The streptococcal pyrogenic toxins A, B, and C (SPEA, SPEB, and SPEC) are responsible for the fever, rash, and other toxicities associated with scarlet fever and streptococcal toxic shock syndrome. This role, together with the ubiquity of diseases caused by Streptococcus pyogenes, have prompted structural analyses of SPEA by several groups. Papageorgiou et al. (1999) have recently reported the structure of SPEA crystallized in the absence of zinc. Zinc has been shown to be important in the ability of some staphylococcal and streptococcal toxins to stimulate proliferation of CD4+ T-cells. Since
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intrinsically disordered protein α-synuclein (αS), a known pathogenic factor for Parkinson's disease, can adopt defined secondary structures when interacting with membranes or during fibrillation. The αS-lipid interaction and the implications of this process for aggregation and damage to membranes are still poorly understood. Therefore, we established a label-free infrared (IR) spectroscopic approach to allow simultaneous monitoring of αS conformation and membrane integrity. IR showed its unique sensitivity for identifying distinct β-structured aggregates. A comparative study of wild-type
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type 2 diabetes mellitus (DM) and Alzheimer's disease (AD) share epidemiological and biochemical features. Both are characterized by insoluble protein aggregates with a fibrillar conformation--amylin in Type 2 DM pancreatic islets, and Abeta in AD brain. To determine whether amylin shares neurotoxic properties with Abeta, we incubated hippocampal and cortical neurons with Abeta42 and human amylin. Different from non-amyloidogenic rat amylin, both caused a dose-, time- and cell type-specific neurotoxicity supporting the notion of a similar toxic mechanism. Depending on the cell type, this findi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We screened human primary and recurrent malignant glioma, juvenile pilocytic astrocytoma, medulloblastoma, and meningioma tissue specimens for alterations in p16 gene structure. Single strand conformation polymorphism (SSCP) analysis was used to screen for point mutations, and a quantitative polymerase chain reaction-based assay was used to screen for homozygous gene deletions. In malignant glioma specimens, homozygous p16 gene deletions were significantly more common in high-grade tumors than in low-grade gliomas. Point mutations causing alteration in predicted protein structure were not dete
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In some families with early-onset Alzheimer's disease (AD) pathogenic mutations have been found in exons 16 and 17 of the amyloid precursor protein (APP) gene. One case of schizophrenia has been described with a mutation at codon 713. We have developed a single strand conformation polymorphism (SSCP) method that detects mutations in these exons and investigated 98 AD cases and 56 elderly healthy controls. An earlier reported mutation at codon 713 in a healthy control and a previously undescribed polymorphism at codon 705 in a sporadic case of AD were found. These mutations are probably not rel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vaccine discovery against eukaryotic parasites is not trivial and few exist. Reverse vaccinology is an in silico vaccine discovery approach, designed to identify vaccine candidates from the thousands of protein sequences encoded by a target genome. Previously, we produced the Vacceed bioinformatics pipeline for identification of parasite membrane and excreted/secreted proteins that were likely be exposed to the hosts immune system. More recently, we improved upon machine learning as the final decision-making process to identify parasite proteins that induce a protective response in an animal m
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of metallo-β-lactamases as formidable adversaries in the antimicrobial resistance crisis stems from their unparalleled capacity to hydrolyze β-lactam antibiotics. This study deciphers the evolutionary strategy of New Delhi metallo-β-lactamase (NDM) variants through studies of conformational dynamics. We employ hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) to map conformational landscapes of NDM in the ligand-free state and in the bound states with inhibitors l-captopril, d-captopril, ebselen, and aspergillomarasmine A (AMA), respectively. Crucially, our findings reveal s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The frequent outbreak of influenza pandemic and the limited available anti-influenza drugs highlight the urgent need for the development of new antiviral drugs. The dsRNA-binding surface of nonstructural protein 1 of influenza A virus (NS1A) is a promising target. The detailed understanding of NS1A-dsRNA interaction will be valuable for structure-based anti-influenza drug discovery. To characterize and explore the key interaction features between dsRNA and NS1A, molecular dynamics simulation combined with MM-GBSA calculations were performed. Based on the MM-GBSA calculations, we find that the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Neurodegenerative diseases such as Alzheimer's disease (AD), Parkinson's disease (PD), amyotrophic lateral sclerosis (ALS), and related proteinopathies are characterized by the misfolding, aggregation, and accumulation of specific proteins that disrupt neuronal homeostasis, leading to neuronal death. Despite major advances in structural biology and molecular neuroscience, identifying and validating druggable targets in neurodegenerative diseases remains challenging. Many involved proteins are intrinsically disordered, exhibit conformational heterogeneity, and form highly dynamic
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Membrane recruitment is a fundamental regulator of protein function. However, the allosteric mechanisms by which lipid binding controls protein activity remain poorly understood. In autophagy, the ubiquitin-like protein LC3 is lipid-anchored to autophagosomes, where it is essential for receptor recruitment and vesicle formation. While LC3-receptor interactions are structurally well defined, how membrane engagement governs LC3 functional dynamics has remained enigmatic. Here, we uncover that membrane binding triggers a major conformational transition in LC3, exposing functional pockets that are
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Additives like arginine, while known to enhance protein stability, were observed to improve the solubility of proteins in an equimolar mixture of arginine and glutamic acid. This study examines the conformational stability of a model protein, chymotrypsin inhibitor 2, in arginine, glutamic acid, and their mixture over a temperature range of 300-440 K using Replica Exchange Molecular Dynamics. The study demonstrates that arginine stabilized CI2 through hydrogen bonds and electrostatic interactions with polar and charged residues, thereby restricting conformational fluctuations and reducing solv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mutant glycine amidinotransferase (GATM) protein polymerizes into a characteristic crystal, resulting in mitochondrial dysfunction in pr … tant protein. This simulation offers valuable insights into the pathological mechanisms of abnormal protein conformation.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diseases caused by viruses of the genus Flavivirus are among the main diseases that affect the world and they are a serious public health problem. Three of them stand out: Dengue, Yellow fever and Zika viruses. The non-structural protein 1 (NS1), encoded by this viral genus, in its dimeric form, plays important roles in the pathogenesis and RNA replication of these viruses. Therefore, the identification of chemicals with the potential to inhibit the formation of the NS1 protein dimer of DENV, YFV and ZIKV would enable them to act as a multi-target drug. For this, we selected conformations of t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The lack of conformational sampling in virtual screening projects can lead to inefficient results because many of the potential drugs may not be able to bind to the target protein during the static docking simulations. Here, we performed ensemble docking for around 2000 United States Food and Drug Administration (FDA)-approved drugs with the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) protein of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) as a target. The representative protein structures were generated by clustering classical molecular dynamics trajectories, which were evolved using
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
α-Synuclein is an intrinsically disordered protein whose aggregation is related to Parkinson's disease and other neurodegenerative disorders. Metal cations are one of the main factors affecting the propensity of α-synuclein to aggregate, either by directly binding to it or by catalyzing the production of reactive oxygen species that oxidize it. His50, Asp121 and several additional C-terminal α-synuclein residues are binding sites for numerous metal cations, while methionine sulfoxidation occurs readily on this protein under oxidative stress conditions. Molecular dynamics simulations are an exc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HKU1 is a human betacoronavirus that causes mild yet prevalent respiratory disease, and is related to the zoonotic SARS and MERS betacoronaviruses, which have high fatality rates and pandemic potential. Cell tropism and host range is determined in part by the coronavirus spike (S) protein, which binds cellular receptors and mediates membrane fusion. As the largest known class I fusion protein, its size and extensive glycosylation have hindered structural studies of the full ectodomain, thus preventing a molecular understanding of its function and limiting development of effective interventions
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is characterized by episodic memory impairment that often precedes clinical diagnosis by many years. Probing the mechanisms of such impairment may provide much needed means of diagnosis and therapeutic intervention at an early, pre-dementia, stage. Prior to the onset of significant neurodegeneration, the structural and functional integrity of synapses in mnemonic circuitry is severely compromised in the presence of amyloidosis. This review examines recent evidence evaluating the role of amyloid-ß protein (Aβ) in causing rapid disruption of synaptic plasticity and memor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aggregation-prone polyglutamine (polyQ) expansion proteins cause several neurodegenerative disorders, including Huntington disease. The pharmacological activation of cellular stress responses could be a new strategy to combat protein conformational diseases. Hydroxylamine derivatives act as co-inducers of heat-shock proteins (HSPs) and can enhance HSP expression in diseased cells, without significant adverse effects. Here, we used Caenorhabditis elegans expressing polyQ expansions with 35 glutamines fused to the yellow fluorescent protein (Q35-YFP) in body wall muscle cells as a model system t…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human T-lymphotropic virus type 1 (HTLV-I) causes adult T-cell leukemia/lymphoma (ATLL) and has been associated with a variety of immunologically-mediated diseases. Recently, the immunodominant epitopes of HTLV-I have begun to be defined through the utilization of synthetic peptides and recombinant proteins. Strategies to define the conformational features of immunogenic peptides and design chimeric and multivalent constructs that mimic native viral proteins have provided the opportunity to create an effective synthetic vaccine against HTLV-I infection. An ideal peptide vaccine to be universal
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human KIN17 protein is a chromatin-associated protein involved in DNA replication. Certain tumor cell lines overproduce KIN17 protein. Among 16 cell lines, the highest KIN17 protein level was observed in H1299 non-small cell lung cancer cells, whereas the lowest was detected in MeWo melanoma cells. Cells displaying higher KIN17 protein levels exhibited elevated RPA70 protein contents. High KIN17 protein levels may be a consequence of the tumorigenic phenotype or a prerequisite for tumor progression. Twenty-four hours after exposure to ionizing radiation, after the completion of DNA repair,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования