The identification of isochromosome 12p [i(12p)] and 12p gains have significant clinical utility in the diagnosis of germ cell tumors (GCTs). We have summarized the results of fluorescence in situ hybridization (FISH) assays to identify i(12p), performed in a Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA)-validated setting for 536 specimens. In addition, the American Association for Cancer Research (AACR) Project GENIE registry and The Cancer Genome Atlas (TCGA) data sets were evaluated for chromosome 12p gains, and a limited number of cases were concurrently evaluated using FISH, single-nu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The single nucleotide polymorphism of the gene 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) C677T (or rs1801133) is the most established genetic factor that increases plasma total homocysteine (tHcy) and consequently results in hyperhomocysteinemia. Yet, given the limited penetrance of this genetic variant, it is necessary to individually predict the risk of hyperhomocysteinemia for an rs1801133 carrier.
OBJECTIVE: We hypothesized that variability in this genetic risk is largely due to the presence of factors (covariates) that serve as effect modifiers, confounders, or both, s
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Several Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in lipid transport genes have been shown to be associated with Coronary Artery Disease (CAD). The Hepatic Lipase (HL)glycoprotein is a key component that catalyzes the hydrolysis of triglycerides and phospholipids in all major classes of lipoproteins.
AIM: We studied whether the HL gene-250G/A polymorphism affect blood lipid level and the CAD in a North Indian population.
MATERIALS AND METHODS: A total number of 477 subjects were enrolled in the study after approval of the Institutional Ethics Committee. Out of 477 subjects, 233 we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Numerous studies have shown a link between the angiotensin-converting enzyme (ACE) and ischemic stroke. Cryptogenic ischemic stroke is the most commonly recorded form of ischemic stroke among young adults. The insertion/deletion (I/D) variant of ACE (rs4646994) has been linked to ischemic stroke.
OBJECTIVES: We examined the potential correlation between this single nucleotide polymorphism and cryptogenic ischemic stroke in young adults.
METHODS: This case-control study included 42 young adults (< 50 years of age) diagnosed with cryptogenic ischemic stroke according to the TOAST c
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The A118G (rs1799971) single-nucleotide polymorphism (SNP) of the OPRM1 gene, which encodes the μ-opioid receptor, reportedly affects postoperative morphine requirements but not fentanyl requirements. The present study investigated whether this SNP influences postoperative fentanyl requirements after laparoscopic-assisted colectomy (LAC).
METHODS: We examined 350 Japanese patients who underwent LAC for colorectal cancer. Postoperative pain was managed with an initial intravenous bolus dose of fentanyl, followed by intravenous fentanyl patient-controlled analgesia (PCA). The primar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: The role of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the frequency and intensity of chemotherapy-induced nausea and vomiting (CINV) in women with breast cancer (BC) is unclear. The primary purpose of this study was to compare/evaluate the effect of SNP-guided antiemetic treatment versus standard CINV treatment.
PATIENTS AND METHODS: A randomised, factorial, phase II multicentre study design was used. Women planned for neoadjuvant or adjuvant chemotherapy with epirubicin, cyclophosphamide and fluorouracil (FEC /EC, with or without fluorouracil) for BC were randomised to SNP-gu
Рандомизированное исследованиеМногоцентровое исследованиеКлиническое исследование II фазыСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epidemiological findings of a listeriosis outbreak in 2013 implicated Hispanic-style cheese produced by company A, and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and whole genome sequencing (WGS) were performed on clinical isolates and representative isolates collected from company A cheese and environmental samples during the investigation. The results strengthened the evidence for cheese as the vehicle. Surveillance sampling and WGS 3 months later revealed that the equipment purchased by company B from company A yielded an environmental isolate highly similar to all outbreak isolates. The whole
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three common diseases, isolated cleft lip and cleft palate (CLP), hypothyroidism and thyroid cancer all map to the FOXE1 locus, but causative variants have yet to be identified. In patients with CLP, the frequency of coding mutations in FOXE1 fails to account for the risk attributable to this locus, suggesting that the common risk alleles reside in nearby regulatory elements. Using a combination of zebrafish and mouse transgenesis, we screened 15 conserved non-coding sequences for enhancer activity, identifying three that regulate expression in a tissue specific pattern consistent with endogen
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: An altered expression of bone morphogenetic protein 4 (BMP4) has been found in malignant melanoma cells. We performed an association study to investigate the effect of putative functional single nucleotide polymorphisms (SNPs) of BMP4 on development of cutaneous melanoma (CM).
METHODS: We selected the predicted functional SNPs 6007 C/T (rs17563) and -3445 T/G (rs4898820) by the combination of three computational tools (FASTSNP, F-SNP and SNP Function Portal) plus another tool (SNP@promoter) skilled in identifying SNPs in transcription regulatory regions. Both SNPs were genotyped in a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate discrimination of single-nucleotide polymorphism (SNP) zygosity remains challenging for isothermal amplification platforms, which typically report mutation presence without resolving allelic composition. This limitation is particularly relevant for metabolic dysfunction-associated steatohepatitis (MASH) in which disease susceptibility and progression are strongly influenced by genetic variants that regulate hepatic lipid metabolism. Here, we report a programmable double peptide nucleic acid and locked nucleic acid (PNA-LNA) molecular switch integrated with loop-mediated isothermal amp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine leukemia virus (BLV) causes enzootic bovine leukosis, a worldwide disease that causes substantial losses in the cattle industry. BoLA-DRB3 is a polymorphic gene associated with BLV proviral load (PVL), which dictates disease progression and transmission risk; progeny PVL is influenced by the BoLA-DRB3 alleles of their sires. In addition, two novel single-nucleotide polymorphisms (SNPs) affecting BLV PVL have been identified in Japanese Black cattle. In this study, to identify whether two specific PVL-associated SNPs (SNPT12 and SNPT13) were associated with elevated PVL in Japanese Black
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Global studies have shown a bidirectional association of gestational diabetes mellitus (GDM) with postpartum depression (PPD). Despite high GDM prevalence in Pakistan (3.3%-17.8%), no prior studies have explored its link with PPD. In this study, association between GDM and risk of developing PPD was investigated and risk factors for PPD were identified using the gold-standard Edinburgh Postnatal Depression Scale (EPDS). Evidence suggests that PPD has strong genetic basis. The BDNF gene is a known candidate for PPD pathogenesis, while the orexin system is linked to arousal, energy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The live-attenuated varicella-zoster virus (VZV) vaccine, mainly based on the Oka strain, is essential for the prevention and control of chickenpox (varicella). Although genomic profiles of internationally prevalent Oka vaccine strain (vOka)-derived preparations have been reported, the comprehensive single-nucleotide polymorphism (SNP) profiles of multiple commercially available Chinese vOka-derived vaccines are still lacking. We performed next-generation sequencing (NGS) on five Chinese-manufactured VZV vaccines, comparing genomic variations against the wild-type parental Oka (pOka) strain an
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Calcineurin inhibitors (CNIs), such as cyclosporine A (CsA), are widely used as immunosuppressants for both prophylactic and therapeutic purposes in patients with graft-versus-host disease (GVHD) after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (allo-HSCT). CsA-related transporters and metabolic enzymes single nucleotide polymorphisms (SNPs) are associated with the efficacy of CsA in individuals. However, few studies have explored how CsA-related SNPs correlate with post-transplant complications and prognosis.
METHODS: Here, our study involved 128 pediatric hematological m
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HMGB1 is nuclear non-histone protein and unique member of cytokines. In viral hepatitis infection HMGB1 serum level increases and translocates towards cytoplasm and extracellular spaces where it activates single stimulating hepatic stellate cell proliferation which induces fibrogenic protein expression and causes hepatocellular carcinoma. In this study, total 150 subjects were recruited to assess the association between HMGB1 SNPs and HBV. Three types of genotypes were found visible in rs3742305 of HMGB1; wild type homozygous GG with 65%, homozygous minor type CC with 6% and heterozygous minor
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tyrosine kinase inhibitor (TKI) drugs have significantly improved chronic myeloid leukemia (CML) outcomes. Neopeptides from CML cells may induce specific immune responses, which are crucial for deep molecular (DMR) and treatment-free remission (TFR). In this study of Ethiopian patients with CML (n = 162), the HLA alleles and single-nucleotide polymorphisms of five cytokines revealed significant associations with clinical outcomes. Clinically unfavorable outcomes correlated with HLA alleles A*03:01/02, A*23:17:01, B*57:01/02/03, and HLA-DRB4*01:01 (p-value = 0.0347, p-value = 0.0285, p-value =
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the proven value of applying genomic data for epidemiological purposes, commonly used high-throughput sequencing formats are not adapted to the response times required to intervene and finally control outbreaks. In this study, we propose a fast alternative to whole-genome sequencing (WGS) to track relevant microbiological strains: nanopore sequencing of multiple amplicons including strain marker single nucleotide polymorphisms (SNPs). As a proof a concept, we evaluated the performance of our approach to offer a rapid response to the most recent public health global alarm, the monkeypox
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Observational evidence on the association of novel single nucleotide polymorphisms (SNPs) of androgen receptor (AR) and estrogen receptor-α (ER- α ) genes with odds of male infertility are rare. This is particularly relevant in the Iranian population where male infertility is relatively high. Objective: This study was designed to investigate the relationship between different SNPs of these genes and male infertility among the Iranian population. Materials and Methods: The present project was a population-based, case-control study conducted on 120 idiopathic azoospermia or severe ol
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: An inability of a man to conceive a potentially fertile woman after a year of unprotected intercourse is defined as male infertility. It is reported that 30-40% of males in their reproductive years have abnormalities in sperm production, either qualitatively or quantitatively, or both. However, genetic factors result in up to 15% of male infertility cases. The present study aimed to analyze the possible correlations between sub-fertility and polymorphisms in sperm mitochondrial CO3, ATP6 and ATP8 genes in sub-fertile men.
METHODS AND RESULTS: For 67 sub-fertile and 44 fertile male
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD), insulin resistance and liver fibrosis are prevalent in individuals co-infected with HIV type 1 (HIV-1)/hepatitis C virus (HCV), even after HCV eradication. Our aim was to evaluate single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with advanced liver fibrosis in HIV-1/HCV co-infected patients.
DESIGN/METHODS: In a cohort of 102 participants, we genotyped 16 SNPs in 10 genes previously associated with NAFLD and the innate immune response and correlated the genotypes with liver fibrosis and fat accumulation.
RESULTS: Multinomial logistic regr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.