Rapid and precise quantification of the infectivity of HIV is important for molecular virologic studies, as well as for measuring the activities of antiviral drugs and neutralizing antibodies. An indicator cell line, a CCD camera, and image-analysis software are used to quantify HIV infectivity. The cells of the P4R5 line, which express the receptors for HIV infection as well as β-galactosidase under the control of the HIV-1 long terminal repeat, are infected with HIV and then incubated 2 days later with X-gal to stain the infected cells blue. Digital images of monolayers of the infected cells
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We demonstrate improved 3D 13C-13C-13C chemical shift correlation experiments for solid proteins, utilizing band-selective coherence transfer, scalar decoupling and homonuclear zero-quantum polarization transfer. Judicious use of selective pulses and a z-filter period suppress artifacts with a two-step phase cycle, allowing higher digital resolution in a fixed measurement time. The novel correlation of C(ali)-C(ali)-CX (C(ali) for aliphatic carbons, CX for any carbon) reduces measurement time by an order of magnitude without sacrificing digital resolution. The experiment retains intensity from
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The indispensable role of the SARS-CoV-2 main protease (Mpro) in the viral replication cycle and its dissimilarity to human proteases make Mpro a promising drug target. In order to identify the non-covalent Mpro inhibitors, we performed a comprehensive study using a combined computational strategy. We first screened the ZINC purchasable compound database using the pharmacophore model generated from the reference crystal structure of Mpro complexed with the inhibitor ML188. The hit compounds were then filtered by molecular docking and predicted parameters of drug-likeness and pharmacokinetics.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plant-derived phytochemicals are increasingly investigated for their antioxidant and enzyme-inhibitory activities as potential sources of bioactive compounds. The present study evaluated the phytochemical composition, antioxidant activity, and in vitro α-amylase inhibitory activity of Madhuca longifolia leaf and bark extracts, followed by GC-MS profiling and exploratory computational analyses of the methanolic leaf fraction. Moreover, we elucidated the ADME properties of GC-MS-putatively identified compounds and their computational molecular interactions with α-amylase. The leaves and barks we
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer continues to be a major global health burden, with receptor tyrosine kinases such as EGFR, ERBB2, and VEGFR-3 being critical therapeutic targets due to their central roles in tumor growth, survival, and angiogenesis. Current therapies, while effective in some contexts, face limitations including resistance, toxicity, and high cost, highlighting the need for novel multi-target approaches. In this study, we report the isolation and computational characterization of a novel defensin-like peptide (DEFL) from Datura stramonium (GenBank accession KT371458). The peptide sequence encoded 74 ami
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Breast cancer remains the most frequently diagnosed malignancy among women worldwide, necessitating multi-target therapeutic strategies that address its molecular complexity and resistance mechanisms. This study presents an integrated computational drug repurposing framework combining machine learning (ML)-based pre-screening, molecular docking, molecular dynamics (MD) simulations, and MM-GBSA binding free energy calculations to identify FDA-approved drugs with polypharmacological potential against five breast cancer targets: HER2, EGFR, VEGFR2, HDAC3, and CDK6. 12 ML algorithms we
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To address the unmet need for a prophylactic therapy against BK polyomavirus (BKPV) in transplant recipients, this study employed a mechanism-based computational approach to design a multi-epitope chimeric nanoparticle (CNP) vaccine, predicting its biopharmaceutical and immunological profile.
METHODS: A comprehensive computational biopharmaceutics pipeline was implemented. Conserved and immunodominant B-cell, helper T-lymphocyte (HTL), and cytotoxic T-lymphocyte (CTL) epitopes from all major BKPV proteins were identified using immunoinformatic tools. Epitopes were rigorously validate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The high structural similarity between the Zika virus (ZIKV) and other flaviviruses, such as Dengue Virus (DENV), complicates the identification of the infecting virus due to the occurrence of cross-reactions in serological assays. This phenomenon has increased the demand for more specific antigens for immunodiagnostic applications.
METHODS: The present work aimed to identify specific regions of ZIKV and produce unique antigens through computational methods, molecular and microbiological techniques.
RESULTS: Based on the computational analysis we successfully expressed two recomb
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lennard-Jones (L-J) parameters, i.e. collision diameter and well depth, of benzene and polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) interacting with bath gases helium and nitrogen are studied theoretically in this work. The results of three different computing methods, called SA, σ-ε, η-ξ methods respectively, are compared with literature data. The SA method determines effective L-J parameters from the spherically averaged intermolecular potentials; the σ-ε method averages L-J parameters obtained from different relative orientations of interacting partners; and the η-ξ method uses an orientation-av
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular solar thermal (MOST) materials store and release solar energy through light-induced reversible reactions involving molecular photoswitches. Solid-state crystalline MOST materials can offer higher energy densities and easier device integration than their liquid counterparts. However, their photochemical mechanisms remain poorly understood. Norbornadiene (NBD), which undergoes a [2 + 2]-photocycloaddition to form its photoisomer quadricyclane (QC), has been proposed as a candidate for MOST applications. We used multiconfigurational quantum mechanical calculations and non-adiabatic mole
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleic acid conformational regulation and enzymatic dynamic modulation play a pivotal role in creating collaborative amplification systems with programmable responses. However, the coordination of sophisticated molecular functions within synergistic cascade networks remains constrained by limited progress in leakage mitigation and modular functionality expansion. Here, we report a dephosphorylation-regulated MNAzyme-primer exchange reaction (PER)-based (Dp-PER) strategy, with its core mechanism centered on cyclic phosphate-locked conformation to suppress signal leakage. This design specifical
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The α-amylase enzyme plays a critical role in the digestion of complex carbohydrates. Inhibiting this enzyme offers a promising strategy for improving glucose regulation in diabetic patients.
