BACKGROUND: Iron (Fe) is an essential micronutrient for plant growth and development. Iron deficiency chlorosis (IDC), caused by calcareous soils or high soil pH, can limit iron availability, negatively affecting soybean (Glycine max) yield. This study leverages genome-wide association study (GWAS) and a genome-wide epistatic study (GWES) with previous gene expression studies to identify regions of the soybean genome important in iron deficiency tolerance.
RESULTS: A GWAS and a GWES were performed using 460 diverse soybean PI lines from 27 countries, in field and hydroponic iron stress condit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Djallonké (West African Dwarf) sheep is a small-sized haired sheep resulting from a costly evolutionary process of natural adaptation to the harsh environment of West Africa including trypanosome challenge. However, genomic studies carried out in this sheep are scant. In this research, genomic data of 184 Djallonké sheep (and 12 Burkina-Sahel sheep as an outgroup) generated using medium-density SNP Chips were analyzed. Three different statistics (iHS, XP-EHH and nSL) were applied to identify candidate selection sweep regions spanning genes putatively associated with adaptation of sheep to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genome-wide association studies (GWASs) have identified single-nucleotide polymorphisms (SNPs) that may be genetic factors underlying Alzheimer's disease (AD). However, how these AD-associated SNPs (AD SNPs) contribute to the pathogenesis of this disease is poorly understood because most of them are located in non-coding regions, such as introns and intergenic regions. Previous studies reported that some disease-associated SNPs affect regulatory elements including enhancers. We hypothesized that non-coding AD SNPs are located in enhancers and affect gene expression levels via chrom
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To systematically evaluate the effects of matrix metalloproteinase-3 (MMP3) and tissue inhibitor of metalloproteinase-2 (TIMP2) on chronic Achilles tendinopathy (AT) susceptibility. Chronic AT is one of the most prevalent and severe injuries in athletes. Early studies suggested that tendon extracellular matrix (ECM) may be involved in the pathogenesis of chronic AT. MMP3 is an important member of the MMP family and is important to ECM integrity. In addition, tissue inhibitor of metalloproteinase-2 (TIMP2) can indirectly limit the activity of MMP3 activity.
DESIGN: Case-control gen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Culex pipiens pallens is an important vector that transmits Bancroftian filariasis, Japanese encephalitis and other diseases that pose a ser … trolling insecticide resistance. Using a combination of SNP and transcriptome data, gene expression quantitative trait loci (eQTLs) were studied in deltamethrin-resistant mosquitoes. The most differentially expressed pathway in the resistant group was identified, and a regulatory network was built using these SNPs and the differentially expressed genes (DEGs) in this pat …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The production and regulation of defensive specialized metabolites play a central role in pathogen resistance in maize (Zea mays) and other plants. Therefore, identification of genes involved in plant specialized metabolism can contribute to improved disease resistance. We used comparative metabolomics to identify previously unknown antifungal metabolites in maize seedling roots, and investigated the genetic and physiological mechanisms underlying their natural variation using quantitative trait locus mapping and comparative transcriptomics approaches. Two maize metabolites, smilaside A (3,6-d
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the success of large-scale genome-wide association studies (GWASs) on complex traits, our understanding of their genetic architecture is far from complete. Jointly modeling multiple traits' genetic profiles has provided insights into the shared genetic basis of many complex traits. However, large-scale inference sets a high bar for both statistical power and biological interpretability. Here we introduce a principled framework to estimate annotation-stratified genetic covariance between traits using GWAS summary statistics. Through theoretical and numerical analyses, we demonstrate tha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell death-inducing DFFA-like effector c (CIDEC, also known as Fsp27) has emerged as an important regulator of metabolism associated with lipodystrophy, diabetes, and hepatic steatosis. It is required for unilocular lipid droplet formation and optimal energy storage. The mechanism between this gene and livestock growth traits, however, has yet to be reported. In this study, we found ten novel single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the 5' transcriptional region of CIDEC in Nanyang (NY) cattle, which are located in the recognition sequences (potential cis-acting elements) of 22 transcription
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The paradigm of resistance evolution to chemotherapeutic agents is that a key coding mutation in a specific gene drives resistance to a particular drug. In the case of resistance to the anti-malarial drug chloroquine (CQ), a specific mutation in the transporter pfcrt is associated with resistance. Here, we apply a series of analytical steps to gene expression data from our lab and leverage 3 independent datasets to identify pfcrt-interacting genes. Resulting networks provide insights into pfcrt's biological functions and regulation, as well as the divergent phenotypic effects of it
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic modifier loci influence the inheritance of diseases and lead to variability in phenotype progression. We report the influence of modifier loci in female Wistar Kyoto (WKY) rats on cellular pathogenesis of nephronophthisis inherited from Lewis polycystic kidney (LPK) rats. The loci modified cellular expression and progression of nephronophthisis in the backcross 1 (BC1) progeny. Mating experiments to produce BC1 progeny were carried out between three male LPK and seven female WKY rats. Fifteen female rats from the F1 generation were mated with the male LPK rats to produce the BC1 progen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Haemoglobin S (HbS) is the gene known to confer the strongest advantage against malaria morbidity and mortality. Multiple HbS effects have been described resulting in protection against parasitaemia and reduction of severe malaria risk. This study aimed to explore HbS protection against severe malaria and Plasmodium falciparum parasitaemia in Angolan children exhibiting different severe malaria syndromes.
METHODS: A case-control study was designed with 430 malaria cases (n = 288 severe malaria and n = 142 uncomplicated malaria) and 319 uninfected controls, attending a central paed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bacterial insecticide Bacillus thuringiensis subsp. israelensis (Bti) is an increasingly popular alternative to chemical insecticides for controlling mosquito populations. Because Bti toxicity relies on the action of four main toxins, resistance to Bti is very likely a complex phenotype involving several genes simultaneously. Dissecting the underlying genetic basis thus requires associating a quantitative measure of resistance to genetic variation at many loci in a segregating population. Here, we undertake this task using the dengue and yellow fever vector, the mosquito Aedes aegypti, as
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies have mainly relied on common HapMap sequence variations. Recently, sequencing approaches have allowed analysis of low frequency and rare variants in conjunction with common variants, thereby improving the search for functional variants and thus the understanding of the underlying biology of human traits and diseases. Here, we used a large Icelandic whole genome sequence dataset combined with Danish exome sequence data to gain insight into the genetic architecture of serum levels of vitamin B(12) (B12) and folate. Up to 22.9 million sequence variants were analyze
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In Drosophila, male flies perform innate, stereotyped courtship behavior. This innate behavior evolves rapidly between fly species, and is likely to have contributed to reproductive isolation and species divergence. We currently understand little about the neurobiological and genetic mechanisms that contributed to the evolution of courtship behavior. Here we describe a novel behavioral difference between the two closely related species D. yakuba and D. santomea: the frequency of wing rowing during courtship. During courtship, D. santomea males repeatedly rotate their wing blades to face forwar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Large-scale genetic association studies can test hundreds of thousands of genetic markers for association with a trait. Since the genetic markers may be correlated, a Bonferroni correction is typically too stringent a correction for multiple testing. Permutation testing is a standard statistical technique for determining statistical significance when performing multiple correlated tests for genetic association. However, permutation testing for large-scale genetic association studies is computationally demanding and calls for optimized algorithms and software. PRESTO is a new softwa
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glaucoma is a leading cause of blindness in virtually every country. Development of an accurate diagnostic test for presymptomatic detection of individuals at risk is an urgent requisition for this condition. Herein, we report mapping of a new adult-onset primary open-angle glaucoma (POAG) locus on 5q22.1 (GLC1G) and identification of its defective gene. Mutation screening of seven candidate genes from the GLC1G critical region (approximately 2 Mb between D5S1466 and D5S2051) identified only one significant alteration in the WDR36 (WD40-repeat 36) gene. This mutation (i.e. D658G) was segregate
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cpk mouse is the most extensively characterized model of autosomal recessive polycystic kidney disease (ARPKD). The major ARPKD-related renal and biliary phenotypes are modulated in F2 mutants by genetic background, suggesting that quantitative trait loci (QTL) modulate disease severity. In 461 F2 cpk mice, kidney length, weight, and volume were scored as quantitative traits (QT), and a semiquantitative method to assess biliary duct number, area (BDA), portal vein area, and total area of each portal field, as well as the severity of cholangitis, was developed. QTL mapping was performed wit…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic linkage analyses in human populations have traditionally combined male and female progeny for determination of quantitative trait loci (QTL). In contrast, most rodent studies have focused primarily on males. This study represents an extensive female-specific linkage analysis in which 236 neuroendocrine, renal, and cardiovascular traits related to arterial pressure (BP) were determined in 99 female F2 rats derived from a cross of Dahl salt-sensitive SS/JrHsdMcwi (SS) and Brown Norway normotensive BN/SsNHsdMcwi (BN) rats. We identified 126 QTL for 96 traits on 19 of the 20 autosomal chro…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To map the gene(s) associated with autosomal dominant (AD) high-grade myopia.
METHODS: A multigeneration English/Canadian family with AD severe myopia was ascertained. Myopes were healthy, with no clinical evidence of syndromic disease, anterior segment abnormalities, or glaucoma. The family contained 22 participating members (12 affected). The average age of diagnosis of myopia was 8.9 years (range, birth to 11 years). The average refractive error for affected adults was -13.925 D (range, -5.50 to -50.00). Microsatellite markers for genotyping were used to assess linkage to several
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inbred mouse strains with age-related hearing loss (AHL) provide valuable models for studying the genetic basis of human presbycusis. Here we report the genetic mapping of a second AHL locus in mice (designated Ahl2) that is a major contributor to the 8- to 10-month difference in hearing loss onset times between NOD/LtJ and C57BL/6J mice. A whole-genome linkage scan of 110 progeny from a (C57BL/6JxNOD/LtJ)xNOD/LtJ backcross revealed statistically significant associations of ABR thresholds with markers on chromosome 5, with a peak lod score of 5.5 for D5Mit309. At 6 months of age, backcross pro
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования