Single-strand DNA (ssDNA)-binding proteins (SSBs) are ubiquitous and essential for a wide variety of DNA metabolic processes, including DNA replication, recombination, DNA damage detection and repair. SSBs have multiple roles in binding and sequestering ssDNA, detecting DNA damage, stimulating nucleases, helicases and strand-exchange proteins, activating transcription and mediating protein-protein interactions. In eukaryotes, the major SSB, replication protein A (RPA), is a heterotrimer. Here we describe a second human SSB (hSSB1), with a domain organization closer to the archaeal SSB than to
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bullous pemphigoid (BP) is an autoimmune disease characterized by autoantibody-mediated activation of immune cells and subepidermal blister formation. Excess amounts of extracellular DNA are produced in BP, however, it remains unclear how extracellular DNA contributes to BP pathogenesis. Here we show a possible mechanism by which interleukin (IL)-26 binds to extracellular DNA released from neutrophils and eosinophils to support DNA sensing. Patients with BP exhibited high circulating levels of IL-26, forming IL-26-DNA complexes in the upper dermis and inside the blisters. IL-26-DNA complexes p
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Artemisinin (ART) is a vital medicinal compound that is used alone or as part of a combination therapy against malaria. ART is thought to function by attaching to heme covalently and alkylating a range of proteins. Using a combination of biophysical methods, we demonstrate that ART is bound by three-way junction and duplex containing DNA molecules. Binding of ART by DNA is first shown for the cocaine-binding DNA aptamer and extensively studied using this DNA molecule. Isothermal titration calorimetry methods show that the binding of ART is both entropically and enthalpically driven at physiolo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
How huntingtin (HTT) triggers neurotoxicity in Huntington's disease (HD) remains unclear. We report that HTT forms a transcription-coupled DNA repair (TCR) complex with RNA polymerase II subunit A (POLR2A), ataxin-3, the DNA repair enzyme polynucleotide-kinase-3'-phosphatase (PNKP), and cyclic AMP-response element-binding (CREB) protein (CBP). This complex senses and facilitates DNA damage repair during transcriptional elongation, but its functional integrity is impaired by mutant HTT. Abrogated PNKP activity results in persistent DNA break accumulation, preferentially in actively transcribed
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sequential measurements of DNA in Haemophilus influenzae cells after X-ray irradiation show rapid initial degradation of DNA followed by a plateau after about 40 min at normal growth conditions. Both the initial rate and final amount of degradation increase with radiation exposure. Degradation is somewhat greater in stationary-phase than in log-phase cells, but colony-forming ability (CFA) is independent of cell stage. Distributions of single-strand lengths of DNA in unirradiated or irradiated cases, as measured by alkaline sucrose gradient techniques, are neither monodispersive nor random, an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: A small pool of infected cells persists in HIV-infected individuals receiving antiretroviral therapy (ART). Here, we developed ultrasensitive assays to precisely measure the frequency of cells harboring total HIV DNA, integrated HIV DNA, and two long terminal repeat (2-LTR) circles. These assays are performed on cell lysates, which circumvents the labor-intensive step of DNA extraction, and rely on the coquantification of each HIV molecular form together with CD3 gene sequences to precisely measure cell input. Using primary isolates from HIV subtypes A, B, C, D, and CRF01_A/E, we d
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xeroderma pigmentosum variant (XPV) patients have normal DNA excision repair, yet are predisposed to develop sunlight-induced cancer. They exhibit a 25-fold higher than normal frequency of UV-induced mutations and very unusual kinds (spectrum), mainly transversions. The primary defect in XPV cells is the lack of functional DNA polymerase (Pol) eta, the translesion synthesis DNA polymerase that readily inserts adenine nucleotides opposite photoproducts involving thymine. The high frequency and striking difference in kinds of UV-induced mutations in XPV cells strongly suggest that, in the absenc
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nephrotic Syndrome is the most widespread pediatric kidney disorder. Genetic alterations in podocyte genes are thought to be responsible for the disease. G-quadruplexes are non-conventional guanine-rich DNA and RNA structures, which are commonly found in regulatory regions. This study examined the potential G-quadruplexes forming sequences in the promoters and gene bodies of podocyte-marker genes. High G-quadruplexes density was found in the vascular endothelial growth facto, cluster of differentiation-151, integrin subunit beta-4, metalloendopeptidase, Wilms tumor-1, integrin subunit beta-3,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cigarette smoking is a major cause of human cancer at a variety of sites, although its carcinogenic mechanisms remains unestablished. Cigarette smoke can be divided into two phases, gas phase and particulate matter (tar). Both phases contain high concentrations of oxidants and free radicals, especially nitric oxide (NO) and nitrogen oxides in the gas phase and quinone/hydroquinone complex in the tar. We have found that incubation of pBR322 plasmid DNA with aqueous extracts of cigarette tar and a NO-releasing compound (diethylamine NONOate) caused synergistic induction of DNA single-strand brea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein radical labeling, like fast photochemical oxidation of proteins (FPOP), coupled to a top-down mass spectrometry (MS) analysis offers an alternative analytical method for probing protein structure or protein interaction with other biomolecules, for instance, proteins and DNA. However, with the increasing mass of studied analytes, the MS/MS spectra become complex and exhibit a low signal-to-noise ratio. Nevertheless, these difficulties may be overcome by protein isotope depletion. Thus, we aimed to use protein isotope depletion to analyze FPOP-oxidized samples by top-down MS analysis. Fo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Severe combined immunodeficiency disease (SCID) is a rare inherited severe immunodeficiency, in which functions of T cells and B cells are impaired. SCID is inherited either in X-linked recessive, or autosomal recessive forms, and is either radiosensitive or radioresistant. Artemis (DCLRE1C gene), DNA ligase IV, DNA-PKC, and Cernunnos/XLF proteins are regarded as NHEJ (Non-Homologous End-Joining) proteins that are involved in the repair process of double-strand DNA breaks and their mutations would lead to cellular radiosensitivity. Diagnostic radiosensitivity assays a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: In recent years, all medical specialists, including ophthalmologists, have been facing the problem of mixed infections. Recurrent inflammation in the anterior and posterior eye segments is often a result of infection by more than one variety of pathogens.
MATERIAL AND METHODS: Over the period 2013-2016, 34 patients (14 men and 20 women) with different inflammatory processes in the eye who appeared DNA-positive for mycoplasmas (Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum) and/or chlamydiae (Chlamydia trachomatis) (PCR testing of tear fluid and/or urine) were followed up. All patient
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expansion of a trinucleotide (CGG) repeat element within the 5' untranslated region (5'UTR) of the human FMR1 gene is responsible for a number of heritable disorders operating through distinct pathogenic mechanisms: gene silencing for fragile X syndrome (>200 CGG) and RNA toxic gain-of-function for FXTAS (∼ 55-200 CGG). Existing models have focused almost exclusively on post-transcriptional mechanisms, but co-transcriptional processes could also contribute to the molecular dysfunction of FMR1. We have observed that transcription through the GC-rich FMR1 5'UTR region favors R-loop formation, wi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitamin B6 metabolism influences the adaptive response of non-small lung carcinoma (NSCLC) cells to distinct, potentially lethal perturbations in homeostasis, encompassing nutrient deprivation, hyperthermia, hypoxia, irradiation as well as the exposure to cytotoxic chemicals, including the DNA-damaging agent cisplatin (CDDP). Thus, the siRNA-mediated downregulation of pyridoxal kinase (PDXK), the enzyme that generates the bioactive form of vitamin B6, protects NSCLC cells (as well as a large collection of human and murine malignant cells of distinct histological derivation) from the cytotoxic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DNA content of nuclei during the 2-cell stage as well as in presumptive tetraploid embryos was investigated. In vivo produced pig zygotes were cultured to the 2-cell stage and either monitored for cleavage to the 4-cell stage or mounted at various times post-cleavage and DNA content determined. The length of the 2-cell stage was 14.8 +/- 3.0 hr. There was a significant increase in the length of the 2-cell stage due to the time in vitro as a zygote (P < 0.001: R2 = 0.866). The DNA content increased (P < 0.05) each 2 hr postcleavage until 10 hr postcleavage. This suggested that there is a sh
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomolecular condensates formed via liquid-liquid phase separation often contain multiple molecular components whose collective interactions determine their physical properties. However, how different molecular species cooperatively regulate condensate mechanics remains poorly understood. In this study, we integrated Raman-Brillouin imaging with fluorescence recovery after photobleaching (FRAP) analysis to quantify the molecular composition, mobility, and high-frequency viscoelastic responses of multicomponent condensates composed of heterochromatin protein 1α (HP1α), DNA, and lipids. DNA inco
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Photodynamic therapy (PDT) is an innovative treatment modality used in cancer therapy and non-malignant diseases. Despite significant advancements in PDT administration, resistance in certain tumors typically limits an increase in survival rates. One strategy to improve PDT outcomes is using DNA repair inhibitors to disrupt the DNA repair mechanism. DNA repair inhibitors are compounds that interfere with the cellular mechanisms responsible for repairing damaged DNA. These inhibitors can be applied to cancer treatment that they make tumor cells more sensitive to other forms of treatments, inclu
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
S. aureus is one of important causes of disease, food poisoning in humans and animals. The generally methods for detection of S. aureus is time consuming. Therefore, a new method is necessary for rapid, sensitive and specific diagnosis of S. aureus. In the present study, two probes and a Bio-barcode DNA were designed for detection of S. aureus (Protein A). Firstly, magnetic nanoparticle (MNPs) and gold nanoparticle (AuNPs) were synthesized at 80 °C and 100 °C, respectively. The AuNPs and the MNPs were functionalized with probe1, Bio-barcode DNA and probe2, respectively. Target DNA was added in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eukaryotic type 1B topoisomerases act by forming covalent enzyme-DNA intermediates that transiently nick DNA and thereby release DNA supercoils. Here we present a study of the topoisomerase encoded by the pathogenic poxvirus molluscum contagiosum. Our studies of DNA sites favored for catalysis reveal a larger recognition site than the 5'-(T/C)CCTT-3' sequence previously identified for poxvirus topoisomerases. Separate assays of initial DNA binding and covalent complex formation revealed that different DNA sequences were important for each reaction step. The location of the protein-DNA contacts
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report on a novel activity of T4 endonuclease V. This enzyme is well known to be specific for the excision of pyrimidine dimers from UV-irradiated DNA. In this work, we show that T4 endonuclease V excises 4,6-diamino-5-formamidopyrimidine from DNA. 4,6-Diamino-5-formamidopyrimidine is formed as a product of adenine in DNA upon action of hydroxyl radicals and upon UV-irradiation. DNA substrates were prepared by UV-or gamma-irradiation of DNA in aqueous solution. DNA substrates were incubated either with active T4 endonuclease V or with heat-inactivated T4 endonuclease V or without the enzyme
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования