OBJECTIVE: Treatment-resistant depression (TRD) occurs in roughly one-third of all individuals with major depressive disorder (MDD). Although research has suggested a significant common variant genetic component of liability to TRD, with heritability estimated at 8% when compared with non-treatment-resistant MDD, no replicated genetic loci have been identified, and the genetic architecture of TRD remains unclear. A key barrier to this work has been the paucity of adequately powered cohorts for investigation, largely because of the challenge in prospectively investigating this phenotype. The ob
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
FOXA1 is a pioneer transcription factor that shapes lineage-specific regulatory programs in hormone-associated cancers. Here, we integrated FOXA1 cistromes, transcriptomes, GWAS loci, expression-associated quantitative trait loci (eQTL) datasets, clinical cohorts, and functional assays to examine how FOXA1-directed transcriptional networks contribute to prostate and breast cancer biology. We identified high-confidence FOXA1 direct target genes that converge on shared oncogenic pathways while retaining cancer-type-specific regulatory modules. These FOXA1-associated transcriptional programs gene…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation (DNAm) is an epigenetic modification involved in gene regulation. DNAm quantitative trait loci (mQTLs) have been identified in many tissues, but bulk-tissue studies obscure cell type-specific effects. Here, we present the first multi-tissue landscape of cell type-dependent regulation of DNAm in humans by mapping cell type-interaction mQTLs (imQTLs) across seven tissue types (breast, colon, lung, ovary, prostate, kidney, and whole blood), identifying 3,150 imQTLs. Inter-individual variability in cell type proportion, rather than mean proportion, was most associated with imQTL di…
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age at onset of walking is an important early childhood milestone which is used clinically and in public health screening. In this genome-wide association study meta-analysis of age at onset of walking (N = 70,560 European-ancestry infants), we identified 11 independent genome-wide significant loci. SNP-based heritability was 24.13% (95% confidence intervals = 21.86-26.40) with ~11,900 variants accounting for about 90% of it, suggesting high polygenicity. One of these loci, in gene RBL2, co-localized with an expression quantitative trait locus (eQTL) in the brain. Age at onset of walking (in m
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atrial fibrillation (AF) is the most common arrhythmia in the world. Human genetics can provide strong AF therapeutic candidates, but the identification of the causal genes and their functions remains challenging. Here, we applied an AF fine-mapping strategy that leverages results from a previously published cross-ancestry genome-wide association study (GWAS), expression quantitative trait loci (eQTLs) from left atrial appendages (LAAs) obtained from two cohorts with distinct ancestry, and a paired RNA sequencing (RNA-seq) and ATAC sequencing (ATAC-seq) LAA single-nucleus assay (sn-multiome). …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bipolar disorder is a heritable mental illness with complex etiology. We performed a genome-wide association study of 41,917 bipolar disorder cases and 371,549 controls of European ancestry, which identified 64 associated genomic loci. Bipolar disorder risk alleles were enriched in genes in synaptic signaling pathways and brain-expressed genes, particularly those with high specificity of expression in neurons of the prefrontal cortex and hippocampus. Significant signal enrichment was found in genes encoding targets of antipsychotics, calcium channel blockers, antiepileptics and anesthetics. In
СтатьяМетаанализПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-related macular degeneration (AMD) is a leading cause of vision loss. To better understand disease pathogenesis and identify causal genes in GWAS loci for AMD risk, we present a comprehensive database of human retina and retinal pigment epithelium (RPE). Our database comprises macular and non-macular RNA sequencing (RNA-seq) profiles from 129 donors, a genome-wide expression quantitative trait loci (eQTL) dataset that includes macula-specific retina and RPE/choroid, and single-nucleus RNA-seq (NucSeq) from human retina and RPE with subtype resolution from more than 100,000 cells. Using Nuc…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cartilage and synovium are essential tissues involved in joint-related diseases and traits, including osteoarthritis (OA), rheumatoid arthritis (RA), and human height. Although genome-wide association studies (GWAS) identify numerous risk loci for these traits, the molecular mechanisms underlying these associations, particularly those involving alternative splicing, remain poorly understood due to the lack of splicing-related genetic data in relevant tissues. To address this limitation, we generate a splicing quantitative trait loci (sQTL) resource for cartilage and synovium. We identify 2,796…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adolescent idiopathic scoliosis (AIS) is the most common spinal deformity. We previously conducted a genome-wide association study (GWAS) an … ere in intron 3 of BNC2, which encodes a zinc finger transcription factor, basonuclin-2. Expression quantitative trait loci data suggested that the associated SNPs have the potential to regulate the BNC2 transcriptional activity and that the susceptibility alleles increase BNC2 expression. We identified a functional SNP, rs10738445 in BNC2, whose susceptibility allele sh …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptin is produced by adipose tissue and acts as a feedback signal to the hypothalamus controlling energy homeostasis, by reducing food cons … le for the regulation of leptin and other obesity-related plasma substances. We have identified two quantitative trait loci (QTLs) contributing to serum leptin levels. These two loci, designated Olep1 [Chromosome (Chr) 2] and Olep2 (Chr 6), were homologous to those of human genome regions containing several potential candidate genes for obesity. These are fatty acid-bind …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptome-wide association studies (TWAS) are widely used to identify genes involved in complex traits and to infer the direction of gen … ins and 33% for complex traits. We propose that much of the sign discordance arises when expression quantitative trait loci in non-trait-relevant tissues tag haplotypes associated with traits in genome-wide association studies via distinct, tightly linked regulatory variants, yielding spurious TWAS associations with the correct genes but with unreliable direction of effe …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pigs are one of the most important livestock species worldwide. Although multiple high-quality reference genomes exist, reliance on a single linear reference limits the detection of structural variants (SVs) and the characterization of population-specific genetic diversity. To address this limitation, we developed SwinePan, a comprehensive and integrated multiomics database for pigs built on a graph-based pangenome framework. SwinePan incorporates a variome derived from the graph-based pangenome, covering 2,598 individuals across 35 breeds, including 185,759 SVs, 117 million SNPs, and 6.8 mill
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a fatal neurodegenerative disease with a lifetime risk of one in 350 people and an unmet need for disease-modifying therapies. We conducted a cross-ancestry genome-wide association study (GWAS) including 29,612 patients with ALS and 122,656 controls, which identified 15 risk loci. When combined with 8,953 individuals with whole-genome sequencing (6,538 patients, 2,415 controls) and a large cortex-derived expression quantitative trait locus (eQTL) dataset (MetaBrain), analyses revealed locus-specific genetic architectures in which we prioritized genes eith
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Phosphodiesterases (PDEs) are considered promising drug targets due to their close association with various pathological and physiological processes. We aimed to investigate the causal relationship between PDE inhibitors and hypertensive disorders of pregnancy (HDP) and fetal growth restriction (FGR).
METHODS: We used expression quantitative trait loci (eQTLs) related to PDEs as surrogate indicators of PDE gene expression levels and conducted single-sample Mendelian randomization (SMR) analysis and two-sample MR validation through the pharmacological target.
RESULTS: SMR analysis …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Fufang Baizhi Tincture (FFBZD) is a traditional topical Chinese medicine. This study demonstrates that FFBZD … . By integrating large-scale Genome-Wide Association Study (GWAS) data with multi-tissue expression Quantitative Trait Loci (eQTL) and protein Quantitative Trait Loci (pQTL) data, we performed summary-data-based MR (SMR) and colocalization analyses. Key computational predictions were then validated in a hydrogen peroxide (H2O2)-induced oxidative stress model in human mel …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mesothelioma is a rare and aggressive cancer with limited therapeutic options and poor prognosis. Despite advancements in understanding its molecular mechanisms, effective biomarkers and therapeutic targets remain elusive.
OBJECTIVE: This study utilizes a multi-omics approach to identify potential biomarkers and therapeutic targets for mesothelioma.
METHODS: A multi-omics framework integrating druggable genomics, Mendelian randomization (MR), and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was employed. Druggable genes were identified using expression quantitative trait loci data, and…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Current osteoporosis medications often prove ineffective for various reasons. Alongside optimizing available agents, new genetic targets should be proposed for drug development. Mendelian randomization (MR) may resolve throughput and confounding issues in traditional observational studies for druggable targets.
METHODS: We employed two-sample MR with protein quantitative trait loci (pQTLs) and expression quantitative trait loci (eQTLs) data as exposures and six bone mineral density (BMD) sites as outcomes. By meta-analyzing pQTL evidence, validating eQTL evidence, conducting MR …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial dysfunction and immune cell infiltration play crucial yet incompletely understood roles in the pathogenesis of calcific aortic … achine learning methods. Subsequent SMR analysis, incorporating multiomics data, such as expression quantitative trait loci (eQTLs) and methylation quantitative trait loci (mQTLs), revealed a significant causal relationship between ALDH9A1 expression and a reduced risk of CAVD. Moreover, ALDH9A1 expression was inversely correlated with M0 macrophages and positively corre …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: We aimed to define the genetic architecture and regulatory mechanisms of Alzheimer's disease (AD) -related plasma biomarkers in an East Asian population.
METHODS: Genome-wide association studies (GWAS) of plasma phosphorylated tau at threonine 217 (pTau217), pTau181, neurofilament light chain (NfL), and glial fibrillary acidic protein (GFAP) were performed in 1,972 individuals from the Korea-Registries to Overcome and Accelerate Dementia Research (K-ROAD) cohort. Results were integrated with Korean single-nucleus transcriptomics, AD-relevant brain quantitative trait loci resourc…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymorphisms of human leukocyte antigen (HLA) genes confer risks for human diseases. Predisposing effects related to T cell receptor (TCR) … TCR repertoires of naive CD4+ T cells of 103 CeD subjects and 103 controls and performed gene usage quantitative trait loci analyses. The naive CD4+ TCR repertoire was significantly affected by TRA, TRB, and in particular HLA polymorphisms. The presence of HLA-DQ2.5 influenced the TCR repertoire, resulting in significant enrichment of TCR genes being involved in recognit …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования