Medicinal and aromatic plants (MAPs) produce a remarkable diversity of specialized metabolites with significant pharmaceutical, nutraceutical, and industrial value. Although advances in long-read sequencing, chromosome-scale genome assembly, and pangenomics have greatly expanded genomic resources, the mechanistic links between genome architecture and phytochemical diversity remain incompletely understood. The present review synthesizes current evidence describing how structural genomic variation may contribute to phytochemical diversity, while acknowledging that many proposed genome-to-metabol…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acinetobacter baumannii is a major multidrug-resistant nosocomial pathogen, yet its population structure and evolutionary dynamics in the Middle East remain poorly understood. This study compared Middle Eastern and global isolates to identify regional genomic signatures. We analyzed 199 high-quality A. baumannii genomes (100 Middle Eastern and 99 global) using pangenome reconstruction, core-genome phylogenetics, resistome and virulome profiling, genome-wide association studies, and machine learning. The pangenome comprised 10,971 genes, including 1102 unique to Middle Eastern isolates. Compare
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fungal infections are increasingly recognized as a major public health challenge, and superficial diseases such as otomycosis remain clinically consequential because persistence, recurrence, and treatment failure are common when the causative species and susceptibility profile are not clearly defined. However, otomycosis associated isolates are often insufficiently characterized at the genomic level. Furthermore, the development of antifungal candidates, particularly for short antimicrobial peptides, remains heterogeneous in terms of the integration of efficacy, biosafety, and mech
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Respiratory Syncytial Virus (RSV) causes significant respiratory infections, particularly in young children and elderly adults. Genetic variations in the fusion (F) protein can reduce the efficacy of vaccination and monoclonal antibody treatments, emphasizing the need for genomic surveillance of this virus.
MOTIVATION: Current pipelines for RSV genome assembly focus on sequence reconstruction but often lack features for detecting genotypes, clinically relevant mutations, or presenting results in formats that are suitable for clinical researchers.
RESULTS: We introduce RSVrecon, a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Rye (Secale cereale L.) is a cereal crop well adapted to marginal environments, where traditional populations represent valuable reservoirs of genetic diversity. In the Aosta Valley (NW Italy), several local rye populations have historically been maintained under small-scale farming systems, but their genetic structure has not yet been investigated using genome-wide approaches.
METHODS: We performed a high-resolution population genomic analysis of twelve rye populations using a K-seq genotyping approach. A genome-wide SNP dataset was generated and used to assess genetic diversit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Limosilactobacillus reuteri, formerly Lactobacillus reuteri, is a rod-shaped, Gram-positive, facultative anaerobe that colonizes the gastrointestinal tract of most vertebrates, including humans. We report the first isolation of L. reuteri strain HDB from the stool of a healthy Indian infant. Species assignment using the Type (Strain) Genome Server (TYGS) placed HDB within the L. reuteri clade, showing closest affinity to L. reuteri subspecies porcinus (dDDH 69.7%) yet clustering phylogenomically with L. reuteri DSM 17938. Hybrid de novo assembly (Illumina + Oxford Nanopore GridION MK1) generat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbially induced calcite precipitation (MICP) has emerged as a sustainable biotechnological approach for soil stabilization and environmental remediation. However, the efficiency of MICP largely depends on selecting environmentally adapted ureolytic bacterial strains with robust biomineralization potential. In the present study, a native marine ureolytic isolate, Bacillus sp. N₉, was comparatively evaluated against selected MICP-associated bacteria using integrated comparative genomics and in vitro functional analyses. Genome-based taxonomic assessment revealed phylogenetic proximity of Bac…
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clavibacter nebraskensis (Cn) is a Gram-positive bacterial plant pathogen that infects the vascular tissue of maize, causing Goss's Wilt and Leaf Blight. Detection of highly virulent strains since the mid-2000s suggests that genetic divergence has contributed to the re-emergence of the disease following its effective management and subsequent disappearance in the 1980s. However, few genomic resources exist for this pathogen, and little is known about genomic variation in the species. Our study aimed to characterize genomic diversity across a set of differentially virulent strains i
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candidatus Portiera aleyrodidarum (hereafter Portiera) is the primary endosymbiont of whiteflies (Hemiptera: Aleyrodidae), residing in specialized bacteriocytes that also co-localize diverse secondary endosymbionts. This study aimed to carry out in-depth genomic analysis of different strains of Portiera and secondary endosymbionts namely Arsenophonus, Cardinium, Hamiltonella, Rickettsia, and Wolbachia obtained from different whitefly species (data obtained from NCBI). Interestingly, hierarchical clustering of the amino acid identity data resulted in a dendrogram that resolved the different str
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
KEY POINTS: Using proteomics and Mendelian randomization, we identified causal proteins for the development of atrial fibrillation in patients with CKD. Immunologic function, cell growth, and neural development were common biologic pathways underlying atrial fibrillation and left atrial enlargement. Machine learning led to a nine-protein risk model that had a similar predictive performance for incident atrial fibrillation as clinical risk scores.
BACKGROUND: CKD is strongly associated with atrial fibrillation. Understanding the biologic pathways for this association and creating predictive mo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Indigenous goats in Nigeria and neighbouring countries support livelihoods across forest-savanna-Sahel environments, yet genomic structure, connectivity history, and adaptive signals are rarely investigated in a single corridor-scale transboundary framework. We analysed three Nigerian populations (Sahel, Red Sokoto/Maradi, and West African Dwarf; WAD) and seven neighbouring populations from Burkina Faso, Mali, and Cameroon using 46,431 autosomal markers from 209 unrelated animals (with a South Asian outgroup where needed). We tested whether recurrent vernacular labels map onto shared genomic b
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This review aims to provide a comprehensive overview of recent advances in the genomics of multiple myeloma and their clinical implications. Multiple myeloma is a hematologic malignancy originating from bone marrow plasma cells, characterized by the infiltration of pathological plasma cells, osteolytic bone lesions, and the presence of monoclonal immunoglobulins in serum and/or urine. Multiple myeloma exhibits significant genetic heterogeneity, which is the core reason for the considerable variability in patient prognosis, differential treatment responses, and the eventual development of drug …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterobacter cloacae (E. cloacae) is an important healthcare-associated pathogen with increasing antimicrobial resistance. Prophages and phage-inducible chromosomal islands (PICIs) are integral components of the E. cloacae genome, yet their contribution to resistance, virulence, and anti-phage defense remains poorly understood. To address this gap, we analyzed 35 complete E. cloacae genomes, identifying 139 intact prophages (10.8-85.7 kb) with an average GC content (~52%) close to that of the host (54-55%). Most prophages (86.6%) were assigned to the families Peduoviridae and Drexlerviridae wi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The carcinogenic liver fluke Opisthorchis viverrini underlies one of the world's heaviest burdens of bile duct cancer, yet for decades it wa … ing host and parasite connectivity. Finally, we emphasize the increasing significance of population genomics and landscape genetics in understanding how transmission systems persist, disperse, reconnect, and respond to environmental change across endemic landscapes.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutual information (MI)-based approaches have increasingly been applied to cancer genomics; however, their use for genome-wide prognostic biomarker discovery remains relatively underexplored. The present article summarizes the conceptual workflow of Mutual Information-based Prognostic Omics Gene (MI-POG) based on previously published applications in breast cancer, lower-grade glioma, and other cancer datasets. The framework consists of clinical endpoint discretization, genome-wide MI-based screening, candidate ranking, and downstream validation using conventional survival-analysis approaches. …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cottonseed meal is widely used as an alternative source of protein in the animal feed industry. However, the presence of toxic gossypol limits its use in livestock production. In order to reduce gossypol toxicity, microbial degradation is generally considered to be an environmentally friendly and cost-effective strategy. Candida tropicalis ZD-3 has demonstrated the ability to degrade gossypol. Nevertheless, the genome of gossypol-induced C. tropicalis ZD-3 has not been fully sequenced, and its comprehensive metabolic profile remains unexplored. In this study, the degradation rate of gossypol b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiovascular diseases (CVD) remain the leading cause of death globally and there is an urgent need for innovative approaches to treatment. One emerging avenue is genetic therapies, which hold particular promise for diseases with a monogenic basis. Gene silencing techniques using antisense oligonucleotides or ribonucleic acid interference strategies are currently at the forefront of genetic therapies in CVD, with several ribonucleic acid-targeted therapies already approved for the treatment of conditions such as familial hypercholesterolaemia and transthyretin amyloidosis. For diseases caused
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Birt-Hogg-Dubé syndrome (BHDS) is the most common monogenic cause of pneumothorax. Most affected families have pathogenic variants in the FLCN gene. Using large genomic registries (UK Biobank (UKB), 100,000 Genomes Project and East London Genes & Health) including >550 000 individuals, we demonstrate that the frequency of clinically validated loss-of-function FLCN variants is 1 in 2710 to 4190. While the lifetime risk of pneumothorax in FLCN mutation carriers in the UKB and a BHDS clinical cohort was substantial (28.4% and 37.3%, respectively, to age 65 years), the lifetime risk of renal cance
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Serratia marcescens is a common opportunistic pathogen in hospitals. Its carbapenem-resistant strains, especially those carrying the blaKPC-2 gene, pose a serious challenge to clinical infection treatment.
METHODS: In this study, we identified 14 strains that were positive for blaKPC-2 from tertiary hospitals in Zhejiang Province, China, through phenotypic tests and sequencing. We also incorporated data from the GenBank public database, resulting in a total of 2005 Serratia strains included for bioinformatic analysis.
RESULTS: A total of 121 strains (6.03%) were found to carry bl
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kidney injury is a severe complication of type 2 diabetes, yet its pathophysiology varies among patients. Although abnormal adipose has been identified as an indicator for the risk of kidney injury in type 2 diabetes, the underlying mechanisms remain unclear. Here, we integrated adipose functional genomics and genome-wide association studies of diabetic nephropathy (DN) to investigate the relationship between adipose and kidney injury. By generating the epigenome, transcriptome and regulatome, we constructed functional genomics map of adipose, revealing the regulatory role of perirenal adipose…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования