Genotype-phenotype correlations in genetic diseases for which missense mutations lead to disease remain a challenge. This is particularly true for diseases caused by alterations of proteins for which no three-dimensional structure is available. One such disease is Mucopolysaccharidosis type I, a disorder arising from a lack of activity of the lysosomal enzyme alpha-l-iduronidase (IDUA, EC 3.2.1.76). This deficiency compromises the degradation pathway of glycosaminoglycans such as heparan sulfate and dermatan sulfate, leading to substrate accumulation, which ultimately results in a multisystem
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A peptide corresponding to the third helical region within the PrP(C) protein, from residues 198 to 218 (helix-3), was synthesised with and without the familial 210-Val to Ile Creutzfeldt-Jakob disease mutation. The NMR structure of PrP(C) predicts no global variation in stability for this mutation, indicating that local sequence rather than global structural factors are involved in the pathological effects of this mutation. 1H NMR analysis of peptides with and without this mutation indicated that it had no significant effect on local helical structure. Temperature denaturation studies monitor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CD81 (TAPA-1) is a widely expressed cell-surface protein involved in an astonishing variety of biologic responses. It has been cloned independently several times for different functional effects and is reported to influence adhesion, morphology, activation, proliferation, and differentiation of B, T, and other cells. On B cells CD81 is part of a complex with CD21, CD19, and Leu13. This complex reduces the threshold for B cell activation via the B cell receptor by bridging Ag specific recognition and CD21-mediated complement recognition. Similarly on T cells CD81 associates with CD4 and CD8 and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is shown here that the three-dimensional arrangement of the amino acids in an RGDF beta-turn (sequence involved in cell adhesion) resembles that of an alpha-helix with a shuffled RGDF sequence (i.e. RGXFD). A miniprotein was designed and constructed which arranges the RGXFD sequence into a well defined helical conformation. The designed protein is bioactive and folds into the desired structure as assessed by nuclear magnetic resonance spectroscopy. The recognition process mediated by a beta-turn can thus be mimicked by an alpha-helix.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The lens capsules of senile cataractous patients were differentiated into three progressive grades of immature (I, II and III) and two progressive grades of mature (I' and II') groups using Fourier transform infrared (FT-IR) microspectroscopy with Fourier self-deconvolution and curve-fitting algorithms, according to the changes in IR peak position and its structural composition. The secondary conformation of both immature-II and mature-I' cataractous human lens capsules was found to change significantly when enhancing the beta-sheet structure but simultaneously decreasing the beta-turn structu
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The kinetics of triple helix formation of procollagen I were measured in normal human fibroblast cultures and cell strains from six patients with osteogenesis imperfecta (OI), a heritable connective tissue disorder. After a 4-minute pulse-labelling with [35S]methionine, the appearance of protease-resistant and thus helical collagen molecules was followed for variable chase times. In control cells, 50% of the molecules were fully triple-helical after 14 minutes. In the six OI cell strains harbouring a single Gly-->Cys substitution at positions 94, 223, 526, 691 and 988 in the helical domain of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we report a 4-month-old boy with T-B+NK- severe combined immunodeficiency (SCID) due to a novel mutation in exon 2 of IL2RG, the gene encoding the interleukin (IL) common gamma chain (γc) of the cytokine receptors for IL-2, IL-4, IL-7, IL-9, IL-15, and IL-21. The patient was born from a twin pregnancy. He manifested recurrent infections of the gastrointestinal tract, whereas his twin brother was asymptomatic with no immune defects. In order to evaluate the effect of this unreported variant on the protein structure, a structural modeling process was performed showing prominent bi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Opaque-2 (O2) is a plant bZIP transcription factor that regulates the expression of alpha and beta prolamines, the main storage proteins in seeds of cereals such as maize and Coix. One of the main processes modulating O2 activity is the heterodimerization with other bZIP transcription factors, but the primary mechanism underlying the partner choice is still unknown. In this paper, we have characterized the bZIP domain of O2 by nuclear magnetic resonance (NMR), circular dichroism (CD), and size-exclusion chromatography. Results obtained from CD measurements suggested that the native O2bZIP has
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brain metal dyshomeostasis and altered structural dynamics of the presynaptic protein α-synuclein (αS) are both implicated in the pathology of Parkinson's disease (PD), yet a mechanistic understanding of disease progression in the context of αS structure and metal interactions remains elusive. In this Communication, we detail the influence of iron, a prevalent redox-active brain biometal, on the aggregation propensity and secondary structure of N-terminally acetylated αS (NAcαS), the physiologically relevant form in humans. We demonstrate that under aerobic conditions, Fe(II) commits NAcαS to
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitric oxide synthases (NOSs), which catalyze the formation of the ubiquitous biological messenger molecule nitric oxide, represent unique cytochrome P-450s, containing reductase and mono-oxygenase domains within one polypeptide and requiring tetrahydrobiopterin as cofactor. To investigate whether tetrahydrobiopterin functions as an allosteric effector of NOS, we have analyzed the effect of the pteridine on the conformation of neuronal NOS purified from porcine brain by means of circular dichroism, velocity sedimentation, dynamic light scattering and SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. We
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Missense mutation L270P disrupts the auto-inhibited state of "Wiskkot-Aldrich syndrome protein" (WASP), thereby constitutively activating the mutant structure, a key event for pathogenesis of X-linked neutropenia (XLN). In this study, we comprehensively deciphered the molecular feature of activated mutant structure by all atom molecular dynamics (MD) approach. MD analysis revealed that mutant structure exposed a wide variation in the spatial environment of atoms, resulting in enhanced residue flexibility. The increased flexibility of residues favored to decrease the number of intra-molecular h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structural stability of the β-lactoglobulin (β-Lg) calyx confers high resistance to gastric proteolysis. While bile salts are known to promote its intestinal digestion, the specific conformational mechanisms and their impact on the resulting peptide cleavage patterns are not fully understood. In this study, we investigated the influence of bovine bile salts on the structural reorganization and digestibility of β-Lg during simulated gastrointestinal digestion. Conformational analyses indicated that bile salts induced limited structural perturbation within an overall retained secondary-struc
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is popularly believed to be triggered by the aggregation of amyloid beta 1-42 (Aβ - 42) peptides, eventually leading to neurodegeneration. Our study delves into the influential role played by Green Iron Oxide Nanoparticles (GIONP). GIONP are typically synthesized using a green chemistry approach, imposing curcumin as a biocompatible reducing and capping agent, leveraging its inherent antioxidant, anti-inflammatory, and neuroprotective attributes. Herein, our research particularly aims to decipher whether GIONP modulates the secondary structure of Aβ1-42 peptides with a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The α-pore-forming toxins (α-PFTs) from pathogenic bacteria damage host cell membranes by pore formation. We demonstrate a remarkable, hitherto unknown mechanism by an α-PFT protein from Vibrio cholerae. As part of the MakA/B/E tripartite toxin, MakA is involved in membrane pore formation similar to other α-PFTs. In contrast, MakA in isolation induces tube-like structures in acidic endosomal compartments of epithelial cells in vitro. The present study unravels the dynamics of tubular growth, which occurs in a pH-, lipid-, and concentration-dependent manner. Within acidified organelle lumens or
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterovirus A71 (EV-A71) is a major neurovirulent agent capable of causing severe hand, foot and mouth disease (HFMD) associated with neurological complications and death. Currently, no FDA-approved antiviral is available for the treatment of EV-A71 infections. The flavonoid silymarin was shown to exert virucidal effects, but the binding site on the capsid was unknown. In this study, the ligand interacting site of silymarin was determined in silico and validated in vitro. Moreover, the potential of EV-A71 to develop resistance against silymarin was further evaluated. Molecular docking of silym
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Papillary carcinoma is the most prevalent type of thyroid cancer. Its diagnosis requires accurate and subjective analyses from expert pathologists. Here we propose a method based on the Hough transform (HT) to detect and objectively quantify local structural differences in collagen thyroid nodule capsules. Second harmonic generation (SHG) microscopy images were acquired on non-stained histological sections of capsule fragments surrounding the healthy thyroid gland and benign and tumoral/malignant nodules. The HT was applied to each SHG image to extract numerical information on the organization
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neprilysin (NEP) and angiotensin-converting enzyme (ACE) are two key zinc-dependent metallopeptidases in the natriuretic peptide and kinin systems and renin-angiotensin-aldosterone system, respectively. They play an important role in blood pressure regulation and reducing the risk of heart failure. Vasopeptidase inhibitors omapatrilat and sampatrilat possess dual activity against these enzymes by blocking the ACE-dependent conversion of angiotensin I to the potent vasoconstrictor angiotensin II while simultaneously halting the NEP-dependent degradation of vasodilator atrial natriuretic peptide
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, the critical roles played by genetic variants of TREM2 (Triggering Receptor Expressed on Myeloid cells 2) in Alzheimer's disease have been aggressively highlighted. However, few studies have focused on the deleterious roles of Nasu-Hakola disease (NHD) associated TREM2 variants. In order to get insights into the contributions made by these variants to neurodegeneration, we investigated the influences of four NHD associated TREM2 mutations (Y38C, W50C, T66M, and V126G) on loss-of-function, and followed this with in silico prediction and conventional molecular dynamics simulation. NHD
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global incidence of the sexually transmitted disease gonorrhea is expected to rise due to the spread of Neisseria gonorrhoeae strains with decreased susceptibility to extended-spectrum cephalosporins (ESCs). ESC resistance is conferred by mosaic variants of penicillin-binding protein 2 (PBP2) that have diminished capacity to form acylated adducts with cephalosporins. To elucidate the molecular mechanisms of ESC resistance, we conducted a biochemical and high-resolution structural analysis of PBP2 variants derived from the decreased-susceptibility N. gonorrhoeae strain 35/02 and ESC-resista
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The medium chain triglyceride ketogenic diet is an established treatment for drug-resistant epilepsy that increases plasma levels of decanoic acid and ketones. Recently, decanoic acid has been shown to provide seizure control in vivo, yet its mechanism of action remains unclear. Here we show that decanoic acid, but not the ketones β-hydroxybutryate or acetone, shows antiseizure activity in two acute ex vivo rat hippocampal slice models of epileptiform activity. To search for a mechanism of decanoic acid, we show it has a strong inhibitory effect on excitatory, but not inhibitory, neurotransmis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.