Although immunotherapy has revolutionised cancer treatment, its benefits remain restricted to a minority of patients with colon cancer. Emerging evidence implicates super-enhancer (SE) networks and ferroptosis dysregulation as key oncogenic drivers, though their synergistic prognostic and immune microenvironment implications are unexplored. Super-enhancer-related ferroptosis genes (SEFGs) were identified by intersecting SE-associated and ferroptosis-related genes. Using TCGA-COAD (training) and GSE39582 (validation) cohorts, we established an 8-gene prognostic signature via LASSO Cox regressio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Gastric cancer (GC) represents a significant global health burden with considerable heterogeneity in clinical and molecular behavior. The anatomical site of tumor origin-proximal versus distal-has emerged as a determinant of prognosis and response to therapy. The aim of this paper is to elucidate the transcriptional and regulatory differences between proximal gastric cancer (PGC) and distal gastric cancer (DGC) through master regulator (MR) analysis. Methods: We analyzed RNA-seq data from TCGA-STAD and microarray data from GEO (GSE62254, GSE15459). Differential gene expression and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer (GC) is a significant public health issue worldwide due to its high rates of morbidity and mortality. Its complex pathological classification and frequent late diagnosis present substantial challenges to clinical treatment. Although chemotherapy is somewhat effective in treating advanced GC, drug resistance in tumor cells continues to hinder progress in treatment. Circular RNAs (circRNAs) are a type of non-coding RNA with a unique, closed, single-stranded, circular structure. CircRNAs primarily act as "molecular sponges" that absorb microRNAs or specific proteins, thereby potent
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
How the oncogenic and tumor-suppressor roles of orphan nuclear receptor 4A1 (NR4A1) are balanced remains unclear. In this issue of Molecular Cell, Cai et al.1 report that a pyrimidine metabolite-UMP-acts as an endogenous regulator of NR4A1 by directly binding to abrogate its suppressive effect on gastric cancer development.
СтатьяКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging evidence has confirmed the inextricable connection between N4-acetylcytidine (ac4C) mRNA modification and the clinical characteristics of malignancies. Nonetheless, it is uncertain whether and how ac4C mRNA modification patterns affect clinical outcomes in melanoma patients. This research integrated single-cell sequencing data and transcriptomics to pinpoint ac4C-related genes (acRG) linked to melanoma progression and evaluate their clinical implications. Cells with elevated acRG score were predominantly located within the melanocytes cluster. Intercellular communications between mela
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC) is a common primary hepatic tumors with a 5-year survival rate of less than 20%. Therefore, it is crucial to elucidate the molecular mechanisms of ICC. Recently, the advance of high-throughput chromosome conformation capture (Hi-C) technology help us look insight into the three-dimensional (3D) genome structure variation during tumorigenesis. However, its function in ICC pathogenesis remained unclear.
METHODS: Hi-C and RNA-sequencing were applied to analyze 3D genome structures and gene expression in ICC and adjacent noncancerous hepatic tissue (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
5-hydroxymethylcytosine (5hmC), an epigenetic modification derived from the oxidation of 5-methylcytosine (5mC) by the ten-eleven translocation (TET) family of dioxygenases, plays a pivotal role in the regulation of gene expression, cellular differentiation, and developmental plasticity. Once considered an intermediate in DNA demethylation, 5hmC is now recognized as a stable and functionally significant epigenetic mark with distinct genomic distributions and significant regulatory implications. This review provides a comprehensive analysis of the biological functions of 5hmC in normal cellular
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypoxia forms an immunosuppression environment and is involved in tumor immune escape, which may be the potential culprit of resistance to anticancer therapies. Nevertheless, there is still a lack of research that explores the characteristics of hypoxia in pan-cancer at the single-cell level and assesses the application of hypoxia in immune checkpoint inhibitor (ICI) efficacy and clinical outcomes. We delineated cell-specific hypoxia levels and developed a computational framework to generate a pan-cancer tumor hypoxia-related transcriptomic signature (HYP.SIG) using 38 scRNA-seq datasets encom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Radiotherapy is a crucial treatment option for various cancers. However, the results of radiotherapy can vary widely across different cancer types and even among patients with the same type of cancer. This variability presents a major challenge in optimizing treatment strategies and improving patient survival. Here, we collected radiotherapy phenotype and expression data from 32 TCGA cancer datasets and performed overall survival analysis for 32 cancer types. Additionally, we conducted a signaling pathway enrichment analysis to identify key pathways involved in radiotherapy resistance and sens
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer (PCa) remains the second leading cause of cancer-related deaths in men, largely due to late-stage detection. Current diagnostic methods suffer from high false-positive rates, leading to overdiagnosis and unnecessary treatments. Given their low predictive value, there is an urgent need for precise and reliable biomarkers to enhance early detection and disease monitoring. Holding to that perspective, with the help of analytic and computational methods, we have elucidated the role of miRNA 1827 as a diagnostic biomarker with therapeutic potential. The expression analysis of miRNA
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer (PCa) is a multifaceted and heterogeneous disease that affects men globally. PCa incidences and related deaths in men are a major clinical challenge that needs immediate attention to prevent, manage, or treat the disease to improve overall health in patients. Activation of androgen receptor (AR) signaling and subsequent transactivation of downstream genes play a predominant role in PCa development, progression, and metastasis. Over the last few decades, the role of epigenetics has been much appreciated in the pathogenesis of PCa. There is widespread involvement of several epige
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ferroptosis is an iron-dependent form of regulated cell death that plays a dual role in cancer progression and suppression. Solute carrier family 7 member 11 (SLC7A11/xCT) is a key regulator of tumor cell ferroptosis that promotes cystine uptake and glutathione synthesis. However, the regulatory mechanisms of ferroptosis remain unclear, which limits its application in cancer therapy. Recent studies have found that non-coding RNAs (ncRNAs), including lncRNAs, miRNAs, and circRNAs, participate in the process of ferroptosis by regulating SLC7A11. In this review, we summarize the mechanisms of ncR
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Upon deregulation of growth control, cells and organs lose their ability to maintain size and function. In addition to autonomous mechanisms, nonautonomous regulators play key roles in controlling tumor growth. In this chapter, we will summarize the work, which identified novel communication factors between the tumor and its microenvironment, and the downstream genetic pathways and outputs of these cell-autonomous and nonautonomous interactions during tumor growth.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ovarian cancer (OC) is a gynecologic disease characterized by the uncontrolled growth and proliferation of abnormal cells in the ovaries, fallopian tubes, or peritoneum. Emerging evidence has shown the pivotal role of non-coding RNAs (ncRNAs), such as miRNAs, in driving the pathogenesis of OC. miRNAs are recognized as small ncRNAs that play critical roles in regulating gene expression in normal development and in disease states, including OC. Among miRNAs, the expression of miR-34a was found to be downregulated in OC. Elevated levels of this miRNA are associated with the induction of apoptosis
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We studied the expression levels of microRNAs (miR-21, miR-27a, miR-221, and miR-429) in the thymus of female Wistar rats after surgical treatment of breast cancer (BC) and after photodynamic therapy for BC followed by tumor resection. In the group without treatment, the levels of pro-oncogenic miR-21, miR-27a, and miR-221 in the thymus were reduced in comparison with those in the group of intact control. After surgical treatment of BC, the levels of miR-21 and miR-27a in the thymus increased in comparison with those in BC without treatment. Surgical removal of the tumor followed by photodynam
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T-cell lymphomas are clinically and biologically heterogeneous malignancies that comprise ~ 10% of non-Hodgkin lymphomas. Outcomes with first-line chemotherapy remain poor. Over the past decade, integrative genomic and epigenomic studies have defined recurrent abnormalities converging on proximal T-cell antigen receptor/costimulatory signaling to the NF-κB/NFAT, JAK/STAT, PI3K/AKT/mTOR, and NOTCH pathways, alongside pervasive alterations in chromatin modifiers and the DNA methylation machinery. In this review, we frame the biology of peripheral T-cell lymphoma as two interdependent layers, inc
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
LIM domains kinase 2 (LIMK2) is a 72 kDa protein that regulates actin and cytoskeleton reorganization. Once phosphorylated by its upstream activator (ROCK1), LIMK2 can phosphorylate cofilin to inactivate it. This relieves the levering stress on actin and allows polymerization to occur. Actin rearrangement is essential in regulating cell cycle progression, apoptosis, and migration. Dysregulation of the ROCK1/LIMK2/cofilin pathway has been reported to link to the development of various solid cancers such as breast, lung, and prostate cancer and liquid cancer like leukemia. This review aims to as
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The protein menin is encoded by the MEN1 gene and primarily serves as a nuclear scaffold protein, regulating gene expression through its interaction with and regulation of chromatin modifiers and transcription factors. While the scope of menin's functions continues to expand, one area of growing investigation is the role of menin in cancer. Menin is increasingly recognized for its dual function as either a tumor suppressor or a tumor promoter in a highly tumor-dependent and context-specific manner. While menin serves as a suppressor of neuroendocrine tumor growth, as seen in the cancer risk sy
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prolyl 3-hydroxylase 1 (P3H1) has been implicated in cancer development, but no pan-cancer analysis has been conducted on P3H1. In this study, for the first time, aspects associated with P3H1, such as the mRNA expression, any mutation, promoter methylation, and prognostic significance, the relationship between P3H1 and clinicopathological parameters, drug sensitivity, and immune cell infiltration were investigated by searching several databases including The Cancer Genome Atlas (TCGA), Genotype-Tissue Expression (GTEx), cBioPortal, and The Tumor Immune Evaluation Resource (TIMER2.0) using bioi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Retinitis pigmentosa GTPase regulator interacting protein 1-like (RPGRIP1L) gene encodes an important protein that performs various physiological functions. Variants of RPGRIP1L are related to a number of diseases. However, it is currently unknown whether RPGRIP1L is correlated with breast invasive carcinoma (BRCA). In BRCA tissue specimens, the expression of RPGRIP1L was found to be elevated in comparison to its levels in normal breast tissue. A notable decline in survival rates was associated with patients exhibiting heightened RPGRIP1L gene expression. Consistent with these findings, ou
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.