BACKGROUND: As a member of the DnaE intein family, Ter DnaE-3 (TE3) is limited by a relatively low splicing rate, significant undesired N-terminal cleavage reactions, and dependence on native exteins.
METHODS: Building on eight previously identified mutation sites from directed evolution, we employed site-directed mutagenesis to systematically investigate how these residues regulate wild-type mini-TE3 splicing and cleavage activities across various expression systems.
RESULTS: In the pKH kanamycin resistance system, the E23G mutation reduces N-cleavage propensity, which may be attributed to …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Precise and scarless DNA insertion and replacement represent two of the major challenges in plant genome editing. Numerous tools have been developed, including homology-directed repair-dependent tools and prime-editing-mediated systems. However, none has fully resolved these challenges. In this study, we develop the "mortise-tenon joint system" (MT), a novel strategy that enables precise and efficient targeted DNA insertion and replacement. By leveraging the APOBEC-Cas9-uracil DNA glycosylase/(apurinic or apyrimidinic site) lyase within our previously reported APOBEC-Cas9 fusion-induced deleti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: ZNF142 gene is a protein-coding gene encoding Zinc Finger Protein 142. ZNF proteins are a vast group of cellular effectors with a wide range of functions such as signal transduction, transcriptional regulation, meiotic recombination, DNA repair, development, and cell migration. Mutations in the ZNF142 gene are related to neurodevelopmental disorder with impaired speech and hyperkinetic movements (NEDISHM). This study on a family with three affected siblings identified a pathogenic frameshift insertion variant. In addition, we conducted a review of the literature on previously repor
Клинический случайСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tricyclazole (8-methyl-[1,2,4]triazolo[3,4-b][1,3]benzothiazole) is a fungicide used globally on rice for treatment of the seasonal rice blast disease. Human exposure to this fungicide can occur via dietary and nondietary routes. In a battery of in vitro assays, tricyclazole did not induce gene mutations in bacteria (Ames test) or at the Hprt locus of CHO cells. It was also negative for the induction of micronuclei in human lymphocyte cultures and unscheduled DNA synthesis (UDS) in primary rat hepatocyte. Paradoxically, tricyclazole induced a mutagenic response at the Tk locus of the mouse lym
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As a master hormone controlling growth and metabolism, GH is also known to regulate reproduction. Studies in mammals have shown that mutations in GH or its receptor (GHR) not only result in retardation in body growth but also reproductive dysfunctions in both sexes. However, the roles of GH in reproduction of other vertebrates are poorly defined. In this study, we created two zebrafish GH (gh1) mutant lines using CRISPR/Cas9. The mutant developed normally up to 14 days postfertilization (dpf); however, a high rate of mortality was observed afterward in both lines, and only a small number of mu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The disciplines of Borrelia (Borreliella) burgdorferi microbiology and Lyme disease pathogenesis have come to depend on the genetic manipulation of the spirochete. Generating mutants in these recalcitrant bacteria, while not straightforward, is routinely accomplished in numerous laboratories, although there are several crucial caveats to consider. This chapter describes the design of basic molecular genetic experiments as well as the detailed methodologies to prepare and transform competent cells, select for and isolate transformants, and complement or genetically restore mutants.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CRISPR-Cas9 genome editing system has been widely used in multiple cells and organisms. Here we developed a CRISPR-Cas9 based in vitro large DNA vector editing system, using the Ad5-based vector as an example. We demonstrate use of this system to generate targeted mutations, in-frame gene deletion, and gene replacement. This in vitro CRISPR editing system exhibits high efficiency and accuracy. We believe this system can be applied in a variety of experimental settings.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spread of Plasmodium falciparum multidrug resistance highlights the urgency to discover new targets and chemical scaffolds. Unfortunately, lack of experimentally validated functional information about most P. falciparum genes remains a strategic hurdle. Chemogenomic profiling is an established tool for classification of drugs with similar mechanisms of action by comparing drug fitness profiles in a collection of mutants. Inferences of drug mechanisms of action and targets can be obtained by associations between shifts in drug fitness and specific genetic changes in the mutants. In this scr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sulfur compounds, such as sulfite (SO(2)), hydrogen sulfide (H(2)S), and glutathione (GSH), play different roles in beer flavor stability. SO(2) and GSH have antiaging effects which are helpful to improve the flavor stability of beer, whereas H(2)S is undesirable to beer flavor because of its unpleasant aroma. Here, we report the development of Saccharomyces cerevisiae which produces higher levels of SO(2) and GSH but lower level of H(2)S to improve beer flavor stability by nongenetic engineering approaches. After two rounds of UV mutagenesis coupled with specific plate screening methods, one …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteria are known to adopt complex metabolic strategies in an effort to counteract the impact of numerous toxic compounds. In this study, a Cr(VI)-sensitive mutant of the Cr(VI)-hyperresistant bacterium Pseudomonas corrugata 28, obtained by insertional mutagenesis using the EZ-Tn5™ <R6Kγori/KAN-2>Tnp, was employed to gain a greater understanding of Cr(VI) resistance in bacteria. The insertion of the transposon, which occurred 16 bp upstream from the start codon of an ORF encoding a soluble pyridine nucleotide transhydrogenase (STH), negatively affected expression of the sth gene. The compromi…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptomyces scabies, a causal agent of common scab, produces both melanin and a secondary metabolite called thaxtomin A. To establish a possible relation between melanin and thaxtomin A production in S. scabies, we carried out N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidine (NTG) mutagenesis and isolated 11 melanin-negative mutants of S. scabies EF-35. These mutants were characterized for thaxtomin A production, pathogenicity, sporulation, and stress resistance. Nine of these mutants showed a significant reduction in thaxtomin A production when compared with the wild strain. However, only a few mutants …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epidermolysis bullosa is a family of inherited blistering skin disorders characterized by blister formation in response to mechanical trauma. Major types of epidermolysis bullosa include epidermolysis bullosa simplex, hemidesmosomal epidermolysis bullosa, junctional epidermolysis bullosa, and dystrophic epidermolysis bullosa. Current treatment for epidermolysis bullosa consists of supportive care for skin and other organ systems and entails a combination of wound management, infection support for chronic wounds, surgical management as needed, nutritional support, and preventative screening for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cation-Cl cotransporters (CCCs) mediate the coupled movement of Na and/or K to that of Cl across the plasmalemma of animal cells. Eight CCCs have been identified to date: two Na-K-Cl cotransporters (NKCC), four K-Cl cotransporters (KCCs), one Na-Cl cotransporter (NCC) and one CCC interacting protein (CIP). All of the NKCCs and KCCs are inhibited by loop diuretics; mercury and other modifying agents are also known to block NKCC-mediated transport. In this work, we have utilized a mutational approach to study the interaction between different substrates and the NKCCs. We relied on the strate
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Four databases with sequence changes for 12000 mutations in mammalian and bacterial cells were searched for genotoxic agents inducing tandem mutations, in which two adjacent base pairs are changed. Ultraviolet light induces about one CC > TT per 10-20 mutations, and other tandem-base changes at about half that frequency. There is strong evidence that cis-diammine dichloroplatinum (II) induces tandems. These results suggest that tandem-base changes are induced by agents that damage two adjacent base pairs in DNA. Tandems, particularly CC > TT, can be used as indicators of exposure to ultraviole
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper examines the impact of advances in knowledge on the molecular biology of human Mendelian diseases on the estimation of genetic risks of exposure to ionizing radiation and to chemical mutagens. More specifically, it addresses the question of whether and to what extent naturally occurring Mendelian diseases can be used as a baseline for efforts in this area. Data on the molecular nature and mechanisms of origin of spontaneous mutations underlying naturally occurring Mendelian diseases and on radiation-induced mutations in experimental systems suggest that for ionizing radiation, natur
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Through a systematic genetic screen, we have identified 55 mutations that affect the development of the PNS of Drosophila embryos. These mutations specify 13 novel and 5 previously characterized genes and define new phenotypes for 2 other known genes. Five classes of mutant phenotypes were identified in the screen: gain of neurons, loss of neurons, abnormal position of chordotonal neurons, aberrant neuronal trajectories, and abnormal morphology of neurons. Phenotypic analyses of mutations identified in this study revealed three novel aspects of PNS development. First, we have identified a nove
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The consequences of two different mutations induced with N-methyl-N-nitrosoguanidine (Strain G1) and Trifluoperazine resistance (Strain G5) in Mucor rouxii, were studied. Mutants were stable and exhibited mycelial morphology in aerobiosis. Mutants cells exhibit phenotypic characteristics of slow-growing. The mutants G1 and G5 cultures showed 16.8% and 35.3% of reduction of the growth relative to parental strain. Morphologically mycelia of mutants cell were indistinguishable from wild-type cells, except from reduction in extension and branching of hyphal that has the mutant G5. Calcofluor and F
Сравнительное исследованиеАннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porphyromonas gingivalis is a primary pathogen involved in the initiation and progression of adult chronic periodontitis. Its colonization o … strains carrying different types of FimAs towards saliva and Streptococcus gordonii surfaces using mutagenesis analysis. We demonstrated differential expression of each fimA gene in these P. gingivalis strains. A correlation of the transcription level of fimA and binding activity of P. gingivalis was revealed. We show that P. gingivalis strains with genotype …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli contains at least two iron storage proteins, a ferritin (FtnA) and a bacterioferritin (Bfr). To investigate their specific functions, the corresponding genes (ftnA and bfr) were inactivated by replacing the chromosomal ftnA and bfr genes with disrupted derivatives containing antibiotic resistance cassettes in place of internal segments of the corresponding coding regions. Single mutants (ftnA::spc and bfr::kan) and a double mutant (ftnA::spc bfr::kan) were generated and confirmed by Western and Southern blot analyses. The iron contents of the parental strain (W3110) and the bf
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.