat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Development of polarized immune responses controls resistance and susceptibility to many microorganisms. However, studies of several infectious, allergic, and autoimmune diseases have shown that chronic type-1 and type-2 cytokine responses can also cause significant morbidity and mortality if left unchecked. We used mouse cDNA microarrays to molecularly phenotype the gene expression patterns that characterize two disparate but equally lethal forms of liver pathology that develop in Schistosoma mansoni infected mice polarized for type-1 and type-2 cytokine responses. Hierarchical clustering ana
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The diagnostic value of allergen-specific immunoglobulin E (IgE) in horses with asthma is uncertain. A recently developed protein microarray detected abnormally high latex-specific IgE concentrations in the serum of horses with severe asthma.
OBJECTIVES: The main objective was to characterize the IgE profiles of asthmatic horses in Switzerland using a protein microarray platform in serum and bronchoalveolar lavage fluid (BALF). The secondary objective was to determine whether serological and BALF allergen-specific IgE concentrations correlated.
ANIMALS: Forty-four asthmatic and 3
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The aim of the study is to develop a DNA microarray for the indication of viral pathogens causing community-acquired pneumonia.
MATERIALS AND METHODS: The study materials were swab samples from the nasopharyngeal and oropharyngeal mucous membranes of patients aged 2 months to 18 years with X-ray confirmed pneumonia. The selection of DNA probes for the specific detection of viral community-acquired pneumonia pathogens and development of the microarray design were carried out using our previously developed disprose program. The nucleotide sequences of pathogens were obtained from th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oral submucosal fibrosis (OSF) is a chronic and progressive disorder, caused by chewing areca nuts, affecting the oral cavity and oropharynx. OSF is characterized by severe symptoms like severe burning sensation, restricted mouth opening, etc. Given the multifactorial and poorly understood molecular basis of the disease, there is a need for novel biomarkers and therapeutic targets.
METHOD: We downloaded 3 RNA-seq, two microarray, one epigenomic, and one single-cell RNA-seq datasets from the gene expression omnibus database. Differentially expressed genes (DEGs) were characterized
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immune dysregulation, polyendocrinopathy, enteropathy, X-linked (IPEX) syndrome is one of the inborn errors of immunity, characterized by impaired function of the regulatory T cells. Clinical manifestations of IPEX syndrome are characterized by various autoimmune diseases with autoantibodies. The comprehensive analysis for autoantibodies using human proteome microarrays in the four patients with IPEX syndrome was performed. The numbers of the highly expressed autoantibody showing relative log2 ratios greater than 1 were 1876, 513, 234 and 831 (mean: 864), respectively. Some novel autoantibodie
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are small RNA molecules that regulate gene expression. Emerging evidence suggests that differential miRNA expression is associated with viral infection and tumorigenesis. Recently discovered microRNAs in the Marek's disease virus (MDV) genome have been suggested to have regulatory roles during MDV oncogenesis. To gain more insight into the molecular mechanisms of the tumorigenesis of MDV, we used microarrays to screen host and viral miRNAs that were sensitive to infection by MDV. Microarray analysis showed significant differential expression of 79 miRNAs, which was confirmed…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To detect CCL20 and CXCR4 expressions in epidermis infected with condyloma acuminatum (CA) and normal epidermis and investigate the effect of their expressions on Langerhans cells in CA epidermis.
METHODS: Gene expression of CCL20 and CXCR4 in 3 epidermal CA lesions and in 3 normal epidermis specimens were detected using Affymetrix oligonucleotide microarrays HG-U 133A 2.0, and the protein levels of CCL20 and CXCR4 in these specimens were measured by Western blotting.
RESULTS: Microarray analysis revealed markedly down-regulated mRNA expressions of CCL20 and CXCR4 in the 3 epiderm…
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circular RNAs(circRNA) are recently demonstrated to have a close relationship with tumors.To investigate the role of circular RNA in the pathogenesis of salivary adenoid cystic carcinoma(SACC), ten SACC tissues and paired normal submandibular gland(SMG) tissues were collected as the tumor group and the control group. Total RNA was extracted and then measured using ceRNA microarray (including mRNA, lncRNA, and circRNA) and miRNA microarray. Gene Ontology(GO) analysis and Kyoto Encyclopedia of Gene and Genomes (KEGG) pathway analysis were performed in order to investigate the function of the dif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A multiplexed microarray chip (Immuno-μSARS2) aiming at providing information on the prognosis of the COVID-19 has been developed. The diagnostic technology records information related to the profile of the immunological response of patients infected by the SARS-CoV-2 virus. The diagnostic technology delivers information on the avidity of the sera against 28 different peptide epitopes and 7 proteins printed on a 25 mm2 area of a glass slide. The peptide epitopes (12-15 mer) derived from structural proteins (Spike and Nucleocapsid) have been rationally designed, synthesized, and used to develop
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phenotypic variability among individuals with neurofibromatosis type 1 (NF1) has long been a challenge for clinicians and an enigma for rese … cordant for optic pathway glioma, plexiform neurofibromas, skeletal manifestations, and malignancy. Microarray analysis identified a total of 81 CNVs meeting our conservative criteria, 37 of which overlap known genes. Of interest, three CNVs were previously unreported. Microarray analysis failed to ascertain any CNV differences within twin pairs, between twins and pa …
СтатьяTwin StudyПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the present study, we investigated the activity and modes of action of cajanin stilbene acid (CSA) and its derivatives in terms of cytotoxicity, gene expression profile, and transcription factor activity. XTT assays on MCF7 cells were performed upon treatment with CSA or derivatives. After the determination of IC50 values, gene expression profiling was performed with Agilent microarray experiments. Deregulated genes were determined with Chipster software, pathway and functional analyses were performed with Ingenuity pathway software. In order to identify the potential upstream regulators, M
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human umbilical cord blood (HUCB) cell therapies have shown promising results in reducing brain infarct volume and most importantly in improving neurobehavioral function in rat permanent middle cerebral artery occlusion, a model of stroke. In this study, we examined the gene expression profile in neurons subjected to oxygen-glucose deprivation (OGD) with or without HUCB treatment and identified signaling pathways (Akt/MAPK) important in eliciting HUCB-mediated neuroprotective responses. Gene chip microarray analysis was performed using RNA samples extracted from the neuronal cell cultures from…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: We investigated interferon-stimulated gene 15 (ISG15), a poorly understood ubiquitin-like modifier, and its enzymatic pathway in dermatomyositis (DM), an autoimmune disease primarily involving muscle and skin.
METHODS: We generated microarray data measuring transcript abundance for approximately 18,000 genes in each of 113 human muscle biopsy specimens, and studied biopsy specimens and cultured skeletal muscle using immunohistochemistry, immunoblotting proteomics, real-time quantitative polymerase chain reaction, and laser-capture microdissection.
RESULTS: Transcripts encoding ISG
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is a substantial need for biomarkers to distinguish latent stage from active Mycobacterium tuberculosis infections, for predicting dis … es in lung tissues from mice infected with M. tuberculosis. Gene expression was screened using cDNA microarray analysis and confirmed by quantitative RT-PCR. Based on the cDNA microarray results, 11 candidate cytokines genes, which were obviously up-regulated during the chronic stage compared with those during the persistent stage, were selected and clustered into th …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования