Microbial cell factories integrate metabolic engineering, synthetic regulation, protein engineering, and computational design to improve catalytic performance and process robustness. Within this landscape, amide transforming enzymes provide diverse functions ranging from nitrogen metabolism and hydrolysis to covalent protein remodeling. This review examines amidases, asparaginases, glutaminases, nitrilases, nitrile hydratases, acylases, and carbamylases, with particular emphasis on microbial transglutaminase (MTGase). MTGase is distinguished by its ability to catalyze covalent ε-(γ-glutamyl) l
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: This study evaluated a predefined combination of curcumin, quercetin, forskolin, and gymnemic acid using both experimental and computational approaches.
METHODS: The phytochemical combination of curcumin, quercetin, forskolin, gymnemic acid was assessed through diabetes-related enzyme inhibition and free radical scavenging assays. Acute and 90-day oral toxicity studies were conducted to evaluate safety. Two independent cohorts of rats induced with streptozotocin one over 120 days and the other over 90 day- were used to examine outcomes related to glycaemia, biochemistry, oxidative stress
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ceramides are N-acyl sphingosine derivatives with important functions in cell signaling and skin impermeability. Virtually all unsaturated sphingosines found in nature contain a 4-5 trans double bond. The trans configuration is essential for most ceramide functions. Several laboratories, including our own, have tried to understand the reasons for that configurational specificity. We found that, unlike the trans-isomer, cis-palmitoyl ceramide exhibited a kinetically restricted solid-solid phase transition with unusually large changes of molecular area under isothermal compression and marked hys
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Therapy resistance remains a critical challenge in colon adenocarcinoma (COAD). The dysregulation of programmed cell death (PCD) pathways significantly influences therapeutic response, but its integrated role in shaping the tumor microenvironment (TME) and driving clinical heterogeneity in COAD is poorly defined.
METHODS: We established a Programmed Cell Death-related Subtype (PCDS) classification by integrating 12 PCD pathways across transcriptomic data from 1,140 COAD patients using non-negative matrix factorization (NMF). The subtypes were validated in independent RNA-sequencing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Few studies have reported that severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) spike protein may suppress cancer cell growth. Here, we investigated the effect of the SARS-CoV-2 spike protein in A549 lung cancer cells using recombinant spike protein (SP), spike protein transfection (SPT), and pseudo-SARS-CoV-2 virus (PSV). To evaluate its anticancer effects and associated molecular changes, we performed RNA sequencing, colony formation, immunofluorescence, cell viability, migration, FACS, western blotting, 3D spheroid, molecular docking, siRNA knockdown, qRT-PCR, apoptosis assays,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The 1,2,3-triazole scaffold is a privileged heterocyclic motif in medicinal chemistry owing to its chemical stability, click-chemistry accessibility, and broad biological activity. This review examines advances in 1,2,3-triazole-based hybrids, emphasizing antitubercular activity against drug-sensitive and drug-resistant Mycobacterium tuberculosis, as well as applications in cancer, diabetes, and drug-resistant bacterial infections. Attention is given to structure-activity relationships and computational drug-design approaches.
METHODS: Recent literature on the design, synthesis,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer (BC) remains a leading cause of cancer-related mortality in women worldwide. Scutellaria barbata, a traditional Chinese medicinal herb, possesses recognized anticancer properties, but its mechanistic role in BC is not fully elucidated. This study employed an integrated in silico approach to identify the key flavonoids, targets, and pathways through which S. barbata exerts its anti-BC effects. A multi-step computational methodology incorporating network pharmacology, molecular docking, and dynamics simulations was utilized to profile bioactive compounds from S. barbata. From an in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is a progressive inflammatory lung disorder in which human neutrophil elastase (HNE, encoded by ELANE) plays a central role in extracellular matrix degradation and airway remodeling. Despite its therapeutic relevance, no clinically approved HNE inhibitors are currently available for COPD treatment. In this study, an integrated computational strategy combining virtual screening, molecular docking, network pharmacology, and functional enrichment analysis was employed to identify potential natural inhibitors of HNE. A library of 8747 phytochemicals fro
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbial biofilm, quorum sensing (QS)-mediated virulence and oxidative stress-induced inflammation are interrelated pathological processes that play a crucial role in persistent infections and chronic illnesses. Due to the multifactorially of such processes, isolated target-based approaches to therapy usually do not provide long-term effectiveness. A combined network pharmacology and multi-level computational approach was used in order to clarify the molecular mechanisms underlying the antibiofilm, anti-quorum sensing (anti-QS), and antioxidant activities of thirty-three bioactive compounds f
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: FAK and PLK1 are regulators of oncogenic signaling and metastasis, and their coinhibition offers a synergistic anticancer strategy. This study employed computational modeling to design quinazoline-based scaffolds as potential dual FAK-PLK1 inhibitors.
METHODS: 54 quinazoline derivatives were analyzed using 2D/3D-QSAR, pharmacophore mapping, pharmacokinetic (ADMET) profile prediction, and molecular docking (PyRx-AutoDock Vina) to identify structural features and evaluate their dual FAK-PLK1 inhibitory potential with favourable pharmacokinetics properties.