METHODS: In this study, a comprehensive computational approach, combining 3D-QSAR modeling, ADMET profiling, molecular docking, molecular dynamics, ligand transport analysis, and retrosynthesis, was used to identify novel ligands with potent inhibitory activity against various indenoquinoxaline-phenylacrylohydrazide hybrids.
RESULTS: The optimal 3D-QSAR model, developed using partial least
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: This study aimed to develop novel molecular hybrid conjugates integrating isatin, rhodanine, and phthalimide pharmacophores to create effective analgesic and anti-inflammatory agents with improved safety profiles over existing treatments.
MATERIALS & METHODS: A series of hybrid conjugates (4a - l) were synthesized and evaluated through in vitro and in vivo biological assays. The most promising compound, 4c, underwent extensive pharmacological and toxicological evaluations. Molecular docking, molecular dynamics simulations, and 2D-QSAR studies were performed to elucidate the mechanism of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dengue fever (DF) is an endemic disease that has become a public health concern around the globe. The NS3 protease-helicase enzyme is an important target for the development of antiviral drugs against DENV (dengue virus) due to its impact on viral replication. Inhibition of the activity of the NS3 protease-helicase enzyme complex significantly inhibits the infection associated with DENV. Unfortunately, there are no scientifically approved antiviral drugs for its prevention. However, this study has been developed to find natural bioactive molecules that can block the activity of the NS3 proteas
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human Neutrophil Elastase (HNE) is one of the major causes of tissue destruction in numerous chronic and inflammatory disorders and has been reported as a therapeutic target for inflammatory diseases. Overexpression of this enzyme plays a critical role in the pathogenesis of rheumatoid arthritis (RA). The focus of this study is to identify potent natural inhibitors that could target the active site of the HNE through the use of computational methods. The molecular structure of small molecules was retrieved from several natural compound databases. This was followed by structure-based virtual sc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vancomycin-intermediate resistant Staphylococcus aureus (VISA) is becoming a common cause of nosocomial infections worldwide. VISA isolates are developed by unclear molecular mechanisms via mutations in several genes, including walKR. Although studies have verified some of these mutations, there are a few studies that pay attention to the importance of molecular modelling of mutations.
METHOD: For genomic and transcriptomic comparisons in a laboratory-derived VISA strain and its parental strain, Sanger sequencing and reverse transcriptase quantitative PCR (RT-qPCR) methods were us
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multimodal optical microscopy has recently converged with artificial intelligence (AI) to enable in silico labelling-the computational prediction of fluorescence-like molecular contrast from label-free measurements. Fluorescence plays a crucial role in linking microscopy and spectroscopy at molecular level, enabling image formation by means of linear and non-linear investigation modalities. Over the past two decades, fluorescence optical microscopy has progressed into optical nanoscopy and single molecule localisation methods that operate at the nano- and even Ångstrom level under ambient cond
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This review provides a comprehensive overview of the fundamental principles, characterization techniques, and recent advances in understanding molecular adsorption and diffusion behaviors within zeolite materials. By examining the distinctive microporous frameworks, tunable pore sizes, and adjustable acid site distributions of zeolites, we highlight how adsorption and diffusion processes critically govern catalytic activity and selectivity. We discuss state-of-the-art experimental approaches alongside multi-scale computational methods, which collectively shed light on the molecular-level trans
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ever-increasing need for effective therapeutic management of thyroid cancer (TC) necessitates the exploration of novel approaches for advanced drug discovery. The current study employed a robust computational pipeline integrating Machine Learning (ML) algorithms, QSAR modeling, molecular docking, molecular dynamics (MD), density functional theory (DFT), and network pharmacology to identify novel Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK) tyrosine kinase inhibitors. An initial library of 3546 compounds from the CHEMBL4247 database was systematically filtered to 578. This screening utilized Lipinski's
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Machine learning has emerged as a powerful approach for molecular property prediction and drug discovery. However, the black-box nature of many machine learning models limits their interpretability, trustworthiness, and adoption in interdisciplinary research settings. This is especially the case in molecular machine learning, where explanations of model predictions are used for informed decision-making and downstream tasks. Shapley values, originating from cooperative game theory, provide a principled framework for attributing model predictions to individual input features. However, existing S
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования