BACKGROUND: Histologic assessment of endomyocardial biopsy (EMB) remains the standard for diagnosing acute cardiac allograft rejection, yet molecular profiling may provide complementary quantitative insights.
METHODS: Microarray data (GSE2596; GPL1053) were obtained from the Gene Expression Omnibus. Acute rejection (R, n = 16) and non-rejection (N, n = 27) samples were analyzed after excluding infection-related groups. Probes were mapped to gene symbols and summarized per gene. Differential expression was assessed using Welch's t-test with Benjamini-Hochberg false discovery rate control. Reac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Endothelial cells play a crucial role in tumor invasion and metastasis. This study explored endothelial cell-targeted therapies for ovarian cancer (OC).
METHODS: The scRNA-seq data were obtained from the Gene Expression Omnibus (GEO) database for cell clustering analysis. Key genes were identified through integrated analysis of bulk RNA-seq data from the GTEx and TCGA databases. Receptor-ligand interactions were inferred using the "CellChat" R package. Hub genes in endothelial cells were screened by hdWGCNA and intersected with protein-protein interaction (PPI) network analysis
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The occurrence of acute bilineage leukemia is thought to be the malignant transformation of a myeloid or lymphoid leukemic progenitor with the potential to differentiate into the other lineages; however, the mechanisms of this lineage switch are not well understood. Here, we report on the extremely rare case of adult Philadelphia chromosome-positive acute bilineage leukemia, which is characterized by T-cell acute lymphoblastic leukemia and acute myelomonocytic leukemia. Chromosome analysis showed 46,XY,del(7)(p11.2),t(9;22)(q34;q11.2) in all metaphases and a minor BCR/ABL chimeric gene was det
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene and cellular therapies hold tremendous promise as agents for treating genetic disorders. However, the effective delivery of genes, particularly large ones, and expression at therapeutic levels can be challenging in cells of clinical relevance. To address this engineering hurdle, we sought to employ the clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/Cas9 system to insert powerful regulatory elements upstream of an endogenous gene. We achieved robust activation of the COL7A1 gene in primary human umbilical cord blood CD34⁺ hematopoietic stem cells and peripheral blood T-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Activation of CD4(+) T cells is governed by interplay between stimulatory and inhibitory receptors; predominance of stimulatory signals favors autoimmune reactions. In patients with rheumatoid arthritis, expression of the critical costimulatory molecule, CD28, is frequently lost. Instead, CD4(+)CD28(null) T cells express killer immunoglobulin-like receptors (KIRs) with a preferential expression of the stimulatory receptor, CD158j. The frequency of CD4(+)CD28(null) T cells in rheumatoid arthritis (RA) correlates with the risk for more severe disease. Moreover, the KIR2DS2 gene, which encodes fo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uveal melanoma (UM) is a highly metastatic cancer with resistance to immunotherapy. The present study aimed to identify novel feature genes and molecular mechanisms in UM through analysis of single-cell sequencing data. For this purpose, data were downloaded from The Cancer Genome Atlas and National Center for Biotechnology Information Gene Expression Omnibus public databases. The statistical analysis function of the CellPhoneDB software package was used to analyze the ligand-receptor relationships of the feature genes. The Metascape database was used to perform the functional annotation of no
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Natural killer T cells (NKT), a unique subset of T lymphocytes, remain incompletely understood in terms of their development and functional regulation. Well-characterized immortalized cell lines are critical tools for investigating NKT cell biology in vitro. We established and maintained a novel NKT cell line, NKT617, derived from the peripheral blood of a patient with aggressive large granular lymphocyte leukemia. Cell morphology was assessed using scanning electron microscopy and transmission electron microscopy. Flow cytometry characterized the cell phenotype, whereas T-cell receptor (TCR)
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying tumor-specific T cell clones that mediate immunotherapy responses remains challenging. Mutation-associated neoantigen (MANA) -specific CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes (TIL) have been shown to express high levels of CXCL13 and CD39 (ENTPD1), and low IL-7 receptor (IL7R) levels in many cancer types, but their collective relevance to T cell functionality has not been established. Here we present an integrative tool to identify MANA-specific TIL using weighted expression levels of these three genes in lung cancer and melanoma single-cell RNAseq datasets. Our three-gene "MANAscore"
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rearrangement of the immunoglobulin (Ig) and T-cell receptor (TcR) genes generally has been considered a useful marker of B- and T-cell lineage in lymphoproliferative disorders. However, concomitant rearrangements of Ig and TcR genes have been commonly reported in the most immature lymphoid malignancies, mainly in B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (ALL). To better characterize the nature of this lineage promiscuity, we have analyzed the configuration of the TcR delta locus in 75 B-precursor ALL. The large majority of cases (87%) displayed a rearrangement or deletion at the delta lo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sézary T cell-activating factor (SAF) was originally defined as an inducer of functional interleukin-2 (IL-2) receptors on normal and malignant T cells in patients suffering from Sézary syndrome. In fact, a combination of SAF and IL-2 stimulated the propagation of T cell lines from the peripheral blood mononuclear cells (PBMC) of those patients, with approximately one third of those cell lines containing the predominant malignant clone as determined via cytogenetic and/or T cell receptor gene rearrangement analysis. Although the primary source of SAF was mitogen-stimulated PBMC of a patient wi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibody affinity maturation, which is an antigen-based selection process for B cells, occurs in germinal centers (GCs). GCB cells must efficiently recognize, acquire, and present antigens from follicular dendritic cells (FDCs) to receive positive selection signals from T helper cells. Previous studies showed that GCB cells undergo adhesive interactions with FDCs, but the regulatory mechanisms underlying the cell adhesions and their functional relevance remain unclear. Here, we identified H3K36me2 methyltransferase Nsd2 as a critical regulator of GCB cell-FDC adhesion. Nsd2 deletion modestly r
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We reported a rare case of composite diffuse large B-cell lymphoma and T lymphoblastic leukemia/lymphoma (T-LBL) in a 46-year-old woman with progressive enlargement of the breast lump. The patient initially sought care at a local hospital with a single left breast lump without any other physical examination findings. Histopathological analysis of which revealed a diffuse infiltration of tumor cells that were rich in cytoplasm with vesicular chromatin and prominent nucleoli. Further analysis of immunohistochemistry showed a cluster of neoplastic cells which express B-cell markers: CD19, CD20 (w
Клинический случайСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Numerous studies of relatively few patients have linked T cell receptor (TCR) genes to psoriasis but have yielded dramatically conflicting results. To resolve these discrepancies, we have chosen to mine RNA-Seq datasets for patterns of TCR gene segment usage in psoriasis. A meta-analysis of 3 existing and 1 unpublished datasets revealed a statistically significant link between the relative expression of TRAJ23 and psoriasis and the psoriasis-associated cytokine IL-17A. TRGV5, a TCR-γ segment, was also associated with psoriasis but correlated instead with IL-36A, other IL-36 family members, and
СтатьяМетаанализПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hirschsprung's disease (HSCR) is a congenital intestinal disease, characterized by the absence of ganglion cells in the distal portion of the intestinal tract. Recently, three susceptibility genes have been identified in HSCR, namely the RET protooncogene, the endothelin B (ETB) receptor gene (EDNRB), and the endothelin-3 (ET-3) gene (EDN3). To investigate whether mutations in EDNRB could be related with HSCR in non-inbred populations in Japan, we examined alterations of the gene in 31 isolated patients. Three novel mutations were detected as follows: two transversions, A to T and C to A at nu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Athymic nude rats resemble nude mice in their lack of a normal thymus and functionally mature T cells. They have been useful in the study of mechanisms of tumor growth or graft rejection in immunocompromised hosts since they can accept major histocompatibility complex (MHC) mismatched organ allografts or xenografts for several months and because a number of tumor cell lines of human and rodent origin grow well in these rats. Injection of a few helper T (Th) cells from euthymic littermate rats partly restores the pool of mature T cells as well as full immunocompetence to reject organ allografts
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Relapsed or refractory B-cell acute lymphoblastic leukemia (R/R B-ALL) patients exhibit heterogeneous responses to CD19 chimeric antigen receptor T-cell (CAR-T) therapy. However, current studies primarily focus on the CAR-T cells or the leukemia blasts, and the patient's intrinsic molecular characteristics before treatment remain poorly understood.
METHODS: Fifteen R/R B-ALL patients enrolled in a phase II, single-arm clinical trial (NCT04684147) were stratified at a three-month landmark into 8 good responders and 7 poor responders. Clinical characteristics, genetic alterations an
СтатьяКлиническое исследование II фазыПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor-specific exhausted CD8 T cells (Tex) adopt diverse phenotypes across human cancers, but the drivers of this heterogeneity remain poorly understood. Using flow cytometry and single-cell RNA and T cell receptor (TCR) sequencing of 106,667 tumor-infiltrating CD8 T cells from head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) tumors, we identified and validated three Tex subsets, each with distinct clonotypes: (1) Tex-Conv, expressing conventional exhaustion genes; (2) Tex-CCR6, distinguished by CCR6 and Tc17-like genes; and (3) Tex-KLR, marked by killer cell lectin-like receptors (KLRs) and part
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical features of the CREST (calcinosis cutis, Raynaud's syndrome, esophageal dysmotility, sclerodactyly, and telangiectasias) syndrome are sometimes exhibited in patients with primary biliary cirrhosis (PBC), but the postulated autoimmune mechanisms behind these conditions are poorly understood. Clonally expanded T cells may play an important role in disease pathogenesis. In this study, overrepresentation of one T-cell receptor beta chain variable region, TCRBV3, was documented in patients with PBC and/or CREST. Overrepresentation of the TCRBV3 gene mRNA was demonstrated by semiquantitativ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transgenic mouse models expressing predefined T-cell receptors (TCRs) have been instrumental in advancing our understanding of T-cell biology. However, these traditional models rely on random genomic insertion of large constructs, require labor-intensive embryo manipulation, and frequently result in aberrant TCR expression and phenotypes. These limitations render traditional models insufficient to meet the mounting demands for rapid and precise model systems to evaluate TCR specificities. In this study, we developed a streamlined method that uses adeno-associated virus (AAV) and CRISPR/Cas9-me
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phenotypic and genotypic characteristics of the peripheral blood mononuclear cells in nine patients with Felty's syndrome have been examined. One patient had an increased number and percentage of peripheral blood mononuclear cells with the phenotype CD3+ Leu-7+ CD16+ and showed a clonal rearrangement of the T cell receptor B chain gene. The remaining eight patients all showed a germline configuration of the T cell receptor B chain gene. In two patients an increased proportion of CD3+ Leu-7+ CD16- peripheral blood mononuclear cells (45 (SD 11)% of peripheral blood mononuclear cells) were found,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.