Proteomics offers vast potential for studying the molecular regulation of the human brain. Formalin fixation is a common method for preserving human tissue; however, it presents challenges for proteomic analysis. In this study, we compared the efficiency of two different protein-extraction buffers on three post-mortem, formalin-fixed human brains. Equal amounts of extracted proteins were subjected to in-gel tryptic digestion and LC-MS/MS. Protein, peptide sequence, and peptide group identifications; protein abundance; and gene ontology pathways were analyzed. Protein extraction was superior us
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eleven mumps vaccine strains, all containing live attenuated virus, have been used throughout the world. Although L-Zagreb mumps vaccine has been licensed since 1972, only its partial nucleotide sequence was previously determined (accession numbers , and ). Therefore, we sequenced the entire genome of L-Zagreb vaccine strain (Institute of Immunology Inc., Zagreb, Croatia). In order to investigate the genetic stability of the vaccine, sequences of both L-Zagreb master seed and currently produced vaccine batch were determined and no difference between them was observed. A phylogenetic analysis b
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To identify a sperm-surface component that is highly antigenic, we immunized female cynomolgus macaques with glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored sperm surface proteins that were released following treatment with phosphatidylinositol-specific phospholipase C (PI-PLC). Five different adjuvants were used in combination with the PI-PLC-released proteins, and three of these proteins (24, 48, and 53 kDa) were shown to be potent antigens for immunization of female monkeys. The 53 kDa protein was found to be a surface coating protein and not a GPI-anchored protein. Polyclonal antibodies to the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gas-phase intra-molecular crosslinking of protein ubiquitin cations has been demonstrated via ion/ion reactions with anions of a homobifunctional N-hydroxysulfosuccinimide (sulfo-NHS) ester reagent. The ion/ion reaction between multiply-protonated ubiquitin and crosslinker monoanions produces a stable, charge-reduced complex. Covalent crosslinking is indicated by the consecutive loss of 2 molecules of sulfo-NHS under ion trap collisional activation conditions. Covalent modification is verified by the presence of covalently crosslinked sequence ions produced by ion-trap collision-induced dissoc
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Upon feeding, mosquito midguts secrete the peritrophic matrix (PM), an extracellular chitin-containing envelope that completely surrounds the blood meal. Because the malaria parasite must cross the PM to complete its life cycle in the mosquito, the PM is a potential barrier for malaria transmission. By antibody screening of an expression library we have identified and partially characterized a cDNA encoding a putative PM protein, termed Anopheles gambiae adult peritrophin 1 (Ag-Aper1). Ag-Aper1 is the first cloned PM gene from a disease vector. Northern analysis detected an abundant Ag-Aper1 t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The serum from a Sjögren's syndrome patient with anti-Golgi antibodies was used as a probe to isolate a 4.6-kilobase pair cDNA insert from a HeLa cDNA library. Expression of the cDNA in Escherichia coli and the in vitro translation products of the cDNA yielded a recombinant protein that migrated in SDS-polyacrylamide gel electrophoresis at 180 kDa. This protein was immuno-precipitated by the human anti-Golgi serum and by immune rabbit serum but not by normal human serum or preimmune rabbit serum. Western blot analysis showed that the prototype human and immune rabbit sera recognized a 245-kDa
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoantibodies to a novel nuclear Ag, Sp100, have recently been described that recognize a nuclear protein with an apparent molecular mass of 95 to 100 kDa and a dot-like distribution within cell nuclei. By immunoscreening of a lambda gt11 cDNA expression library derived from HeLa cells with an anti-Sp100 autoimmune serum a 0.7-kb cDNA (Sp26) coding for a fragment of Sp100 was isolated. Expression of this cDNA and use of the recombinant protein in ELISA revealed that the fragment carries major Sp100 autoepitopes and that anti-Sp100 autoantibodies predominantly occur in patients suffering from
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary ciliary dyskinesia most often arises from loss of the dynein motors that power ciliary beating. Here we show that DNAAF3 (also known as PF22), a previously uncharacterized protein, is essential for the preassembly of dyneins into complexes before their transport into cilia. We identified loss-of-function mutations in the human DNAAF3 gene in individuals from families with situs inversus and defects in the assembly of inner and outer dynein arms. Knockdown of dnaaf3 in zebrafish likewise disrupts dynein arm assembly and ciliary motility, causing primary ciliary dyskinesia phenotypes tha
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multimerin is a massive, soluble protein found in platelets and in the endothelium of blood vessels. Multimerin is composed of varying sized, disulfide-linked multimers, the smallest of which is a homotrimer. Multimerin is a factor V/Va-binding protein and may function as a carrier protein for platelet factor V. The cDNA for human multimerin was isolated from lambda gt11 endothelial cell libraries using antibodies, and the isolated cDNA clones were used to obtain the full sequence. The full-length multimerin cDNA was 4.2 kilobase pairs. Northern analyses identified a 4.7-kilobase transcript in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although previously thought to be unlikely, recent studies have shown that de novo gene origination from previously non-genic sequences is a relatively common mechanism for gene innovation in many species and taxa. These young genes provide a unique set of candidates to study the structural and functional origination of proteins. However, our understanding of their protein structures and how these structures originate and evolve are still limited, due to a lack of systematic studies. Here, we combined high-quality base-level whole genome alignments, bioinformatic analysis, and computational st
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human amniotic fluid has been shown to contain a protein that binds insulin-like growth factor I and II (IGF-I and IGF-II). Partially purified preparations of this protein have been reported to inhibit the biologic actions of the IGFs. In these studies our laboratory has used a modified purification procedure to obtain a homogeneous preparation of this protein as determined by polyacrylamide gel electrophoresis and amino acid sequence analysis. During purification the ion exchange chromatography step resulted in two peaks of material with IGF binding activity termed peaks B and C. Each peak wa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel widely expressed homologue of the VAV oncogene, VAV2 (53% identical residues), has been identified within the critical region for the tuberous sclerosis gene, TSC1, on human chromosome 9q34. By Southern blot analysis, analysis of allele-specific transcription, and direct sequencing of the VAV2 mRNA/cDNA from patient lymphoblastoid cell lines, we demonstrate that both alleles of this gene are expressed in TSC patients and there are no significant mutations. VAV consists of a novel array of signalling domains and is thought to play an important role in signal transduction in haematopoiet
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salp15, a 15-kDa salivary gland protein plays an important role in tick blood-feeding and transmission of Borrelia burgdorferi, the causative agent of Lyme borreliosis. The comparative studies reveal that Salp15 is a genetically conserved protein across various Ixodes species. In this study, we have identified a Salp15 homolog, designated as Iaff15, from Ixodes affinis ticks that are the principal enzootic vectors of B. burgdorferi sensu stricto in the southeastern part of the United States. Comparison of the annotated amino acid sequences showed that Iaff15 share 81% homology with I. sinensis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carriers of the Glu167Lys coding variant in the TM6SF2 gene have recently been identified as being more susceptible to non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD), yet exhibit lower levels of circulating lipids and hence are protected against cardiovascular disease. Despite the physiological importance of these observations, the molecular function of TM6SF2 remains unknown, and no sequence similarity with functionally characterized proteins has been identified. In order to trace its evolutionary history and to identify functional domains, we embarked on a computational protein sequence analysis
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emergence and spread of pandemic strains of Vibrio parahaemolyticus have drawn attention to make detailed study on their genomes. The pathogenicity of V. parahaemolyticus has been associated with thermostable-direct hemolysin (TDH) and/or TDH-related hemolysin (TRH). The present study evaluated characteristics of tdh and trh genes, considering the phylogenetic and in silico functional features of V. parahaemolyticus and other bacteria. Fifty-two tdh and trh genes submitted to the GenBank were analyzed for sequence similarity. The promoter sequences of these genes were also analyzed from transc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recombinant forms of Neisseria meningitidis human factor H binding protein (fHBP) are undergoing clinical trials in candidate vaccines against invasive meningococcal serogroup B disease. We report an extensive survey and phylogenetic analysis of the diversity of fhbp genes and predicted protein sequences in invasive clinical isolates obtained in the period 2000-2006.
METHODS: Nucleotide sequences of fhbp genes were obtained from 1837 invasive N. meningitidis serogroup B (MnB) strains from the United States, Europe, New Zealand, and South Africa. Multilocus sequence typing (MLST) a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The database of human Expressed Sequence Tags was previously used to identify PRAC (Prostate 47:125-131, 2001), a novel gene specifically expressed in human prostate, prostate cancer, rectum, and distal colon. In this report, we have identified PRAC2, another gene with a similar expression pattern that is located adjacent to the original PRAC gene on chromosome 17q21.3.
METHODS: Using a computer-based analysis, a cluster of sequence homologous ESTs was identified that is mainly derived from human prostate cDNA libraries. The tissue specificity was examined by multiple tissue RNA d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have isolated and characterized a novel human and rat organic anion transporter subtype, OATP-D. The isolated cDNA from human brain encodes a polypeptide of 710 amino acids (Mr 76,534) with 12 predicted transmembrane domains. The rat clone encodes 710 amino acids (Mr 76,821) with 97.6% amino acid sequence homology with human OATP-D. Human and rat OATP-D have moderate amino acid sequence homology with LST-l/rlst-1, the rat oatp family, the prostaglandin transporter, and moatl/MOAT1/KIAA0880/OATP-B. Phylogenetic tree analysis revealed that OATP-D is branched in a different position from all k
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have identified and characterized fragments of 15 salicylic acid (SA) early response genes. The kinetics of induction and response to cycloheximide (CHX) treatment allowed classification of genes into four groups. Classes I-III are characterized by immediate-early responses, showing increased accumulation of mRNA within 30 min of SA treatment. Moreover, CHX did not block induction of these genes, indicating that latent cellular factors mediate the SA response. Class IV genes were induced more slowly, but still within 2 to 3 h of SA treatment, and required protein synthesis for expression. A
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mass spectrometric analysis of a prion protein (PrP)-containing complex isolated from ram cauda epididymal fluid revealed a protein that showed homology to a carboxylesterase-like protein previously identified in cat urine (cauxin). Using anti-cauxin antibodies, immunoreactive bands were detected in corpus and cauda epididymal fluid from all mammals tested (ram, boar, mouse, and cat). In the ram, the protein was also present in seminal fluid but not found to be associated with sperm. The bands reacting with the anti-cauxin antibody coincided with those having esterase activity in a zymographic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования