Amylin or human islet amyloid polypeptide (hIAPP) is a small peptide co-secreted with insulin. Its peripheral aggregation on the lipid bilayer leads to fibril formation. The formation of hIAPP fibrils is hypothesized to rupture the membrane of β -cells, which culminates in β-cell death. Following additional studies, amylin fibril formation is a hallmark of T2DM and is also implicitly responsible for Alzheimer's disease. This study reports the virtual screening of 1000 phytoconstituents of traditional Indian medicinal plants to get potential inhibitors of amylin, which will likely restrict and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malaria is a complex disease caused by parasites of the genus Plasmodium and is the leading cause of morbidity and mortality worldwide. The most severe form of malaria disease is caused by Plasmodium falciparum. Thus, a combination of different approaches is needed to control malaria. Resistance to first-line drugs and insecticides, on the other hand, makes the need for an effective vaccination more urgent than ever. Because erythrocyte parasites cause the most clinical symptoms, developing a vaccination for this stage of infection might be highly beneficial. In this research, we employed vari
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV) is widely known due to its role in the etiology of infectious mononucleosis. However, it is the first oncovirus that was identified and has been implicated in the etiology of several types of cancers. Globally, EBV infection is associated with more than 200, 000 new cancer cases and 150, 000 deaths yearly. A prophylactic or therapeutic vaccine targeting tumors associated with EBV infection is currently lacking. Therefore, this study aimed to develop a multiepitope-based polyvalent vaccine against EBV-associated tumors using immunoinformatics approach. The latency-assoc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ser/thr phosphatase Stp1 is an important virulence factor for Staphylococcus aureus (S. aureus) and plays a key role in its infectivity, suggesting that it could serve as a potential target for treatment of S. aureus infection. Previous studies found that the activity of Stp1 was inhibited by MDSA and its derivatives. In this paper, we used molecular docking, molecular modeling, molecular dynamics simulations, binding free energy decomposition calculations, and hydrogen bond analyses to explore the structure-activity relationship. Energy decomposition indicated that MDSA, hydroxymethyl MDSA, c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We performed a homology modeling of the structure of a non-mutated and mutated Ser83→Phe DNA gyrase of Porphyromonas gingivalis. The model presented structural features conserved in type II topoisomerase proteins. We designed and evaluated in silico structural modifications to the core of Moxifloxacin by molecular docking, predicted toxicity and steered molecular dynamics simulations (SMD). Our results suggest that 8D derivative of Moxifloxacin could present a strong inhibitory activity in Porphyromonas gingivalis bacteria that exhibits resistance to some conventional fluoroquinolone drugs. Al
СтатьяVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Visceral leishmaniasis (VL) or kala-azar, the most severe form of the disease, is endemic in more than eighty countries across the world. To date, there is no approved vaccine against VL in the market. Recent advances in reverse vaccinology could be promising approach in designing the efficient vaccine for VL treatment. In this study, an efficient multi-epitope vaccine against Leishmania infantum, the causative agent of VL, was designed using various computational vaccinology methods. Potential immunodominant epitopes were selected from four antigenic proteins, including histone H1, sterol 24-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diminishing β-cell mass of pancreas in type II diabetes mellitus (TIIDM) is intricately linked with high fibrillation propensity of islet amyloid polypeptide (IAPP, aka amylin). IAPP is one of the most amyloidogenic peptide secreted by pancreatic β-cells. In the autopsy of TIIDM patients, IAPP rich amyloid plaques are found containing different components of extracellular matrix (ECM), including heparin. For a positively charged IAPP, interaction with heparin which has accessible high density negatively charged functional groups is anticipated to moderate the fibrillation kinetics. Hence,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Owing to its fundamental roles in cell cycle phases, the cell division cycle 25B (CDC25B) was broadly considered as potent clinical drug target for cancers. In this study, 3D QSAR pharmacophore models for CDC25B inhibitors were developed by the module of Hypogen. Three methods (cost analysis, test set prediction, and Fisher's test) were applied to validate that the models could be used to predict the biological activities of compounds. Subsequently, 26 compounds satisfied Lipinski's rule of five were obtained by the virtual screening of the Hypo-1-CDC25B against ZINC databases. It was then dis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As a neutral carrier component for the preparation of a potentiometric membrane sensor, the affinity and selectivity of the salophen type Schiff base ligand obtained by 1:2 condensation of 2.3-diaminopyridine with salicylaldehyde toward a series of common cations has been fully examined by DFT/B3LYP and integral equation formalism polarizable continum model (IEF-PCM or only given with PCM as default input in the computations) in combination with the experimental data. Both the potentiometric measurements and DFT calculations have exhibited that the ionophore shows appreciable selectivity for C
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diuretics such as hydrochlorothiazide, hydroflumethiazide, quinethazone, metolazone, chlorthalidone, indapamide, furosemide, and bumetanide containing primary sulfamoyl moieties were reevaluated as inhibitors of 12 human carbonic anhydrases (hCAs, EC 4.2.1.1). These drugs considerably inhibit (low nanomolar range) some CA isozymes involved in critical physiologic processes, among the 16 present in vertebrates, for example, metolazone against CA VII, XII, and XIII, chlorthalidone against CA VB, VII, IX, XII, and XIII, indapamide against CA VII, IX, XII, and XIII, furosemide against CA I, II, an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report results of 12 ns, all-atom molecular dynamics simulation (MDS) and Poisson-Boltzmann free energy calculations (PBFE) on calmodulin (CaM) bound to two molecules of trifluoperazine (TFP) and of N-(3,3, diphenylpropyl)- N'-[1- R-(3,4-bis-butoxyphenyl)-ethyl]-propylenediamine (DPD). X-ray data show very similar structures for the two complexes, yet the antagonists significantly differ with respect to their CaM binding affinities, the neutral DPD is much more potent. The goal of the study was to unravel the reason why TFP is less potent although its positive charge should facilitate bindi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The advent of disease-modifying treatments and risk-reduction strategies in the clinic have increased the demand for biomarkers for early disease detection, prediction of clinical course of disease, individual risk prediction and monitoring of treatment effects. The studies in this special issue span ultra-sensitive fluid assays and automated laboratory platforms, structural and molecular neuroimaging, electrophysiology, digital cognitive and behavioral monitoring, multi-omics, neuromodulation, and the computational frameworks necessary to integrate these diverse data.
Редакционная статьяIntroductory Journal ArticleПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Steroid sulfatase (STS) plays a crucial role in intratumoral estrogen biosynthesis and represents an attractive therapeutic target in estrogen receptor-positive breast cancer. In this study, a new series of potential STS inhibitors based on the quinone methide oxime scaffold, precisely 2-(4-hydroxyiminocyclohexa-2,5-dien-1-ylidene)-2-phenylacetonitrile framework, were designed and evaluated using an integrated in silico approach. A virtual library comprising 216 compounds (including syn/anti isomers) was screened by molecular docking against the human STS crystal structure (PDB ID: 8EG3). The
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Boron neutron capture therapy (BNCT) is a highly targeted, selective and effective technique to cure various types of cancers, with less harm to the healthy cells. In principle, BNCT treatment needs to distribute the 10boron (10B) atoms inside the tumor tissues, selectively and homogeneously, as well as to initiate a nuclear fission reaction by capturing sufficient neutrons which releases high linear energy particles to kill the tumor cells. In BNCT, it is crucial to have high quality boron agents with acceptable bio-selectivity, homogeneous distribution and deliver in required quantity, simil
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The target-engagement predictor, implemented within the InSilicoTrials cloud-based, AI-powered platform for model-informed drug discovery and development, enables early exploration of time-dependent pharmacological responses. Predictions can be generated using inputs ranging from molecular structure to in vitro, animal, and clinical data. Scaling and translation across species are supported, accounting for differences in body size and plasma protein binding. This tutorial demonstrates the application of the target-engagement predictor for benchmarking and decision-support in the evaluation of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein foundation models (pFMs) have emerged as pivotal tools in advancing protein science. By leveraging advanced deep learning architectures trained on large-scale protein datasets, pFMs learn generalizable patterns in proteins, enabling accurate prediction of key protein characteristics and generation of novel proteins with tailored properties. In this review, we provide a comprehensive exploration of the developments, applications, challenges, and prospects of pFMs. We systematically examine the multimodal dataset resources that underpin the development of pFMs, ranging from protein seque
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Evolutionary simulations of multiple chromosomes, even up to the scale of full-genome simulations, are becoming increasingly important in population genetics and evolutionary ecology. Unfortunately, the popular simulation framework SLiM has always been intrinsically limited to simulations of a single diploid chromosome. Modeling multiple chromosomes of different types, such as sex chromosomes, has always been cumbersome, even with scripting, presenting a substantial barrier to the development of full-genome simulations. Here we present SLiM 5, a major extension of SLiM's capabilities for simul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1,3-Butadiene (1,3-BD) is a gaseous environmental pollutant classified as a Group 1 carcinogen by the International Agency for Research on Cancer (IARC). While its carcinogenic effects are well-known, the molecular mechanisms underlying its nephrotoxicity remain unclear. This study utilizes network toxicology and bioinformatics to explore the targets and mechanisms of 1,3-BD-induced nephrotoxicity. Key targets such as BCL2, CASP3, MMP9, SIRT1, and TNF were identified as central mediators of renal toxicity. Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway analyses h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptosporidiosis constitutes a serious public health problem, notably in immunocompromised individuals, while effective therapeutic options remain limited. The objective of the present work was to evaluate the anticryptosporidial activity of thymol through in silico and in ovo approaches. Molecular docking assessed thymol interactions with four key Cryptosporidium targets involved in essential metabolic pathways: glycolysis [lactate dehydrogenase (LDH)], protein biosynthesis [lysyl-tRNA synthetase (LysRS)], nucleotide synthesis [inosine monophosphate dehydrogenase (IMPDH)], and calcium-depend
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The classification of novel protein folds remains a central challenge in structural bioinformatics, particularly as deep learning models like AlphaFold2 dramatically expand the universe of predicted protein structures. In this study, we investigated 664 candidate novel fold (CNF) domains from the TED database that both TED and DPAM methods had classified with low confidence. These CNFs span a structurally diverse and largely non-redundant set of domains, most of which lack clear sequence or structural similarity to known folds. Many CNFs appear as insertions into known transmembrane or enzymat
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования