BACKGROUND: Colistin is a last-resort antibiotic used in extreme cases of multi-drug resistant (MDR) Gram-negative bacterial infections. Colistin resistance has increased in recent years and often goes undetected due to the inefficiency of predominantly used standard antibiotic susceptibility tests (AST). To address this challenge, we aimed to detect the prevalence of colistin resistance strains through both Vitek®2 and broth micro-dilution. We investigated 1748 blood, tracheal aspirate, and pleural fluid samples from the Intensive Care Unit (ICU), Neonatal Intensive Care Unit (NICU), and Tube
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is increased awareness of the worldwide spread of specific epidemic multidrug-resistant (MDR) lineages of the human commensal Staphylococcus epidermidis. Here, using bioinformatic analyses accounting for population structure, we determined genomic traits (genes, SNPs and k-mers) that distinguish S. epidermidis causing prosthetic-joint infections (PJIs) from commensal isolates from nares, by analysing whole-genome sequencing data from S. epidermidis from PJIs prospectively collected over 10 years in Sweden, and contemporary S. epidermidis from the nares of patients scheduled for arthropla
Сравнительное исследованиеСтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)-producing K. pneumoniae (KPC-KP) have disseminated worldwide and are a major threat to public health. The multidrug-resistant (MDR)-phenotype of KPC-KP are commonly associated with the presence of high molecular weight blaKPC plasmids. Restriction-modification (R-M) systems provide bacteria with innate defense against plasmids or other infectious gene elements. As blaKPC plasmids are favored by such MDR K. pneumoniae, it was of interest to examine the co-distribution of R-M and acquired blaKPC plasmids in KPC-KP. A total of 459 clinical K. pneumoniae i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa is one of the most important causes of infection in intensive care units (ICUs). It is intrinsically resistant to many antimicrobials and easily acquires additional resistance genes via horizontal gene transfer of mobile genetic elements. In this study, 1528 P. aeruginosa isolates obtained from a Dutch national surveillance programme between the years 1998-2011 were analysed for the presence of extended-spectrum β-lactamase (ESBL) genes (blaCTX-M, blaSHV, blaTEM, blaBEL, blaPER, blaVEB and blaOXA-10) and metallo-β-lactamase (MBL) genes (blaIMP, blaVIM and blaNDM). Of the
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
qnrE1, found in a clinical Klebsiella pneumoniae isolate, was undetectable by PCR assays used for the six qnr families. qnrE1 was located on a conjugative plasmid (ca. 185 kb) and differed from qnrB alleles by 25%. Phylogenetic reconstructions of qnr genes and proteins and analysis of the qnrE1 surroundings showed that this gene belongs to a new qnr family and was likely mobilized by ISEcp1 from the chromosome of Enterobacter spp. to plasmids of K. pneumoniae.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Enterobacteriaceae clinical isolates showing amikacin resistance (MIC 64 to >256 mg/L) in the absence of 16S rRNA methyltransferase (MTase) genes were found. The aim of this study was to clarify the molecular mechanisms underlying amikacin resistance in Enterobacteriaceae clinical isolates that do not produce 16S rRNA MTases.
METHODS: PCR was performed to detect already-known amikacin resistance determinants. Cloning experiments and sequence analyses were performed to characterize unknown amikacin resistance determinants. Transfer of amikacin resistance determinants was performed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ubiquitous water-borne Gram-negative bacterium Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida is the causative agent of furunculosis, a worldwide disease in fish farms. Plasmids carrying antibiotic resistance genes have already been described for this bacterium. The aim of the present study was to identify and characterize additional multidrug resistance plasmids in A. salmonicida subsp. salmonicida. We sequenced the plasmids present in two multiple antibiotic-resistant isolates using high-throughput technologies. We also investigated 19 other isolates with various multidrug resistance profiles
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: SXT-R391 Integrative conjugative elements (ICEs) are self-transmissible mobile genetic elements able to confer multidrug resistance and other adaptive features to bacterial hosts, including Vibrio cholerae, the causative agent of cholera. ICEs are arranged in a mosaic genetic structure composed of a conserved backbone interspersed with variable DNA clusters located in conserved hot spots. In this study, we investigated ICE acquisition and subsequent microevolution in pandemic V. cholerae. Ninety-six ICEs were retrieved from publicly available sequence databases from V. cholerae cli
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neonatal necrotising fasciitis is very rare in comparison to the adult presentation of the disease and a Plastic Surgeon may only encounter one such case during his or her career. Often this is initially misdiagnosed and managed as simple cellulitis. It generally affects previously healthy babies, the site is often the lower back area and a history of minor skin trauma may be elicited. The causative organism is usually Streptococcus or polymicrobial, as is the case in the adult population. We present the case of a previously healthy 11-day-old infant with idiopathic, rapidly progressive necrot
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study reports a cluster of septicaemic newborns with imipenem-resistant Escherichia coli in the blood and delineates the possible mechanisms of transmission of imipenem resistance with respect to the New Delhi metallo-β-lactamase (NDM-1) gene.
METHODS: During a point prevalence survey, attempts were made to isolate Gram-negative bacilli (GNB) from the environment of a sick newborn care unit (SNCU) and body sites of neonates. Subsequently, four fresh neonates admitted to the SNCU developed sepsis with E. coli. E. coli isolates from body sites and blood of the newborns were ana
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To investigate the presence and distribution of integron-carrying bacteria from a slaughterhouse wastewater treatment plant (WWTP).