RESULTS: 2D-QSAR modeli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vertigo is a debilitating vestibular disorder affecting approximately 10-30% of the global population, yet no dedicated computational chemistry study has systematically characterised the properties of its pharmacological agents using machine learning. In this study, we present the first Quantitative Structure-Property Relationship (QSPR) analysis of 47 clinically established anti-vertigo drugs using nine Neighborhood degree-based topological indices, combined with three machine learning algorithms such as Ridge Regression, Random Forest (RF) and Gradient Boosting Regression (GBM). The topologi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Harmful microalgal or cyanobacterial blooms result in accumulation of structurally diverse toxins, including cyclic peptides, lactones, and alkaloids, which pose significant risks to aquatic ecosystems and human health. Experimental studies on the enzymatic detoxification of these compounds are limited by their structural complexity and the limited commercial availability of many toxins. In this study, computational molecular docking and molecular dynamics simulations were used to evaluate potential interactions between 31 enzymes and 26 microalgal and cyanobacterial toxins. The affinity, cont
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chia seed peptides that activate alcohol dehydrogenase (ADH)/ aldehyde dehydrogenase (ALDH) were identified through enzymatic protein hydrolysis, combined with ultrafiltration, peptidomics, and computational learning. The results showed that chia seed peptides in different molecular weight ranges exhibited distinctly different spectral and physicochemical properties. The 3-5 kDa fraction demonstrated stronger fluorescence properties, solution stability (ζ-potential value was -24.80 ± 0.22 mV), and thermal stability (30.2 % mass retention at 600 °C). The <3 kDa fraction exhibited significant AD
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Limited clinical data and unstable animal models hinder understanding isotretinoin-induced keratoconus. We addressed this by integrating pharmacovigilance with computational approaches.
METHODS: Isotretinoin-associated ocular surface adverse events were extracted from the FDA Adverse Event Reporting System (FAERS). Disproportionality analyses detected pharmacovigilance signals, and age confounding bias was assessed with multivariable logistic regression. Network toxicology and transcriptomics defined candidate targets. Enrichment analyses implicated biological processes and pathways.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Childhood neuroblastoma (NB) is a malignant tumour that is a member of a class of embryonic tumours that have their origins in sympathoadrenal progenitor cells. There are five stages in the clinical NB staging system: 1, 2A, 2B, 3, 4S, and 4. For those diagnosed with stage 4 neuroblastoma (NBS4), the treatment options are limited with a survival rate of between 40 and 50%. Since 1975, more than 15 targets have been identified in the search for a treatment for high-risk NBS4. This article is concerned with the search for a multi-target drug treatment for high-risk NBS4 and focuses on four possi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orofacial clefts (OC) are a congenital anomaly typically classified as syndromic or non-syndromic. Among the syndromic cases, Van der Woude syndrome (VWS) and popliteal pterygium syndrome (PPS) are primarily caused by pathogenic variants in IRF6, which encodes a transcriptional factor essential for orofacial development. Our aim is to identify and characterize IRF6 variants in two syndromic OC cases and assess their structural and functional consequences through computational modeling. Sequencing of IRF6 exons 3, 4, 7, and 9 was conducted in one proband with VWS and one proband with PPS, as we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer is a major cause of cancer-related mortality in men worldwide. The anti-proliferative activity of Gongronema latifolium leaf extracts on some cancer cells has been reported. Herein, we investigated the growth inhibitory effect of the Gongronema latilolium leaf methanol extract and isolated pregnane (iloneoside) against prostate cancer cell lines using the MTT cell proliferation assay, apoptosis quantification, cell cycle analysis using flow cytometry and computational analysis molecular docking, molecular dynamics simulation (MDs), binding free energy computation and cluster an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present quantum-quantum and quantum-quantum-classical schemes based on many-body Green's functions theory in the GW approximation with the Bethe-Salpeter equation (GW-BSE) employing projection-based-embedding (PbE). Such approaches allow defining active and inactive subsystems of larger, complex molecular systems, with only the smaller active subsystem being explicitly treated by GW-BSE offering significant computational advantages. However, as PbE can modify the single-particle states in the Kohn-Sham (KS) ground state calculation and screening effects from the inactive region are not auto
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & OBJECTIVES: The world is currently under the threat of coronavirus disease 2019 (COVID-19) infection, caused by SARS-CoV-2. The objective of the present investigation was to repurpose the drugs with potential antiviral activity against receptor-binding domain (RBD) of SARS-CoV-2 spike (S) protein among 56 commercially available drugs. Therefore, an integrative computational approach, using molecular docking, quantum chemical calculation and molecular dynamics, was performed to unzip the effective drug-target interactions between RBD and 56 commercially available drugs.
METHODS: T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza is still a chronic global health threat, inducing a sustained search for effective antiviral therapeutics. Computational methods have played a pivotal role in developing small molecule therapeutics. In this study, we applied a combined in silico and in vitro approach to explore the potential anti-influenza activity of cyproheptadine, a clinically used histamine H1 receptor antagonist. Virtual screening based on the average quasivalence number (AQVN) and electron-ion interaction potential (EIIP) descriptors suggests similarities between cyproheptadine and several established anti-infl
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.