METHODS: Enterobacteriaceae and aeromonads were isolated at different stages of the wastewater treatment process and screened for the presence of integrase genes by dot-blot hybridization. Integrase-positive strains were characterized in terms of phylogenetic affiliation, genetic content of integrons and antimicrobial resistance profiles. Plasmid location of some integrons was established by Southern-blot hybridization. Strains containing integron-car
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sweetpotato whitefly, Bemisia tabaci MED/Q and MEAM1/B, are two economically important invasive species that cause considerable damages to agriculture crops through direct feeding and indirect vectoring of plant pathogens. Recently, a draft genome of B. tabaci MED/Q has been assembled. In this study, we focus on the genomic comparison between MED/Q and MEAM1/B, with a special interest in MED/Q's genomic signatures that may contribute to the highly invasive nature of this emerging insect pest.
RESULTS: The genomes of both species share similarity in syntenic blocks, but have signif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acinetobacter is ubiquitous, and it has a high species diversity and a complex evolutionary pattern. To elucidate the mechanism of its high ability to adapt to various environment, 312 genomes of Acinetobacter strains were analyzed using the phylogenomic and comparative genomics methods. It was revealed that the Acinetobacter genus has an open pan-genome and strong genome plasticity. The pan-genome consists of 47,500 genes, with 818 shared by all the genomes of Acinetobacter, while 22,291 are unique genes. Although Acinetobacter strains do not have a complete glycolytic pathway to directly uti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fifty non-duplicate multiresistant isolates of Pseudomonas aeruginosa from a regional hospital in Northern Thailand were investigated for their antimicrobial susceptibility, presence of class 1 integrons and arrangement of gene cassettes as well as their genetic relationships. All but one isolate were classified as extensively drug-resistant P. aeruginosa (XDR-PA). Forty-one isolates (82%) were found to carry class 1 integrons. Amplification of the variable regions of class 1 integrons revealed seven diverse bands ranging in size from 0.7 kb to 7.0 kb. Sequence analysis of class 1 integron var
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: This study aims to elucidate the genomic characteristics of three Escherichia coli strains isolated from stool specimens of healthy individuals co-carrying tet(X4) and blaNDM-1 gene, which confer resistance to tigecycline and carbapenems, respectively. Whole-genome sequencing (WGS) and bioinformatic analysis were conducted to identify the genomic characteristics. Fourteen E. coli strains belonging to the same sequence type (ST) 4014, comprising eleven strains retrieved from public databases and three strains from this study, were integrated into a phylogenetic analysis. Conjugation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yersinia pestis, the causative agent of plague, harbors at least three plasmids necessary for full virulence of the organism, two of which are species specific. One of the Y. pestis-specific plasmids, pMT1, is thought to promote deep tissue invasion, resulting in more acute onset of symptoms and death. We determined the entire nucleotide sequence of Y. pestis KIM5 pMT1 and identified potential open reading frames (ORFs) encoded by the 100,990-bp molecule. Based on codon usage for known yersinial genes, homology with known proteins in the databases, and potential ribosome binding sites, we dete
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated the cephalosporin resistance of Escherichia coli from waterfowl among different breeding mode farms. In 2021, we isolated 200 strains of E. coli from waterfowl feces samples collected from Sichuan, Heilongjiang, and Anhui provinces. The key findings are: Out of the 200 strains, 80, 80, and 40 strains were isolated from waterfowl feces samples in intensive, courtyard, and outdoor breeding mode farms, respectively. The overall positive rate of the ESBL phenotype, detecting by the double disk diffusion method, was 68.00% (136/200). In particular, the rates for intensive, courtyard
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Plasmid-encoded colistin resistance mcr-1 genes are mainly reported in Escherichia coli worldwide. Here, we characterized a multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae 70,241 clinical isolate harbouring mcr-1.1 and blaOXA-181, recovered from a tertiary-care hospital in Tunis, Tunisia.
METHODS: Antimicrobial susceptibility was tested by broth microdilution and interpreted using EUCAST 2025 criteria. Whole-genome sequencing was performed with Oxford Nanopore long-read technology. In silico analyses (MLST, resistance genes, plasmid typing) were conducted using tools from the Center for
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella Paratyphi A (SPA) causing paratyphoid fever, a significant health concern in South Asia, particularly in Pakistan. This research aimed to explore the antibiotic resistance pattern, genetic diversity, and the evolutionary dynamics of SPA isolated from suspected paratyphoid patients in Pakistan. Whole-genome sequencing (WGS) of (n = 10) isolates predicted predominantly serotype O-2, H1: a, H2:1,5. Sequence type (ST85) was detected, alongside three STs (ST21eb, ST6d3b, ST95c4) and eight pathogenicity islands. The study reported extensively drug resistant (XDR) isolates (SPA 2,14,27,79)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotic resistance gene (ARG) pollution is critical environmental problem, and horizontal gene transfer acts as a driving evolutionary force. In theory, due to the phylogenetic distance between eukaryotes and prokaryotes, eukaryotic microalgae can be a natural barrier that plays a negative role in ARG transfer among the symbiotic bacteria to decrease ARG abundance in sludge during wastewater treatment. However, this hypothesis is far from proven and needs to be tested experimentally, so this study investigated the influence of eukaryote microalgae (Scenedesmus) on the ARG profile of symbiot
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования